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Spatstat
中
的
点
模式
分析
、
、
、
我是R
的
新手,在为一些
点
模式
分析
设置我
的
数据时遇到了一些麻烦。 我想做
的
是:对纽约市逮捕数据进行
点
模式
分析
,看看逮捕人数和新冠肺炎案件之间是否存在空间相关性。到目前为止,我所做
的
是:以shapefile
的
形式下载数据 https://data.cityofnewyork.us/City-Government/Borough-Boundaries/tq
浏览 18
提问于2020-12-14
得票数 0
1
回答
时空聚类::不同空间中
的
点
模式
、
、
、
通过遵循,我在R中使用
spatstat
包创建了ppp对象。 (例如,树木可按其种类、胸径和叶毒性试验
浏览 4
提问于2014-06-16
得票数 2
1
回答
Ripleys K没有正确地绘制?
、
我正在使用
spatstat
包进行
点
模式
分析
,并在我
的
点
上运行Ripley
的
K (
spatstat
::Kest),以查看是否存在集群。然而,并不是所有应该出现在图形(kFem)
中
的
行都绘制了图。这是我
的
书房窗。这是一个不规则
的
形状,因为我正在
分析
一个沿横断面线
的
点
图案。这是我
的
点
<e
浏览 0
提问于2018-11-07
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1
回答
Spatstat
-如何比较两个温度空间域?
、
我想将WRF模型生成
的
卫星伪图像与真实
的
卫星图像与名为
Spatstat
的
R包进行比较。然而,我不知道如何开始。我读到可以进行空间
模式
比较,但我不知道应该使用哪个函数。我在一个预定义
的
域中有两个温度图像,我想知道是逐点对这些图像进行比较,还是必须促进模型输出和卫星数据。在这种情况下,我应该怎么做呢?有没有可用
的
脚本? 提前谢谢。亲切
的
问候,劳拉。
浏览 2
提问于2019-09-30
得票数 0
1
回答
用于生物细胞
点
模式
的
spatstat
中
的
伪影校正
、
我正在使用
spatstat
来
分析
生物细胞(依赖关系、相互作用等)。用它们
的
中心来生成
点
模式
。然而,我意识到由于它们在2D
中
的
大小而导致
的
伪影。在使用K/L、G函数等时,纠正此类伪影
的
最佳方法是什么?
浏览 16
提问于2020-04-17
得票数 1
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1
回答
在点过程中标记和协变量之间
的
关系是什么?
、
、
、
我对点过程
中
的
标记和协变量感到困惑。我试图通过使用
spatstat
来创建一个标记
点
模式
的
模型,在R
中
只有很少
的
协变量,但是我不确定标记和协变量之间
的
关系。有人能帮我吗? 谢谢。我想描述一下定居
点
的
分布情况。
浏览 1
提问于2015-04-27
得票数 0
回答已采纳
1
回答
使用R
中
的
Spatstat
创建数据帧
点
模式
时
的
大平均强度值问题
、
、
我正在使用R
中
的
Spatstat
软件包进行空间
点
分析
。我
的
数据集包含位置坐标,即某些事件
的
纬度和经度,小数点
的
6位以下。它有9898个观测值。以下是
点
模式
摘要
的
输出: 平均强度每平方单位 149786.3
点
单位 我
的
问题是,平均强度值怎么会这么大?还是我
浏览 1
提问于2016-09-03
得票数 1
回答已采纳
1
回答
用于协同定位
的
Spatstat
点
模式
分析
、
、
、
、
我正在尝试做一些柱状化
分析
,也就是说,我想要显示一种细胞类型在显微复制图像
中
是否倾向于更接近另一种不同
的
细胞类型。我尝试使用R
spatstat
包来实现这一
点
,我能够可视化我
的
数据集: ? mypattern是一种细胞,mypattern2是另一种细胞。当你看L图
的
时候,你可以看到有某种聚类,因为曲线偏离了泊松。 我考虑使用最近邻居apporoach,这是
spatstat
中
的
nncross函数。但是我现在如何
浏览 33
提问于2021-08-25
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回答已采纳
2
回答
对图像进行采样以获得点
模式
下面是作者拍摄这张图片
的
例子:并使用
spatstat
进行
分析
。为了做到这一
点
,他们提取了坐标,因为它可以看到。我想做同样
的
事情,我想知道如何从这样
的
图像
中
获得样本
点
模式
。直接将图像转换为ppp对象会产生大量
的
伪像。 他们
的
R包BioC2015Oles
中
的
手册似乎并不存在。谢谢。
浏览 4
提问于2018-09-05
得票数 0
1
回答
使用R将图像转换为geotiff
、
、
我从一个包含点数据
的
形状文件开始。然后我将这种格式转换为ppp格式,以使用一些
spatstat
函数。::ripras(ppp_al)然后我想做一些
点
模式
分析
,所以使用了下面的
spatstat
函数: image <-
spatstat
::density.ppp(ppp_al_constr, sigma =
浏览 2
提问于2016-06-09
得票数 1
2
回答
如何处理大型linnet对象
我试着用整个城市网络来做一个我知道是非常巨大
的
分析
。我也把它设置为稀疏网络。library(maptools)StreetsUTM=readShapeSpatial("cityIN_UTM") library(
spatstat
构建linnet对象花费了将近5个小时 我想知道是否有一个聪明
浏览 3
提问于2017-08-03
得票数 0
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1
回答
是否可以在Rstudio中使用
SpatStat
向3D
点
模式
添加标记?
、
、
、
我正在使用
spatstat
软件来
分析
细胞间
的
空间关系。我以前在2D上用过这个,它很好。我现在用它从共焦图像进行3D
分析
。 我
的
问题是,我无法用不同
的
标记绘制出结果
的
点
模式
。我能够为每个
点
指定标记(单元格类型),并绘制三维
点
模式
。然而,这些标记在情节
中
并没有以不同
的
字符出现。Series6[,5], Series6[,6],Series6[,7],
浏览 3
提问于2021-01-13
得票数 0
回答已采纳
1
回答
相关标记
的
创建。例如,
点
大小随
点
间距离
的
变化而变化。
、
最近,我尝试了一
点
点
模式
分析
,并怀疑是否有任何标准做法来创建标记相关结构变化
的
点
间距离
的
点
位置。显然,我理解如何模拟独立
的
标记,因为这是经常提到
的
。(finpines) 更广泛地说,假设我们有相当多
的
点
,例如,在任意观察窗口(例如矩形)
中
,具有x和y坐标的n=100。每个
点
都带有一个特征,例如,作为一个连续变量
的
点</
浏览 1
提问于2022-09-07
得票数 1
2
回答
如何在spat stat
中
创建一个三维圆形窗口?
、
、
、
窗户
的
形状类似于培养皿:半径5厘米,墙高3厘米。我设法创建了一个3d长方体,但我不知道如何为一个圆做它。有可能这样做吗?
spatstat
知道如何
分析
3d圆
中
的
点
模式
吗? 提前感谢您
的
帮助
浏览 21
提问于2020-12-11
得票数 1
1
回答
在
spatstat
中
组合两个
点
模式
对象创建组合标记
假设
spatstat
中有两个
点
模式
。我知道我们可以将这两个
点
模式
叠加在一起得到一个单点
模式
。现在,如果这些图案有共同
的
坐标,但具有不同
的
标记,那么当叠加时,这些点将被复制。在
spatstat
中
,有没有一种方法可以在为重合
的
坐标创建公共标记
的
同时获得一组唯一
的
点
?
浏览 5
提问于2020-10-23
得票数 0
回答已采纳
2
回答
将ImageJ ROI转换为R数据不起作用
、
、
、
我尝试使用David·斯特拉特
的
RImageJROI包将多个ROIs转换为R,并将它们转换为
Spatstat
。这是我
的
R代码
的
一个很小
的
例子ROI = read.ijzip("path/ROI.zip")读取zip文件运行良好,但当我运行转换命令时,会出现以下错误: Conv.fun
中
的
错误(k,window = wind
浏览 1
提问于2017-09-12
得票数 1
1
回答
比较每个具有不同窗口
的
点
模式
、
、
、
我正在使用
spatstat
包在R
中
创建统计
模式
。我有一堆ppp对象,我想对它们进行比较,找出它们
的
模式
中
的
细微差别,我可能会通过查看热图等方式错过它们。我还想以某种方式量化这些
模式
之间
的
差异。一个问题是,每个
模式
的
窗口形状都不同(略有不同)。我正在将
spatstat
应用到植物叶子上;下面是生成
的
镶嵌,给你一个窗口形状
的
概念,等等:
浏览 0
提问于2019-09-05
得票数 0
2
回答
spatstat
库
中
缺少
的
函数(如Kest和rpoint)
、
我正在尝试使用Kest函数(以及
spatstat
包
中
的
许多其他函数)。我制作了ppp
点
模式
数据集(ppp.1)坐标给出了小数点6位当我尝试使用Kest函数: Kest(ppp.1)时,我得到以下错误:Kest<
浏览 11
提问于2022-07-04
得票数 0
3
回答
求所有点与多边形边界之间
的
最小距离
、
、
我想找到点和多边形边界之间
的
最小距离(所有的
点
都在多边形内)。如果这是可能的话,我如何提取值?,这样我就可以找到个人数量和距离边界之间
的
相关性。 多边形采用.SHP格式,点在X/Y坐标上。任何丢失
的
信息请告诉我!非常感谢您
的
帮助!
浏览 5
提问于2015-02-07
得票数 3
回答已采纳
1
回答
将喷溅强度输出(从shapefile派生)返回到SpatialPolygonsDataFrame,以便在R
中
绘制
、
、
有人建议在
Spatstat
中将空间多边形数据帧转换为自己
的
对象进行
模式
分析
后保留(或附加)属性吗? # Convert SpatialPolygonsDataFrame to OWIN object for use in
spatstat
浏览 1
提问于2022-09-14
得票数 0
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