R编程:生物指数的计算？

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我有一个物种丰度数据集( .csv数据格式)，我想编写一个自动化的r脚本来计算每个采样点的生物指数(BI)。基于在线-缺勤数据的BI。这是我的数据(P表示物种的存在)：添加了代码格式 df = data.frame(Species = c("Sp1", "Sp2","Sp3", "Sp4", "Sp5", "SP6"

浏览 30提问于2020-05-20得票数 0

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用实体变量表示生物特征数据--可能是32字节？

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想知道哪种变量类型最接近于表示生物特征二进制数据？假设计算存储和能力呈指数增长，网络延迟可以进一步减少，那么是否有可能将S私钥作为生物特征存储，从而实现一个分散身份的网络？

浏览 0提问于2018-09-05得票数 3

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我有一张来自不同卫星的63个样本点的植被指数导出表。这给了我一个包含63个观察值(样本点)和56个变量(1个样本ID，50个植被指数，4个生物量和1个LAI)的表格。表的最后5列是生物量和LAI，第一列是样本ID。我想生成一个曲线图，显示单个植被指数与其中一个生物量参数之间的关系。我可以使用plot函数来做到这一点，一次只有一个观察值和变量。plot(data$Dry10, data$X8047EV

浏览 2提问于2015-09-02得票数 0

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运行香农和辛普森:素食包

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我对使用素食包计算生物多样性指数很感兴趣。辛普森指数起作用了，但香农论证没有结果。simpsons indices simpson.D simpson.I simpson.R

浏览 0提问于2019-08-20得票数 1

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香农多样性计划:基本问题

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我是一名生物专业的学生，正在尝试编程，但在为一个研究项目编写基本的指数计算器时遇到了一些问题。我需要一个程序，它将提示用户输入数据点一次一个，执行正确的计算(-1*(x*ln(x)))对每个数据点，并输入新的计算值到一个数组。一旦用户输入'done'，我希望程序对数组值求和并返回索引值。我是新来的，所以对于任何严重的错误我深表歉意。在正确的方向

浏览 0提问于2018-06-19得票数 1

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使用R提取XML数据的书籍(或其他参考资料)

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我将讲授如何使用R从XML/HTML中提取数据的课程。我确实有一些实践经验(其中大部分是我在SO的帮助下自学的)，但我想要一些参考资料来帮助我组织我的想法和课程。有没有人知道任何参考资料(可以是书、讲座笔记、网站等)使用R？附言:我知道这不是一个确切的编程问题，但它是相关的，我以前在这里看到过相关的问题。

浏览 0提问于2011-09-01得票数 2

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生物信息学资源

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当谈到编程时，我们肯定会有一些博客可供关注，但当你想尝试不同的领域时，你如何找到大人物呢？我希望尝试生物信息学领域，并在我的日程表中添加一些从这个领域阅读的博客。你能给我推荐一些博客吗？

浏览 8提问于2010-01-13得票数 5

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PHP -无需存储就可以操纵大数。

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我正试图从rosalind.info中解决生物信息学问题，但我被这个问题拒之门外：这个问题让你在编程时如何管理大量的数据，这是生物信息学中的一个常见案例。我尝试过不同的东西

浏览 1提问于2016-01-24得票数 2

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如何计算表达式

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给出等式-> (index+rotation)%rot=f；，如果我知道f的值，那么计算指数的公式是什么?我数学不是很好，但我想知道在我的编程中计算指数。

浏览 1提问于2017-02-02得票数 0

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R统计中散射指数的计算

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我试图在R中计算散点图的散射指数，虽然我有这个公式，但我对R和编码还很陌生，不知道如何用编程语言编写它。公式是：我的数据是： O = c

浏览 0提问于2019-01-08得票数 1

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用实数作为指数的科学表示法

我想用科学符号来定义一个数字，例如：但是，在matlab中，我不能用非整数指数来完成这个任务： | Error: Unexpected MATLAB expression

浏览 3提问于2016-05-18得票数 0

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如何在循环中使用所有可能的向量组合的子集？

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我有一个在不同地点发现的物种数据集。我使用在超过三个地点发现的那些作为重点来计算一些生物多样性指数。在我当前的代码中，我随机选择了三个包含所选物种的站点。subset(sites, Site %in% sample(unique(Site), 3)) 但我想计算所有可能的组合的指数，在那里发现该物种。Species[i] <- paste(bat_names[i]) theta.out

浏览 22提问于2021-10-06得票数 0

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指数是如何计算的？

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我正在尝试确定我的一个算法的渐近运行时，它使用指数，但我不确定指数是如何以编程方式计算的。我特别在寻找用于双精度浮点数的pow()算法。

浏览 1提问于2008-10-02得票数 6

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是否有一个R函数可以计算综合生物标记物反应(IBR)指数？

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有人能帮我吗，BENOIT BELIAEFF和THIERRY (2002)创建了集成生物标记物响应(IBR)，但是我没有找到任何R的工具来帮助这个计算，有人知道吗？

浏览 0提问于2020-12-03得票数 0

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R中(生物)复制的最优相关计算

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我有一个具有以下结构的数据框架： data.frame( feature1 =rnorm(100, 0, 1), feature3 = rnorm(100, 0.1, 1) 我正在用以下代码计算每个数据列(此处为“Feature1-3”)的(生物)复制之间的

浏览 3提问于2022-07-19得票数 0

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幂律、指数幂律和指数截断幂律的AIC计算软件

对于这三个模型中的每一个，我计算1-(sum(SSE)/sum(SST))来估计每个模型的简单线性回归的R^2值，该值在Excel表格底部以黄色高亮显示。现在，我有三个R^2值(幂law= 0.507，指数= 0.777，指数截断幂律=0.899)。首先，指数截断幂律似乎具有最佳拟合(最高R^2值)。如果p值小于0.05，则指数截断的值实际上是一种苦拟合，而不是

浏览 3提问于2012-11-16得票数 2

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IEEE 754浮点运算

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因此，对于浮点运算，据我所知，是学校年级数学的衍生物。乘法和除法是在计算后加或减指数的。在执行代码设计(纸面上)时，我遇到了以下几个问题：我在网上发现了一些东西，但没有任何东西能真正说明如何处理这件事。现在，从学校年级的数学，你必须标准化的值，然后你可以运行

浏览 1提问于2016-06-21得票数 0

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你认为生物信息学最好的语言是什么？

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我在生物信息学方面做了几项研究工作，并使用Matlab进行研究。Matlab有很多强大的工具，而且很容易使用。我确实考虑过基因组测序和预测代谢途径。我想知道其他人认为什么是最好的？或者，可能没有一种特定的语言，而是几种最适合生物信息学工作的语言，这些工作数学繁重，需要处理大量数据。

浏览 3提问于2010-06-08得票数 9

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如何在R中绘制在x轴上有分类变量的散点图？

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所以我有以下数据: NW是不同的森林，分为两组("Gruppe")，一些已经被围栏(Z)，一些没有(KZ)。然后，对于每一森林的两组，我计算了生物多样性(香农指数，H)和均匀度(E)。Here a short section of the data (i am not allowed to upload pictures yet :D) 我想创建两个散点图，一个用于香农指数，另一个用于Eveness，其中在x轴上显示森林(NW)，并将每个森林的不同组

浏览 35提问于2020-01-28得票数 0

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