R无法从github下载websockets包 - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

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「R」持续尝试下载 GitHub 包

有时候 GitHub 网络莫名奇妙网不好，也可以是本地防火墙什么的有限制，上面的包下载不下来，因此无法安装。这种情况有时候重试几次可能就成功，但每次手动重复真的很费劲，下面的函数可以用于持续尝试下载。...稍微修改下也可以使用于 CRAN、Bioconductor 包。...pkg) { Sys.sleep(1) tryCatch( { message("=> Try installing ", pkg) remotes::install_github

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BiocManager无法安装R包

一般来说就是Windows电脑的中文用户名需要修改电脑系统的环境变量，R包下载等等。...但是今天有一个学员起初是下载R包无法联网，所以失败，根据我们的经验当然是options(download.file.method = 'libcurl')就轻轻松松解决啦，不过这次居然是仅仅是解决了R自带...R包下载问题，使用BiocManager仍然是无法安装R包，如下所示： ?...='libcurl') 果然，现在在Windows电脑里面R语言的安装R包和下载文件就OK啦。...接下来就继续安装R包吧使用管理员打开R哦，然后就 options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn

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解决无法下载Github桌面版问题，以及Github桌面版离线包

随着越来越多的应用程序转移到云上，Github已经成为了管理软件开发以及发现已有代码的首选方案。 Github Desktop桌面版是Github退出的可视化Git提交程序。...Github Desktop主要就是为了简化开发工作的流程。...二、问题在下载Github桌面版的时候常常遇到：无法访问下载页面好不容易进入了下载页面点击下载又是404 好不容易终于开始下载了又是各种连接失败好不容易连接成功又是龟速下载三、解决思路一...、直接下载离线包：但是这个不是最新版本，安装完成后还需要启动软件进行更新： https://download.csdn.net/download/q764424567/12809361 二、修改DNS...修改DNS，导向正确的地址，就可以顺滑访问了，Github网站的访问也可以修改DNS来解决，包括在Github下载项目，下载安装包。

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解决GitHub文件无法下载的问题

一、问题从Github下载文件的时候，发现链接挂了，下载不了，提示无法显示此网页二、原因分析这个通常是域名解析的问题，DNS解析之后，链接不到正确的网址上，就会显示上面的错误通过修改hosts...可以解决掉此问题当然如果下载慢，github登录不上，也可以通过修改hosts解决，这个以后再说三、解决思路 1、去https://www.ipaddress.com/输入raw.githubusercontent.com

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R包安装方式以及Github包安装报错解决

写在开头最近在疯狂补数据挖掘课以及跟着生信技能树整理的#R语言在补充R语言基础知识恰好看到了无法在线下载安装GitHub包？...来自github的包有些软件包会放在Github上，版本可能更新的比较及时，因为上传到Bioconductor需要审核我们下载的时候用Bing搜索相应的R包的名字，然后跳转到Github上面找到下载的方法...Github上R包如果是github上的包，可以采用输入作者名以及R包名字之后使用命令进行安装安装Github上的包 #使用devtools安装 install.packages('devtools...所以可以按照报错信息提供的网址，将R包下载到本地之后导入到Rstudio里面 remotes::install_github("genecell/COSGR") #报错信息 Downloading GitHub.../repos/genecell/COSGR/tarball/HEAD' R包安装报错下载到本地之后再导入Rstudio 根据报错信息中提供的网址，将R包下载到本地，保存在你能方便找到的地方。

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TCGA数据下载：R包TCGAbiolinks介绍

昨天介绍了TCGA2STAT这个R包，今天来继续根据博文 TCGA数据下载方法简介中的顺序来介绍R包TCGAbiolinks包，其下载数据类型类似于TCGA2STAT，但是又比它难懂。...R包的下载 ## try http:// if https:// URLs are not supported source("https://bioc.ism.ac.jp/biocLite.R")...biocLite("TCGAbiolinks") 涉及的包很多，可能很久才能下载完，下载建议使用R，不要用Rstudio，效果更好。...可下载的数据这里请参考TCGA2STAT对数据的介绍。...，对下载数据做了介绍，还有涉及到不同的平台，下载什么样的数据。

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TCGA数据下载：R包RTCGAToolbox介绍

这里再介绍一个包：RTCGAToolbox包，这个包是我最为推荐的，原因是我使用时它下载数据最快、最为稳定可靠。.../biocLite.R") biocLite("RTCGAToolbox") 帮助文档： http://bioconductor.org/packages/release/bioc/manuals/...案例介绍 #包下载 source("https://bioconductor.org/biocLite.R") biocLite("RTCGAToolbox") #加载包 library(RTCGAToolbox...，这里以乳腺癌为例，数据下载完后会直接放在你的工作目录，不同地方下载的速度不一样，我这里等待了好久才下完。...个人见解强烈推荐这种下载方法来下载TCGA数据，它会是你的下载更加的靠谱。靠谱，就是稳定、快！

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TCGA数据下载：R包RTCGA介绍

根据博文 TCGA数据下载方法简介中的顺序J继续来介绍R包RTCGA包。...R包下载 ## try http:// if https:// URLs are not supported source("https://bioconductor.org/biocLite.R"...) biocLite("RTCGA") 涉及的包很多，可能很久才能下载完，下载建议使用R，不要用Rstudio，效果更好，稳定。...对RTCGA可下载的数据介绍这里我给出RTCGA这个包的github.io主页链接，从这里可以了解到如何下载数据，还有如何从各种数据中提取所要的数据集。下载数据的工作流程： ?...需要先下载RTCGA包，再来获取其它数据。可以遵循上图的流程来做或查看官网的帮助文档本期完结！

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「R」解锁 GitHub 包快速安装新方式

在国内下载 GitHub R 包或者克隆仓库经常失败，虽然在 Gitee 上设置镜像是一个不错的办法，但总是这么操作也挺麻烦了。今天分享一个解决的办法，就是使用我新写的 R 包啦！...这个包使用了国人提供的 GitHub 镜像 FastGit[1] （在此致谢），所以下载就快很多了。...安装使用下面命令从 Gitee 上安装该包： remotes::install_git("https://gitee.com/ShixiangWang/wfun") 载入： library(wfun...) 例子安装 GitHub/Gitee 仓库中的 R 包 install("ShixiangWang/ezcox") install("ShixiangWang/tinyscholar", gitee...下载 GitHub/Gitee 仓库的发布和存档文件 x <- tempdir() download("ShixiangWang/tinyscholar", destdir = x) #> Downloading

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同样的GitHub包你就下载失败

对R语言熟练的小伙伴，通常是不仅仅使用CRAN或者bioconductor的包，也会尝试很多开发者未正式发表的包，比如存放在GitHub等仓库的。...在线包，需要devtools包或者remotes里面的install_github函数： ?...加载devtools包或者remotes包加载了devtools包或者remotes包后就可以使用install_github函数，如下： ?...使用install_github函数可以看到，很简单就成功了，因为这个包本身就不大，下载速度也ok，包本身就两三个函数，并不复杂。 ?...另外一个办法就是采用特殊办法去先下载GitHub离线包并且解压，然后使用 install.packages("GitHub项目下载路径-master/",repos=NULL,type="source"

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R语言基础-02（数据框、下载包）

","r2","r3","r4")#只修改某一行/列的名colnames(df1)[2] ...Species=="c",]test[test$Species %in% c("a","c"),]矩阵不支持$删除#删除 rm(l)#删除一个rm(df1,df2)#删除多个rm(list = ls()) #清空下载包...install.packages('BiocManager')BiocManager::install("ggplot2")#3.github的包要写作者devtools::install_github...require(string))install.packages("stringr")包是否下载成功的唯一标准是library()没有error，当提示package not available时，原因可能为...：1.名字写错；2.安装命令错误；3.包与R语言版本不符合（极少数）；4.包过时。

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从github上下载代码到本地

创建仓库并用git上传文件 git 上传错误This oplation equires one of the flowi vrsionsot the NET Framework:.NETFramework 从github...上下载代码到本地 Github最简单上传教程：真正的两分钟就可以学会！...guitar Github搜索代码技巧 Git 简单实用教程目录从github上下载代码到本地先到git官网下载自己电脑对应版本的git https://git-scm.com/ 安装完成后在桌面右键...,然后就可以在这里输入命令了, ---- 从github上下载代码到本地先到git官网下载自己电脑对应版本的git https://git-scm.com/ 安装完成后在桌面右键,然后就可以在这里输入命令了..., 显示复制下面链接复制红框地址（即为该项目的地址），然后打开GIt Bash命令行窗口，输入命令$ git clone http://github.com/.....对应下载地址注意

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「R」Windows R 安装包显示无法锁定目录怎么搞？

今天笔记本电脑装包反反复复出现下面错误： Error in install.packages : ERROR: failed to lock directory ‘D:\Tool\R_Library’...for modifying Try removing ‘D:\Tool\R_Library/00LOCK’ 尝试下解决方案： install.packages("Rcpp", dependencies...= TRUE, INSTALL_opts = '--no-lock') 把 Rcpp 改成要装的包名。...不行的话把报错文件删了： unlink("D:/Tool/R_Library/00LOCK", recursive = TRUE) 参考：https://stackoverflow.com/questions.../questions/14382209/r-install-packages-returns-failed-to-create-lock-directory

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安装GitHub的R包困难解决方案

比如安装GitHub的R包，因为并不是所有的R包都会被正式的发布在CRAN或者bioconductor，所以对于简简单单分享在GitHub的R包一般我们搜索到如下代码： library(devtools...image-20191120214502005 其实还可以先下载GitHub的这个R包的项目文件： ?...github local r package 一般来说，程序员之友论坛就会是答案：https://stackoverflow.com/questions/17366772/install-r-packages-from-github-downloading-master-zip...image-20191121222747036 另外一个小技巧实际上，非常多的时候，我们只是记住了R包的名字，而不知道作者，所以下载的时候给出作者+R包名字有点困难，一个 githubinstall...当然了，我觉得没啥意思，我通常是连R包都不记得名字，就是复制粘贴嘛！

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Windows 10 解决无法完整下载安装语言包（日语输入法无法下载使用）

最近我想在我的 Windows 10 上安装一个新的语言包，在 “设置” -> “时间和语言” -> “语言” 中，添加了新的语言之后，语言进入了下载状态。...于是几乎可以认定语言包的下载缓存确认是在这个路径中的，但是导致无法下载安装的本质原因却不是这个。暂时关闭 UAC 后来我尝试了网上的其他各种方案，都没有解决。...我打开了 UAC 设置，临时把滑块从最顶部拖到最底部，以关闭 UAC。点击“下载”后，终于有反应可以继续完成下载了。看起来是解决了，但这三个下载按钮只有一个可以继续下载安装。...---- 参考资料 WIN10无法完整下载日语语言包，不能下载基本输入语言，不能下载日语补充字库。。...Community win10 可选功能更新（输入法）失败 - Microsoft Community 解决Windows10专业版无法安装语言包！！！

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使用 wgetcurl 下载 GitHub Release 生信软件包

我们在 Linux 服务器上安装软件，有时候需要在服务器下载 GitHub 上 Release 的一些资源(软件包)，这时候我们可以使用 wget 或者 curl 进行处理，这里拿 htslib 开源的配置中心...HTSlib 为例，下载他的 Release 版本。...--content-disposition https://github.com/samtools/htslib/releases/download/1.15.1/htslib-1.15.1.tar.bz2...curl curl 下载命令示例：curl -LjO curl -LjO https://github.com/samtools/htslib/releases/download/1.15.1.../htslib-1.15.1.tar.bz2 上面的例子以 htslib 为例，tar.bz2 压缩包下载下来后，就可以执行 tar -jxvf 解压缩和后续的一系列安装操作了。

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零散笔记：R安装xlsx包遇到报错以及github下载指定文件夹的内容

有时候一个github项目下会有好多个文件夹，如果只想下载其中的某一个该如何实现呢？...搜索了一下，找到了一个链接 https://downgit.github.io/#/home，将github目录的链接复制过来就可以直接下载 ?...image.png 如果我只想下载代码 code那一个文件夹，点进去这个文件夹，然后将链接复制到开头提到的网址就可以了 R语言安装xlsx包遇到的报错之前读取数据我都是将excel中的数据另存为csv...格式然后再读入，今天试着使用R语言直接读取excel格式数据，查到可以使用xlsx这个包，直接使用install.packages('xlsx')安装，加载的时候却遇到报错 Error: package...Try re-installing Java and make sure R and Java have matching architectures. ?

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从spring官网下载spring 架包

1、找到spring官网地址：http://spring.io/ 2、点击projects 3、点击springframework 4、点击图片进入github 5、找到downloading spring...7、点击artifacts 点击放大镜搜索 8、找到libs-release-local点进去找到org/spring-framework/spring 找到最新版本 9、点击download 等待下载完成

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TCGA数据下载：R包TCGA2STAT介绍

上期介绍了若干种获取TCGA数据的方法，今天这期会落点于TCGA2STAT这个R包的介绍上，一步步的来说明下载方法，哪些数据是可以下载到的。...R包的下载 install.packages("TCGA2STAT") 选择如何的镜像，咱们在中国，就选择china，这样的话下载速度会很快，也容易安装R包成功。...可下载的数据 1、 RNASeq ，默认是count类型，是指下载raw read counts数据。...谷歌查到说需要安装Cygwin软件，然后通过R语言命令来加载，而且每次使用都必须做加载，命令如下： Sys.setenv(TAR="D:/cygwin64/bin/tar",R_GZIPCMD="D:/...也许你所在地方刚好能很好的下载也说不定。

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GEOquery包的getGEO函数总是无法下载肿么办

通常我都是教大家使用下面的代码下载任意GEO数据库的数据集： options(stringsAsFactors = F) # 注意查看下载文件的大小，检查数据 f='GSE76275_eSet.Rdata...' library(GEOquery) # 这个包需要注意两个配置，一般来说自动化的配置是足够的。...修改后就没有问题啦，下载进度条很喜人： ? 但是，这个时候会引入另外一个问题，如下: ? 新的问题需要新的解决方案，我们下回再讲。

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