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1
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R
中
lme4
中
glmer
中
的
数据
大小
问题
:
导致
收敛
问题
的
数据
集
大小
r
、
modeling
、
lme4
我正在尝试使用
lme4
包
中
的
glmer
来模拟几个变量对自循环发生
的
可能性
的
影响。这是一个拥有超过900,000个
数据
点
的
非常大
的
数据
集
。 当我尝试运行模型时,我得到了这个错误。convergence code: 0 Model failed to converge with max|grad| = 0.0013493 (tol = 0.001, component 1) 这是一个动物运动
的
浏览 79
提问于2019-04-25
得票数 0
2
回答
lme4
::
glmer
与Stata
的
melogit命令
r
、
stata
、
lme4
、
mixed-models
有了这么大
的
样本数量,我们就包括了很多我们正在调整
的
预测因子--也许是50个左右
的
固定效应。我用
R
中
的
lme4
::
glmer
将模型拟合成二进制结果,并对每个主题进行随机截取。我不能详细介绍
数据
,但是我使用
的
glmer
命令
的
基本格式是: fit <-
glmer
(outcome ~ treatment + study_quarter + dd_quarter
浏览 9
提问于2017-06-21
得票数 10
回答已采纳
1
回答
如何对
lme4
::
glmer
模型
的
新
数据
使用predict()?
r
、
predict
、
lme4
、
mixed-models
我一直在尝试为
glmer
模型建立预测性能(AUC ROC)。当我尝试在测试
数据
集
上使用predict()函数时,该函数
的
输出是我
的
训练
数据
集
的
长度。[foldsamples[[n]],]
GLMER
<-
lme4
::
glmer
和
glmer<
浏览 3
提问于2017-04-20
得票数 0
1
回答
变长误差非平衡处理比较结果
的
lme4
glmer
函数
r
、
lme4
我使用
lme4
包运行一个使用二进制响应
的
比例
数据
的
广义线性混合模型。对于我
的
治疗,我有不同
的
样本
大小
,并且得到以下错误,我理解这是因为我有不相等
的
样本
大小
: #Excluding N
浏览 2
提问于2015-05-14
得票数 0
1
回答
误差:(最大陡度) PIRLS步长-对于比率
数据
,pwrssUpdate
中
的
分步半截未能减少
lme4
中
的
偏差。
r
、
lme4
我
的
数据
是比率
数据
。所以我尝试用
lme4
()和二项式模型来分析它。这是我
的
代码:下面是一组样本
数据
: type我
的
数据
中
是否有错误,或任何其他错误?我在Windows上使用
R
3.0.3。
浏览 7
提问于2015-05-02
得票数 0
回答已采纳
1
回答
R
:
glmer
.nb
中
的
负二项式模型
r
、
regression
、
lme4
、
mass
运行此
glmer
.nb,我收到错误消息 警告信息: 1:在vcov.merMod(object,use.hessian = use.hessian)
中
:由有限差分Hessian计算
的
方差协方差矩阵不是正定
的
,或者包含NA值:回到从RX 2估计出来
的
var-cov :在vcov.merMod(对象,相关性=相关性,sigm = sig)
中
:从有限差分赫森计算出来
的
方差协方差矩阵不是正定<e
浏览 7
提问于2022-01-06
得票数 0
1
回答
如何估计大计数值
lme4
中
的
多层泊松模型?
r
、
lme4
、
poisson
下面是一个测试
数据
集
,它近似于我
的
数据
情况。在实际
数据
中
,迁移结果变量略低于理想泊松分布(min=0, max=9450, mean=85, median=10)。library(
lme4
) set.seed=777 td=data.frame(IDo=rep(1:55,each=55),IDd=rep(1:,我正在使用
lme4
运行交叉分类
的
多级泊松模型。在使用默认nAGQ=1
浏览 5
提问于2016-08-19
得票数 1
回答已采纳
1
回答
混合效应logistic回归: MASS和
lme4
的
不同结果
r
、
lme4
、
mixed-models
我对MASS和
lme4
进行了混合效应
的
logistic回归,但是我得到了不同
的
结果,我想知道(和哪里)是否有什么
问题
。也就是说,我认为输出没有任何
问题
。如果我绘制
数据
,这些结果是有意义
的
(而且它也是根据预测
的
)。看起来当我使用
lme4
时,模型不能进行交互我能相信第一个(质量)输
浏览 0
提问于2016-11-26
得票数 2
1
回答
理解
glmer
算法;帮助使用
R
进行调试
r
我试图在Haskell
中
复制
lme4
的
一些子集。我或多或少地管理了lmer部分,其结果与Bates (2009年)“
lme4
中
的
线性混合模型实现”
中
的
示例相匹配。所以现在我开始讨论广义位。一件稍微令人放心
的
事情是,我可以使用一个高斯家族和一个身份链接函数,在lmer示例上运行我
的
glmer
--等效
的
。所以事情并不是大错特错。我
的
意思是我
的
Hask
浏览 1
提问于2019-10-31
得票数 1
回答已采纳
2
回答
R
:
glmer
.nb错误
r
、
lme4
family %in% c("quasibinomial", "quasipoisson", "quasi")) stop("\"quasi\" families cannot be used in
glmer
library(
lme4
)我有一个
数据
集
如下所示: cdat$ va
浏览 14
提问于2016-08-10
得票数 1
回答已采纳
1
回答
使用
glmer
.nb
的
nb.control参数
r
我正在使用
R
的
lme4
包
中
的
glmer
.nb函数开发一个负二项模型。实际
的
模型本身有点复杂,但应该(至少我相信)在统计上是合理
的
。我现在
的
问题
出现是因为模型很难
收敛
,并返回以下警告: In checkConv(attr(opt, "derivs"), opt$par, ctrl = control$checkConv, :,当我收到这个警告时,我会在
glmer
浏览 0
提问于2017-10-03
得票数 5
1
回答
lme4
::
glmer
.nb函数根据我运行模型
的
顺序生成“家庭
中
的
错误$ S4 :未为这个S4类定义
的
$ operator”
r
、
lme4
、
mixed-models
library(
lme4
) data=dummy2, control=glmerControl(optimizer="bobyqa"))dummy <- as.dat
浏览 4
提问于2016-09-27
得票数 7
回答已采纳
1
回答
为什么`parameters::model_parameters`为负二项式“`rstanarm`”模型抛出一个错误
r
、
lme4
、
mixed-models
、
sjplot
、
rstanarm
我试图为stan_
glmer
.nb (rstanarm)输出创建一个表,但是来自包parameters
的
model_parameters抛出了一个奇怪
的
错误,我不知道如何解决。也许这是个窃听器。缩短版本信息
的
sessionInfo()输出:Platform: x86_64-w64-mingw32/x64 (64-bit)library(
lme4
)
浏览 1
提问于2020-10-13
得票数 5
回答已采纳
1
回答
比较模型与dplyr和broom::一瞥:如何继续,如果产生错误?
r
、
error-handling
、
dplyr
、
broom
我希望使用
R
.
中
的
lme4
包将
数据
集中
的
每个变量作为单变量
glmer
模型运行,我想用dplyr/tidyr包准备
数据
,并用扫帚包组织来自每个模型
的
结果(例如,浏览(
glmer
.)。我非常感谢那些被困在这个框架内
的
帮助。我在
R
方面不太出色,但能够生成一个
数据
集
,该
数据
集会引发错误,并且具有与我所使用
的
<
浏览 0
提问于2016-08-19
得票数 0
回答已采纳
1
回答
复制
R
中
面板
数据
Stata
的
xtlogit回归
r
、
stata
、
lme4
、
plm
我试图复制
R
中
的
面板
数据
运行
的
Stata xtlogit再回归,我
的
意思是在不同年份(person_id)对不同
的
个人(year_id)有多个观察。我
的
因变量(DV)是二进制变量。cformat(%3.2f) pformat(%3.2f) re vsquish noomitted nolog noemptycells vce(robust) 我尝试使用以下公式在
R
中
复制这一点:+ IV2 + some_control
浏览 4
提问于2016-08-06
得票数 0
回答已采纳
1
回答
为什么
R
在
收敛
失败时会自动进入浏览器模式?
r
、
rstudio
、
plyr
、
lme4
、
purrr
我正在
R
中进行基于仿真的功率分析,我通过RStudio (0.98.932)运行
R
,使用plyr::rdply和
lme4
::
glmer
函数分别生成
数据
和拟合模型(关于
R
环境和包版本,请参阅下面的可复制示例
的
结尾该程序是随机生成给定参数化
的
数据
集
,并将模型与其相匹配。然而,这个模型不时地无法
收敛
。我存储在每次模拟中出现
的
所有警告,所以我唯一
的
问题
是
浏览 3
提问于2016-06-29
得票数 1
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1
回答
如何在Ubuntu Rstudio服务器上使用1个以上
的
核心(8个可用)来创建
R
?
r
、
lme4
、
rstudio-server
、
cpu-cores
、
rparallel
我想在一个大型
数据
集
(250,000个观测值)上运行
lme4
包
中
的
glmer
过程。该模型在笔记本电脑上运行需要15分钟以上。我们使用
的
是基于Ubuntu
的
Rstudio服务器。
问题
是这台服务器上有8个核心可用,但当我运行
glmer
过程时,只使用了其中
的
1个,并且需要超过1个小时才能获得结果……我如何才能解决这个
问题
并提高时间效率?我在谷歌上发现我可能不得不使用parallel程序,
浏览 3
提问于2018-01-18
得票数 0
1
回答
增加
lme4
版本1.1-7
的
迭代次数
r
、
lme4
当我试图使用包
的
glmer
函数进行混合效果二项式回归时,我遇到了迭代
问题
,
lme4
版本为1/1-7。当我使用代码运行模型时:我收到警告: 使用代码: mode
浏览 4
提问于2015-05-20
得票数 2
1
回答
在
R
中
运行HLM中介
r
、
glm
、
lme4
logit"), data =
R
1_data) 我收到了一条错误消息: names(
R
1_d
浏览 0
提问于2018-09-23
得票数 0
1
回答
lme4
GLMM
中
的
“迭代极限达到”--这是什么意思?
lme4
、
mixed-models
、
random-effects
我构建了几个具有不同随机拦截器组合
的
glmer
.nb模型,对于其中一个模型(嵌套
的
随机拦截,具有最低
的
AICc),我始终得到:“迭代限制已达到”,而没有通常
的
“警告消息:在theta.ml
中
(Y,mu,我知道
的
是: 是什么
导致
了这个
问题
?我能做些什么
浏览 14
提问于2021-11-26
得票数 2
回答已采纳
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