我试图用data.table包解决以下问题：[有没有比'‘更快的方法来子集稀疏矩阵 Error in Z[, cols] : invalid or not-yet-implementedtapply(.SD, INDEX = "gene_name", FUN = simple_fun, Z = Z, 以下是我的解决方案：
l
浏览 71提问于2016-09-24得票数 1
基本上，我有一个巨大的稀疏矩阵(大约300 k x 150 k，最初是用R的{tm}包创建的术语文档矩阵)，它使用{slam}包保存为一个简单的三重子矩阵，并且我运行一个函数，它遍历一组术语，然后根据这些项对其进行细分不幸的是，细分过程非常缓慢。
在试图更快地找到子集的过程中，我偶然发现了data.table包，它在我使用它运行的</em
浏览 3提问于2016-03-21得票数 1
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从tweet创建稀疏矩阵
、、、
我有一些tweet和其他变量，我想把它们转换成稀疏矩阵。Sample Tweet :) 1我想把它转换成这样的矩阵： 1 1 1 0 1
浏览 5提问于2016-12-06得票数 0
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我使用的是text2vec，它提供了非常好和快速的结果。第二，一些我的R计划试图实现的基本细节。我们有一个数据库，为每个家庭/企业地址提供1000万个独特的</
浏览 0提问于2018-02-16得票数 0
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以下是我正在做的事情：当我在R命令提示符上执行步骤时，这很好。，但当它在包的函数中完成时，步骤2将引发以下错误： row col[2,] 3 1
[3,]
浏览 2提问于2020-03-02得票数 2
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R中的逻辑矩阵
、、
所以这是一个一般性的问题，在过去的6个月里，我一直在使用R，虽然我喜欢原生数据结构，但矩阵的一些功能对我来说有点不清楚。 我的问题是关于R处理逻辑矩阵的方式。假设我有一个用TRUE和FALSE语句填充的n x n大小的逻辑矩阵。当我使用LogicalMat过滤MatA (两个维度相同)时： MatA[LogicalMat] 是否在后台的某种循环中计算FALSE值？
浏览 22提问于2020-04-28得票数 2
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我正在尝试将dgCMatrix类的稀疏矩阵子集设置为训练和测试集，然后将这些矩阵转换为xgb.DMatrix对象以运行eXtremeGradientBoosting。我运行以下代码(它是可重现的)：b <- cast_sparse(a,X1,X2,X3p[[1]]) :
The length of labels must equal to the numb
浏览 1提问于2018-06-16得票数 2
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我正在尝试创建一个大的0矩阵，以便在插入和转换一些数据后将其转换为网络对象。我使用的数据是用户ID及其朋友ID的列表。我正在使用我在中找到的代码将用户和朋友之间的连接转换为1。当我尝试基于数据的维度创建矩阵时，问题就出现了，因为我的R会话一直在中止。
为了具体起见，我将展示我的整个过程，因为我认为问题不是内存或系统问题，而是我的数据问题。因此，我首先对数据进行了子集</em
浏览 4提问于2015-10-29得票数 1
我试图用稀疏矩阵和称为quanteda的包创建一个矩阵乘法，它使用data.table包，与这个线程相关。honor student") 如何使矩阵<
浏览 2提问于2017-01-09得票数 0
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该文件是使用FFT函数作为卷积的输出创建的，其中涉及将原始光栅分解成六条，每条处理一条，并使用重叠添加方法将结果矩阵附加到csv文件中。我现在试图使用R包GeoTIFF将结果写回光栅文件类型(例如ESRI、等)。CSV文件中的每个数字映射到光栅的等效单元格。在R中这样做的明显方法是：library(data.table)
data <- fr
浏览 4提问于2014-06-17得票数 1
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我正在处理一个项目，它要求我迭代文档项矩阵，将所有非零值转换为1，并将零值保持在零。我现在使用的函数要花费很长时间才能运行，我希望帮助优化代码。我现在的代码是 x <- ifelse(x > 0, 1, 0)labels = c("No", "Yes"))}
其中data_dtm是
浏览 0提问于2018-11-14得票数 0
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下面是MATLAB内置函数spones(S)的docstring用非零稀疏矩阵元素代替非零稀疏矩阵元素。R= spones( S )生成的矩阵与S具有相同的稀疏结构，但具有非零位置的矩阵。我希望使用numpy/scipy数据结构(例如，来自scipy.sparse的稀疏矩阵<
浏览 4提问于2012-05-14得票数 3
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我正在寻找最佳的方法来计算稀疏矩阵A的伪逆列的子集。以下是一些相关事实：
伪逆是稠密矩阵。我目前正在使用scipy.linalg.lstsq(A,Id) (其中Id是NxN恒等矩阵的NxM子矩阵
浏览 2提问于2016-05-27得票数 1
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目标：在文件中查找初次出现的列索引*如excel +F[1] 2
DT <- data.table(A = c(NA,NA), function(x) grep("^APPLE",setDF(DT)[,x],value = TRUE)))[1]Error in `[.data.table** )的情况下获得预期结果
浏览 1提问于2019-05-16得票数 1
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我有两个大小为100000 x 100000的sq矩阵(a，b)。我必须求这两个矩阵的差(c = a-b)。结果矩阵'c‘是一个稀疏矩阵。我想找出所有非零元素的索引。最简单的方法是使用两个for循环。但这是计算密集型的。你能告诉我任何算法或包/库，最好是在R/python/c中尽可能快地做到这一点吗？
浏览 2提问于2011-09-09得票数 6
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对于将R中稀疏矩阵中的所有行相加的简单任务，Matrix::rowSums()做了很好的工作：m <- rsparsematrix(10000, 5000, 0.1relative user.self sys.self我正在寻找最快的解决方案，<em
浏览 1提问于2020-12-11得票数 0
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当我试图使用sim2()从text2vec包创建一个Jaccard相似矩阵时，我被一个奇怪的性能问题弄糊涂了。我有一个稀疏矩阵21万x 500，我想得到Jaccard相似矩阵，如前所述。当我直接尝试在sim2函数中使用矩阵时，它需要超过30分钟，并在错误消息中删除。这是我使用的R脚本：JaccSim <- sim2(my_sparse_mx, method = "jaccard&q
浏览 3提问于2017-06-23得票数 1
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我希望通过提供矩阵的维数m x n以及我期望的非零元素的数量来预先分配R中的稀疏矩阵(使用simple_triplet_matrix)。Matlab有函数"spalloc“(见下文)，但我在R中找不到对应的函数。有什么建议吗？S= spalloc(m，n，nzmax)创建一个大小为m×n的全零稀疏矩阵S，该矩阵
浏览 1提问于2015-05-30得票数 0
我想在矩阵中积累索引元素，比如表和R中的tapply函数。正如文档所述：“任何具有i和j的重复值的s元素都被相加在一起。”但是，我必须使用full ()将获得的稀疏矩阵转换为完整的矩阵：这是否一种有效
浏览 4提问于2014-03-10得票数 1
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我有三个大的矩阵: I，G和G^2，它们是400万乘以400万的矩阵，它们是稀疏的。我想要检查它们是否是线性独立的，我想在R中这样做。对于较小的矩阵，一种方法是向量化每个矩阵:将列堆叠在一起，并测试由三个堆叠向量组成的矩阵是否具有三个秩。
然而，由于我的问题的规模，我不确定如何继续。(1)有没
浏览 2提问于2013-05-20得票数 1
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