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「R」Shiny:用户界面(三)布局

library(shiny) 概览 Shiny 应用布局由层次函数调用创建,其中 R 中的层次结构与输出中的层次结构匹配。...页面函数 最重要的布局函数是上面已经展示过的 fluidPage(),我们使用它将多个输入和输出控件组合形成一个 Shiny 应用。如果我们仅使用 fluidPage() 会是怎样的? ?...主题 创建一个好看的主题通常需要花费大量时间,作为初学者的我们应该关注内容和页面。Shiny 提供了自带的一系列主题可以自由选择,减少我们对于主题的工作。下面代码展示了 4 个基本的主题。...这样可行的原因是Shiny 代码本质上就是 R 代码,读者可以使用 R 中已知的任何工具增强效率、减少重复。请谨记三的原则:当你拷贝和粘贴代码超过 3 次,就应该考虑编写一个函数或者 for 循环。...作为一名 R 的使用者,我们并不需要关注和学习 HTML 细节。但你如果已经掌握了网页编程的知识,那么你将更加容易学习、理解相关知识,直接使用 HTML 标签实现你想要创建的任意自定义内容。

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    Nucleic Acids Research 在线发表癌症miRNA组学数据库CancerMIRNome

    Pre-built预后模型是对单变量CoxPH中显著的miRNA再做多变量CoxPH筛选和模型构建。用户也可以自己提供miRNA列表,选择一个机器学习方法来自己构建预后模型。...关于Shiny app开发 是否要选择使用Shiny开发数据库/网页工具 我自己只会用Shiny,看到其他人用更“高端”的工具开发数据库也会着实羡慕一下。尤其是UI,简直太好看了。...我和同事几乎每个人每年都要开发多个Shiny apps,当然这些对UI的要求不会特别高,以实用性为导向。...另外有很多针对advanced Shiny app开发的R包可以直接拿来学习和使用。...从零创建一个App 理解input和output 保持正确的要点 渲染和输出 session的解释 ID的用法 根据数据更新UI 表格-方案选择 表格-renderTable 表格-kableExtra

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    「R」Shiny 教程笔记

    p2:输入与输出 Inputs 是与用户交互的组件,用户获取用户输入。Outputs 是 Shiny 通过响应用户输入而在指定区域展示的输出,一般为图表。...当在 UI 插入一个输出组件后,会自动分配一块空间用于展示,但展示的生成和逻辑都在服务端完成。 ? ? ? ? ? ? p3:Server server:集成输入生成输出。...p4:分享 Shiny 将所有脚本和材料保存到一个目录,目录下代码通常以以下 2 种方式之一存储: app.R ui.R & server.R ? ? ?...render* 函数创建一个 observer 对象,它关联了生成上述结果的代码块。 当输入发生改变时,上述代码块会被重新运行,生成新的结果。...fixedPage(): 创建固定宽高的页面。 navbarPage(): 带多个标签页的页面布局。 navbarMenu(): 创建多个标签页的下拉栏。

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    十个超级好用的R语言编程技巧,一般人绝不知道!

    R Shiny中的req函数和validate函数 R Shiny常常让人崩溃,特别是在弹出一般性错误提醒而程序员又一头雾水的时候。...)}) validate()函数则可以在输出结果前进行检查。如果某个条件没有满足,特定的错误提醒会弹出。...styler包有多个函数可以自动编辑代码,生成tidyverse风格。只需要简单地运行styler::style file(),它就会完成大部分(并不是所有)的工作。 7....如果参数化了R Markdown文件,只要通过一个命令,就可以自动生成一份相似的关于猫的报告。 具体来说,需要在R Markdown文件的YAML标头中设置参数,并给每个参数赋值。...R Shiny中的HTML标签(以在Shiny应用程序中播放音频为例) R Shiny中有110种HTML标签,可以为各种各样的HTML命令,如格式化,提供快捷方式。

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    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-07

    作为R脚本分享 任何使用R的人都可运行你的shiny app,他们需要你的app.R的一个副本,还有其他支持材料(比如www文件夹或者帮助脚本) 发送你的文件到另一个用户,email或者github等...GitHub提供了许多支持协作的功能,例如问题跟踪器,Wiki,以及与git版本控制系统的紧密集成。要使用GitHub,您需要注册(免费)并选择一个用户名。...但是,Shiny创造了绝佳的机会,可以与没有R(也无意安装它)的人们共享输出。您的Shiny应用恰好是世界上使用最广泛的通信工具之一:网页。...如果您使用自己的URL托管应用程序,则用户可以访问该应用程序(而不必担心生成该应用程序的代码)。 如果您熟悉网络托管或有权访问IT部门,则可以自己托管Shiny应用程序。...您可以使用同一台Shiny Server在多个网页上托管多个Shiny应用程序,并且可以从防火墙后面部署这些应用程序。

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    如何在Ubuntu 18.04上使用devtools安装R包

    介绍 R是一种流行的开源编程语言,专门研究统计计算和图形。它广泛用于开发统计软件和执行数据分析。R社区以不断为特定研究领域添加用户生成的包而闻名,这使其适用于许多领域。...我们首先需要执行几个系统级任务,因此我们将使用以下命令或使用CTRL-D退出监视器: q() 其中任何一个都会提示您保存工作区图像,R的工作环境包括用户定义的对象。...检查防火墙 Shiny是一个Web应用程序框架,因此为了在浏览器中查看其示例,我们需要确保在我们的防火墙上允许Web流量。内置Web服务器在每次启动时随机选择一个端口,除非我们使用特定值启动它。...运行闪亮: 我们将连接到R,这次是普通用户。务必输入R标题大小写。 R 接下来,我们将加载Shiny包: library("shiny") Shiny包含11个内置示例,演示了它的工作原理。...然后,我们运行了没有提升权限的示例Shiny应用程序,以验证所有用户是否都可以访问该程序包。

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    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-02

    上面是shiny团队的稿件 l2-shiny的页面布局 基于上篇对shiny app 结构的了解 是时候开始从零构建一个shiny app了 二、构建一个用户界面 此篇旨在如何构建app对用户界面,如何布局用户界面然后加文字图片和其他...sidebarLayout 永远包含两个参数: sidebarPanel 函数输出 mainPanel 函数输出 默认状态下边栏会在左侧,也可以通过sidebarLayout中的可选参数position...其他面板的文字亦是如此 要添加更高级的内容,使用Shiny的HTML标签函数,这些函数对应HTML5的标签,如下对照表 3.标题 创建标题元素: 选择一个标题函数(e.g. h1 or h5) 给一段想在标题中显示的文本...app代码中 网页面板的对应位置就会显示设置的文本,通过逗号分隔,同一个面板能插入多个元素 ui <- fluidPage( titlePanel("My Shiny App"), sidebarLayout...,但是还有许多其他标签用于自定义你的用户界面,参考: Shiny HTML Tags Glossary 7.练习 用布局,HTML,img 函数就能创造一个非常有吸引力和有用的用户界面 如下图,快用上面学到的内容写出这样一个

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    Shiny-R语言轻松开发交互式web应用

    Shiny应用程序会自动刷新计算结果,这与电子表格实时计算的效果类似。当用户修改输入时,输出值自动更新,而不需要在浏览器中手动刷新。...Shiny用户界面可以用纯R语言构建,如果想更灵活,可以直接用HTML、CSS和JavaScript来写。...高度定制化的滑动条小工具(slider widget),内置了对动画的支持。 预先构建有输出小工具,用来展示图形、表格以及打印输出R对象。...与常见的R语言做出的图不同,Hello shiny有一个可以调整bins(柱的个数)的滑条,用户可以滑动选择bins的数目,app图表会随即产生变化....从某种程度上说,它很简单——根据用户选择的bin的数目来将直方图画出来。

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    学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

    R包,其中的一些R包适用于多个主题。...它的一部分是由R语言编写的,另一部分是由Java和Python语言编写的。用户可以部署H2O的R程序安装包,之后就可以在R语言环境下运行了。 ROCR:通过绘图来可视化分类器的综合性能。...R代码的输出 yaml:用于实现R数据与YAML格式数据之间的通信。...Shiny Server Open Source:为Shiny应用程序提供开源免费的服务器 Shiny Server Pro:为企业级用户提供一个Shiny应用程序服务器 rsconnect:用于将...htmltools:用于生成HTML格式输出 nloptr:提供了一个NLopt非线性优化库的接口 minqa:一个二次近似的优化算法包 rngtools:一个用于处理随机数生成器的实用工具 NMF

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    shiny入门学习路径

    什么是Shiny? Shiny 是一个为 R 模型提供 Web 交互界面的应用框架,非常容易编写应用,不要求有 Web 开发技能。...Shiny 由 RStudio 公司开发,通过 CRAN 下载安装,利用R语言轻松开发交互式Web应用。简单讲:快速搭建交互应用界面(可以发布形成固定网页)。...#安装Shiny程序包 install.packages("shiny") 2.学习目录 P-1:初步认识shiny app的结构 一个文件夹,加上包含Shiny命令的app.R文件,再加上用到的数据文件和...app.R总是由三部分组成: ui:定义用户界面定义(布局交互界面)。其中ui定义网页中对象的展示方式,包括文字的字体,字号,颜色,排列方式,以及各种组件的默认参数,可以选择的参数等。...server函数读取组件中收集到的数据,计算后,再传递给UI。 shinyApp :对函数的调用(运行)。shinyApp(ui, server)分别调用ui和server函数,生成网页。

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    「R」Rmarkdown与Shiny

    嵌入表格和图表 这也是rmarkdown吸引人的地方,通过R代码直接输出表格和图!这有赖于益辉大神写的knitr包。...一个shiny应用程序基本由两个重要部分组成:一个是Web浏览器交互的HTTP服务器,另一个是HTTP服务器交互的R会话。...下面我们写一个最小的shiny应用程序,写一个R脚本定义它的用户界面和服务器逻辑,用户界面是一个boostrapPage,它包含一个numericInput用于接收一个整数表示样本容量,一个textOutput...我们可以根据想展示给用户的参数来定义shiny应用程序的用户界面,shiny提供了丰富的输入控件: shiny_vars = ls(getNamespace("shiny")) shiny_vars[...下面是shiny提供的输出控件: shiny_vars[grep("Output$", shiny_vars)] #> [1] "cancelOutput" "dataTableOutput

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    学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

    R包,其中的一些R包适用于多个主题。...它的一部分是由R语言编写的,另一部分是由Java和Python语言编写的。用户可以部署H2O的R程序安装包,之后就可以在R语言环境下运行了。 ROCR:通过绘图来可视化分类器的综合性能。...:用于自定义数据表的输出 xtable:用于自定义数据表的输出 highr:用于实现R代码的LaTeX或HTML格式输出 formatR:通过tidy_source函数格式化R代码的输出 yaml:用于实现...Shiny Server Open Source:为Shiny应用程序提供开源免费的服务器 Shiny Server Pro:为企业级用户提供一个Shiny应用程序服务器 rsconnect:用于将...htmltools:用于生成HTML格式输出 nloptr:提供了一个NLopt非线性优化库的接口 minqa:一个二次近似的优化算法包 rngtools:一个用于处理随机数生成器的实用工具 NMF:提供了一个执行非负矩阵分解的算法和框架

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    Shiny 基础

    ,添加文字,图像和其他的一些HTML元素 让我们先生成一个空白的UI界面,然后再一步步的扩充它: library(shiny) # Define UI ---- ui 输出,要想创建一个交互式的输出需要两步: 在UI里面添加一个R对象 在server函数内部告诉R如何去创建这个对象 在UI里面添加R对象 shiny提供了一系列的函数将R对象转化成UI界面的输出...,R对象名称为selected_var 提供R代码来创建这个对象 将R对象的名称放在UI里面只是告诉shiny在哪儿放置我们的输出结果,接下来我们需要告诉shiny如何去创建这个对象 server函数会创建一个类似列表的对象...shiny render*函数的输出,不同的render*函数对应不同类型的输出: ?...image-20201106230835574 每个render函数也都有一个参数:使用{}括起来的R代码,每次更新输出的时候,shiny都会运行这里面的代码 server函数还会将app当前的所有组件的值存为一个

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    学习R语言,一篇文章让你从懵圈到入门

    R包,其中的一些R包适用于多个主题。...它的一部分是由R语言编写的,另一部分是由Java和Python语言编写的。用户可以部署H2O的R程序安装包,之后就可以在R语言环境下运行了。 ROCR:通过绘图来可视化分类器的综合性能。...R代码的输出 yaml:用于实现R数据与YAML格式数据之间的通信。...Shiny Server Open Source:为Shiny应用程序提供开源免费的服务器 Shiny Server Pro:为企业级用户提供一个Shiny应用程序服务器 rsconnect:用于将...htmltools:用于生成HTML格式输出 nloptr:提供了一个NLopt非线性优化库的接口 minqa:一个二次近似的优化算法包 rngtools:一个用于处理随机数生成器的实用工具 NMF

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    盘点2015年度10大最流行的Python库

    YAPF 的终极目标是生成和遵循代码规范的程序员写出的一样的代码。可帮你减少维护代码的苦差事。 3.tqdm tqdm(读音:taqadum, ?????)在阿拉伯语中的意思是进展。...tqdm可以在长循环中添加一个进度提示信息,用户只需要封装任意的迭代器 tqdm(iterator),是一个快速、扩展性强的进度条工具库。 ? 4.pyvim 用Python语言实现的Vim编辑器。...在网页上显示一个数据面板是与人分享数据科学发现的最直观方法。对R语言来说有Shiny来简化数据科学家开发网页的工作,而Pyxley就相当于Python版的Shiny。...8.pupy Pupy是一个远程管理工具(Administration Tool),开源并且支持多个平台。...它试图解决的就是数据集规模的问题,但对用户提供的确是单机上Python的体验,而且能够与现有的Python数据生态圈(Pandas、Scikit-learn、Numpy)进行集成。

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    基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-04

    上面是shiny团队的稿件 l4-反应输出 了解小工具如何和反应输出联系,反应输出即无何时用户改变小工具都会自动更新的对象 展示反应输出 是时候给app注入灵魂了,此篇介绍如何构建一个反应输出在app中展示...只要用户触发小工具,反应输出会自动响应 如下图,右边的两行文字会根据用户对小工具的操作改变 此篇创建一个名为census-app的app 总的两步 可以通过两步处理构建反应输出 加一个R对象到你的用户界面...告诉shiny如何在server函数构建对象,该对象会在它的代码构建一个小工具的值的时候反应 第一步:加一个R对象到UI shiny提供了一个函数家族,将R对象转换成在UI中的输出,每个函数创建特定类型的输出...当用户改变小工具,shiny会使用新的值重建依赖于那个小工具的所有的输出,重建对象达到更新的目的 这就是如何用shiny创建反应,通过连接input列表中的值到output中的对象。...,操作选择框的时候文本也会随之改变 在改变的时候,反应部分的代码甚至会变黄,有助于理解反应输出 练习 在上面的App加第二行反应文本,加到app的主面板,展示如 “You have chosen a range

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    单细胞分析工具||ShinyCell交互式展示单细胞数据

    所需的R包 reqPkg = c("shiny", "shinyhelper", "data.table", "Matrix", "DT", "hdf5r", "reticulate...进阶用法 4.1 meta config调整 如上介绍,生成shiny网页的第一步是根据单细胞数据的meta信息生成相应的config文件,用以设置模块可视化的细节。...4.2 多个数据集 ShinyCell支持在同一个网页内独立展示多个的数据集,可参考示例网页http://shinycell2.ddnetbio.com 简单生成方法如下 ## 数据集1 seu 的R语言环境下安装相关R包,并准备相关数据 # (2) 生成shiny网页文件 seu <- readRDS("readySeu_rset.rds") scConf =...(四):降维 单细胞最好的教程(三):特征基因选择 单细胞最好的教程(二):归一化 Python 单细胞分析教程(一):质量控制 单细胞分析工具||COSG鉴定marker基因

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    R文档沟通|Dashboards入门(4)

    这是通过将 runtime: shiny 添加到标准仪表盘文档来实现的,然后添加一个或多个输入控件或响应式表达式来动态驱动仪表板内组件的外观。...在 flexdashboard 中使用 Shiny 可以将一个静态的 R Markdown 报告变成一个交互式文档。...在仪表盘第一列添加 {.sidebar} 属性,使其成为 Shiny 控件输入的控制台(注:这一步不是必须的,但这是基于 Shiny 仪表盘的经典布局)。 根据需求,添加 Shiny 的输入和输出。...注:文档顶部标记为 global 的 R 代码块在全局环境中都可以被调用。这将为用户带来更好的启动性能,强烈推荐大家使用。...输入栏 通过添加 {.sidebar} 属性设置一个默认布局为左对齐,250像素宽度的左侧边栏。 在搭建多个页面的仪表盘时,如果你想创建一个应用于所有页面的工具条。

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