R Shiny -如何使用本地csv文件和自定义函数 - 腾讯云开发者社区

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将Shiny APP搭建为独立的桌面可执行程序 - Deploying R shiny app as a standalone application

某天，我发现了Shiny这个东西，当时兴冲冲的尝试官网上各种各样的例子，最后发现这个东西似乎只能充当一个“玩具”。如果要在本地运行，它需要一个完整的R环境，这对相当一部分用户来说是极度不友好的。...毕竟很多科研工作者的出发点是将自己的研究过程和结果分享展示给他人，而不是出于商业的目的，部署在服务器上供他人使用需要持续投入计算资源和维护成本，这不是长久之计。目的？...那么，如果我们实现了一个精妙的Shiny App，如何0成本的分享给别人，且别人能够方便的使用呢？.../R路径下生成了一个以mod_为前缀的模块文件，把mod_csv_file.R这个文件的内容改成这样的： #' csv_file UI Function #' @description A shiny.../R/run_app.R') run_app() 出现下面这个界面Shiny App基本上就成了，可以打开一个csv文件自己测试一下。

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mxnet：结合R与GPU加速深度学习

mx.set.seed而不是R自带的set.seed函数来控制随机数。...目前我们提供的评价函数包括”accuracy”，”rmse”，”mae” 和 “rmsle”，用户也可以针对需要自定义评价函数，例如： demo.metric.mae shiny和imager两个R包： install.packages("shiny", repos="https://cran.rstudio.com") install.packages...("imager", repos="https://cran.rstudio.com") 现在你已经配置好了mxnet, shiny和imager三个R包，最困难的部分已经完成了！...准备就绪之后，你的浏览器中会出现一个网页应用，就用本地或在线图片来挑战它吧！如果你只需要一个图像识别的模块，那么我们下面给出最简单的一段R代码让你能进行图像识别。

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您找到你想要的搜索结果了吗？

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绘制旭日图：sunburstR

shiny是R的Web应用程序框架，使用R构建交互式Web应用程序较容易 1....例一 library(shiny) #读取source中提供的示例visit-sequences.csv示例数据 #只使用前100行来加速包的构建和检查 # https://gist.github.com...应用程序和交互式Rmd文件中使用d2b输出函数 server <- function(input, output, session) { output$s2b 和计数 ) 2....使用来自R数据集的颜色列 library(treemap) library(d3r) rhd <- random.hierarchical.data() tm <- treemap( rhd, index

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十个超级好用的R语言编程技巧，一般人绝不知道！

", "rabbit" ="rabbitdata.csv")) 当需要根据一个或多个输入菜单选择在Shiny应用程序中加载不同的数据集甚至环境文件时，这个技巧非常有用。...R Shiny中的req函数和validate函数 R Shiny常常让人崩溃，特别是在弹出一般性错误提醒而程序员又一头雾水的时候。...随着Shiny的发展，越来越多的验证函数和测试函数加入了Shiny，帮助程序员更好地诊断和提醒错误。当操作环境中没有其他变量时，req（）函数可以悄无声息地阻止一个操作的发生，并且不弹出错误提醒。...但是，如果在转换文件选择参数时，选择了RStudio中Knit下拉列表中的选项（或使用了kint_with_parameters（）函数），一个菜单就会出现，来在转换文件前选择参数。非常棒！ ?...它可以在R Markdown中使用，并有非常直观的HTML快捷方式，可以创建具有嵌套和逻辑结构的各种风格的漂亮幻灯片。HTML格式的演示文稿也意味着人们在听演讲时可以继续使用平板电脑或手机。

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Shiny||文件的上传与下载

Shiny可以将用户的数据上传到到你的应用程序里。用户可以通过浏览器进行数据的上传，并且服务器端可以访问这些数据。一般情况下，shiny上传的数据有文件大小有限制，一般不能超过5M。...例如，在server.R的最前面加上 options(shiny.maxRequestSize=30*1024^2)，可以把文件大小限制提高到30MB。...文件的上传运行下面这个上传文件的例子： library(shiny) runExample("09_upload") ?...header=input$header, sep=input$sep, quote=input$quote) }) }) shinyApp(ui,server) 文件上传函数为ui文件中的 fileInput...accept提示用户上传文件类型。文件的下载运行下载示例文件 library(shiny) runExample("10_download") ?

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基于shinydashboard搭建你的仪表板（二）

以每一个完整的小栗子讲解怎么使用每一个输入项。 ? 上表中最后4个输入项函数可以归为一类：控制型输入项，控制操作是否生效。...说明以下所用到的app.R脚本按照标准的shinydashboard代码书写，谨记：侧边栏一般放置输入项以及菜单栏，主体中呈现输出部分，故输入项函数和菜单栏函数写在ui脚本dashboardSiderbar...fileInput输入项 fileInput函数主要用于从本地上传数据。...总结本部分简单介绍常用的几个侧边栏的输入项函数。当你做交互式界面的时候，需要用到几个输入项函数时，累加一起使用即可。...重点注意输入项函数写在ui中dashboardSidebar函数中，有输入项函数就有输出项函数与之对应，输出项函数成对出现（*Output函数和render*函数），*Output函数写在ui中的dashboardBody

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如何使用File Browser结合cpolar实现远程访问和共享本地储存的文件

，它可以帮助用户轻松地管理他们的文件和文件夹，并通过Web界面进行访问和共享。...File Browser的主要功能包括文件和文件夹的上传、下载、重命名、复制、粘贴、删除等操作，以及文件搜索、预览和分享链接生成。它还支持用户和权限管理，以确保文件的安全性和隐私性。...下面就和大家分享一下如何在Windows系统搭建这款网盘神器filebrowser并结合cpolar内网穿透实现公网访问本地云盘文件。...然后再输入一次filebrowser config set -r c://FBshare命令后回车：显示如下图所示，即为本地部署完成。...隧道名称：可自定义命名，不能与已有的隧道名重复，这里我填写了FileBrowser 协议：选择http 本地地址：8080 域名类型：免费选择随机域名地区：China Top

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-01

上面是shiny团队的稿件 shiny是一个直接用R来制作交互式网页应用 (interactive web applications (apps)) 的R包一、欢迎使用shiny 如下就是一个简单朴素的...函数最后，shinyApp 函数根据上面的那对ui和server创建一个shinyApp 项目 library(shiny) # 一个用户界面对象 ui <- fluidPage() # 一个服务函数...shinyApp(ui = ui, server = server) 2.启动一个app 每个app的结构都一样，一个 app.R 文件包含 ui 和 server. 通过新建一个文件夹?...runApp和其他R中的许多函数(read.csv, read.table)一样，第一个参数的是从工作目录到app的目录的文件路径，以上代码假设my_app文件夹包含在你的工作路径，因此，只需要输入文件夹的名字...Shift+Enter) 点击灰色的向下展开小箭头还有更多惊喜哦一个个点点看 5.回顾一下怎么创建一个app 创建一个以myapp为名的路径（文件夹）保存app.R到myapp文件夹中使用runApp

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在我们的shiny服务器部署一个RNA-seq下游分析网页工具

源代码是公开的，在：https://github.com/szenitha/Shiny-Seq 所以我想着把它安装在我们自己的服务器里面，方便国内的粉丝使用！.../Shiny-Seq.git 无需要编译，直接启动 http://49.235.27.111:3838/paper/Shiny-Seq/App/ 一般来说，第一次安装肯定会报错，需要排查，比如这个代码里面经常出现文件名大小写混淆的错误...，应该是操作系统迁移的问题： ls *.R|while read id;do( mv $id ${id/.R/.r});done 碰到比较麻烦的事情就重启，基本上重启能解决99%的事情。...会在R里面当做列名字被强制性转为点) 然后是临床信息文件，第一列必须的样本名字，必须跟表达矩阵的第一行一模一样哦！！！后面其它列可以是各种各样的信息咯。...一些效果还是很棒的，至少不需要你自己写代码了，不过就是需要你耗费很多时间来摸索如何使用这个网页工具咯，而且少了很多自定义的快乐。 ?

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「R」Shiny 教程笔记

整理之前在知识星球打卡汇总的 Shiny 笔记，作为速学、速查使用和分享。基于 https://shiny.rstudio.com/tutorial/ 视频而非文字教程写的笔记。...p4：分享 Shiny 将所有脚本和材料保存到一个目录，目录下代码通常以以下 2 种方式之一存储： app.R ui.R & server.R ? ? ?...p11：使用 isolate() 隔离响应表达式如何在不更新图的情况下更新标题呢？这就需要使用 isolate() 了。 isolate() 创建一个非响应对象（看作 R 常规值）。...p21：使用 CSS 设置风格 CSS，即层叠样式表提供了自定义网页中元素布局的框架。 Shiny 使用的是 Bootstrap 3 CSS 框架。...外部 css 文件应当放在 www 目录下，然后放到 header 部分进行链接。联合 tags$style() 和 HTML() 手动写 CSS；或使用 includeCSS()。

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手把手教你使用shiny创建一个网页工具（基于Windows）

更改配置安装成功之后，为了保证后续的R语言能正常使用MySQL，需要修改配置文件。默认安装的配置文件在"C:\ProgramData\MySQL\MySQL Server 8.0\my.ini"。...安装必要的R包安装方式如下GIF图所示，基本步骤就是打开Shiny项目中的 TF_map.Rproj,然后打开其中 scripts/install_packages.R, 把里面提到的所有R包都装了就行...作者会给你提供一个微云网盘链接，我们以其中比较小的文件为例进行演示。在shiny的应用文件夹创建一个文件夹db,然后将下面文件下载到该文件夹中。（选择一个较小的作为演示） ?...启动Shiny 在上述的准备之后，就可以在本地运行该Shiny应用。但是呢，这里还有一个坑，就是在作者的ui.R里面，作者居然还在里面给我藏了一个有趣的bug。...刚开始运行时，R提示了几个warnning，然后网页端里面的内容明显没有完全加载。 ? 经过我的直觉排查，我发现作者在ui.R里面使用了中文的引号。 ?

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70-R茶话会15-你的编程菜鸟路上缺失的一课

这时候或许可以借助循环和switch 实现替换，教程在，[[17-R编程03-控制语句与函数]]： > sapply(tmp, function(x){ + switch(EXPR = x, +...08-优秀的R使用者，优秀的代码习惯]]，以及包：[[22-R茶话会03-美化代码]] 这一次来看看tidyverse 官方的包：Welcome | The tidyverse style guide[...5-学会在你的R 分享内容里使用变量以Rmd 为例子: You can do this by defining parameters in the YAML header of your R Markdown...例子：Example projects • flexdashboard (rstudio.com)[6] shiny 测试的两个好用函数：req and validate functions The req...比如添加到启动环境里，见面就夸我，怪不好意思的，[[10-R工具指南09-自定义R的启动环境]] 花里胡哨的tag Most people don’t take full advantage of the

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基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-02

上面是shiny团队的稿件 l2-shiny的页面布局基于上篇对shiny app 结构的了解是时候开始从零构建一个shiny app了二、构建一个用户界面此篇旨在如何构建app对用户界面，如何布局用户界面然后加文字图片和其他...其他面板的文字亦是如此要添加更高级的内容，使用Shiny的HTML标签函数，这些函数对应HTML5的标签，如下对照表 3.标题创建标题元素：选择一个标题函数（e.g. h1 or h5）给一段想在标题中显示的文本...，比如高和宽，注意是以像素为单位 img(src = "my_image.png", height = 72, width = 72) img函数会特定位置查找图片，文件必须在与app.R同目录下的一个叫...www的文件夹中，shiny会通过特殊的处理，将这个文件夹中的文件与浏览器共享，www就是存放图片，样式表等东西的大本营，里面的文件用于浏览器构建app的网页部分。...titlePanel, sidebarPanel 或 mainPanel 给网页添加元素用逗号分隔多个元素 www文件夹存放图片并通过img 函数使用我的答案 library(shiny) # Define

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R : Shiny|搭建单细胞数据分析云平台

您还可以使用CSS主题、htmlwidgets和JavaScript动作来扩展您的应用程序。...image 根据自己的喜好，我选择的是Multiple File（ui.R/server.R），主要是给人一种前端和后端分开的感觉，其实app.R也是一样的通过两个函数来分别控制，我起的名字是seuratreport...+--- server.R # 基本后台文件 +--- ui.R # 界面控制文件 +--- www # 可以放一些我的界面修饰文件css，help.R之类的 | +--- header.html...把文件放到正确的位置就可以启动我们的shiny了：本地Shiny 程序 runApp('H:\\singlecell\\SCshiny\\seuratreport') ?...还可以添加函数实现图片下载功能哦~ 部署我们的云平台故事远没有结束。本地的Shiny平台每次启动都要经过RStudio，一个人都能用RStudio了，为什么还要强推Shiny呢？

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【最终章】R语言从入门到精通Day18：Shiny高级可视化

换句话说，使用shiny包能让你的数据分析结果“表达能力”更强。...大家需要拿到后台代码才能在本地运行本例，没有安装shiny包的同学需要先安装并载入shiny包代码文件保存在文件夹kmeans下的app.R中，在R中运行（*此时R中的路径应在app.R的上一级，即和文件夹...例2 了解了上面这些例子之后，观察示例中的代码不难发现，一个shiny app中一定包含了R脚本app.R，这个脚本位于文件夹下（如kmeans），运行这个shiny app只需要运行函数runApp(...那如果你想把你的shiny app分享或者展示给其它人，最简单的方式就将整个文件夹（包括数据、附加代码等）分享；当然你也可以选择上传至Github，这样你让对方在本地运行： > runGitHub( "...shiny包借鉴了很多编写网页的思想和方法，从而实现了网页应用和R语言的“双剑合璧”，同时它也能和Markdown包、CSS、JavaScript等方法联合使用，是一种非常优秀的数据可视化方法，希望能成为大家日后数据可视化的新工具

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将Python和R整合进一个数据分析流程

◆交互式图像或控制板：bokeh， plotly和intuitics最近都把Python的图形使用扩展到了Web浏览器，但是举个使用shiny的例子，R中的shiny 控制面板运行速度更快，而且往往需要更少的代码...在R语言中推荐下面的程序包： ●对于CSV文件，使用readr ●对于JSON文件，使用jsonlite ●对于YAML文件，使用yaml Python中推荐： ○对于CSV文件，使用csv ○对于JSON...文件，使用json ○对于YAML文件，使用PyYAML csv 和json模块是Python标准的库文件，是Python内置模块，而PyYAML需要额外安装程序包。...总结 R 和Python之间的数据传递可以通过单一传递途径进行： △使用命令行传递参数 △使用常见的结构化文本文件传递数据然而，在某些实例中，需要将文本文件作为中间文件存储在本地，这不仅很麻烦而且还影响性能...接下来，我们将讨论如何在R和Python中直接调用并在内存中输出。

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将Python和R整合进一个数据分析流程

交互式图像或控制板：bokeh， plotly和intuitics最近都把Python的图形使用扩展到了Web浏览器，但是举个使用shiny的例子，R中的shiny 控制面板运行速度更快，而且往往需要更少的代码...在R语言中推荐下面的程序包：对于CSV文件，使用readr 对于JSON文件，使用jsonlite 对于YAML文件，使用yaml Python中推荐：对于CSV文件，使用csv 对于JSON文件...，使用json 对于YAML文件，使用PyYAML csv 和json模块是Python标准的库文件，是Python内置模块，而PyYAML需要额外安装程序包。...总结 R 和Python之间的数据传递可以通过单一传递途径进行：使用命令行传递参数使用常见的结构化文本文件传递数据然而，在某些实例中，需要将文本文件作为中间文件存储在本地，这不仅很麻烦而且还影响性能...接下来，我们将讨论如何在R和Python中直接调用并在内存中输出。

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如何使用Shiny Server部署R应用程序

什么是Shiny？ Shiny是R编程语言的库，允许您在本机R中创建交互式Web应用程序，而无需使用HTML，CSS或JavaScript等Web技术。...没有服务器的同学可以在这里购买，不过我个人更推荐您使用免费的腾讯云开发者实验室进行试验，学会安装后在购买服务器。您还需要在您的本地计算机安装RStudio，如何安装请参考RStudio官方文档。...选择多个文件，然后选择一个目录来存储新应用程序的文件。 Rstudio自动打开两个新文件：ui.R和server.R。...： sudo apt install r-base 添加Shiny Package 使用install.packages()添加有Shiny包： sudo su - \ -c "R -e \"install.packages...更改此文件后，重新启动该shiny-server服务： sudo systemctl restart shiny-server.service 总结为了使部署的应用程序与本地环境中所做的更改保持同步，

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Vitessce: 多模态和空间分辨单细胞数据的综合可视化

研究人员可以在数据分析过程中使用 R 和 Python 包来探索本地或远程数据集。 Vitessce 网站和在线配置编辑器旨在与合作伙伴共享可视化内容以及调试。...Vitessce in R environments, R, RStudio and Shiny apps 在 R 环境、R、RStudio 和 Shiny 应用中使用 Vitessce Para_01...Vitessce 可以作为 R 语言包在脚本、R 文档和 Shiny 应用中使用。...视图实现是相互独立的，并使用自定义的 React 钩子函数从协调模型中获取值并加载数据。...空间视图和散点图视图都使用了一个自定义层，该层利用在WebGL中编写的定量颜色映射函数，在图形处理单元（GPU）上高效地将特征值映射到颜色。

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自学攻略 | RStudio深度探索

在《生信小白自学攻略》的第一篇中，我们成功安装了R和RStudio。本篇我们就来学习R和Rstudio是如何结合使用的。...查看器（Viewer）：用于显示本地Web内容，如R Markdown生成的HTML报告、Shiny应用等。...如何创建和使用R Project：新建项目：在RStudio中，点击菜单栏 File -> New Project...。...假设你有一个名为 gene_expression.csv 的数据文件，如果它与你的R脚本在同一个R Project文件夹下，你只需简单地使用 read.csv("gene_expression.csv"...如果工作目录不正确，R就无法找到这个文件。如何查看和设置工作目录：查看当前工作目录：在控制台输入 getwd()，R会返回当前的工作目录路径。

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将Shiny APP搭建为独立的桌面可执行程序 - Deploying R shiny app as a standalone application

mxnet：结合R与GPU加速深度学习

绘制旭日图：sunburstR

十个超级好用的R语言编程技巧，一般人绝不知道！

Shiny||文件的上传与下载

基于shinydashboard搭建你的仪表板（二）

如何使用File Browser结合cpolar实现远程访问和共享本地储存的文件

基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-01

在我们的shiny服务器部署一个RNA-seq下游分析网页工具

「R」Shiny 教程笔记

手把手教你使用shiny创建一个网页工具（基于Windows）

70-R茶话会15-你的编程菜鸟路上缺失的一课

基于R语言的shiny网页工具开发基础系列-02

R : Shiny|搭建单细胞数据分析云平台

【最终章】R语言从入门到精通Day18：Shiny高级可视化

将Python和R整合进一个数据分析流程

将Python和R整合进一个数据分析流程

如何使用Shiny Server部署R应用程序

Vitessce: 多模态和空间分辨单细胞数据的综合可视化

自学攻略 | RStudio深度探索

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