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Python解析psiBlast输出的JSON文件结果

"正确地打开方式": [ "阅读", "置顶", "转发" ] } } 在Python...Python解析PSIBLAST的JSON输出结果 BLAST的输出结果可以有多种,在线的配对比较结果,线下常用的表格输出,这次尝试的是JSON的输出,运行命令如下 psiblast -db nr -out...Known_CPS.CUI.mfa.psiblast -evalue 0.0001 -outfmt 13 -num_threads 10 -num_iterations 0 -in_msa Known_CPS.CUI.mfa 这次编程的目的是通过解析输出的...JSON结果获取匹配的蛋白的名字和序列,JSON文件解析的关键是知道关注的信息在哪个关键字下可以找到,然后需要怎么操作进入到关键字所在数据层,具体操作见如下视频,视频中一步步尝试如何不断试错,解析JSON...文件,获得想要的Python脚本和解析结果。

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下列python语句的输出结果是print_下列 Python语句的输出结果是「建议收藏」

【单选题】Python语句 print(type(1/2)的输出结果是 【填空题】下列Python语句的程序运行结果为: class account: def __init__(self, id, balance...(只写函数名) 【判断题】如有下面代码,输出的结果是一个元组 def f(a,b,c): print(a,b,c) f(*(1,2,3)) 【单选题】下面的程序段求x和y两个数中的大数,( )是不正确的...【填空题】下列 Python语句的输出结果是 def judge( param,*param2): print(param2) judge(1,2,3,4,5) 【填空题】将读取的内容写入到文件中。...【单选题】Python语句 print(type([1,2,3,4])的运行结果是 【单选题】print(r”\nGood”)的结果是 【填空题】下列 Python语句的输出结果是 def judge(...(i,end=’-‘)”的输出结果为( ) 【单选题】Python语句 print(type(1J))的输出结果是 【填空题】Python语句re. split(‘\W+’,’go, went, gone

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    python3美化表格数据输出结果

    技术背景 在前面一篇博客中我们介绍过关于python的表格数据处理方案,这其中的工作重点就是对表格类型的数据进行梳理、计算和展示,本文重点介绍展示这个方面的工作。...使用tabulate美化表格输出 首先介绍一个工具tabulate,可以直接打印数组格式的表格数据,并且有多种输出格式可选。...代码的执行结果如下: [dechin@dechin-manjaro table]$ python3 pt_test.py +-------+---+---+---+---+ | Index | 0...tabulate是一样的,所以输出结果也类似,相当于多了一种输出格式。...由于表格数据本身是没有对输出格式进行规范化的,因此打印出来的数据会显得比较杂乱,不利于直观的阅读。因此引入这两种工具,加强了输出结果的可读性。

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    python3美化表格数据输出结果

    技术背景 在前面一篇博文中我们介绍过关于python的表格数据处理方案,这其中的工作重点就是对表格类型的数据进行梳理、计算和展示,本文重点介绍展示这个方面的工作。...使用tabulate美化表格输出 首先介绍一个工具tabulate,可以直接打印数组格式的表格数据,并且有多种输出格式可选。...代码的执行结果如下: 1 2 3 4 5 6 7 [dechin@dechin-manjaro table]$ python3 pt_test.py +-------+---+---+---+---...tabulate是一样的,所以输出结果也类似,相当于多了一种输出格式。...由于表格数据本身是没有对输出格式进行规范化的,因此打印出来的数据会显得比较杂乱,不利于直观的阅读。因此引入这两种工具,加强了输出结果的可读性。

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    Jenkins 控制台输出中的奇怪字符

    有时候,在对一些文件进行编译的时候,会看到下面的奇怪输出字符。 e[1;33m 如上图显示的貌似一些乱码的东西。...问题和解决 其实这个不是问题,这是因为在你的程序中可能使用了 ANSI escape code 这种输出。 其目的是为了在中断中显示彩色的输出内容。...具体安装的方法我们就不在这里说了,你可以通过访问 Jenkins 的插件界面,通过搜索插件名称来进行安装。 上图显示已经安装成功的插件。...Jenkins 中的配置 在 Jenkins 中访问你需要进行配置的项目。...然后保存退出后再对你的项目在 Jenkins 上进行重新编译。 这个时候就可以在控制台上看到彩色输出了。 如上图显示的彩色输出。

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    奇怪的 Python 整数缓存机制。

    首先我们打开 Python 的解释器,在里面输入如下内容: >>> a = 1024 >>> b = 1024 >>> a is b False 当 a 和 b 的值皆为 1024 的时候,a is b...为 False,那这里我有一个问题:当 a 和 b 的值皆为 6 的时候,a is b 的输出结果是什么呢?...is 判断两个是不是引用同一个对象和上述代码中的 id 输出结果,照猫画虎,得出了一个结论:当 a 和 b 等于 1000 的时候,a 和 b 引用的不是同一个对象;当 a 和 b 等于 6 的时候,a...其实这就是 Python 中的「整数缓存机制」在作怪! 在 Python 中,它会对比较小的整数对象进行缓存([-5, 256]),而并非是所有的整数对象。...刚刚只是在命令行中执行的时候,当在 Pycharm 或者在文件中执行的时候,因为解释器做了部分优化,结果又完全不一样了,范围成了大于等于 -5 的任意整数。

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    快速学习-Mybatis 的输出结果封装

    第4章 Mybatis 的输出结果封装 4.1 resultType 配置结果类型 resultType 属性可以指定结果集的类型,它支持基本类型和实体类类型。...需要注意的是,它和 parameterType 一样,如果注册过类型别名的,可以直接使用别名。没有注册过的必须使用全限定类名。...例如:我们的实体类此时必须是全限定类名(今天最后一个章节会讲解如何配置实体类的别名) 同时,当是实体类名称是,还有一个要求,实体类中的属性名称必须和查询语句中的列名保持一致,否则无法 实现封装。...4.2 resultMap 结果类型 resultMap 标签可以建立查询的列名和实体类的属性名称不一致时建立对应关系。从而实现封装。...同时 resultMap 可以实现将查询结果映射为复杂类型的 pojo,比如在查询结果映射对象中包括 pojo 和 list 实现一对一查询和一对多查询。 4.2.1 定义resultMap <!

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    意想不到的输出结果

    ❝今天在stackoverflow问答平台上看到的一个问题,一段简单的代码,得到的却是预料中不一样的结果。❞   下列代码会输出什么?...int i = 0; std::cout << i++ << ++i;   Qt君使用MSVC编译器输出的是12,而在使用Mingw编译器输出的是02。 「为什么会出现这种情况呢」?   ...「最主要原因是函数形参之间没有明确的求值顺序约定」。这就会导致不同的编译器得出不一样的结果。   ...比如有函数f1(f2(a, b), f3(c, d)),参数1f2(a, b)和参数2f3(c, d)的调用顺序是不确定的,有些编译器会先调用f3(c, d)后再f2(a, b),而有些编译器会先调用f2...总结   由于上述形参不确定行为,我们尽量避免形参之间自增或自减的操作。

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    用python输出stata一样的标准化回归结果

    如果你经常用stata写论文,会了解stata有个outreg2的函数,可以把回归的结果输出成非常规范的论文格式,并且可以把多个回归结果并在一起,方便对比。例如下图 ?...本文的目的是用python实现outreg2的效果,得到上面这样的结果,方便对比和分析。...01 OLS格式化输出 例子使用前文Fama-Macbeth中使用过的数据,首先取其中一期的数据做回归,这里主要是展示格式化输出的结果,所以不要太在意系数的符号和显著性。...这里的info_dict里子定义了三个行数,效果是两行空白,第三行输出变量个数,也就是图里的Observation,如果你想在结果里输出更多的统计量,也可以用类似的方法实现,小数位数也是可以调的。...另外这个包目前还是在完善过程中,所以如果python版本不一样,输出结果可能会有一些差异,比如上图是用python3.7实现的,python3.8实现出来R2的结果会显示在回归系数的下方。

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    Python 为什么会有个奇怪的“...”对象?

    它是中文标点符号的半个省略号,也即由英文的 3 个点组成。如果你是第一次看到,很可能会觉得奇怪:这玩意是怎么回事?PS:如果你知道它,仔细看过本文后,你同样可能会觉得奇怪!...但我本人还是倾向于使用 pass,不知道你是怎么想的呢? 2、奇怪的 Ellipsis 和 ... ......虽然官方说它们是同一个对象的两种写法,而且说成是单例的(singleton),但我还发现一个非常奇怪的现象,与文档的描述是冲突的: ? 如你所见,赋值给 ......(4)表示无限循环 最后,我认为有一个非常终极的原因,除了引入“...”来表示,没有更好的方法。 先看看两个例子: ? 两个例子的结果中都出现了“...”,它表示的是什么东西呢?...是 Python 3 中的一个内置常量,它是一个单例对象,虽然是 Python 2 中就有的 Ellipsis 的别称,但它的性质已经跟旧对象分道扬镳 ...

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    python的标准输入,输出,错误输出。

    1:标准输入:     python中的sys模块有标准输入,标准输出,以及标准错误输出的方法。 #!...print data, #print data  #也可以借助于print函数来输出,print函数的输出默认的结果时多带一个换行符的,若想去掉换行符可以在左后面加一个>逗号 输出结果如下: [root...@lianxi1 Day01]# python Day01.py  wer rew wer       #标准输出的结果 rew wer        #print的输出 rew 2:从标准输入统计输入的行数...return n fd = sys.stdin print lineCount(fd) 输出结果如下: [root@lianxi1 Day01]# python Day02.py  dfs sdf                    ...:%d\n" %i)#一秒出一个     time.sleep(1)     #sys.stdout.flush() #刷新缓存,执行的加-u选项效果一样 输出结果: [root@lianxi1 Day01

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    python中奇奇怪怪的注释方式

    注释是给你看的,而不是让计算机运行的程序。注释是程序文档的一部分,但是运行时会忽略掉它们。...---- 第一种——# 单行注释 在程序(或者其他任何东西)前面加一个“#“即可把它变成注释 #print(123) 这虽然是一个print函数,但是程序并不会运行它,因为它的前面加了“#”,解释器会自动忽略它们...行末注释 print(123)#这是一个输出123的程序 注:在“#”后的程序皆会被理解为注释(本行) 多行注释 #123 #234 #234444 在任何一行程序前加上“#”都会变为注释(下面会介绍更简单的方法...#”都会变为注释(下面会介绍更简单的方法) ---- """ 这是一个字符串,但是毫无作用,所以也可以看做一个注释(尽管严格意义上来讲并不是) """11 11 11 11 1""" 注:他是可以跨行的

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    基于Amos路径分析的输出结果参数详解

    系列文章共有四篇,本文为第二篇,主要由整体层面关注输出结果参数。.../zhebushibiaoshifu/article/details/114333349)中,我们详细介绍了基于Amos的路径分析的操作过程与模型参数,同时对部分模型所输出的结果加以一定解释;但由于Amos...所输出的各项信息内容非常丰富,因此我们有必要对软件所输出的各类参数加以更为详尽的解读。...其中,本文主要对输出的全部参数加以整体性质的介绍,而对于与模型拟合程度相关的模型拟合参数,大家可以在上述博客3、博客4中查看更详细的解读。...如下图,若为非标准化结果,自变量、残差旁的数字代表其方差;而对于标准化结果,箭头旁的数字代表对应回归方程的R方。具体请见这篇博客[6]。 ?

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