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    Python在生物信息学中的应用:将序列分解为单独的变量

    我们有一个包含 N 个元素的元组或序列,现在想将它分解为 N 个单独的变量。 解决方案 任何序列(或可迭代对象)都可以通过一个简单的赋值操作来分解为单独的变量。...唯一的要求就是变量的总数和结构必须与序列相吻合。...例如: >>> s = 'Hello' >>> a, b, c, d, e = s >>> a 'H' >>> b 'e' >>> e 'o' >>> 当做分解操作时,有时候想丢弃某些特定的值。...Python 并没有提供特殊的语法支持这个需求,但是你可以使用任意变量名去占位,到时候不使用这些变量就行了。...50, 91.1, (2012, 12, 21) ] >>> _, shares, price, _ = data >>> shares 50 >>> price 91.1 >>> 但是请确保你选择的变量名没有在其他地方使用到

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    「Postgresql架构」使用PostgreSQL中的JSONB数据类型加快操作

    为避免这种情况,您可以考虑存储稍后可能在常规字段上汇总的数据。 有关此问题的进一步评论,您可以阅读Heap的博客文章何时在PostgreSQL架构中避免使用JSONB。...用例:书籍条目 让我们使用带有书籍条目的玩具模型来说明在PostgreSQL中使用JSON数据时的一些基本操作。...如果您使用json或jsonb,本节中的操作将基本相同,但让我们回顾它们以刷新我们可以用JSON做什么,并在我们看到jsonb好吃之后立即设置我们的用例。...结论 PostgreSQL文档建议大多数应用程序应该更喜欢将JSON数据存储为jsonb,因为我们已经看到有显着的性能增强和仅有的小警告。...并且说明显而易见的是,作为9.4版中引入的一个特性,jsonb不是向后兼容的,你需要使用的jsonb关键字设置JSON表将破坏传统平台上的SQL代码。

    6.1K20

    如何在Ubuntu 18.04上使用PostgreSQL 10设置逻辑复制

    取消注释,并将其更改为将PostgreSQL 预写日志(WAL)级别设置为logical。...这会增加日志中的条目量,添加必要的信息以提取差异或更改特定数据集: ... wal_level = logical ... 此日志上的条目将由副本服务器使用,允许从主服务器复制高级写入操作。...to any port 5432 最后,重新启动PostgreSQL服务器以使更改生效: sudo systemctl restart postgresql 将配置设置为允许逻辑复制后,您现在可以继续创建数据库...在db-master上,您将创建一个发布my_publication,它将作为将发送给您的订阅者的数据的主副本- 在我们的示例中为db-replica。...Log级别配置不正确(必须设置为logical); db-master未配置为接受来自正确的db-replica专用IP地址的传入连接; 像UFW这样的防火墙阻塞了端口5432上传入的PostgreSQL

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    【DB宝93】PG审计插件之pgaudit

    请谨慎确定要在您的环境中记录哪些审核内容,以避免过多记录,可以根据需要开启审计,关闭审计设置pgaudit.log=’none’,并重新加载即可。...设置pgaudit.role为auditor,并授予account表的SELECT和DELETE权限。...禁用此设置将减少psql和PgAdmin等工具在日志中大量查询catalog的噪音。 默认值为 on. pgaudit.log_client 指定日志消息是否对客户端进程(如 psql)可见。...默认值为打开。 pgaudit.log_statement_once 指定日志记录是包含带有语句/子语句组合的第一个日志条目的语句文本和参数,还是包含每个条目。...禁用此设置将减少冗长的日志记录,但可能会使确定生成日志条目的语句变得更加困难,尽管语句/子语句对以及进程id应该足以识别与前一个条目一起记录的语句文本。

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    Navicat 面向 PostgreSQL 查询超时的工具解决方案

    在PostgreSQL 等专业级数据库中,可以通过设置 statement_timeout 变量来限制整个数据库甚至每个用户的查询执行时间。...下面,我们将学习如何在 Navicat 16 for PostgreSQL 中运用这个重要的数据库变量。...以下是将值设置为 60 秒的语句: ALTER DATABASE mydatabase SET statement_timeout = ‘60s’; 在 Navicat 16 for PostgreSQL...中,我们可以选择主菜单中的“工具”>“服务器监控”>“PostgreSQL”以查看 statement_timeout 变量。...当然,如果你想直接 show 语句,也可以在 Navicat 轻松实现: 为特定用户设置查询超时 为了更精确地控制,我们可以为特定用户设置查询超时值(总是会有人选择整个数据库…)。

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    解读年度数据库PostgreSQL:如何巧妙地实现缓冲区管理器

    请注意,术语“缓冲区描述符层”只是在本章中为方便起见而使用的术语。缓冲池层是一个数组。每个槽都存储一个数据文件页,数组槽的索引称为buffer_id。缓冲区管理器的三层结构如图1所示。 ?...获取相应散列桶槽分区上的BufMappingLock共享锁。 查找标签为'Tag_C'的条目,并从条目中获取buffer_id。本例中buffer_id为2。...第二,将相应描述符的IO_IN_PROGRESS标记位设置为1,以防其他进程访问。 第三,将所需的页面数据从存储加载到缓冲池插槽中。...第四,更改相应描述符的状态,将IO_IN_PROGRESS标记位设置为"0",且VALID标记位设置为"1"。 第五,释放io_in_progress_lock。...第五,更改相应描述符的状态;将IO_IN_PROCESS位设置为"0",将VALID位设置为"1"。 第六,释放io_in_progress_lock和content_lock。

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    解读年度数据库PostgreSQL:如何巧妙地实现缓冲区管理器

    请注意,术语“缓冲区描述符层”只是在本章中为方便起见而使用的术语。缓冲池层是一个数组。每个槽都存储一个数据文件页,数组槽的索引称为buffer_id。缓冲区管理器的三层结构如图1所示。 ?...获取相应散列桶槽分区上的BufMappingLock共享锁。 查找标签为'Tag_C'的条目,并从条目中获取buffer_id。本例中buffer_id为2。...第二,将相应描述符的IO_IN_PROGRESS标记位设置为1,以防其他进程访问。 第三,将所需的页面数据从存储加载到缓冲池插槽中。...第四,更改相应描述符的状态,将IO_IN_PROGRESS标记位设置为"0",且VALID标记位设置为"1"。 第五,释放io_in_progress_lock。...第五,更改相应描述符的状态;将IO_IN_PROCESS位设置为"0",将VALID位设置为"1"。 第六,释放io_in_progress_lock和content_lock。

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    缓冲区管理器:解读年度数据库PostgreSQL

    请注意,术语“缓冲区描述符层”只是在本章中为方便起见而使用的术语。缓冲池层是一个数组。每个槽都存储一个数据文件页,数组槽的索引称为buffer_id。缓冲区管理器的三层结构如图1所示。 ?...获取相应散列桶槽分区上的BufMappingLock共享锁。 查找标签为'Tag_C'的条目,并从条目中获取buffer_id。本例中buffer_id为2。...第二,将相应描述符的IO_IN_PROGRESS标记位设置为1,以防其他进程访问。 第三,将所需的页面数据从存储加载到缓冲池插槽中。...第四,更改相应描述符的状态,将IO_IN_PROGRESS标记位设置为"0",且VALID标记位设置为"1"。 第五,释放io_in_progress_lock。...第五,更改相应描述符的状态;将IO_IN_PROCESS位设置为"0",将VALID位设置为"1"。 第六,释放io_in_progress_lock和content_lock。

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    解读年度数据库PostgreSQL:如何巧妙地实现缓冲区管理器

    请注意,术语“缓冲区描述符层”只是在本章中为方便起见而使用的术语。缓冲池层是一个数组。每个槽都存储一个数据文件页,数组槽的索引称为buffer_id。缓冲区管理器的三层结构如图1所示。...获取相应散列桶槽分区上的BufMappingLock共享锁。     3. 查找标签为'Tag_C'的条目,并从条目中获取buffer_id。本例中buffer_id为2。     4....第二,将相应描述符的IO_IN_PROGRESS标记位设置为1,以防其他进程访问。     第三,将所需的页面数据从存储加载到缓冲池插槽中。    ...第四,更改相应描述符的状态,将IO_IN_PROGRESS标记位设置为"0",且VALID标记位设置为"1"。     第五,释放io_in_progress_lock。...第五,更改相应描述符的状态;将IO_IN_PROCESS位设置为"0",将VALID位设置为"1"。

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    PostgreSQL技术大讲堂 - 第23讲:缓冲区管理器

    函数将buffer_tags映射到插槽,插槽中记录了buffer_tags和描述层的buffer_id的映射关系。...· 第三层(Buffer Pool)     缓冲池是存储数据文件页(如表和索引)的简单数组。缓冲池数组的索引称为buffer_ids。     缓冲池被分割成大小为8 KB的插槽,等于页面大小。...在缓冲区表中搜索条目时,后端进程保存共享的BufMappingLock。当插入或删除条目时,后端进程持有独占锁。...下面显示如何将脏位设置为“1”:     1、获取缓冲区描述符的自旋锁。     2、使用按位操作将脏位设置为“1”。     3、松开旋转锁。...在设置这个参数时,还应该考虑PostgreSQL的共享缓冲区以及将被用于PostgreSQL数据文件的内核磁盘缓冲区。默认值是4GB。

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    重磅 | 十年来扩展PostgreSQL的一些经验和教训

    由于PostgreSQL的MVCC方法,不能简单地删除或更新索引条目。还必须添加新的索引条目。这带来了与表膨胀相同的挑战—随着行的更新和删除,无效索引条目会随着时间的推移而累积。...在正常的PostgreSQL操作中,被更新删除或过时的元组不会从表中物理删除。它们将保持存在,直到完成VACUUM。因此,有必要定期进行VACUUM,尤其是在频繁更新的表上。...4 模式优化 我将介绍的第一个优化解决如何避免由数据保留策略引起的膨胀。使用PostgreSQL表分区,您可以将一个表变成多个表,并且在您的应用程序中仍然只有一个表的外观。...有两种升级方法可为服务可用性提供不同的余量。第一个选项是pg_upgrade。该工具将数据库从旧格式重写为新格式。它要求数据库在升级过程中处于脱机状态。...可以使用逻辑复制的原因是,对更改进行了解码和应用,就像将SQL语句流发送到副本一样(而不是简单地将页面更改写入磁盘)。 从高层次看,该过程看起来像: 使用升级的PostgreSQL版本设置新服务器。

    1.6K20

    PostgreSQL 索引类型详解

    GIN 索引: 适用场景:全文搜索、数组包含查询、JSONB 数据类型查询。 特点:支持对复杂查询条件的优化,如使用数组和 JSONB 类型的数据。...Partial 索引: 适用场景:对表中特定子集数据的查询优化。 特点:只对表中满足条件的行建立索引,节省存储空间和提高查询性能。...对于多列索引,等式约束应用于前导列,并且在第一个没有等式约束的列上应用不等式约束,这些约束将限制扫描索引的部分。...显然,具有非默认排序顺序的索引是一种相对特殊的功能,但有时它们可以为某些查询带来巨大的性能提升。是否值得维护这样的索引取决于查询中需要特定排序顺序的频率。...自动创建唯一索引: 当为表定义唯一约束或主键时,PostgreSQL 会自动创建唯一索引。该索引覆盖构成主键或唯一约束的列(如果适用,会创建多列索引),并用于实施约束。

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    CynosDB for PostgreSQL 架构浅析

    安全性: CynosDB在腾讯云 VPC 中运行,将数据库隔离在用户的虚拟网络中,并使用行业标准加密 IPsec V** 与用户本地 IT 基础设施连接,可以配置防火墙设置并控制对数据库实例的网络访问,...,设置 io_in_progress 位 为 '1', 而 valid 位为 0,通过XLogFlush() 把 WAL 缓存中的WAL 数据 进行 翻译 转换成 CynosDB 的SLOG(Segemnt...获取包含旧数据条目的 BufMappingLock 的分区,并设置为排他模式。 获取新数据条目的 BufMappingLock 的分区,并插入新数据条目(TAG_H, id=5)到缓存表。...从 存储服务 加载 数据页 到 缓存池中 对应的slot中,更新 该slot对应的缓存描述符 相关标志信息flags,设置 dirty bit 为0,并初始化其它 bit。...在PostgreSQL数据库中 XLOG 或 WAL 日志为 事务日志。

    5.6K221

    PostgreSQL中的查询简介

    PostgreSQL,通常缩写为“Postgres”,是一种具有面向对象方法的关系数据库管理系统,这意味着信息可以表示为PostgreSQL模式中的对象或类。...但是,它是专门为运行PostgreSQL的Ubuntu 18.04服务器编写的。要进行此设置,您需要以下内容: 具有sudo权限的非root用户的Ubuntu 18.04计算机。...有关设置的帮助,请按照我们的指南“ 如何在Ubuntu 18.04上安装和使用PostgreSQL ”中的“安装PostgreSQL”部分进行操作。 有了这个设置,我们就可以开始教程了。...如果您尝试在表中查找特定条目,但不确定该条目是什么,则这些条目很有用。为了说明,让我们说你已经忘记了几个朋友最喜欢的主菜,但你确定这个特别的主菜以“t”开头。...(在本例中为tourneys),即使它在右表中没有相应的记录。

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