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从PBS作业调用python脚本
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如何从pbs作业调用python脚本运行？更多细节:我目前正在处理以下形状的pbs文件(此部分工作正常，不应更改)：#PBS -N # work name #PBS -l #PBS -m cd $PBS_O_WORKD
浏览 22提问于2017-08-10得票数 1
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我正在尝试创建一个脚本来创建脚本(并做其他事情)。我的问题是，创建的这些脚本包含环境变量，当实际运行我的脚本时，它们不会出现在脚本中。for i in {001..116} rm job#PBS -N $i-Fe63S#P
浏览 2提问于2017-08-04得票数 0
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我正在尝试弄清楚如何让我的PBS脚本突出显示在bash格式的vim。PBS脚本只是bash脚本，它不是以clasic shebang开头，而是在集群计算机上的排队系统上使用。下面是一个简单的PBS脚本示例。####Parameterized PBS Script #####PBS -l walltime=0
浏览 1提问于2012-04-05得票数 2
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我有一个处理多个环境变量的PBS脚本。PBS是bash的包装器，它将bash脚本发送到作业调度队列。处理后的变量形成一个运行的命令。用bash编写PBS脚本，并在bash注释中为作业调度程序提供附加信息。
如何以编程方式确定我的脚本是由qsub (解释PBS脚本的命令)调用的，还是由bash调用的？如果脚本是在bash<
浏览 4提问于2014-06-02得票数 2
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链式数组PBS作业
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我试图使用PBS高性能计算机作业调度程序链接两个计算作业。我的脚本如下： #!/bin/bash #PBS -q thin #PBS -l select=1:ncpus=1 #/bin/bash
#PBS -N 2
浏览 4提问于2017-06-28得票数 0
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我有多个R脚本可读(最多3，即tr1.R，tr2.R，tr3.R)。下面给出了读取单个脚本的bash脚本#PBS -l nodes=1:ppn=10,walltime=00:05:00#PBS -m eRscript ~/tr1/bin/bash
#PBS -l nodes=
浏览 0提问于2021-05-23得票数 0
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我正在编写一个BASH脚本，并使用bash命令。下列哪一项是正确的(或者都是不正确的)？或
bash \$pbs_dir/\${module_name}.\${target_ID}.\${instance_ID}.pbs
浏览 2提问于2016-06-15得票数 4
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我经常使用类似下面的简化的2脚本来在集群中分发令人尴尬的并行工作，并使用PBS/MPI。我想知道这些命令是否可以合并到一个文件中，以便清晰和减少杂乱。我更感兴趣的是理解bash/mpirun的局限性，而不是寻找解决原始问题的替代方法，比如PBS数组。PBS脚本：#PBS -q debug
mpirun -n $PBS_NP $
浏览 0提问于2014-06-23得票数 1
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/bin/bash#PBS -lnodes=1:ppn=8echo $PBS_O_WORKDIRecho $PBS_O_WORKDIR行返回一个空行。cd $PBS_O_WORKDIR返回主目录，而不是启动命令的目录。
浏览 9提问于2022-01-31得票数 0
我正在用C++进行批处理，想知道是否可以在PBS脚本文件中定义一个.cpp文件名(见下文)。我希望能够有两个脚本文件(都类似于下面的文件)：一个指定我希望使用func_parallel.cpp，另一个指定我希望使用func_serial.cpp，而不必在代码中手动执行此操作。脚本文件：#PBS -l walltime=00:10:00
#PB
浏览 0提问于2014-07-24得票数 0
我以为文件格式是Windows脚本，但下面是Unix脚本，不是吗？那么这个文件和一个.sh文件有什么区别呢？#PBS -l mem=900mb,walltime=25000:00:00,cput=25000:00:00,nodes=1:ppn=1
.
浏览 0提问于2021-02-01得票数 1
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如何同时提交多份R工作？
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我有一个R脚本，它运行多个文件，比如file=1到50。我通常提交重复的工作，例如5次，每次10个文件，通过改变R-脚本中的数字。那么，我怎样才能一次提交5份工作而不提交5次呢？示例bash代码：#PBS -o default.out
#PBS -e errorfile
浏览 0提问于2021-05-22得票数 1
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对于使用qsub调用的PBS脚本，我想知道实际分配了多少CPU总量，以防PBS文件中定义的数字被命令行的输入覆盖。例如，使用以下pbs脚本文件：#!/bin/bash#PBS -l nodes=32#PBS -j oe
#PBS -q nor
浏览 3提问于2013-07-23得票数 4
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我正在使用PBS，HPC提交串行编写的C代码。我必须在5个不同的目录中运行5个代码。当我选择一个节点和5个核心时，select=1:ncpus=5，使用./submit &提交它。
浏览 0提问于2018-12-18得票数 1
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我有以下脚本，它尝试将作业提交到PBS队列。format(qscript,inpfile,dir))
subprocess.Popen(["qsub",qscript],cwd=dir)dude@machine$ python submit01.py 编辑:脚本编辑器/bin/ba
浏览 1提问于2016-10-25得票数 0
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我使用torque提交blow所示的测试脚本#PBS -N test#PBS -q ser#PBS -S /bin/bash
sed 's/a//' <<< aaabbbaaa
浏览 14提问于2017-12-04得票数 2
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我需要发送PBS作业的名称作为工作目录中的最后一个文件夹。我应用下面这行代码： #PBS -N (eval "${PWD##*/}") 但这似乎是一个不正确的选择。
浏览 28提问于2020-08-19得票数 0
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/bin/bash#PBS -S /bin/bash#PBS NODE_NUM="1"#PBS HOURS="24"
#PBS MINU
浏览 6提问于2015-02-16得票数 0
我只是忘记了我为一个已经结束的作业请求了多少内存。对我来说，我请求的内存似乎不够。我通过qsub -l h_vmem=?G请求了内存。有什么方法可以找到它(SGE调度器)吗？提前谢谢你。
浏览 5提问于2018-04-09得票数 1
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我正在尝试在集群中运行matlab脚本(ga_opt_main.m)。我必须编写一个作业提交文件，它本质上只是一个shell脚本。但是我从来没有写过shell脚本，下面就是我写的 #PBS -q *queuename* #PBS -l walltime=02:00:00 <e
浏览 0提问于2012-08-04得票数 3
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