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ORCA做结构优化及轨迹查看

ORCA做结构优化的关键词非常简单,与Gaussian类似,直接写上opt即可,同样也可以使用opt freq的组合,在优化完结构之后进行频率计算。示例如下: !...ORCA没有官方的可视化程序可以观看优化轨迹。...其操作非常简单,只需将ORCA的输出文件拖入OfakeG打开后的界面,即可生成一个fake的Gaussian输出文件,具体介绍可参看卢老师的帖子: http://sobereva.com/498 ORCA...的结构优化功能并没有高斯强大,但是ORCA在RI近似方面却比高斯做得要好,对于大体系,在ORCA中使用纯泛函加RI近似,计算速度是非常快的。...可以将ORCA的能量和力传给Gaussian进行结构优化,具体可参看《使用external关键词将其他程序与高斯对接进行结构优化、IRC分析等计算》一文。

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    ORCA做DLPNO-CCSD(T)计算

    在我们平时的计算中,需要用高精度方法的电子能量时,如果体系较大,无法做标准CCSD(T)计算,可以考虑使用ORCA的DLPNO-CCSD(T)方法。 在J. Chem....ORCA中DLPNO-CCSD(T)的输入文件书写很简单: %pal nprocs 16 end !...如果体系很大,也可以配合ORCA的RIJK或RIJCOSX近似来加快Hartree-Fock计算,此时的关键词分别为: !...而不使用SC近似,对(T)部分进行迭代求解,这部分功能在ORCA中应该写为DLPNO-CCSD(T1),这样结果与标准CCSD(T)更为接近。在J. Chem....注意:似乎ORCA无法设置临时文件存放的目录,实际运行中临时文件产生在工作目录,因此,为了获得更好的性能,建议将DLPNO-CCSD(T)作业放到高速硬盘上提交。

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    利用MOKIT从ORCA向其他量化程序传轨道

    本文介绍如何使用MOKIT从ORCA向其他量化程序传轨道,有以下可能的用途: (1)在ORCA中进行了RIJK或RIJCOSX加速的大体系HF/DFT计算,想传轨道给其他程序进行后续计算,或想产生fch...用ORCA算完后运行orca_2mkl h2o -mkl转化生成h2o.mkl文件,下面我们以该文件为例展示如何传轨道,读者若使用本文功能,请务必顺带阅读文末注意事项。 1....对于ORCA产生的.mp2nat,.mdci.nat和.nbo这些实际上是gbw格式的文件,转化成mkl文件前除了修改文件名外,还有一种办法 orca_2mkl h2o.mp2nat h2o_mp2no.mkl...mkl文件有个缺点是不含赝势信息,笔者曾在ORCA官方论坛上发帖建议未来ORCA在mkl文件中增加赝势信息,但ORCA开发者表示目前没兴趣。...我们用ZnMe2_o.inp文件在ORCA中做目标计算,最后把轨道传回已存在的fch文件 orca_2mkl ZnMe2_o -mkl # 假设ZnMe2_o.gbw已被更新,重新产生mkl cp

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    Orca: A Modular Query Optimizer Architecture for Big Data(翻译)

    在第3节中,我们介绍了Orca的架构并描述了其组件。第4节介绍了查询优化的工作流程。第5节描述了Orca与后端数据库系统之间如何交换元数据。...ORCA 架构 Orca是Pivotal数据管理产品(包括GPDB和HAWQ)的新查询优化器。Orca是基于Cascades优化框架[13]的现代自顶向下查询优化器。...DXL的一个主要优点是将Orca打包为一个独立的产品。图片图2显示了Orca与外部数据库系统之间的交互。Orca的输入是一个DXL查询。Orca的输出是一个DXL计划。...这些转换器的实现完全在Orca之外进行,这使得多个系统可以通过提供适当的转换器来使用Orca。图片Orca的架构具有高度的可扩展性;所有组件都可以单独替换并单独配置。图3显示了Orca的不同组件。...图片图12 显示了Orca相对于Planner在所有查询中的性能提升速度,超过1的速度提升比例表示Orca的性能改进。我们观察到,对于80%的查询,Orca能够生成类似或更好的查询计划。

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    ORCA计算旋轨耦合矩阵元

    在常见的量子化学程序中,能在TD-DFT级别下进行旋轨耦合计算的程序有ADF、BDF、Dalton和ORCA等。此外,用Gaussian结合PySOC程序也可以实现SOC的计算。...本文以ORCA 5.0.1为例介绍旋轨耦合矩阵元的计算。 二、计算实例1 体系一来自文献Chem. Sci., 2019, 10, 5031–5038一文中的mBrPhCz分子,分子结构如下: ?...在%tddft区域内设置TD-DFT计算的相关参数:nroots表示计算6个激发态;dosoc设为true表示计算旋轨耦合,并且此时会自动计算三重态;ORCA中TD-DFT默认使用TDA近似,此处将tda...对RI不了解的读者可阅读往期文章《在ORCA的SCF计算中使用RI近似》。...四、小结 本文简单介绍了用ORCA计算SOC矩阵元的方法,希望对大家的研究有帮助。目前不少论文中对ISC过程还仅仅是拿能量接近来说事,显然是不太够的,用SOC更有说服力。

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    ORCA教程:双杂化泛函的使用

    常见的量子化学程序多数支持双杂化泛函,而其中ORCA由于支持RI及DLPNO等近似,计算效率非常高。本文主要介绍ORCA中的双杂化泛函的使用,所用版本为ORCA 5.0.2。...二、几何结构优化 ORCA中支持双杂化泛函的解析梯度,且对于DLPNO版本也支持,因此可以用双杂化泛函做几何结构优化。在ORCA中,有不少双杂化泛函不支持解析梯度,例如上述PWPB95泛函。...而双杂化泛函解析频率计算,在ORCA 5.0.2中还不支持,因此无法使用opt freq组合在优化完结构后进行频率计算。...几何结构优化的结果解读,可参考《用ORCA做结构优化及轨迹查看》一文。...除了这三种类型的计算外,在ORCA中还可以使用双杂化泛函进行其他类型的计算,如NMR性质的计算,具体可参阅手册。

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    PyVibMS更新:支持ORCA、xtb、Q-Chem输出

    题中所述三种程序是比较流行的量子化学计算程序,笔者近期对PyVibMS插件进行了改进,使它能够原生支持ORCA、xtb和Q-Chem程序计算得到的振动分析输出。...下面就ORCA、xtb和Q-Chem这三种量子化学计算程序,演示如何用PyVibMS显示分子振动。 1....ORCA 4 打开一个干净的PyMOL窗口,开启PyVibMS插件窗口后,在输入文件处选定 examples/ORCA/h2o/h2o.hess,在弹出的对话框内将文件类型调成 ORCA Hess File...ORCA产生的 .hess文件并非ORCA计算的主输出文件,它是振动分析产生的额外输出文件。 目前支持ORCA 4及以上的版本,但需要注意的是ORCA在处理多原子直线分子时似乎有个错误。...例如对于二氧化碳分子(examples/ORCA/co2),ORCA只给出了3个振动而实际为4个。

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    ORCA中获取Gaussian格式的重收缩def2系列基组文件

    该基组为ORCA内置,目前BSE基组库上没有。最近在MOKIT中加入了小程序mkl2gjf,可以将基组数据导出。...(2)若你不将高斯与ORCA严格对比,高斯中无需写nosymm, nobasistransform和iop(3/93=1),ORCA中无需写VeryTightSCF, Thresh和Tcut。...首先创建ORCA输入文件DKH-def2-SVP.inp,包含H-Kr元素,坐标任意: %maxcore 2000 !...注意2:此为ORCA内置基组,本人只是转化了格式,仅能保证转化正确,而不对该基组的正确性、精度等问题负责。...编程爱好者可尝试:完成此事不止一种做法,也可以在ORCA输入文件里加PrintBasis关键词然后从ORCA输出文件中读取、转化基组格式,这样不用做un-normalized处理,比处理mkl里的基组数据还简单

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    《量子化学软件基础》习题(8)

    分别使用BDF和ORCA计算REF1中胞嘧啶所有态的FIC-NEVPT2能量,比较结果。 3. 分别使用BDF和ORCA计算REF1中胞嘧啶所有态的FIC-MRCISD能量,比较结果。 解答: 1....需要注意,不论是ORCA还是BDF,对于不同对称性的态,NEVPT2是分块计算的。...② 为使ORCA和BDF的NEVPT2计算结果能够对照,注意正确设置冻芯近似:ORCA是默认设定冻芯近似而BDF不默认设置,若都想设置冻芯近似,可在后者输入文件的TraInt模块里加入关键字Frozen...③ 使用BDF和ORCA计算得到的单点能结果略有差别。...目前ORCA中的FIC-NEVPT2尚不支持这种canonstep的设置。 3. 分别使用BDF和ORCA中的FIC-MRCI方法重复上述计算,比较结果。

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    解释微调+130亿参数Orca:推理能力打平ChatGPT

    能力差距 虽然GPT-4的参数量没有公开,但130亿参数的Orca肯定比GPT-4要小很多倍,而ChatGPT和Orca之间的能力差距更小,更适合作为中间教师,并且这种方式已经被证明可以提高更小的学生模型在知识蒸馏中的模仿学习性能...实验部分 研究人员主要验证了Orca在推理上的能力。...虽然Orca与Text-da-Vinci-003的表现相当,但仍然比ChatGPT低5分,Orca在与数学有关的任务(在SAT、GRE、GMAT中)上与ChatGPT表现出较大的差距。...Orca的性能根据系统信息的类型有很大的不同,对于训练的模型来说,空的系统消息往往效果很好。...Orca在不同任务的325个样本中超越了ChatGPT(Orca-beats-ChatGPT例子),其中大部分来自LogiQA(29%),而其他LSAT任务和SAT-英语任务各占不到10% 在Big-Bench

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    AWS Glue漏洞可以让其他人接管云服务:凸显公共云的信任风险

    Orca的研究人员可以在与Glue服务有信任关系的其他AWS客户帐户中担任角色。Orca坚持认为,每个使用Glue服务的帐户至少有一个信任Glue服务的角色。...Orca Security在第二份公告中表示,该漏洞是XML外部实体(XXE)问题,可能允许攻击突破隔离不同AWS用户的保护措施。...Orca的Alon表示,云提供商应努力改善服务的隔离机制,以防止攻击者利用核心服务中的漏洞来危及整个云的安全模型。...Orca发现,在问题披露出来两周后,四分之三的客户仍然容易受到Log4j漏洞的攻击。...Orca Security在去年9月和10月发现了问题。他们使用假帐户来测试漏洞,防止研究人员泄露其他AWS客户的数据。亚马逊已修复了漏洞,补丁已经过Orca的测试,以确保补丁切实有效。

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    微软也搞起了开源小模型!利用OpenAI的ChatGPT和GPT-4 训练,实力碾压当前最强开源模型

    Orca 的研究人员意识到了这个问题,并努力做出了改进。在 Big-Bench Hard 上使用零样本提示的性能测试中,括号内的 2900% 代表 Orca 相对 Vicuna 的改进程度。...Orca 在因果判断任务上表现出色,性能与 GPT-4 相当,同时超过 ChatGPT 4.7%。在检测翻译错误上,Orca 和 ChatGPT 水平差不多。...Vicuna 自然也不在话下,但 Orca 的得分比其高出 24.3%。...Orca 的研究人员主要采取了以下两项重要创新举措: 1....解释性训练 在 Orca 之前,Vicuna 和 Alpaca 等模型只能从 GPT-4 等模型中采样简单的{用户指令,回答}查询来进行蒸馏,借此训练新模型模仿自己的老师: 但在 Orca 这边,研发思路发生了巨大转变

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