5.13 绘制散点图矩阵 第六章描述数据分布 6.1 绘制基本直方图 6.2 基于分组数据绘制多组直方图 6.3 绘制密度曲线 6.4 基于分组数据绘制多组密度曲线 6.5 绘制频数分布折线图 6.6...,'=100')) #指定具有颜色和填充色的点形以及包含NA的填充色 ggplot(hw,aes(x=ageYear,y=heightIn,shape=sex,fill=weightgroup...#这里可以调整回归的参数如颜色等。...Q：如何绘制核密度估计曲线？...Q：如何基于分组数据绘制多组密度曲线？
不同类型拟合曲线的绘制 3.1 loess数据平滑曲线 局部加权回归（Locally Weighted Scatterplot Smoothing，LOESS）主要思想是取一定比例的局部数据，在这部分子集中拟合多项式回归曲线...ggplot2绘制时，使用geom_point绘制散点图，geom_smooth加入拟合曲线，method选择为loess,se=TRUE表示加入置信带，span控制loess平滑的平滑量，较小的数字产生波动线...，根据ggplot的思想不断叠加图层。...4.2 非线性拟合 非线性拟合绘制残差图与线性拟合类似，唯一不同的点在：利用lm函数拟合不同的回归模型，以下使用了公式： ，后面的绘制与上面相同。...这两个图采用黑色到红色渐变颜色和气泡面积大小两个视觉暗示对应残差的绝对值大小，用于实际数据点的表示；而拟合数据点则用小空心圆圈表示，并放置在灰色的拟合曲线上。用直线连接实际数据点和拟合数据点。
图形展示 图形解读 ❝此图使用经典的企鹅数据集进行展示，在散点图的基础上按照分组添加拟合曲线及回归方程与R,P值，后使用ggExtra添加密度曲线与数据分布直方图，使用已有R包进行绘制非常的方便，此图大概有以下几点注意事项...❞ 1.拟合曲线的添加 ❝拟合曲线的添加在R中常用的大概有两个函数geom_smooth与ggmpisc::stat_poly_line。两者均可用于在R图形中添加平滑线或拟合线，需要选择正确的模型。...它允许指定多项式的阶数，即回归方程中最高次项的次数。可直接在图形上添加拟合线，而不是基于数据点的平滑。 geom_smooth是一个更通用的函数，用于在 ggplot2 图形中添加平滑曲线或拟合线。...它可以自动选择平滑参数，还可以显示拟合线周围的置信区间。 回归方程的添加 ❝stat_poly_eq:用于添加多项式回归方程和相关统计量(如 R2、p 值等)的标签。...「高分论文的图表分析复现以及一些个性化图表的绘制」均包含数据+代码；按照往年数据小编年产出约在150+以上 ❞
绘制密度图的方法： plot(density(x)) 其中的x是一个数量型向量，由于plot()函数会创建一副新的图形，要向一幅已经存在的图形上叠加密度曲线，可使用lines()函数： >par(mfrow...箱线图 箱线图（又称为盒须图）通过绘制连续型变量的五数总括，即最小数、下四分位数、中位数（第50百分数）、上四分位数（第75百分数）以及最大值，描述了连续型变量的分布。...还可以通过多个分组因子绘制箱线图，不同缸数和不同变速箱类型的车型绘制了每加仑汽油行驶英里数的箱线图： > mtcars > mtcars > boxplot(mpg~am.f*cyl.f,data=mtcars...ggplot绘制箱线图和小提琴图 简单箱线图 >install.packages("ggplot") >library(ggplot2) > p ggplot(mpg, aes(class,hwy...一个字符型向量(color)被添加到到了数据框 x中，根据cyl的值，它所含的值为"red"、"blue"或"darkgreen“，此外，各数据点的标签取自数据框的行名（车辆型号），数据点根据气缸数量进行分组
小提琴图是通过使用密度曲线描述一组或多组的数值数据分布。每条曲线的宽度对应于各区域数据点的近似频率。...通常密度会随附一种叠加的图表类型，如箱形图，以提供一些其他的数据信息，即矩形上下边框代表第一个和第三个四分位数，中间点是中位数。 小提琴图可以用来观察数据的分布情况，也可用于比较多个组之间的分布。...每个组的密度曲线的波峰、谷线和尾部可以进行比较，以确定哪些组是相似的，哪些组是不同的。...legend.position="none" #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法...，小提琴图都是个不错的选择，而且简单易绘制，大家可以借鉴哦~
#使用diamonds的数据子集作为绘图数据，克拉(carat)数为X轴变量，价格(price)为Y轴变量。...数据与映射部分介绍了ggplot函数执行各种属性映射，只需要添加不同的几何对象图层，即可绘制出相应的图形。...箱式图 箱线图通过绘制观测数据的五数总括，即最小值、下四分位数、中位数、上四分位数以及最大值，描述了变量值的分布情况。...#添加默认曲线 #method 表示指定平滑曲线的统计函数，如lm线性回归, glm广义线性回归, loess多项式回归, gam广义相加模型(mgcv包), rlm稳健回归(MASS包) ggplot...#formula 表示指定平滑曲线的方程，如 y~x, y~poly(x, 2), y~log(2) ，需要与method参数搭配使用 ggplot(mpg, aes(displ, hwy)) +geom_point
、形状或大小等图形属性的一个映射，其中还可能包含对数据进行统计变换（如求均值或方差），最后将这个映射绘制在一定的坐标系中就得到了我们需要的图形。...图中可能还有分组，就是生成关于数据的不同子集的图形。..., geom=c('point','smooth')) 若不想绘制置信区间，则可以设置se=FALSE： 而关于拟合曲线的形式，可以通过method参数自行确定，比如我们希望拟合出一条线性曲线，...，每一个属性都需要由标度x，y来驱动，才能实现从指定数据——指定图层的映射，对应的，colour，shape等参数，也是由标度进行控制，再映射到对应图层上的对应样式颜色的变换，而ggplot2有一个特性...中创建了基础的数据映射之后，又接连添加了两个图层，第一个图层绘制出以因子转化后的cyl为shape的散点图，第二个图层绘制出以因子转化后的cyl为colour的光滑拟合曲线，这时summary我们的p也可以观察到分图层的各图层信息
在ggplot2中，图层可以包括几何对象（如点、线、面等），统计变换，数据映射等。 比例（scales）： 定义了图形的比例尺，例如x轴和y轴的取值范围和断点。...分面（facet）： 表示图形是否使用了分面，分面可以将数据的子集并排或堆叠显示。 环境（environment）： 存储了图形的计算环境，可能包含用于计算图形的变量和函数。...常用参数 除了导入结果数据的object以及需要绘制的features基因集，还可以修改颜色和点的大小和透明度： cols：用于绘制不同类别的小提琴图的颜色。...pt.size：图中代表单个细胞数据点的大小。 alpha：数据点的透明度。 选择需要展示的细胞群组以及分组信息： idents：指定要在图中包括哪些细胞群组（例如，细胞类型）。...split.plot：控制是为分割的每个组绘制多个还是单个小提琴形状。 stack：是否水平堆叠每个特征的图表。 combine：是否将图表组合成一个单一的patchworked ggplot对象。
car包中的scatterplot()函数增强了散点图的许多功能，它可以很方便地绘制散点图，并 能添加拟合曲线、边界箱线图和置信椭圆，还可以按子集绘图和交互式地识别点。...scatterplotMatrix()函数的另一个用法 > library(car)#主对角线的核密度曲线改成了直方图，并且直方图是以各车的气缸数为条件绘制的。...主对角线的核密度曲线改成了直方图，并且直方图是以各车的气缸数为条件绘制的。图形包含主对角线中的直方图以及其他部分的线性和平滑拟合曲线。...另外，子群（根据气缸数）通过符号类型和颜色来区分标注默认地，回归直线拟合整个样本，包含选项by.groups = TRUE将可依据各子集分别生成拟 合曲线。...该函数可以在指定的(x, y)坐标上绘制圆圈图、方形 图、星形图、温度计图和箱线图。
由于ggplot2中的geom_line()函数只能绘制折线图，需要用到ggalt提供的geom_xspline()函数绘制光滑的曲线图 geom_line 将所有点连接起来，是折线图但不平滑 geom_smooth.../stat_smooth一条平滑的线,但他是拟合曲线，不会遍历所有数据点 实现遍历所有点的光滑曲线需要用到插值原理 一个更好的选择是使用插值splines.这也是一个使用多项式的插值,但不是只使用一个(...如你所尝试的),它使用很多.它们被强制执行以使曲线连续的方式遍历所有数据点....函数获得一系列插值点后用geom_line()绘制的曲线明显光滑了 spline_int <- as.data.frame(spline(mydata$x, mydata$y)) ggplot(spline_int...axis.text = element_text(size=10,face="plain",color="black") ) image.png也可以直接用geom_xspline()函数 绘制填充面积的曲线图
car包中的scatterplot()函数增强了散点图的许多功能，它可以很方便地绘制散点图，并能添加拟合曲线、边界箱线图和置信椭圆，还可以按子集绘图和交互式地识别点。...重要参数： formula # 模型公式；类似y~x，如果按组绘制，则类似y~x|z，其中z为分组变量； data # 为模型公式中变量来源的数据集； subset # 指定筛选数据子集； x, y #...分别表示水平（x轴）和垂直（y轴）坐标的数字向量； boxplots # 如为x，则在下方绘制水平x轴的边界箱线图；如为y，则在左边绘制垂直y轴的边界箱线图； # 如为xy，则在水平和垂直轴上都绘制边界箱线图...；设置""或FALSE则不绘制边界箱线图； regLine # 默认添加拟合回归线；如为FALSE，则不添加； # 指定lm()函数拟合回归线，默认参数为regLine=list(method=lm,...等； col # 未分组时，直接指定绘制颜色；分组时，设置参数长度应等于组数的颜色向量； pch # 点的绘图符号；分组时默认按顺序使用字符； library(car) scatterplot(Volume
该图显示了集合中的 12 辆汽车： 背景中的气缸。4、6 和 8 缸的浅色、中色和深色。 用蓝色标出每辆车每加仑的里数。 这篇文章是逐步展示如何将所需的元素添加到圆形图中。...add_rownames\[1:12,\] 绘制数据映射 为了映射我想绘制的任何列的值，我创建了函数。它基本上会检查您想要绘制多少个变量并为 x 和 y 值绘制正弦曲线。...lim <- max # 用自己的数据和美学来绘制每一层的图案 ggplot() + geom_polygon+ geom_point+ theme+ coord_equal 径向线...创建 x、xend、y 和yend 数据点以绘制其间的线段。...r % mutate r$xed <- 0 r$yed <- 0 #用自己的数据和美学来绘制每一层的图案 ggplot() + geom_segment +
今天我们给大家介绍一个绘制抖动散点图的R包ggbeeswarm，但是呢，如果真正多样化绘制还需要ggplot2的协助。...那么也就是我们需要两个包来完成我们抖动散点图的绘制：ggbeeswarm和ggplo2。具体安装我们不再赘述，ggplot2的使用可以参考我们前面的《R语言绘图之ggplot2》。...那么如何为两组数据增加颜色呢，具体实例如下： ggplot(mapping=aes(labs,dat))+geom_quasirandom(aes(color=labs)) ?...那我们如果需要对每一组数据设置子集，那么就用到了下面的程序： labs2子集的因子 ggplot(mapping=aes(labs,dat,color...当然抖动散点图不是所有的都会绘制出来很好看，这就需要我们自己去实践，下面是对不同个数样本的数据的绘制，到时候可以根据自己的数据选择是否适合，毕竟美观才是我们的目的。
那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装：install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离，数据相关的绘图与数据无关的绘图分离，并按图层作图。...3. ggplot2的函数介绍： ggplot2里的所有函数可以分为以下几类： 用于运算（我们在此不讲，如fortify_，mean_等） 初始化、展示绘图等命令（ggplot，plot，print等）...绘制密度图 stat_density2d 绘制二维密度图 stat_function 添加函数曲线 stat_hline 添加水平线 stat_identity 绘制原始数据，不进行统计变换 stat_qq...绘制Q-Q图 stat_quantile 连续的分位线 stat_smooth 添加平滑曲线 stat_spoke 绘制有方向的数据点（由x和y指定位置，angle指定角度） stat_sum 绘制不重复的取值之和
ggrepel 提供避免标签重叠的功能，特别适用于散点图和其他需要标记数据点的图形。...ggpubr:简化使用ggplot2生成的图形的美化和扩展功能 graph:ggraph在绘制数据结构（图形、网络、树、层次结构) cowplot 可以将多个ggplot2图形组合成一个布局，支持绘制漂亮的图形排版...ggh4x:定制刻面、多种色标和其他选项 ggbeeswarm 在较小的数据集中展示每个数据点的分布和密度。 survminer:利用ggplot2绘制生存曲线图。...ggforce 提供额外的几何对象和统计图层，例如箭头、曲线等，增强了ggplot2的绘图功能。 GGally 轻松地创建复杂的多变量图形和数据可视化。...gggenes:绘制基因组图谱,通过简单而灵活的方式来可视化基因组注释数据。 ggblend 用于混合、复制、调整、转换和合成 ggplot2 层的运算代数。
1 数据（Data）和映射（Mapping) 下面以一份钻石的数据为例，这份数据非常大，随机取一个子集来画图。...以克拉(carat)数为X轴变量，价格(price)为Y轴变量。...#geom_point()完成的就是几何对象的映射，ggplot2提供了各种几何对象映射，如geom_histogram用于直方图，geom_bar用于画柱状图，geom_boxplot用于画箱式图等等...(aes(x=price,fill=clarity)) #####colour参数指定的是曲线的颜色，而fill是往曲线下面填充颜色。...ggplot2提供了很多的geom_xxx函数，可以满足我们对各种图形绘制的需求。
本节分享一个小案例，如何使用ggplot2中的「stat_smooth」函数来快速绘制残差图。 ❝残差图是一种用于回归分析的图形工具，它显示了模型的预测值与实际观测值之间的差异，即残差。...残差是观测值与模型预测值之间的差值。 ❞ 「残差图的主要目的是：」 「检查线性回归模型的假设」：线性回归模型有几个关键的假设，如误差项的独立性、常数方差（同方差性）和误差项的正态性。...「检查模型的拟合情况」：如果残差图显示出某种模式或趋势，而不是随机分布的点，这可能意味着模型没有充分捕捉到数据中的某些信息或关系。...具体代码 # 使用mtcars数据集 mtcars %>% ggplot(aes(wt,mpg)) + geom_point() + # 添加散点图层，显示每辆车的重量和每加仑的英里数...geom_smooth() + # 基于wt和mpg的数据点拟合回归曲线 stat_smooth(geom="point",color="blue",xseq=mtcars$wt) + #
该数据集摘自 1974 年的美国《汽车趋势》杂志，包含 32 辆汽车的燃油消耗、设计和性能等方面的 11 个指标：mpg（耗油量）、cyl（气缸数）、disp（排量）、hp（总功率）、drat（后轴比）...直接运行 p 得到的只是一个空白的画布，还需要定义用什么样的图形来表示数据。 以 geom 开头的一系列函数用于指定图形元素，包括点、线、面、多边形等。...分面是将整个数据按照某一个或几个分类变量分成多个子集，然后用这些子集分别作图。例如，要将上图按照变量 am 的两个水平分别展示，可以使用下面的命令。绘图结果如下图所示。...接下来我们将探索用 ggplot2 包绘制常用统计图形的方法。 2.分布的特征 在探索数据的过程中，最基本的手段就是观察单个变量的取值情况。对于连续型变量，可以绘制直方图或密度曲线图。...另外，我们还可以用 ggplot2 绘制与上图相似的小提琴图，结果如下图所示。
在上述散点图中添加一条平滑曲线,通过method参数可以指定曲线拟合的方法，默认为method="loess"--平滑局部回归。参数span控制曲线的平滑程度，取值越大曲线越平滑。...aes( )来指变量，还可以指定其他分类变量，如颜色，形状，大小等。...=clarity))#定义的第一图层存储于p中 (2)几何对象 基本图层确定了数据源和映射后，通过加号(+)就可以不断地添加新图层.第二图层添加几何对象类的函数，在图中绘制图形元素其他类型的图形，如直方图...如点、线、多边形等，还可以用来绘制. ? 上面函数内部的基本参数都是一样的。...4.7图形保存 完成绘图后，最后一步是按照指定文件格式、属性保存和导出图形，以备以后使用。R绘制好的图可以保存成多种格式，对应的生成函数名即它的扩展名。
，如趋势、周期性等。...如果数据点沿对角线密集分布，说明该时间序列存在自相关性，点分布越集中则自相关性越强。如果数据点分散分布，则表明该序列是随机的，前值对后值没有预测作用。...季节子序列图 有些图形工具专门用于探究时间序列的季节性成分，如季节子序列图。 季节子序列图的绘制方法是:根据数据的季节周期，将整个序列分组，每组包含一个完整的季节周期。...我们可以利用分组密度图等可视化工具，来观察这些干扰事件对数据的影响。将数据按照干扰事件进行分组，每组对应一个不同的状态，然后分别绘制每组数据的密度曲线，从而比较不同状态下数据的分布差异。...滞后散点图: 将当前值与前若干滞后值绘制在散点图上，检验序列的自相关性。 自相关系数图: 绘制不同滞后阶数下的自相关系数，判断序列中趋势和周期性的存在。
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