我一直在研究一些dicom系列，发现厚度属性和itkimage.GetSpacing()2值并不总是一致的。
例如，dcm文件中编码的厚度(0018,0050)值为1.5 mm，但z轴上所指示的相应间距为1.00。那么，我应该使用什么值来表示z轴上相邻体素中心s之间的物理距离？如果它们是不同的东西，那么间隔实际上意味着什么？
我在python中检索厚度和间距值，如下所示：
//thickness using dicom
thickness = dicom.read_file(dcm_file)[0x0018, 0x0050].value
//spacing using simpleITK
r
浏览 0提问于2018-02-08得票数 2
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DCE MRI数据中的时间采样间隔是多少。这意味着，我有一个像素随时间(30个时间样本)的信号强度，我想知道采样间隔是多少。
是TR，还是应该从每个DICOM图像中读取dicom信息并计算时间？如果我应该从DICOM信息中计算它，是不是"Content Time“标签给了我信息？我在Matlab中工作。
浏览 0提问于2013-04-03得票数 1
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我在Python包中看到了一堆DICOM映像：
my_dicom = dicom.read_file('my_dicom.dcm')
my_dicom = my_dicom.pixel_array
我的图像实际上是一个256张图像的堆栈，每个图像有3个通道，尺寸为256英尺，宽度为256。
所以我试着：
my_dicom.shape
并获取
(3,256,256,256)
维度输出中条目的顺序是什么？我有1/6的变化，选择正确的假设。这些文件并不具有启发性。
浏览 1提问于2018-01-25得票数 2
DICOM图像除了记录“切片厚度”外，还记录了“切片位置”参数。
问题：“切片位置”在哪里？我知道它在身体的深度--但它也必须在图像中，对吧？
我认为一个系列必须或可能有一个对应的系列，在这个系列中我们可以找到“切片位置”的引用。
如果我是对的，怎么找到那些图片呢？那么如何在相应的图像中建立切片的点呢？
此外，如果你知道一个写得很好的dicom图像结构的参考指南，请分享。
非常感谢。
浏览 2提问于2010-11-30得票数 0
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我感兴趣的是从RTDOSE矩阵的DICOM头中提取图像坐标到患者坐标的转换矩阵。我只有一个RTDOSE作为单个DICOM文件。当我得到imageorigin患者时，似乎只给出了第一个切片的起源。如何获取最后一个切片的原点？(或者更好的说法是:我的意思是如何将这个.dcm文件提取到单独的片中？)
任何帮助都将不胜感激。扎赫拉
浏览 2提问于2014-09-06得票数 0
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一个简单的问题，因为我正在开发一个基于dcm4che的java应用程序。
我想要计算/找到一个dicom图像的“位置”成它的序列(序列)。我的意思是找出这个图像在它的系列中是否是第一、第二等等。更具体地说，我想计算/查找：
成序列的切片数
每个切片(dicom图像)在序列中的位置
对于第一个问题，我知道我可以使用标签0020,1002 (但它并不总是填充).第二张吗？
浏览 4提问于2015-07-14得票数 0
我使用gdcm ImageReader来读取多帧dicom文件。它正确地读取多帧，但我无法显示多帧二进制位文件。
我用vtkImageViewer来显示单帧图像，
vtkImageViewer viewer = new vtkImageViewer();
vtkDICOMImageReader reader = new vtkDICOMImageReader();
reader.SetInputfile(..\\inputFile);
viewer.SetInput(reader.GetOutput());
它正确显示单个帧图像，但不显示多帧图像。有人知道如何显示
浏览 3提问于2017-04-12得票数 2
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我在matlab上加载了一系列DICOM文件。我需要从DICOM slices.Does创建一个YUV文件，有人知道怎么做吗？
致以敬意，
浏览 1提问于2014-05-21得票数 0
我正在使用cornerstone在浏览器上显示DICOM图像。
我能够加载图像，但想要不同的视图。从技术上讲，它们被称为冠状视图和矢状视图。
是否可以使用基石库？如果是，是如何实现的？
浏览 0提问于2015-09-29得票数 3
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我是dicom开发小组的初学者。我需要在dicom图像上创建一个本地化图像行。那么，有没有什么好主意。任何极客。
浏览 1提问于2012-04-20得票数 6
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我正在将DICOM文件中的体素中的一些3D区域转换为mm^3。我想在这里非常确定，因为我只得到了DICOM文件，并且我无法测量我在mm^3中实际需要的这些3D区域。
在DICOM文件中，我看到我可以访问体素大小，因此，例如，如果我获得了体素计数，我将使用：
mm^3 = voxelCount * (voxelWidth * voxelHeight * voxelDepth)
这听起来合乎逻辑，但不知何故，我觉得我可能遗漏了一些东西。在DICOM文件中，还有其他信息，如“切片之间的距离”、“切片厚度”等。
那么，通常情况下，为了产生这样一个计算公式，必须考虑的所有变量是什么？我们该如何计算呢？
浏览 0提问于2012-03-08得票数 3
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我正试着把所有的图像保存在一个多帧的DICOM文件中。现在，通过使用pydicom和matplotlib库，我能够成功地在单帧DICOM文件中查看和保存单个图像，如下所示：
filename = pydicom.data.data_manager.get_files(*base folder path*,*dicom filename*)[0]
ds = pydicom.dcmread(filename)
plt.imshow(ds.pixel_array, cmap=plt.cm.bone)
plt.show()
现在，我希望能够在多帧DICOM映像中查看和保存所有图像，但是通过使用这个代
浏览 13提问于2022-04-11得票数 1
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如果图像方向(病人)标签(0020,0037)读取1,0,0,0,1,0，0,018,5100，病人位置标签(0018,5100)读取“HFS”，假设它存在，如何解释片位置标签(0020,1041)？我知道它代表了“图像平面的相对位置(毫米)”，我只是在DICOM参考坐标系统(RCS)中把距离的终点与Z轴联系起来有困难。
示例：i在范围内有一个切片位置编号序列：-1873.382，-771.782
由于数量在增加，在DICOM中，Z轴在上向下方增加，我是否可以得出结论：'-1873.382‘是最下等切片的位置？
另外，需要注意的是，对于每个片，my Image (Patient) (0
浏览 7提问于2016-10-19得票数 6
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我正在使用Image Position (0020,0032)计算切片之间的距离，并以毫米为单位计算距离，如何将其转换为像素？
DICOM中的“像素间距”标签表示像素之间的物理距离，但它仅用于图像的行和列。如果我想以像素为单位计算切片之间的距离，我应该使用此标记中的哪个值？
浏览 5提问于2016-06-09得票数 2
如果没有写入DICOM头文件，如何计算MRI序列的时间分辨率？
我还可以使用哪些其他DICOM信息来计算时间分辨率？
值得一提的是，这是一个3D序列。我有20个切片，每个切片有99个时间点。
浏览 0提问于2018-11-20得票数 1
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我正在尝试加载一个DICOM系列的所有三个方向(萨基特，轴和日冕)。数据集是轴向的，所有的轴向切片显示都很好。但当显示矢状面和日冕视图时，AMI.js只呈现到轴向切片的数量右。你也许能更好地理解我画的意思。因此，图片一显示呈现直到切片147，而图片二显示切片148。该系列有147张DICOM图像。
你知道为什么会发生这种情况吗?我要改变的是，所有的切片都会被正确地显示出来？显示另一组数据，其中DICOM是在日冕方向，工作良好。
浏览 3提问于2018-04-16得票数 0
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我有一组dicom图像(包含160个.dcm文件)。我可以通过下面的python代码可视化一个单个文件：
import pydicom as dicom
import os
import numpy
import matplotlib.pyplot as plt
filename = "./myfiles/MR000130.dcm";
dataset = dicom.dcmread(filename)
plt.imshow(dataset.pixel_array, cmap=plt.cm.bone)
plt.show()
我的问题是：
我如何将这些海量数据可视化为一张
浏览 0提问于2018-04-26得票数 1
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从DICOM头提供以下信息，如何计算体素大小的第三个值？我假设前两个值是0.515625和0.515625。
BitsAllocated: "16"
BitsStored: "12"
Columns: 512
HighBit: "11"
ImageOrientation: "1\0\0\0\-1\0"
ImagePosition: "-144\-34.7242241\925.599976"
ImageType: "ORIGINAL\PRIMARY\AXIAL\HELIX"
InstanceNumbe
浏览 0提问于2020-12-21得票数 3
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我正在尝试弄清楚DICOM Image Position (0020,0032)是绝对坐标还是只是我所具有的任何切片方向的坐标？
例如，我有两个平面，一个矢状面和一个冠状面，分别与来自DICOM标头的(x，y，z)形式的mm图像位置交错。我的问题是，矢状平面的(x，y，z)坐标与冠状平面的(x，y，z)坐标在相同的3D空间中，或者是图像位置值仅特定于该平面。
那么，图像位置是从某个绝对原点引用的，还是针对每个特定的图像方向而改变的？
非常感谢！
浏览 19提问于2015-06-13得票数 10
我试图在zip文件夹中读取dicom文件，但当我运行此代码时，会出现以下错误：
Errno 13拒绝许可：“病人_DICOM/”
file = patient.PATIENT_DICOM
with zipfile.ZipFile(file,'r') as zip:
zip.extractall()
ls= zip.infolist()
slices = [pydicom.read_file(s.filename) for s in ls]
浏览 4提问于2020-02-12得票数 0
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我在matlab中加载了一个DICOM图像作为矩阵。我的问题是，如何在每个正交方向上显示该图像的特定切片？
如位置为100的视图切片x，y=0，z=0
浏览 1提问于2012-10-14得票数 3
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我有一个单一的DICOM图像，我想从它获得真正的测量毫米。
我有"PixelSpacing“的信息: 1.4063 1.4063。这是否意味着，在x和y平面上，1个像素对应于1.4063 mm？
我还有SliceThickness: 8，这是否意味着z方向的切片之间的距离是8mm？谢谢!
谢谢大家，太好了。
浏览 5提问于2015-12-21得票数 1
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我正在尝试使用索引服务服务器来搜索DICOM文件。我想知道索引服务是否支持.dcm和.dicom文件扩展名。我确实读过关于IFilters的文章，但找不到任何适用于DICOM文件的。谢谢!
浏览 3提问于2011-09-02得票数 1
计算机断层扫描(CT)扫描仪的特点往往是他们可以获得的图像数量，在一个龙门旋转(即。16片扫描仪)。16片扫描仪被认为比那些每次旋转所拍摄的图像要少的多。
磁共振(MR)中类似质量的关联将是特斯拉的场强。在我使用DICOM标准的经验中，经常被捕获，尽管它是Type 3(可选的)属性。
然而，似乎没有类似的(容易)的方法来提取CT切片的容量。看来，如果我能确定，结合龙门角度/位置，那么计算可能是可能的。
也就是说，根据DICOM标准，是否可以从所需的DICOM标记中派生出每次旋转的片数？
浏览 0提问于2020-06-16得票数 0
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我有一组2D图像，然后我做了一个MPR来生成另一个视图，现在我想将新系列保存为DICOM，那么我如何使用原始系列已知的ImagePosition和ImageOrientation来确定ImagePosition或新图像？附注:问题是原始系列可能在x、y和z方向上定向
浏览 0提问于2011-07-27得票数 1
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我需要将DICOM感兴趣区域(ROI)的相对电子密度(RED)与来自DICOM CT的信息混合在一起，其中一些ROI应该覆盖CT信息。顺便说一下，我在C#工作。我的问题是，我需要以正确的方式绘制ROI填充，例如，肺部显示为低红色，而身体为水eq。我可以使用边界矩形来获得一个概念，如果一个可能在另一个中，但一旦知道，我仍然需要确定它们是否重叠，或者一个是否完全包含在另一个中。我可以在单独的位图上对每个ROI进行原始绘制，并逐个进行切片体素比较，但这似乎很慢。我还没有找到一个好的答案，我希望有人知道一个更好的方法来确定绘画(绘画填充)的顺序，以快速的方式工作。
谢谢
浏览 1提问于2014-07-03得票数 0
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我正在使用matlab中的肺数据集，但我需要正确地对切片进行排序并显示它们。
我知道这可以使用Dicom头中的“实例号”参数来完成，但是我没有成功地运行正确的代码。
我怎么能这么做？
这是我的代码：
Dicom_directory = uigetdir();
sdir = strcat(Dicom_directory,'\*.dcm');
files = dir(sdir);
I = strcat(Dicom_directory, '\',files(i).name);
x = repmat(double(0), [512 512 1 ]);
x(:,:,1)
浏览 2提问于2016-04-19得票数 1
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我想从DICOM中提取所有具有相同组号的dicom标记。例如，我想提取属于组0010的所有标记。我试过这个，当然它犯了一个错误：
import pydicom
ds=pydicom.dcmread('dicomfile.dcm')
print(ds[0x0008,0x0020]) # print the tag corresponding to group number 0008, and element number 0020
print(ds[0x0010,:]) # ERROR, does not print a list of all tags belonging
浏览 14提问于2022-01-27得票数 0
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我目前正在做一个处理DICOM文件的项目。我成功地解析了一组DICOM文件中的数据。当我试图处理DICOM文件的像素数据并将其传递到画布以显示它时，就会出现问题。 我使用了"Dwv“库来解析DICOM文件。它帮助我以数组的形式获取像素数据，并将其传递给创建画布上下文的新ImageData的函数。 function buildCanvas(width, height, pixelData) {
var imgData = context.createImageData(width, height);
for (var i = 0; i < imgData.data
浏览 22提问于2019-08-28得票数 0
1回答
我目前正在做一个任务，我需要使用NumPy，Matplotlib，(Marchingcubes，Triangulation或Volumemodel)将DICOM切片绘制成一个3D模型。 我已经尝试了这个网站上的方法： https://www.raddq.com/dicom-processing-segmentation-visualization-in-python/ 但不幸的是，这对我来说并不奏效 import pydicom
import numpy as np
import os
import matplotlib.pyplot as plt
import ipywidgets as
浏览 93提问于2019-06-23得票数 2
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我正在尝试寻找数字乳房断层合成多帧DICOM图像的方向(头-脚，外侧-内侧)。有人能告诉我如何做到这一点吗？基本上，我应该检查哪些DICOM标签？
浏览 1提问于2015-06-10得票数 0
3回答
由于显示了，MPR视图，基于字典的。我用一系列的dicom文件制作了一个3D数组。我从冠状面和矢状面展示。
My 3D array includes:
- z = count of dicoms
- c = column value for every dicoms
- r = Row value for every dicoms
但我有个问题。当切片之间有一定的空间时，用这种方式生成的图像并不能显示正确的视图。因为我想不出他们之间的模拟距离！
我不知道如何计算切片之间的空间？我想在切片之间增加额外的空间。例如，如果切片之间的空间是4，我必须添加4倍z内部切片。
我希望能达到我的意思
浏览 2提问于2013-02-18得票数 7
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我正在使用SimpleITK读取DICOM，并将特定的切片保存为PNG文件。我可以将一个新的DICOM文件写回磁盘，而且看起来和预期的一样。但是，每当我尝试将其保存为任何其他格式时，它都会被严重损坏。我的意思是，它看起来一点也不像输入，它完全是乱码。
代码如下：
var imageReader = new ImageFileReader();
imageReader.SetOutputPixelType(PixelIDValueEnum.sitkUInt8);
var dicomFileNames = ImageSeriesReader.GetG
浏览 0提问于2019-07-01得票数 0
3回答
我的问题是，我必须开发一个程序，可以打开C#中的DICOM CT图像(没有任何库)，我也应该处理轴、冠和矢状图像。我已经弄清楚了，但是冠状和矢状面的重建是不对的。我查看了无数的论坛和问题，但我只是没有找到正确的方法来找到冠状的，矢状的决议。如果有人能给我一个公式或者别的什么，我会很高兴的。
据我所见，这些是获得解决方案所需的信息：
宽度和高度:512x512图像编号: 518(0018,0050)片厚: 1.25(0018,0080)片间距:0.625<code>H 19</>(0028,0030)像素间距: 0.845703 /0.845703<代码>H
浏览 6提问于2019-10-16得票数 0
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我是PyTorch的新手，我想为3D DICOM MRI制作一个分类器。我想使用来自monai库的预先训练过的resnet18，但是我对张量的输入维度感到困惑。在我的数据采集器中，图像的形状是2160,256,256，其中2是batch_size，160是每个病人的dicom图像数，256 x256是图像的维数。当我试图运行模型时，我得到了这样的错误：期望5维权重为64，3，7，7，7，7，7，7，7，7，7，7，7，7，7，7维输入，但是得到了2,160,256,256的4维输入，而不是。
如果我解开张量，然后再把它给我得到的模型：给定groups=1，尺寸64，3，7，7，7，7，7，7，
浏览 1提问于2021-12-14得票数 0
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我有一个关于DICOM协议的基本问题。
我知道如何计算DICOM图像(A、P、L、R、H、F)的每个切片的方向标签。但是，当我得到一个从0001到0024的Axial切片时，我需要知道切片顺序是从头到脚还是从脚到头。
我该如何计算呢？
浏览 11提问于2011-07-06得票数 16
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我试图将不同的DICOM文件堆叠成一个多片系列，以便在ITK上可视化它们。然而，我似乎无法获得一个有效的DICOM系列。
我已经排序了所有的文件与他们的切片定位，我有许多订购单.dcm文件，与他们的原始信息。我用一个uid替换了它们的所有原始系列实例uid，用我设置为'999‘的一个自定义序列号替换了它们的序列号(因此它们属于一个系列)。对于所有文件，图像方向设置为[1;0;0;0;1;0]，对于所有文件，切片厚度设置为8mm。然后，我创建了一个包含原始切片positionings [info(num)]的信息结构数组。
我试过这样的方法：
for i=1:num %where num
浏览 2提问于2019-04-03得票数 1
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我必须用c#编写一个程序，能够解析DICOM并显示轴向、冠状和矢状切割。
似乎这是很多工作，但我必须这样做！
我想，第一步就是理解DICOM文件。
我一直在阅读本教程，但他使用的是我不允许购买的RZDCX库。
关于DICOM属性还有一些很好的解释，我还阅读了标准的一些部分(首先，第3部分)。
但我很难理解它们。有这些图像属性:像素表示，像素数据，平面配置.我想理解它们能够显示图像是非常重要的，我认为我应该更多地了解像素是如何工作的，以便有更好的理解。
但还有一件事我真的搞不懂：
我应该如何或在哪里得到这三种不同的切割？(轴/冠/矢状)。我在标准中一直在寻找关于它们的属性，但是我没有找到任何属性
浏览 12提问于2016-01-14得票数 7
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我应该用Matlab表示来自2D图像的三维体图像。DICOM格式的二维图像数目为90幅。此外，每幅图片的大小为512 * 512。这个任务是关于Z轴中切片之间的距离.以下是我的代码：
**
clear variables
clear all
close all
names=dir('C:\Users\User\Desktop\Projekt\2-DICOM-Daten von einem Cone-Beam CT (CBCT)\CT.Test CatPhan
CBCT A\*.dcm');
for i=1:size(names,1) %names is a struct co
浏览 2提问于2021-03-07得票数 1
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4回答
我的工作需要使用DICOM文件。每个DICOM文件由单个目录中的许多.dcm文件组成。我需要通过网络发送这些文件，由于文件的大小，这一过程在某种程度上是这样的。我也是一名程序员，我想知道压缩这些文件的理想方法是什么？我说的是在本地计算机上进行压缩，然后在目标计算机上进行解压缩(即压缩只是为了加快通过网络传输文件的速度)。有没有一种简单的方法来裁剪DICOM文件？(这些文件包含整个头部的图像，而我只对头部的一小部分感兴趣)。
谢谢!
浏览 0提问于2010-07-07得票数 5
1回答
我有多个Dicom格式的CT数据集，所有数据集都有不同数量的切片或2D CT图像。
示例：
数据集1形状：(512 X 512) x 100
数据集2形状：(512 X 512) x 130
数据集3形状：(512 X 512) x 122
如何调整数据的大小，使数据集的深度(切片数)相同？
此数据将被传递到一个输入形状为:片、512、512、通道1的二维CNN。
谢谢你的帮助
浏览 13提问于2022-04-06得票数 0
1回答
我是个慢跑新手。我正在编码DICOM图像的3D渲染。当使用慢跑绘制图像时，我创建了crud 3D视图。以下步骤如下：
导入DICOM文件栈。
从文件中创建BufferedImages。
为每个图像创建纹理。
//创建一个OpenGL纹理对象(int i=0;i<image.length;i++) { texturesi =i=0；i<image.length；i++，false)；textureCoords = texturesi.getImageTexCoords()；textureTopi = textureCoords.top()；textureBottomi =
浏览 2提问于2015-01-30得票数 1
2回答
我有一个dicom文件，其中包含110个图像，它们的名称是随机的。我正在尝试根据它们的SliceLocations (n)重命名它们，并使用dcm扩展名重写它们，即n(1).dcm，n(2).dcm，…
如有任何建议，我们将不胜感激。
我试过了
image_list=dir('*.dcm');
for i=1:110
img=dicomread(image_list);
imgHdr = dicominfo(image_list(i).name);
for j = size(img,4);
dicomwrite(img(:,:,:,j),['n('
浏览 3提问于2015-05-11得票数 1
我想要更改我的dicom体积数据的切片厚度。我使用的是vtkImageViewer2。
例如，原始数据间距为2，有200个切片，当我将切片厚度值更改为4时，我必须看到100个切片。
Original: 1,2,3,4,5...
Modified: 1, 2, 3...
我的代码：
if ((modif & InputEvent.BUTTON1_MASK) == InputEvent.BUTTON1_MASK) {
etat = 1;
int nb0 = imageViewer.GetSlice() + 1;
浏览 0提问于2015-12-17得票数 0
DICOM已经为系列提供了一个足够唯一的标识符(例如)，那么为什么还要在较低级别的对象(例如)上包含一个标识符呢？
我发现真正令人恼火的是，当引用其他对象时-例如，当RTPlan对象通过 / ReferencedSOPInstanceUID引用RTStruct对象时-它是使用SOP Instance UID完成的。但是，任何DICOM -如find/move --都不能与SOP Instance UID协同工作，它们只能与Series Instance UID协同工作。那是怎么回事呢？是否必须加载整个Series才能找到所有被引用的对象？
浏览 12提问于2009-09-16得票数 26
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当我收到侦察图像时，我可以在哪里找到DICOM标头中的x管角度信息？基本上，我需要知道球探是在x管在顶部时拍摄的，或者它是在90度或任何其他度。
浏览 0提问于2015-11-17得票数 0
我正在尝试将一系列的MRI DICOM图像(.dcm)转换为.nnrd格式。我找到了在3D切片器中做这件事的，并且我设法做到了。问题是创建的新nrrd图像失去了原始DICOM图像的像素间距。
在附加设置中，在转换图像时，我也取消勾选了“压缩”框，但问题仍然存在。例如，检查Imagej中的两个图像(原始.dcm和新.nrrd)，我得到以下结果：
有人知道怎么解决这个问题吗？任何其他替代方案(保留像素间距)都是可以接受的。
提前谢谢你，托马索
浏览 1提问于2018-04-06得票数 0
我有很多图片(pydicom文件)。我想一分为二。从1图像，我想2个图像:部分左和部分右。 输入: 1000x1000输出: 500x1000 (宽x高)。 目前，我只能读取文件。 ds = pydicom.read_file(image_fps[0]) # read dicom image from filepath 第一部分，我想把一半放在一个文件夹里，另一半放到第二个文件夹里。这就是我所拥有的：enter image description here这就是我想要的：enter image description here 我使用Mask-RCNN来解决本地化问题。我想裁剪50%的图像
浏览 38提问于2019-03-23得票数 0
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