ASP.NET MVC应用程序可在调试中运行，但在使用Plesk和GoDaddy发布时无法运行

的问题可能是由于以下原因导致的：

1. 配置问题：在Plesk或GoDaddy上发布应用程序时，可能需要进行一些特定的配置。确保你已经正确配置了应用程序的相关设置，例如数据库连接字符串、身份验证方式等。
2. 服务器环境问题：Plesk和GoDaddy使用的服务器环境可能与你在本地开发环境中使用的环境有所不同。这可能导致某些依赖项或配置在发布后无法正确加载。确保你已经将应用程序所需的所有依赖项和配置文件正确地部署到服务器上。
3. 版本兼容性问题：Plesk和GoDaddy可能使用不同版本的.NET Framework或IIS。确保你的应用程序与服务器上使用的版本兼容，并进行相应的配置。
4. 日志和错误处理：在发布后无法运行的情况下，查看服务器上的日志文件以获取更多信息。这些日志文件可能包含有关应用程序运行时发生的错误或异常的详细信息。根据日志中的错误信息，尝试解决问题或进行进一步的调试。

如果你遇到了特定的错误信息或问题，请提供更多详细信息，以便我能够给出更具体的解决方案。