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IGV查看拷贝数变异需要的segment文件格式解析

但是绝大部分小伙伴其实并不会给很标准的文件格式给我们,还好我们的数据清洗技术还不错,就是费一点功夫,慢慢整理每个样品的snp或者indel,基本过滤和格式转换后,就可以出全景图,比如2021的文章:《Correlation...: 肿瘤队列突变全景图 但是它仅仅是Indels和SNV,并不是拷贝数变异信息,IGV查看拷贝数变异需要的segment文件格式。...巧妇难为无米之炊,如果不给我们segment文件格式拷贝数变异信息记录文件,我们没办法进行可视化的。...可视化: 类似于IGV一样的CNV可视化 那它到底是需要什么样的文件呢?...有了这样的segment文件格式拷贝数变异信息记录文件,基本上你看到的文献里面的图表,我们都可以帮忙制作 出来。

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    Shell 命令行,svn add 需要添加很多文件时的简化脚本

    Shell 命令行,svn add 需要添加很多文件时的简化脚本 我一直使用 git 版本管理工具,对于 svn 很不熟悉。现在接到一个项目是用 svn 进行管理的。...现在我添加了很多的新文件,一条一条命令的输入显得非常的麻烦。因此,我随手写了一个脚本,来实现了我需要的这个功能。 实现脚本 files=$(svn st | grep ? | sed 's/\?...表示未添加的文件 我们可以用 grep ? 过滤出来需要添加的文件。 sed 可以过滤掉 ?...和 空格,只留下这些要上传的文件的路径 使用一个 for 循环,在文件路径前面加上 svn add 就可以实现添加文件了。 整体代码非常短,也非常简单,但是避免了我一次次的输入。...最后,我把这个代码写成全局的命令,命名为 svnadd 就可以在任何地方使用了。 实现方式2 上面用了循环,其实,svn add 是可以接受多个文件参数的,也就是可以通过命令,来添加所有的文件。

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    VC++6.0单文件版及安装版,希望能帮助到需要的童鞋!

    嗯大部分都是学生,号主我也是从学生时代过来的,在大学期间相信大家都有学习一门叫做C语言的课程,而这门课程的考核就需要用到的vc++6.0,同样的,国家计算机二级考试也需要用到这个。...另外,它提供了大量的代码,指导用户编程时实现某些技术和功能。因此,使用VC++提供的高度可视化的应用程序开发工具和MFC类库,可使应用程序开发变得简单。【搜狗百科】 ?...下面开始今天的内容: 一、单文件版 如何使用: 1、解压缩 2、点击根目录的ShortCut.exe ? 3、看看桌面是不是已经出现了vc6的快捷方式?接下来知道怎么做了吧 ? ?...注意事项: windows7/vista下面的兼容问题: 如果运行的时候有兼容问题的提示,选中左下角的“不再显示此消息”,然后点“运行程序”按钮 对于单文件版的话,大家浏览器搜索下载的一般都是,比如搜狗浏览器...下载 公众号后台回复关键词 190716 或者加群私聊号主远程复制给你 二、安装版 如何使用: 1、解压缩 2、点击根目录的AUTORUN ? 3、选择需要的语言安装,然后逐步点击安装即可!

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    C#.NET Framework 使用 Uri 类型表示文件路径时需要注意的问题

    Uri Uri Class (System) | Microsoft Docs 从文档和 Uri 的属性可以看出,Uri 主要是为 web 端的场景服务的,当然,本地文件也可以用,但需要注意一个重要的问题...,本地文件,只能使用 LocalPath 这一个属性,用于表示文件路径。...其它属性都有可能出错,从而找不到文件。 本地文件只能使用 LocalPath 这一个属性。 本地文件只能使用 LocalPath 这一个属性。 本地文件只能使用 LocalPath 这一个属性。...false AbsolutePath C:/Test/zhang%20san/test.txt false LocalPath C:\Test\zhang san\test.txt true 教训 本地文件只能使用...本地文件只能使用 LocalPath 这一个属性。 本地文件只能使用 LocalPath 这一个属性。

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    批量合并Excel数据时“外部表不是预期格式”或“文件包含损坏数据”的两种情况

    很多朋友在用Power Query合并(汇总)Excel数据时,碰到过“DataFormat.Error:外部表不是预期格式”或“DataFormat.Error:文件包含损坏的数据”的错误提示:...版以前)格式Excel文件; 2、文件夹中包含了一些临时的缓存文件。...- 情况1:xls文件 - 首先要说明的是,并不是Power Query不支持xls格式Excel文件的读取,只是某些专业平台或系统导出的xls文件读取会出错而已。...End Sub - 情况2:临时缓存文件 - 这种情况处理比较简单,在从文件夹导入数据时,就能看到(文件名开头为“~$”),这种文件产生的原因有很多,比如文件正在打开的过程中,或者出现操作错误没有正常退出等等...: 这些文件通常都是不需要的,所以,PQ从文件夹读入文件后,即可直接通过筛选(文件名开头不是“~$"的工作簿)的方式去掉:

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    打开PDF时阅读器显示的标题与PDF文件名称不一致的解决方法

    本文介绍打开PDF文件时,PDF阅读器所显示的文件名称与文件实际名称不一致的解决办法。   ...就在刚刚准备一篇空间三维建模相关的博客时,偶然发现了如下一个问题:   在打开这个图中名称为空间三维建模_操作.pdf的PDF文件后,在PDF阅读器中其题目却变成了另一个名称:   没错,由原有的PDF...那么问题就清楚了:我用了Office 2019 Word自带的PDF转换,其默认保留了原有的Word文件“标题”信息;而对于部分PDF阅读器(例如本文中我用的是Foxit),其在显示PDF文件的名称时,...尤其需要注意的是,似乎有的PDF阅读器不会用原有Word文件的标题作为PDF打开后显示的名称——比如之前我一直用金山的PDF阅读器,就似乎一直没有发现这个问题,从而说明有可能其和现在我用的Foxit在显示...那么我们更加需要注意了:这种只有自己看的PDF文件出了问题还好,如果是比较重要的PDF——比如以后给面试官发自己用模板修改的、已命名为XXX个人简历.pdf的简历,我们自己的电脑用的PDF阅读器显示的名称没有问题

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    将包含数字形式的文本文件导入Excel中时保留文本格式的VBA自定义函数

    标签:VBA Q:有一个文本文件,其内容包含很多以0开头的数字,如下图1所示,当将该文件导入Excel中时,Excel会将这些值解析为数字,删除了开头的“0”。...,参数strDelim是文本文件中用于分隔值的分隔符。...假设一个名为“myFile.txt”的文件存储在路径“C:\test\”中,可以使用下面的过程来调用这个自定义函数: Sub test() Dim var As Variant '根据实际修改为相应的文件路径和分隔符....Value = var '插入数组值 End With End Sub 这将打开指定的文本文件,并使用提供的分隔符将其读入,返回一个二维数组。...然后,可以使用该数组来定位要放置数据的区域,并相应地设置格式。示例结果如下图2所示。

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    实测9款AI文件助手!原来最好用的并不是全网称赞的谷歌NotebookLM...

    2.获取摘要:点击摘要文件自动生成摘要,并列出关键主题和问题,可以帮助我们更好地理解材料。3.结构化格式:NotebookLM可以将信息自动整理成常见问题、学习指导等结构化形式。...小编想上传相同的文件...文件上传上,但无法像文心一言进行提问,因为文本超出了限制,文心一言直接罢工不进行分析了。使用文心一言时需要注意文件的大小。万知:零一万物推出AI工作平台。...通义智文:通义智文是阿里云推出的免费AI阅读助手,可阅读网页、论文、图书和文档,也可上传音视频进行分析。但与谷歌相比,其分析的速度远慢于谷歌,通义智文需要在5分钟之内。...点击总结,可以自动跳转到相应的文章页面,这样大大提高了阅读理解文章的效率。2.自动生成脑图。谷歌及以上测评的工具都无法自动生成脑图,它们需要提问,需要提供信息。...而且生成的并不一定是“图”而是“文字总结”。3.提高英语阅读能力。可以将全文档进行汉译英,英译汉,并且点击英语内容板块,可以立即定位到相应的书本内容板块!4.对于问题回答进行答案来源的总结。

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    • • ​​​​ 目录​ • shell命令概述 • 获得命令帮助 • Linux命令行的格式 • 文件和目录管理 • Bash的命令历史 • Bash的命令别名 • 重定向 • vim文本编辑器

    100100 shell命令概述 Shell作用:命令解释器 介于操作系统内核与用户之间,负责解释命令行 获得命令帮助 内部命令help 命令的“--help” 选项 使用man命令阅读手册页 命令行编辑的几个辅助操作...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。

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    扔掉手里的Kindle,VR带你开启全新阅读体验

    随着智能手机的普及,掌上阅读电子书对于人们来说已经成为日常。但无论是阅读传统书籍还是电子书,读者都必须选择一个合适的姿势,手捧书本或手机来进行阅读。...然而,VR体验的开发者认为,VR科技能够帮助读者彻底解放他们的双手,躺在舒适的床上进行阅读。 ? 基于这种想法,日本的一名VR开发者表示其将制作一款名为《Voxtor》的VR书店应用。...这无疑能帮助许多想读名著却又被西方人巨长的名字吓跑的读者,因为你不需要刻意地去记住这些字符,而只要去感受这个虚拟角色的生平。 化身刘姥姥,VR阅读带你在《红楼梦》里逛大观园 ?...VR阅读确能创造很好的情境和感染力,但读者在接受新奇冲击时,是否能保持自我的思考尚未可知。也有专家担忧,太过逼真的VR环境或许会剥夺书本带给人们,尤其是孩子的想象力。...阅读也是一样,VR和书本的结合必将带来新的改变。 本文属VRPinea原创稿件,转载请洽:brand@vrpinea.com

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    《重构》再版——听Martin Fowler聊聊新版的故事

    当我在写作中选择一种语言作为示例时,我主要从读者角度进行考虑。我想“哪种语言能帮助大多数读者理解这本书中的概念?”...一本网络优先的书 互联网对我们的社会产生了巨大的影响,尤其影响了我们收集信息的方式。在我首次出版这本书时,大部分关于软件开发的知识都是通过书本传递的。...这样的组织方式就像一部抽象的文学作品,虽然传统意义上以书本为代表,但将来却并不需要这样的书本。大多数图书行业仍然将纸质书视为主流。...我们的目的是,当你购买《重构》的第二版时,不仅可以在书店购买它的纸质版,也可以在网上购买它任何形式的电子版,在阅读的过程中随时在需要时访问网站,这份对网站的访问权也是你花钱买到的最重要的东西。...这就提出了一个问题,即电子书(如epub和kindle格式)应该扮演什么样的角色。一个有力论点是:电子书应该包含网站上的所有内容。

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    SpringBoot整合Swagger2

    背景介绍 ---- 在团队开发中,一个好的 API 文档不但可以减少大量的沟通成本,还可以帮助一位新人快速上手业务。...这种做法存在以下几个问题: 1)API 接口众多,细节复杂,需要考虑不同的HTTP请求类型、HTTP头部信息、HTTP请求内容等,想要高质量的完成这份文档需要耗费大量的精力; 2)难以维护。...属性 说明 value url的路径值 tags 如果设置这个值、value的值会被覆盖 produces 返回的格式类型例如:"application/json, application/xml" consumes...高级特性认证时配置 案例演示 @RestController @Api(value = "书本管理",tags = {"书本管理"}) //tags可以代替value属性 @RequestMapping...属性 说明 value url的路径值 tags 如果设置这个值、value的值会被覆盖 produces 返回的格式类型例如:"application/json, application/xml" consumes

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    第二章:Swagger2

    背景介绍 在团队开发中,一个好的 API 文档不但可以减少大量的沟通成本,还可以帮助一位新人快速上手业务。...这种做法存在以下几个问题: 1)API 接口众多,细节复杂,需要考虑不同的HTTP请求类型、HTTP头部信息、HTTP请求内容等,想要高质量的完成这份文档需要耗费大量的精力; 2)难以维护。...属性 说明 value url的路径值 tags 如果设置这个值、value的值会被覆盖 produces 返回的格式类型例如:"application/json, application/xml" consumes...高级特性认证时配置 案例演示 @RestController @Api(value = "书本管理",tags = {"书本管理"}) //tags可以代替value属性 @RequestMapping...属性 说明 value url的路径值 tags 如果设置这个值、value的值会被覆盖 produces 返回的格式类型例如:"application/json, application/xml" consumes

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    文件目录的权限和归属 访问权限 读取:允许查看文件内容、显示目录列表 写入责解释命令行 获得命令帮助 内部命令help 命令的“--help” 选项 使用man命令阅读手册页 命令行编辑的几个辅助

    ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。...,其中的几个选项解释如下: -c:表示文件系统在mount次数达到设定后,需要运行fsck检查文件系统。...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。...ACL可以针对单一使用者,单一文件或目录来进行r,w,x的权限规范,对于需要特殊权限的使用状况非常有帮助。

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    前后端分离的书本管理系统

    Spring通过使用普通旧Java对象 (POJO) 帮助开发人员创建高效的应用程序。 Spring框架正在成为这些问题的解决方案。...使用 Spring 可插入的 MVC 架构,从而在使用Spring进行WEB开发时,可以选择使用Spring的Spring MVC框架或集成其他MVC开发框架,如Struts1(现在一般不用),Struts...(是一个配置文件): YAML文件格式是Spring Boot支持的一种JSON超集文件格式,相较于传统的Properties配置文件,YAML文件以数据为核心,是一种更为直观且容易被电脑识别的数据序列化格式...application.yaml配置文件的工作原理和application.properties是一样的,只不过yaml格式配置文件看起来更简洁一些。...(此文件呢就是一个连接数据库来生成mapper.....等文件) 是 mybatis-generator-maven-plugin插件的配置文件,配置该插件,用于连接数据库自动生成mybatis需要的代码文件

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    假期充电 | 用经典图书评分数据集,练手推荐系统(附参考源码)

    Book-Crossing 是一个共享阅读网站,由 Ron Hornbaker 在 2001 年 4 月 17 日创建,旨在将图书流通与互联网结合,让读完的书籍流通起来,被更多的人继续阅读。 ?...Book-Crossing Logo 及意大利语 Slogan 意为自由放取书籍 读者可以在 Book-Crossing 网站注册,然后给自己的书本编码后,让书籍流通起来,而且可以追踪书籍后续传阅漂流的过程...Book–Crossing Dataset 发布机构:弗莱堡大学 Cai-Nicolas Ziegler 包含数量:1,149,780 条评分数据 数据格式:CSV Dump / SQL Dump 数据大小...BX-书籍 包含书本的 ISBN 标识,除此之外,还提供了作者、出版年份、出版社等基于内容的信息,在拥有多位作者的情况下,仅提供第一作者;并且该数据集提供了链接到封面图像的 URL,相关链接直接指向 Amazon...BX-书本评级 包含图书评分信息,其中评级分为明确、从 1 – 10 表示和用 0 表示的隐含值。

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    高效阅读 培养终身受用的阅读力

    用读书笔记辅助阅读 在四种读书笔记中,摘录式和注解式比较简单,基本上就是书本原有内容的延伸;而感悟式和书评式需要有一些写作的基础,尤其是书评式读书笔记,是依托书本内容的二次创作 依据特定主题的精细阅读...阅读实用型的书,是为了获得实用的方法和好的应用效果,所以在阅读时,可以直奔主题,抓住内容的要点 除了从每一页、每一小节里找重点内容,更重要的方法是站在全书结构的角度,理解整本书的布局。...,但最好是对书本内容的概括 为了便于记录,也便于日后复习,建议内容部分采用条目式的记录方法。...中国图书馆分类也是在国内图书馆做图书检索时可以查到的图书编号。比如经济类的图书都是F编号,找到F书架,再找到具体书目的数字编号就可以找到这本书。...哲学是所有学科之母,它能帮助人们形成自己的价值观、世界观。这种作用是巨大的,但不是显性的。

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