我在CentOS 6.9上运行slurm17.11.7。我已经修改了我的/gpfs0/export/slurm/conf/epilog脚本。我最终希望将作业资源利用率信息打印到每个用户的作业所使用的stdout文件中。 在向其他用户推出它之前，我已经在脚本末尾的条件中对它进行了测试。下面是我修改后的epilog脚本： #!exec 2>> /va
浏览 95提问于2019-01-18得票数 0
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我有一个有四个节点A、B、C和D以及Slurm版本17.11.7的计算集群。我在与Slurm数组作业做斗争。我有以下bash脚本：mkdir -p $FOLDER脚本生成以下文件：
根据${SLURM_ARRAY_TASK_ID}命名的
浏览 0提问于2018-06-18得票数 1
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我最近开始了一项新工作，需要通过Slurm在HPC上运行一些脚本。
我的脚本是用Python编写的，因此我希望在.slurm文件中使用.slurm来执行这些脚本。但是，当我尝试运行.slurm文件时，它似乎无法调用python脚本。附件是我的array.slurm文件，以供参考。我已经让帐户和邮件用户空的上传到这里进行匿名，但我有这些在我运行脚本
浏览 3提问于2022-02-26得票数 1
我想使用默认的服务工作者(sw.js)文件的Create-React-App模块。sw.js文件如下所示： window.location.hostname === 'localhost' || registration.unregister(); }我想要的是向这个
浏览 0提问于2019-07-24得票数 3
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我在单个节点(控制和计算)上使用Slurm，似乎无法正确限制内存。该脚本似乎使用小内存值(3G)调用SBATCH，但我看到顶部的值超过25G。Sacct给了我正确的值： squeue -o "%C %m"2 3G 这是我的slurm.conf： ###EnforcePartLimits=NO#EpilogSlurmctld=
浏览 395提问于2020-11-05得票数 1
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嗨，我正在尝试利用一个处理管道，它是用来使用slurm在多个计算机集群上运行的，但是我更愿意在单个编译器上运行它。我在Ubuntu 18上，已经安装了Slurm，但是我无法让管道读取我的slurm.conf文件，这是我从SlurmVersion18.08配置工具在线创建的，目的是将它作为一个节点运行，所以我不必重写管道代码每次我尝试运行这个管道sh脚本时，日志文件都会给出这个错误。S批处理:错误：_parse_next_key:在无法识别的键处解析错误: SlurmctldHost批处理
浏览 0提问于2018-10-28得票数 6
我希望通过一个main.py脚本使用不同的参数多次运行python脚本，如下所示：arg2=12 #arg to be change during runs参数被编码在由S批处理运行的bash文件中例如，如果我这样做：然后，在我更改之后立即运行，但再次运行文件，如下所示：
sbatch sbatch_run.s
浏览 1提问于2016-08-04得票数 16
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我希望同时从多个目录中执行SLURM脚本。更具体地说，我有十个数组文件夹，它们通过array_1通过array_10编号，我想从其中执行脚本。在每个目录中，脚本创建了10个子目录，标记为${SLURM_ARRAY_TASK_ID}_ztag。但是，我必须从十个array_目录中的每个目录中手动执行SLURM脚本。通常，使用shell脚本，这将是一个简单的for循环，但是由于#SBATCH不是由bas
浏览 5提问于2020-06-01得票数 0
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我想为我运行的每个Slurm作业创建一个唯一的目录。然而，mkdir似乎中断了SBATCH命令。当我试着：mkdir /path/to/my_dir_$SLURM_JOB_ID...the Slurm</em
浏览 1提问于2020-12-10得票数 2
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我用这个脚本下载文件。没有-b，wget逐个下载文件。有了-b，我可以在后台同时下载文件。不幸的是，这个脚本在SLURM中不起作用。它只在Slurm中不使用-b即可工作。下载文件的Script #!
浏览 0提问于2021-01-17得票数 1
我正在尝试学习slurm系统，但我在理解上遇到了一些问题。我正在尝试使用sbatch中的--array参数并行运行一系列作业。我使用的sbatch命令：正在运行的test.sh文件：
srun --cpus-per-task 10 -k --exclusive --ntasks 1 -N 1 echo "`date ` array_index: $SLURM_ARRAY_TASK_IDnode:
浏览 10提问于2015-02-13得票数 0
在安装Slurm的HPC设置中，在用户使用ssh登录之后，将执行一个脚本，其中使用带有交互式bash的srun提交作业。脚本放在.profile上，用户不能修改它。这是bash脚本文件的内容。> -p --mem=< MEMORY> -time=HH:MM:SS -N <NUM_NODES> -gres=GPU：<NUM_GPU>-pty /bin/bash -i
有办法阻止这个用户绕过slurm
浏览 3提问于2022-08-25得票数 1
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我用脚本启动SLURM作业，脚本必须工作，这取决于它的位置，它是在脚本内部使用SCRIPT_LOCATION=$(realpath $0)获得的。但是SLURM将脚本复制到slurmd文件夹，并从那里开始作业，这会导致进一步的操作混乱。
是否有任何选项可以在slurm作业被移动/复制之前获得用于slurm作业的脚本的位置？脚本位于网络共享文件夹/storage&
浏览 0提问于2019-07-10得票数 13
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我正在整理一个snakemake slurm工作流程，我的工作目录被slurm输出文件弄得乱七八糟。我希望我的工作流程至少将这些文件定向到我的工作目录中的“slurm”目录。在阅读了所有相关问题后，我尝试了以下内容：2)通过</em
浏览 6提问于2020-05-18得票数 5
我正在运行大约400个文件通过SLURM管道与批处理。当我用sbatch ./myscript.sh file_x对一个任务排队时，所有的文件都会排队到同一个节点。我在S批处理脚本的开头尝试了一个#SBATCH参数的变体，但没有成功。到目前为止，我尝试过的是：#SBATCH -N 1#SBATCH -o slurm_out/output_%j.txt
#SBATCH -e slurm<
浏览 0提问于2019-07-10得票数 2
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我使用rm命令意外地删除了终端中Slurm作业的作业提交脚本。据我所知，再也没有(相对容易的)方法来恢复那个文件了，我也没有把它保存在任何地方。我之前已经使用过这个作业提交脚本很多次了，所以有很多Slurm作业提交(都完成了)都使用过它。是否可以通过某种方式从以前已完成作业中恢复作业脚本？
浏览 26提问于2020-03-08得票数 2
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我正在尝试在slurm上运行一些并行代码，其中不同的进程不需要通信。我天真地使用了python的slurm包。但是，我似乎只使用了一个节点上的cpu。
浏览 1提问于2016-10-11得票数 9
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slurm脚本给出“未找到命令”
、、、、
我正在尝试向slurm提交一个脚本，该脚本在输入文件上运行m4。m4安装在我们的集群上，如果我单独运行脚本，一切都会正常工作。但是当我通过slurm脚本向slurm提交一个运行时，我得到了一个错误。/m4it.shsbatch m4it.slurm.&#
浏览 0提问于2015-05-04得票数 1
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我使用云壳中的terraform从github安装slurm。
没有办法编辑贫民窟的图像吗？
谢谢。
浏览 0提问于2021-09-03得票数 0
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当某些类型的事件发生时，Slurm可以使用--mail-type和--mail-user等选项通过电子邮件通知用户。我以这种方式收到的电子邮件包含了一个空洞的主体和一个看起来像：
我想配置slurm，这样邮件的标题或更好的正文包含了与slurm命令squeue --format返回的类似的其他信息。
浏览 7提问于2018-10-26得票数 8
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