囊括了上游分析的bash代码和下游每一张Figure的复现代码，是一个非常好的学习单细胞与ATAC-Seq联合分析的文献资源，代码可以说整理的非常好了，还包括各种readme说明。...作者甚至还将代码整理了一个wiki版本的，这说明有各种详细的说明以及代码大纲，简直不要太棒！...鉴于大家访问github等网站不太方便，我们已经整理好这篇文献的代码到百度云盘，只要回复20240603-scENDO_scOVAR即可获取下载链接~ zenodo上的部分代码展示如下：https://...写在文末 我在《生信技能树》，《生信菜鸟团》，《单细胞天地》的大量推文教程里面共享的代码都是复制粘贴即可使用的， 有任何疑问欢迎留言讨论，也可以发邮件给我，详细描述你遇到的困难的前因后果给我，我的邮箱地址是...jmzeng1314@163.com 如果你确实觉得我的教程对你的科研课题有帮助，让你茅塞顿开，或者说你的课题大量使用我的技能，烦请日后在发表自己的成果的时候，加上一个简短的致谢，如下所示： We thank
Java中多线程的使用（超级超级详细）线程安全 4 什么是线程安全？...有多个线程在同时运行，这些线程可能会运行相同的代码，程序运行的每次结果和单线程运行的结果是一样的，而且其他变量的值也和预期的值一样，这就是线程安全 我们下面来用一段代码来演示线程不安全的情况，下面用车站卖票来举例...package ThreadSafe; public class Main { public static void main(String[] args) { //使用同一个对象...ThreadSafe threadSafe = new ThreadSafe(); Thread one = new Thread(threadSafe, "一号");...，执行了System.out语句，这是他的时间片到期了，b线程进入，b线程在他的时间片内执行完了之后，a线程接着往下运行，他用的不是b执行过的ticket--，而是原来的ticket，就导致了问题的发生
Stream 使用一种类似用 SQL 语句从数据库查询数据的直观方式来提供一种对 Java 集合运算和表达的高阶抽象。...Stream API可以极大提高Java程序员的生产力，让程序员写出高效率、干净、简洁的代码。...Stream和IO包下的InputStream和OutputStream一样吗？...，借助Stream（转化、聚合等方法）可以帮助我们更方便的去输出我们想要的结果 3、其他方式 使用流的静态方法，比如Stream.of(Object[]), IntStream.range(int,...更底层的使用StreamSupport，它提供了将Spliterator转换成流的方法。 Stream常用API（中间操作） 还记得我们在前面介绍Stream的时候提到了一个惰性计算。
问题 1：foreach 是顺序消费吗 我的答案是：不一定。 在并行流中调用java.util.stream.Stream#forEach方法时并不会保证元素消费的先后顺序。...如果需要在并行流中保证元素顺序消费需要使用java.util.stream.Stream#forEachOrdered方法。 ?...foreach是顺序消费吗 问题 2：foreach 是快速失败吗 废话不多说，直接上代码，眼见为实： ?...问题 3：foreach 之前添加元素会怎么样 以下代码的执行结果是什么？会抛异常吗？...ArrayList(Arrays.asList(1, 2, 3, 4)); Stream stream = list.stream(); list.add(6); stream.forEach
，目前阿里巴巴的代码检测插件也会提示可以将fori的形式转换为foreach的形式。...Stream.foreach arrayList.forEach(array -> { // dosomething }); 此种方式是JDK 1.8之后随lambda表达式出现的for循环方式，代码更加简洁...，并且可配合其他新特性使用更少的代码、以最简单的形式完成复杂操作，但是使用本方式要注意return、break并不能完成在前两者的目的。...return; } } //输出 hello hello1 //③ 使用Stream.foreach的形式 arrayList.forEach...continue: 跳出本次循环，到下一个迭代循环 return : 直接返回方法，当前方法的后续代码将都不会被执行 注意：在Stream.foreach中，return的作用相当于普通for
Java中多线程的使用（超级超级详细）线程安全+保证线程安全的三种方式 （同步代码块+同步方法+lock锁） 5 当我们使用多线程访问同一个资源时，且多个线程对资源有写的 操作就容易出现线程安全问题，java...为了解决线程安全问题引入了同步机制来解决，即在一个线程使用公共代码块的时候另一个线程不可以使用 下面我用一个抢票的案例来给大家讲解保证线程安全的几种方式 首先我们先来看看没有使用锁的情况下出现的情况...，可以想象为在改对象上上了一把锁 1.锁可以是任意的类型 2.多个线程对象要使用同一把锁 任何时候都最多允许一个对象拥有同步锁谁拿到锁就谁进入同步代码块 使用以下代码块来演示 package ThreadSafe...使用synchronized修饰的方法叫做同步方法，保证线程安全，当a线程执行该方法的时候，其他线程只可以在方法外等待 public synchornized void method(){ 可能产生线程安全的代码块...Lock锁的功能 public void lock（）加同步锁 public void unlock（） 释放同步锁 下面使用一段代码演示 package ThreadSafe; public class
“你知道茴香豆的‘茴’字有几种写法吗？” 纠结单例模式有几种写法有用吗？有点用，面试中经常选择其中一种或几种写法作为话头，考查设计模式和coding style的同时，还很容易扩展到其他问题。...我们从饱汉出发，通过其变种逐渐了解实现单例模式时需要关注的问题。 基础的饱汉 饱汉，即已经吃饱，不着急再吃，饿的时候再吃。所以他就先不初始化单例，等第一次使用的时候再初始化，即“懒加载”。...（得益于类加载机制），写起来超级简单，使用时没有延迟；坏处是有可能造成资源浪费（如果类加载后就一直不使用单例的话）。...基础的枚举 将枚举的静态成员变量作为单例的实例： // 枚举 // ThreadSafe public enum Singleton4 { SINGLETON; } 代码量比饿汉模式更少。...但用户只能直接访问实例Singleton4.SINGLETON——事实上，这样的访问方式作为单例使用也是恰当的，只是牺牲了静态工厂方法的优点，如无法实现懒加载。
，如上面的str变量使用var定义，编译器就能通过右边的"helloworld"自动推断出这是一个String类型的变量。...但是，值得注意的是，这个var并不是一个关键字，很多同学看到变量都能使用var来定义，那var还不是关键字吗？事实上，它真的不是一个关键字。..."\t")); 这是一个forEach的用法，其中需要用到变量x，因为这里它自动推断出了x的类型为String，所以String被省略了，那么加上var之后代码变成这样： String[] arr =...client.send(request, responseBodyHandler); String body = response.body(); System.out.println(body); 这是一段基本的访问百度的请求代码...Flight Recorder 这是一个记录仪，用于诊断程序运行过程，那么在之前这是一个商业版的特性，是要收费的，从Java11开始，Fight Recorder免费提供使用并开源。
如果在多线程环境下使用队列，它是不能直接拿来用的。...基于它做一个线程安全的队列也并不复杂。基本的原理就是用std::mutext信号量对std::queue进行访问控制，以保证任何一个线程都是独占式访问，下面是完整的代码。...threadsafe_queue&)=delete; /* * 使用迭代器为参数的构造函数,适用所有容器对象 * */ template<typename _InputIterator...container_type &c):data_queue(c){} /* * 使用初始化列表为参数的构造函数 * */ threadsafe_queue(std:...pop函数wait_and_pop,你也可以根据自己的需要对代码进行适当的改造，以符合自己的需求。
看了学习多线程事半功倍 Java锁机制了解一下 AQS简简单单过一遍 Lock锁子类了解一下 线程池你真不来了解一下吗？ 本篇主要是讲解死锁，这是我在多线程的最后一篇了。...我们只能通过中止并重启的方式来让程序重新执行。 这是我们非常不愿意看到的一种现象，我们要尽可能避免死锁的情况发生！...我们可以这样来改造： 同步代码块最好仅被用于保护那些涉及共享状态的操作！...使用tryLock()能够有效避免死锁问题~~ 2.4死锁检测 虽然造成死锁的原因是因为我们设计得不够好，但是可能写代码的时候不知道哪里发生了死锁。...执行某方法时就需要持有锁，且不释放 解决：缩减同步代码块范围，最好仅操作共享变量时才加锁 永久等待 解决：使用tryLock()定时锁，超过时限则返回错误信息 在操作系统层面上看待死锁问题(这是我之前做的笔记
使用yeild实现的协程时需要先用next激活，才能使用send发送数据。 next时会产生 yield右边的数据，也就是name。 send时接收值的是yield左边的数据，也就是x。...在 asyncio 中，协程使用@asyncio.coroutine 来装饰 。使用 yield from 来驱动。...= asyncio.get_event_loop() loop.run_until_complete(coro) loop.close() 输出如下 暂停一秒后，打印“Fosen” 这是最简单的异步...tips: 若在协程中需要有延时操作，应该使用 await asyncio.sleep()，而不是使用time.sleep()。...公众号对代码格式不是很友好，如果想看清晰代码的同学请移步我的个人博客https://blog-yancyuu.vercel.app/ 吧，记 得用浏览器打开哦。
什么是Lambda表达式 JDK8开始支持Lambda表达式,用来让程序编写更优雅 利用Lambda可以更简洁的实现匿名内部类与函数声明与调用 基于Lambda提供stream流式处理极大简化对集合的操作...实例讲解Lambda语法 (参数列表) -> 实现语句 Lambda 标准使用方式 Object obj = (Integer a, Integer b) -> { return a+b+0f...Lambda允许忽略参数类型 Object obj = (a, b) -> { return a+b+0f; } System.out.println(obj.operate(3, 4)); 单行实现代码可以省略大括号和...基于Lambda实现函数式编程 函数式编程理念是将代码作为可重用数据代入到程序运行中 函数式编程强调"你想做什么",而不是"你想怎么做" JDK8后提供了一系列新的函数式接口,位于java.util.function...Stream流式处理 Stream流式处理是建立在Lambda基础上的多数据处理技术 Stream对集合数据处理进行高度抽象,极大简化代码量 Stream可对集合进行迭代,去重,筛选,排序,聚合等一系列处理
我们将深入分析现有代码，并进行改进，以解决潜在的性能问题。 1....然而，我们需要注意一些潜在的性能瓶颈： 全局锁：代码中使用了一个全局锁，这可能导致并行性受限，因为所有线程都必须按顺序等待获取锁。...然而，这种实现可能不是在所有情况下都是最高效的。 2. 优化方向 为了解决现有代码中存在的问题，我们可以考虑以下优化方向： 2.1 细粒度锁 我们可以尝试减小锁的范围，仅在必要的关键区域使用锁。...2.4 GIL 问题 如果代码运行在 CPython 中，并且 GIL 是性能瓶颈，考虑使用 multiprocessing 模块，使用多个进程而不是多线程。...结论 通过对生成器线程安全性的优化，我们尝试解决了现有代码中的潜在问题，并提高了在多线程环境中的性能表现。然而，优化的效果取决于具体的使用场景，因此在实际应用中，建议进行更全面的测试和性能评估。
在此模式下，所有的互斥锁都将被禁用，相关代码被删除，SQLite 在多线程并发访问时将不再安全。但根据马克思辩证法，此模式下代码量最小，对数据库的增删改查的单次运行效率最高。...编译时对线程模式的选择 使用 SQLITE_THREADSAFE 来选择不同的线程模式，具体如下： -DSQLITE_THREADSAFE=0 单线程模式 -DSQLITE_THREADSAFE=1...线序化模式（默认） -DSQLITE_THREADSAFE=2 多线程模式 函数 sqlite3_threadsafe() 可以返回编译时的线程模式，如果是单线程模式则其返回 false，否则它将返回...如果在编译时选择了单线程模式，那么用于保护临界资源的互斥锁及其相关代码将被移除，因此此后在启动时、运行时都将无法改为线序化或者多线程模式。 ? 3....启动时对线程模式的选择 使用 thesqlite3_config() 来修改线程模式。
假设有一个类X： class X { public: void xoo(); }; 这里总结几个常见的做法： 1.本身不加锁，由调用者来加锁，坏处是如果多数场景都是加锁的，由会产生重复代码 class...，加if判断 class X { public: X(bool is_threadsafe) :_is_threadsafe(is_threadsafe) { } ...if (_is_threadsafe) { _lock.unlock(); } } private: bool _is_threadsafe...lock); // 总是加锁 _raw_x.xoo(); } private: CLock _lock; RawX _raw_x; }; 下面提出一种在mooon中使用的相对更优雅的方法...LockHelper lh(_lock); // 这里并不一定真是加锁 } }; 如果需要X是线程安全的，可以这样使用： X x; 如果不需要X是线程安全的，则可以如下使用： X x; 这样的一个
Brian Goetz想表达的意思是，如果这个对象是安全的，那么对于使用者而言，在使用的时候不需要考虑多个线程同时写入或读写安全的问题，也不需要额外加锁，那么这个对象我们才能称之为线程安全的对象。...启动线程时导致线程安全问题 线程创建和启动时导致的线程安全问题，我们创建对象并进行发布和初始化供其他类或对象使用是常见的操作，但如果我们操作的时间或地点不对，就可能导致线程安全问题。...如代码所示： public class ThreadSafe { private static List persions; public static void main...理论上得到的结果应该是 20000，但实际结果却远小于理论结果，比如可能是15796，也可能是16923，每次的结果都还不一样，这是为什么呢？...这是因为多线程下，线程的执行和调度是由CPU决定的，而CPU 的调度线程是以时间片为单位进行分配的，每个线程都可以得到一定量的时间片。
(threadSafe).start(); new Thread(threadSafe).start(); } } 运行结果（截取部分）： （发现票卖重了，而且卖了不存在的票，这就有问题了...①同步代码块； ②同步方法； ③锁机制； 2、同步代码块 格式： synchronized(锁对象){ 可能出现线程安全问题的代码（从访问到共享数据的代码开始） } 锁对象的含义： 前面的线程开始执行后回去拿取堆内存中的锁对象...，后面的线程开始执行后再去拿锁对象就拿不到了，所以无法继续执行，需要等待前面的线程执行完毕，归还锁对象，后面的线程才能拿到锁对象，继续执行； 注意： ①通过代码块中的锁对象，可以使用任意的对象； ②但必须保证多个线程使用的所对象是同一个...4、同步方法 使用步骤： ①把访问了共享数据的代码抽取出来，放到一个方法中； ②在方法上添加synchronized修饰符； 格式 访问修饰符 synchronized 返回值类型 方法名(参数列表)...方法和语句可获得的更广泛的锁定操作； 使用步骤： ①在成员位置创建一个ReentrantLock（可重入锁）； ②在有可能出现安全问题的代码前，调用获取锁的方法（闭锁）； ③在有可能出现安全问题的代码后
在此模式下，所有的互斥锁都将被禁用，相关代码被删除，SQLite 在多线程并发访问时将不再安全。但根据马克思辩证法，此模式下代码量最小，对数据库的增删改查的单次运行效率最高。...2.编译时对线程模式的选择 使用 SQLITE_THREADSAFE 来选择不同的线程模式，具体如下： -DSQLITE_THREADSAFE=0 单线程模式 -DSQLITE_THREADSAFE=1...线序化模式（默认） -DSQLITE_THREADSAFE=2 多线程模式 函数sqlite3_threadsafe()可以返回编译时的线程模式，如果是单线程模式则其返回 false，否则它将返回 true...如果在编译时选择了单线程模式，那么用于保护临界资源的互斥锁及其相关代码将被移除，因此此后在启动时、运行时都将无法改为线序化或者多线程模式。...3.启动时对线程模式的选择 使用thesqlite3_config()来修改线程模式。
为此使用基于单向链表实现的队列，单向链表包含一个不含数据的头节点，后续的每个节点存储指向数据的指针与指向下一个节点的指针。这样的话，就可以对头尾节点分别加锁，减小锁的粒度。...采用无锁结构可以最大限度地实现并发并且提高代码健壮性，避免锁阻塞其他线程，或者持锁线程抛出异常时其他线程无法继续处理。 以下是采用引用计数和宽松原子操作的无锁栈容器的实现。...书中这段代码讲解了28页，有兴趣的可以仔细读读原文。...set_new_tail(old_tail, old_next); } } } }; 相信读者已经了解了正确写出无锁代码的困难与繁复...如果想自行设计，请注意以下原则： 1、在原型设计中使用std::memory_order_seq_cst次序，便于分析和推理； 2、使用无锁的内存回收方案，例如上面的引用计数；
随着Java语法的不断改进以及JDK 8的推出，这种方式在实际企业开发中并不常见，大多出现在传统的大学教材中。如今，甚至阿里巴巴的代码检测插件也建议将fori形式转换为foreach形式。...Stream.foreachjava 代码解读复制代码arrayList.forEach(array -> { // 执行操作});这是在JDK 1.8之后引入的一种for循环方式，结合lambda...表达式使用。...代码更加简洁，可以与其他新特性配合使用，以最简洁的形式完成复杂操作。但需要注意，使用该方式时，return和break不能像前两种方式那样达到同样的目的。...Integer i : integers) {if (i == 2) {System.out.println(i);continue;}System.out.println("当前值" + i);}}在Stream.foreach
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