访问外部snakemake目录中的脚本，但不定义绝对路径

，可以通过以下方式实现：

1. 使用相对路径：在snakemake规则中，可以使用相对路径来引用外部脚本。相对路径是相对于当前工作目录的路径。例如，如果外部脚本位于snakemake文件的同一目录下，可以直接使用脚本的文件名来引用它。
2. 使用环境变量：可以在snakemake规则中使用环境变量来引用外部脚本。首先，设置一个环境变量，指向外部脚本所在的目录。然后，在snakemake规则中使用该环境变量来构建脚本的路径。这样可以避免硬编码绝对路径，使得脚本在不同环境中的部署更加灵活。
3. 使用配置文件：可以在snakemake的配置文件中定义外部脚本的路径。在snakemake规则中，通过读取配置文件来获取脚本的路径。这样可以集中管理所有外部脚本的路径，并且可以根据需要在不同的环境中进行配置。
4. 使用软链接：可以在snakemake工作目录中创建一个软链接，指向外部脚本所在的目录。然后，在snakemake规则中使用软链接的路径来引用脚本。这样可以将外部脚本的路径隐藏在软链接中，使得snakemake规则更加简洁。

需要注意的是，以上方法都是通用的技术手段，不依赖于特定的云计算品牌商。根据具体的需求和环境，选择合适的方法来访问外部snakemake目录中的脚本。