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将根树转换为HDF5
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我在根目录中有一个包含1000个事件和15个变量的TTree。我想把它全部转换成一个hdf5数据集。我如何在HDF5组中组织我的数据，以便我可以按事件编号和按变量访问数据(例如，如果我想要所有事件的‘动能’变量的所有数据)？注意:我已经尝试过root2hdf5转换工具，但它不适用于具有数组/复合数据类型的</e
浏览 11提问于2018-10-05得票数 0
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如何将超大数组保存为多个小文件？
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在linux 64位环境中，我有非常大的float64阵列(单个阵列将是500 to到1TB)。我想用统一的方式访问numpy中的这些数组: ax:y。所以我不想一个文件一个文件地访问这些数组。有没有什么工具可以让我在多个不同的文件上创建memmap？hdf5或pytables可以将单个CArray存储到多个小文件中吗？也许是类似于fileInp
浏览 8提问于2016-09-16得票数 1
在HDF5组手册中的一些HDF5示例中，字节顺序被显式地设置为“小endian”。在其他一些例子中，没有给出明确的定义。我现在的问题是，我需要关心字节顺序吗？来自的片段datatype.setOrderDataSet dataset = file.createDataSet(
浏览 2提问于2018-01-04得票数 1
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我想要分析一个.h5文件中的一些数据集，这些数据集是使用类似Pandas的东西提供的，但是我遇到了一个问题，这个问题似乎是由于我到目前为止使用的工具不支持数据集中的某些数据类型造成的。我可以使用HDFView访问数据集，但是使用它将所有数据导出到文本文件，然
浏览 41提问于2019-10-11得票数 0
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这包括对多维单元格的支持，如文档中的以下示例所示： name = StringCol(itemsize=16) # 16-charactersingle-precision) 然而，在单个单元中存储任意形状的多维数组是可能的吗按照上面的示例，类似于pressu
浏览 3提问于2012-01-19得票数 1
我正在编写一个读取由另一个库生成的hdf5文件的c++库。目前，我使用中间C结构(使用char*或char[]变量)，然后将其转换为最终的C++结构。然
浏览 37提问于2017-01-22得票数 0
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我有一个HDF5文件数据集，它包含不同的数据类型(int和float)。array = np.array(f['/Group1/Dataset'])
如何将此数据<
浏览 0提问于2019-03-11得票数 0
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我有一个想要转换成HDF5格式的数据集。它是来自的数据集。ghcnd_all.tar.gz├── ghcnd-version.txt└── status.txt如何将此数据集转换为单个.hd
浏览 3提问于2015-09-02得票数 4
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我正在用h5py将6个数据集写入一个新的hdf5。其中3个是一种格式，3个是另一种格式。对于第一组中的3组，我使用了dt="s103"，它完美地捕获了数据类型。对于另一组3，我需要数据类型为H5T_STD_U8LE，以匹配光盘上的另一个hdf5文件。在创建要写出的数据集时，如何完成此操作？
浏览 0提问于2020-03-20得票数 0
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我正在为HDF5数据库构建一个应用程序/模式，当您第一次构建HDF5文件时，该应用程序接口的一部分能够指定数据集的数据类型(和形状的一部分)，但不必在文件关闭和删除文件对象的包装器之前编写您指定的数据集因此，我希望将数据保存在HDF5文件中
浏览 0提问于2017-12-05得票数 2
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例如，我有一系列事件对象，其中事件是具有不同专门化(例如，HolidayEvent和SickDayEvent)的层次结构的基类。基类有一些字段(例如日期、雇员)，每个专门化都添加了自己的一组字段(例如，HolidayEvent有holidayName，SickDayEvent有numDays)。有什么方法可以很好地对多态数据元素(如HDF5中的多态数据元素)建模吗？我的意思是，显而易见的选择--创建一个包含<
浏览 3提问于2013-11-05得票数 2
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我需要将任何类型的文件转换为.h5文件，以便能够在另一个名为parosol的程序上工作。HDF5是用于存储和管理数据的数据模型、库和文件格式。它支持无限的数据类型，并被设计为灵活和高效的I/O和大容量和复杂的数据。
对转换文件有什么建议吗？干杯
浏览 0提问于2016-08-26得票数 0
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在HDF5中，我们得到了一些包含数据集、表格数据的文件，其中每一列都有名称，并且可能具有不同的数据类型(例如，string类型的"author“，无符号整数类型的”计数“，等等)。HDF5数据集到NetCDF仅仅是具有单维数组值的变量集合，而不是表吗？
编辑:让我进一步解释。如果我打开HDF5
浏览 3提问于2013-04-18得票数 1
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这可能是一个非常愚蠢的问题，至少是一个非常简单的问题。如果不值得详细回答的话，请告诉我正确的方向。
我的理解是，HDF5可以很好地存储分层数据。我使用文件系统来存储我的数据--根目录、子目录、数据文件(txt)和元数据文本文件。目录名通常也是描述性的。因此，将这些数据捆绑到一个hdf5文件(或
浏览 0提问于2015-01-08得票数 0
如何将多个数据集写入单个HDF5文件？同样，如何从同一个文件中重新读取这些数据集？ // close file resource
浏览 5提问于2012-03-09得票数 0
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请问有标准的paraview能读取的hdf5文件的标准范例吗？想在python里自己写paraview能读取的hdf5文件，但不知道格式是怎样的？
浏览 358提问于2023-10-09
假设我将以编程的方式从互联网获得10万本开放的访问书籍，作为文本字符串。我的目的是对它们做一些分析(用熊猫)。我已经在我的应用程序的某些部分使用mongodb，但是我不认为将它放在一个挂件中并将它转移到另一台机器是不容易的。Sqlite是可移植的，但我讨厌编写sql。我看到的其他选项是将其作为单独的文本文件或hdf5放在文件系统中</em
浏览 3提问于2014-11-18得票数 8
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向h5文件中添加字符串
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filters=tables.Filters(complevel=5, complib='zlib')) 我想在我的文件中添加一个长度为160的字符串。有什么优雅的方法吗？
提前谢谢你。
浏览 6提问于2016-06-06得票数 1
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