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Sci Adv | 刘琦团队开发基于人工智能度量学习的单细胞类型鉴定新方法

在单细胞转录组测序数据的分析过程中,细胞类型鉴定是必须且重要的一步。常规的细胞类型鉴定依赖于细胞类型标记基因,这种方法费时费力且不稳定,可重复性差,易导致不同实验室的鉴定结果不可比较。...cell assignment 的论文【3】,发布了基于人工智能度量学习的单细胞类型鉴定新方法scLearn,以及简单易用的R包平台和包含人类、小鼠在内的多个组织器官的预训练的完整reference数据集...利用参考数据集来鉴定新的细胞类型的方法具有两个方面的需求:(1)如果query细胞的细胞类型存在于reference中,那么需要以尽可能高的准确率对这些query细胞匹配正确的细胞类型(single cell...但是现有的方法普遍存在两个不足,一是对于以上两个方面的要求往往不能同时兼顾;二是鲁棒性不佳,无法适用于多个来源的数据集。...究其原因,作者认为现有的方法在框架设计上存在两方面的共性问题,一是衡量相似性的测度是人为选定的或者固定的,二是判定“unassigned”的阈值也是人为选定的。

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    【手记】走近科学之为什么明明实现了IEnumerable的类型却不能调用LINQ扩展方法

    比如Json.NET的JObject明明实现了IEnumerable,具体来说是IEnumerable>,按说JObject类型的对象是可以直接调用...Select、Where等linq扩展方法的,但偏偏就是不行,代码如下: using System.Linq; ... var jobj = new JObject(); var xxx = jobj.Select...(x=>x); //报错:JObject未包含Select定义,也不存在第1个参数为JObject的Select扩展方法... foreach(var x in jobj) { } //可以 var xxx...= ((IEnumerable>)jobj).Select(x=>x); //也可以 究竟是人性的扭曲还是道德的沦丧?...,等于JObject直接和间接实现了两个不同的IEnumerable,当.Select的时候编译器不能确定调用哪个类型的Select,所以就这样了。

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    大话蜜罐日志分析

    攻击者的识别独立于蜜罐的架构或交互类型,并且可以用不同的粒度来完成。...事实上,模式检测的真正技能是选择适当的聚类算法(和相似性度量),因为存在数百个聚类算法。这就是为什么我们在蜜罐攻击模式检测领域看到这么多不同的方法,也是任何其他聚类学科的原因。...然而,这种分析可能由于主动地址空间随机化算法的存在而产生较大的偏差。 数据段关键字:EIP和引发故障的EIP 使用不同的受损机器来执行计划的攻击的各个阶段。...此外,在确定来源或目标和描述频率方面存在共同的共识,因为许多指标和分析方法在整个出版物中重复使用。这种情况的背后的原因是直接(表观)信息被评估,并且在像简单查找扩展的国家映射的情况下。...由于分析更复杂,这种研究比简单的描述性分析出现得比较晚,方法之间存在较少的重叠。这对于模式检测尤其如此,这可以通过许多不同的相似性度量和聚类算法(如在子V-G中解释的)来完成。

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    Matplotlib 中文用户指南 3.6 图例指南

    以字体大小为单位度量。 默认值为None,它将从legend.borderpad rcParam中获取值。 labelspacing:浮点或None 图例条目之间的垂直间距。 以字体大小为单位度量。...handlelength:浮点或None 图例句柄的长度。 以字体大小为单位度量。 默认值为None,它将从legend.handlelength rcParam取值。...handletextpad:浮点或None 图例句柄和文本之间的间距。 以字体大小为单位度量。 默认值为None,它将从legend.handletextpad rcParam中获取值。...borderaxespad:浮点或None 轴和图例边框之间的间距。 以字体大小为单位度量。 默认值为None,它将从legend.borderaxespad rcParam中获取值。...以字体大小为单位度量。 默认值为None,它将从legend.columnspacing rcParam中获取值。

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    快速学习COSMIC软件规模度量方法

    来源:http://www.uml.org.cn/ COSMIC简介 COSMIC是一种主流的软件功能规模度量方法,其原理是通过识别“数据移动”的个数来度量软件规模,每个数据移动计为一个COSMIC功能规模单位...;度量阶段是根据度量单位和度量规则汇总度量结果。...最终度量结果可表示为: x CFP(v.y) 其中:x表示使用v.y版本的COSMIC方法得到的软件规模度量数值汇总,如:2500CFP(4.0) 扩展COSMIC度量方法 COSMIC度量方法被设计用于度量...因此COSMIC度量方法当前不能单独明确地度量数据运算子过程的FUR规模,该方法也没有捕获数据移动的数据属性数量多软件规模的影响。针对这类情况,COSMIC度量方法提供了本地化扩展。...本地化扩展得到的所有度量数值汇总,如:100FP 用户功能需求度量案例分析 下面以物联网风控平台中的一个功能用户需求场景为例,分析如何运用上述介绍的度量方法来进行识别通用软件模型元素并进行度量。

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    在oracle中计算时间差

    计算时间差是oracle data数据类型的一个常见问题。oracle支持日期计算,你可以创建诸如“日期1-日期2”这样的表达式来计算这两个日期之间的时间差。...一旦你发现了时间差异,你可以使用简单的技巧来以天、小时、分钟或者秒为单位来计算时间差。为了得到数据差,你必须选择合适的时间度量单位,这样就可以进行数据格式隐藏。...使用完善复杂的转换函数来转换日期是一个诱惑,但是你会发现这不是最好的解决方法。...number数据类型。...在这个例子里,我们有一个离线(logoff)系统级触发机制来计算已经开始的会话时间并把它放入一个oracle statspack user_log扩展表格之中。

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    不同批次矫正方法的比较分析

    文章对14种单细胞数据不同批次矫正的方法进行比较,从以下5个场景进行评价: 应用不同技术识别相同细胞类型, 不同的细胞类型, 多个批次, 大数据 模拟数据。...使用cLISI度量,大多数方法在细胞类型纯度方面的得分都高于0.98(图5)。由于该度量标准仅测量局部细胞纯度,因此该度量标准很难捕获特定于细胞类型的亚群边缘的混合。...1 细胞类型不同 由于不相似批次中存在两种高度相似的细胞类型,因此数据集1对批次校正算法提出了一个有趣的挑战。可视化图的检查表明,大多数方法都能够将两个批次混合在一起(图6)。...1 大数据 数据集8由使用不同技术获得的两批鼠类大脑数据组成(图16)。细胞数量在不同类型的细胞中分布不均,第2批中的大部分细胞由星形胶质细胞,神经元,少突胶质细胞和多突胶质细胞组成。...总的来说,scGen是最好的方法,是批量混合的最佳方法(p 的细胞类型纯度(p = 0.34)。

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    干货 | Elasticsearch 趋势科技实战分享笔记

    2)无法灵活、快速地扩展。 3)更适合固定、小型数据集。 基于时间的索引面临的问题: 1)如何确定间隔? 数据量 变更频率 默认尝试每周为单位分割——建议 2)如何实施?...假设你只关心度量结果,不是原始文件内容。 将节省磁盘空间并减少IO。 这个点,需要结合实际的业务场景具体问题具体分析。...最好能列一个Excel表统计一下,包含但不限于: 序号、名称、类型、作用、备注。 以上对计算单条数据大小也有用。 步骤2:评估数据量。...(此处可能会有多次反馈迭代) 3、数据去重的思考? 方法1:指定唯一id 缺点: 1、唯一值无法压缩,不利于存储。 2、存在高基数问题。...3、存在高基数问题。 方法3:用distinct query实现 深入方法待进一步探讨。 4、小结 以上内容是Elasticsearch南京分享会20180630上的分享核心笔记。

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    你真的懂分数吗?(三)——带分数到小数到百分数

    今天我们继续通过更多例子来看看分数模型的更多不可思议的应用。 带分数 在实际场景中,在均匀分割假设成立的情境下,很多时候分的不是一个单元,大概率结果不是真分数,因此就存在大于1的分数的表达问题。...至于无限不循环小数的无理数,也是一样,用小数来表达可以使得此分数值和真值的误差值一定小于10 ^ - (小数位数 - 1),相当于不断地在已有的a元素中的m个单位,又划分为m2个单位,取其比真值小,但最大的那么多个单位给它...因此,这样用不断地划分进而使得误差不断小的循环思维就使得求解一个值给定精度要求的值并实现它成为可能,也能够在实验验证的场景下解决问题。...比如测量血氧饱和度,单位到多少就不影响医生诊断疾病了;高楼的地基深度,精度到多少m就能通过检验了;甚至割圆法算圆周率本身也是这么个思路的扩展,只不过每多算一倍边的多边形,其无理数的复杂程度又会提高,而每次都无章可循...,比牛顿的级数方法差多了。

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    一文搞懂什么是效应量度量

    研究调查的主要产品是效应量的一个或多个度量,而不是P值。 – Things I have learned (so far), 1990。 统计测试只能描述是否存在影响的可能性。无法描述效应的大小。...根据要量化的效应类型,将效应量统计方法分组。计算效应量的两组主要方法有: Association。用于量化变量之间关联的统计方法(例如,相关性)。 Difference。...原始单位结果。效应量可以使用变量的原始单位,这可以有助于在领域内进行解释(例如,两个样本均值之间的差异)。 无单位结果。效应量可能不具有诸如计数或比例(例如,相关系数)的单位。...使用多种度量报告效应量以可以帮助不同类型的读者了解你的发现。 有时,为了便于读者理解,以及在将来的元分析中易于包含的一些标准化措施,结果最好报告在原始单元中。...我们可以看到效果显示样本之间存在强正相关。 Pearson’s correlation:0.712 用于计算关联效应量的另一种非常流行的方法是r平方度量,r ^ 2,也称为决定系数。

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    你需要先理解神经网络的语言、树和几何性质

    一个原因是:如果这个树有分支,则无法实现等距离扩展。 ?...右:平方的距离等于树距离。 备注 这个证明的价值不只是证明存在这个结果,而且是在明确的几何构建中存在这个结果。...其它嵌入和缺乏嵌入的情况 Hewitt 和 Manning 问是否还有其它有效的树嵌入类型,也许是基于欧几里德度量的其它幂。我们可以提供一些有关这些嵌入的部分结论。...而 p=2 的情况则很不一样,我们还没有一种用于描述这种嵌入的几何性质的简单方法。 另一方面,当 p的树嵌入甚至不一定存在。...注:PCA 能得到比 t-SNE 或 UMAP 更可读的可视化。当点在一个低维流形上聚类或分散时,非线性方法的效果可能最好——基本上与 n-立方体的顶点相反。

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    阿里数据仓库-数据模型建设方法总结(全)

    3.2 维度设计高级主题 3.2.1 维度整合 应用间差异: 应用在编码、命名习惯、度量单位等方面会存在很大的差异。...应用出于性能和扩展性的考虑,或者随技术架构的演变,以及业务的发展,采用不同的物理实现。 集成类型(同维度整合): 命名规范的统一。表名、字段名等统一。 字段类型的统一。...多事务事实表在设计时有两种方法进行事实的处理: ①不同业务过程的事实使用不同的事实字段进行存放; ②不同业务过程的事实使用同一个事实字段进行存放,但增加一个业务过程标签。...但 这种方式存在一个问题一一在同一个周期内会存在多条记录(如淘宝收藏商品事务事实表,增加【收藏删除类型】,collect/delete); 当不同业务过程的度量差异较大时,可以选择第一种多事务事实 表的设计方式...,将不同业务过程的度量使用不同 字段冗余到 表 中,非当前业务过程则置零表示。

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    SpringBoot - 构建监控体系02_定义度量指标和 Actuator 端点

    文章目录 Pre Actuator 中的度量指标 Micrometer 度量库 Meter接口 计量器类型 如何创建这些计量器 扩展 Metrics 端点 自定义 Metrics 指标 使用 MeterRegistry...,并重点介绍了如何扩展常见的 Info 和 Health 监控端点的实现方法。...这一讲我们继续讨论如何扩展 Actuator 端点,但更多关注与度量指标相关的内容。同时,我们还将给出如何创建自定义 Actuator 的实现方法,以便应对默认端点无法满足需求的应用场景。...现在访问 actuator/metrics/customertickets.generated.count 端点,我们就能看到如下所示的随着服务调用不断递增的度量信息。...在 customer-service 中,我们同样希望系统存在一个度量值,该度量值用于记录所有新增的 CustomerTicket 个数,这次的示例代码如下所示: @Component public

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    IJCAI 2019精选论文一览,从底层到应用都有了

    利用最近提出的 CP 网络度量,以及神经网络架构 CPMETRIC 来计算该度量。使用这两个工具,我们将了解如何构建快速灵活的价值对齐系统。...随着时间的推移,为了得到最好的治疗,患者可能需要几位专家的建议,并且以他们当地的语言来表达。...在创建这样的系统方面仍然存在一些问题,因为埃塞俄比亚农村地区的大多数人是文盲,不能指望他们具备计算机知识。因此研究者深信,需要用区域语言来发展这种系统。...使用不同影响的法律概念,他们从测试数据集构建 fairgroups 来反映不同特性的相对重要性,并对这些 fairgroups 应用逻辑回归。...为了解决这个这个问题,Pluto1 为 AML 从业者,提供了一种分布式和可扩展的批处理系统,基于深度学习的自然语言处理(NLP)技术,以提高日常任务效率。

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    阿里大数据之路:数据模型篇大总结

    3.2 维度设计高级主题 3.2.1 维度整合 应用间差异: 应用在编码、命名习惯、度量单位等方面会存在很大的差异。...应用出于性能和扩展性的考虑,或者随技术架构的演变,以及业务的发展,采用不同的物理实现。 集成类型(同维度整合): 命名规范的统一。表名、字段名等统一。 字段类型的统一。相同和相似字段的字段类型统一。...多事务事实表在设计时有两种方法进行事实的处理: ①不同业务过程的事实使用不同的事实字段进行存放; ②不同业务过程的事实使用同一个事实字段进行存放,但增加一个业务过程标签。...但 这种方式存在一个问题一一在同一个周期内会存在多条记录(如淘宝收藏商品事务事实表,增加【收藏删除类型】,collect/delete) 当不同业务过程的度量差异较大时,可以选择第一种多事务事实 表的设计方式...,将不同业务过程的度量使用不同 字段冗余到 表 中,非当前业务过程则置零表示。

    1.8K22

    基于OneData的数据仓库建设

    抽象词隶属于一种抽象类型,如访问终端类型下的pc、安卓、苹果。 度量/原子指标:具有明确含义的业务名词。如:支付金额。...事实类型 作为度量业务过程的事实,有可加性、半可加性和不可加性三种类型: 可加性事实指可以按照与事实表关联的任意维度进行汇总。 半可加事实只能按照特定维度汇总,不能对所有维度汇总。...使用退化维度提高事实表的易用性。 4. 事实表设计方法 选择业务过程及确认事实表类型。 声明粒度。 确定维度。 确定事实。 冗余维度。 5. 事实表 单事务事实表,针对每个业务过程设计一个事实表。...多事务事实表有两种方法进行事实处理: 不同业务过程的事实使用不同的事实字段进行存放;如果不是不是当前业务过程的度量,可以考虑用0值填充。...当不同业务过程的度量差异较大时,可以选择第一种多事务事实表的设计方式,将不同业务过程的度量使用不同字段冗余到表中,非当前业务过程则置为0,这种方式存在的问题是度量字段0值会比较多。

    1.2K20

    老曹眼中的敏捷开发

    世界上不存在这样一种方法: 只要套用,就可以写出完美的软件,无论使用的哪种设计模式; 但确实可能存在一种开发方式,可以帮助我们一步步构造出需要的软件和架构——这有可能就是敏捷开发。...回顾会议的时间一般在1-3个小时,要找最舒适的地方(最好有回顾看板)。开始的时候轮流发言,而不是主动发言。记录问题并总结,并讨论改进的方法,放在回顾看板上。...Scrum的主要缺陷有,团队压力大,不方便跨时区和跨语言的协同团队,而且一旦启动无法被中断,更重要的是程序维护的成本偏高,对工程师的要求较高,尤其是应用的架构和可扩展性。...敏捷开发乃至一般的开发过程都会涉及到一件事,任务估点,就如何见招拆招。个人觉得,一个task 最好以2个小时为单位,半小时设计,半小时编码,半小时测试,半小时文档、注释以及重构。...众所周知,所有的估算都是不准确的,以2小时为单位是为了降低误差。就像我们度量的时候,以米为单位度量,误差就是米,以毫米来量,误差就是毫米。2个小时一个task,就相当于开发中的“毫米”。

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    大疆腾讯携手杀疯了!——单目深度估计挑战赛冠军方案-ICCV2023

    ——单目深度估计挑战赛冠军方案-ICCV2023 1.论文摘要: 利用图像进行精确3D场景重建是一个存在已久的视觉任务。由于单图像重建问题的不适应性,大多数成熟的方法都是建立在多视角几何之上。...配备该模块,单目模型可以稳定地在数以千计的相机型号采集的8000万张图像上进行训练,从而实现对真实场景中从未见过的相机类型采集的图像进行零样本泛化。...原文链接:https://arxiv.org/abs/2307.10984 2.方案简介 通过作者提出的方法,可以轻松将模型训练扩展到自数以万计的不同相机采集的11个数据集的800万张图像,覆盖各种室内外场景...{f} 是焦距(以微米为单位), \delta 是像素大小(以微米为单位),( u_0 , v_0 )是原则中心。...为解决各种焦距导致的图像表观中的深度不确定性,作者提出了规范相机空间变换方法。借助该方法,可以轻松地将训练扩展到从10000多个相机采集11个数据集中的800万幅图像,实现零样本转移和高准确性度量。

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