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模块化最大化与GenLouvain在python中的实现

模块化最大化是一种网络分析方法,旨在将网络划分为具有高内部连接性和低连接性的模块,以揭示网络的组织结构和功能模块。GenLouvain是一种用于实现模块化最大化的算法,它基于Louvain算法,通过迭代优化网络的模块划分来最大化模块化度量指标。

在Python中,可以使用networkx库和community库来实现GenLouvain算法的模块化最大化。首先,使用networkx库创建网络图,并添加节点和边。然后,使用community库中的函数将网络图划分为模块。最后,可以计算模块化度量指标,如模块化Q值,来评估划分的质量。

以下是一个示例代码:

代码语言:txt
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import networkx as nx
import community

# 创建网络图
G = nx.Graph()
G.add_edges_from([(1, 2), (1, 3), (2, 3), (3, 4), (4, 5), (4, 6)])

# 使用GenLouvain算法进行模块化最大化
partition = community.best_partition(G)

# 输出模块划分结果
print(partition)

# 计算模块化度量指标
modularity = community.modularity(partition, G)
print("Modularity:", modularity)

在这个示例中,我们创建了一个简单的网络图,并使用GenLouvain算法将其划分为模块。最后,我们计算了模块化度量指标(Modularity)来评估划分的质量。

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