查看R中的最佳dtw对齐
在云计算领域，R是一种流行的编程语言和环境，用于数据分析和统计计算。dtw是动态时间规整（Dynamic Time Warping）的缩写，是一种用于比较两个时间序列之间相似度的算法。
动态时间规整（DTW）是一种非常灵活的时间序列对齐方法，可以处理时间序列之间的非线性变换和时间偏移。它通过计算两个时间序列之间的最佳匹配路径，来衡量它们之间的相似度。
DTW对齐在许多领域都有广泛的应用，包括语音识别、手写识别、生物信息学、金融时间序列分析等。它可以用于比较不同长度的时间序列，并且对于噪声和变形具有较好的鲁棒性。
在腾讯云的产品中，可以使用云服务器（CVM）来搭建运行R语言的环境。此外，腾讯云还提供了云数据库（TencentDB）来存储和管理数据，云函数（SCF）来实现无服务器计算，以及人工智能服务（AI Lab）来支持机器学习和数据分析等任务。
关于R语言和DTW算法的更多信息，您可以参考以下链接：
- R语言官方网站：https://www.r-project.org/
- R语言中文社区：https://www.r-project.cn/
- 动态时间规整（DTW）算法介绍：https://en.wikipedia.org/wiki/Dynamic_time_warping
- 腾讯云云服务器（CVM）产品介绍：https://cloud.tencent.com/product/cvm
- 腾讯云云数据库（TencentDB）产品介绍：https://cloud.tencent.com/product/cdb
- 腾讯云云函数（SCF）产品介绍：https://cloud.tencent.com/product/scf
- 腾讯云人工智能服务（AI Lab）产品介绍：https://cloud.tencent.com/product/ai
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我试图使用dtw-python包对某些时间序列进行分类，这是实现这张漂亮的纸中描述的动态时间扭曲的R包的python版本。默认情况下，对dtw函数的调用返回包含距离以及已找到的翘曲路径(文档)的DTW对象。
使用K最近邻分类需要计算每个可能的对X \in T, Y \in E的DTW(X，Y)，其中T是一个测试集，E是eval集。结果可以存储在|T| \times |E|距离矩阵\lambda中，然后用于寻找最佳匹配。不过，计算量很大。在引用的文件中，我们可以看到：
\lambda可以通过代理：：dist( q，q，method = "DTW")直接计算。这样计算K×K对齐比在
浏览 0提问于2022-01-17得票数 0
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我目前正在处理R中的多变量动态时间扭曲( dtw )。到目前为止，我发现的最好的库是dtw包，如下所示：http://dtw.r-forge.r-project.org/ 但我不知道多变量dtw实际上是如何实现的，在包的描述中也没有描述它。总而言之，我想知道它是实现了DTWD (依赖DTW)还是DTWI (独立DTW)。 有没有人有一个想法或建议如何找出这两种方法中的哪一种？或者，有没有允许我选择变体的库？
浏览 46提问于2019-05-15得票数 2
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我正在使用R中的dtw包来对齐时间序列数据。我可以很容易地获得对齐，但不知道如何显示两个时间序列匹配的峰值的最佳对齐(拉伸/压缩对齐)。绘制对齐结果会导致相应的峰值显示它们之间的虚线，而不是显示拉伸的版本。如何同时显示这两个波形的拉伸版本。
这是我使用的代码：
library(dtw)
p149 <- c(-13.000,-20.637,-19.000,-11.000,2.604,10.000,44.000,57.327,44.000,10.000,2.313,-11.000,-20.000,-6.545,1.000,52.000,70.082,57.000,17.000,18.593
浏览 23提问于2020-02-13得票数 2
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理解动态时间翘曲
、、
我们希望使用R的库来缩小某些时间序列数据并将其扩展到一个标准长度。
考虑三个具有等效列的时间序列。moref长度(行)为105，mobig为130，mosmall为100。我们希望将mobig和mosmall投影到105个。
moref <- good_list[[2]]
mobig <- good_list[[1]]
mosmall <- good_list[[3]]
因此，我们计算两个对齐。
ali1 <- dtw(mobig, moref)
ali2 <- dtw(mosmall, moref)
如果我们打印出对齐，结果是：
DTW alignment ob
浏览 4提问于2014-09-09得票数 2
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我正在尝试在DSX的R笔记本中安装R的DTW包。当运行安装命令时: install.packages("dtw")给出以下错误：“安装程序包‘dtw’有非零退出状态”警告。
浏览 3提问于2017-05-05得票数 1
我在rpy2中使用rpy2包。我希望能够指定用于运行DTW分析的窗口类型和大小。
我已经运行了以下代码：
import numpy as np
import rpy2.robjects as robjects
import rpy2.robjects.numpy2ri
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
r = robjects.r
r('library("dtw")')
query = np.array([0.0,1.0,2.0,3.0])
reference = np.array([0.0,1.9,2.4,3.0])
#
浏览 2提问于2014-04-16得票数 1
3回答
我对将我拥有的时间序列数据聚类到6个组中很感兴趣。我拥有的数据将每行表示为单个时间序列数据，就像这样，我有大约800到1000个时间序列数据。但是每个时间序列数据都有不同的长度，例如，时间序列数据“1”有102个值，时间序列数据“2”有56个值，时间序列数据“3”有180个值，以此类推。我在excel中的样本数据如下所示：
A B C D E F G H I J K L M N O P Q R S T
1 7.4 8.1 8.5 9.1 9.6 10.2 10.7 1
浏览 3提问于2019-10-01得票数 1
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匹配2个数组的值
、、
我正在尝试创建一个程序，该程序将对一组数组进行评级，以找到与给定数组最接近的一个。所以假设给定的数组是
[1, 80, 120, 155, 281, 301]
其中一个要比较的数组是
[-6, 78, 108, 121, 157, 182, 218, 256, 310, 408, 410]
如何将第一个数组中的值与其在第二个数组中的闭合值进行匹配，从而使其总差值最小。如果这一点不清楚
1 => -6, 80 => 78, 120 => 121, 155 => 157
大于281应该匹配到310，因为它更接近于256，但是这将强制301匹配到256。所以最好的整体匹配是
浏览 0提问于2016-05-21得票数 0
当我通过statconnector连接C#和R时，我可以在R中访问stat库的基本功能。但是如果我装入一个library()，我就不能调用它的任何函数。
我尝试的代码是：
rConn.SetSymbol("n1", 20);
rConn.Evaluate("library(dtw)");
rConn.Evaluate("x1<-rnorm(n1)");
rConn.Evaluate("x2<-rnorm(n1)");
rConn.Evaluate("Score<-dtw(x1,x2,keep.intern
浏览 0提问于2013-04-01得票数 0
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DTAIDistance包可用于查找k与输入查询的最佳匹配。但是它不能用于多维输入查询。此外，我希望在一次运行中找到多个输入查询的k最佳匹配。
我修改了DTAIDistance函数，使其可以用于搜索多维查询的子序列。我使用njit结合并行处理，i.e.the p_calc函数应用于每个输入查询。但我发现，与简单地逐个循环输入查询(即calc函数)相比，并行计算似乎没有加快计算速度。
import time
from tqdm import tqdm
from numba import njit, prange
import numpy as np
inf = np.inf
argmin=np.
浏览 6提问于2021-08-16得票数 0
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正如标题中所指出的，我想知道DTW (动态时间规整)是否可以用于计算两个缺失值时间序列之间的DTW距离。
假设这两个时间序列是两个气象站的每日温度，并且具有相同的长度(例如365天)，并且两个时间序列的缺失值在不同的日期。
如果这是可能的，那么R中的dtw包是否能够处理缺少的值？我没有找到像na.rm = T这样可以在dtw()中设置的参数。
非常感谢!
感谢你给我的建议。下面是两个时间序列的简化示例，其中每个时间序列仅包含52个元素，缺少的值被设置为NA。
TS1 = c(-3.26433, -5.09096, NA, -8.4158, -5.85485, -3.49234
浏览 0提问于2012-11-22得票数 8
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没有名为‘dtw’的包
、、、
我正在使用谷歌colab，我试图通过rpy2使用一个r包，但它给我一个错误，我如何添加这个包到谷歌colab中的rpy2。这是我的代码。
import numpy as np
import rpy2.robjects.numpy2ri
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
from rpy2.robjects.packages import importr
import rpy2.robjects as robj
R = rpy2.robjects.r
DTW = importr('dtw')
错误：
R[write to console]:
浏览 3提问于2020-09-27得票数 0
我是R和时间序列的新手。假设我有5个时间序列向量(具有不同的长度)，我希望使用动态时间扭曲来找到它们之间的相似性。如你所知，DTW只比较两个时间序列。我需要检查5次访问(10次)中的每一次，以计算距离，然后进行比较。 使用DTW package，此代码仅适用于两个时间序列。 v1<-c(358.214, 359.240, 360.039, 361.163, 361.164, 362.113, 362.114)
v2<-c(392.664, 414.588, 414.589, 421.463, 421.464, 427.863)
v3<-c(470.776, 470.777,
浏览 28提问于2020-11-26得票数 1
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现在关闭的展示了如何在python中使用R包。这有点笨拙，但是R包非常棒，比当前可用的python实现更好。不幸的是，像Sakoe这样的窗口函数在尝试指定"window.size“时不能工作。到参数的映射似乎存在一个问题。请注意“。”在使用rpy2时，应该用"_“替换in参数。但按照这一惯例，这个论点并不是出于某种原因而使用的。
import numpy as np
import rpy2.robjects.numpy2ri
from rpy2.robjects.packages import importr
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
浏览 0提问于2018-06-21得票数 0
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📷
我想用Python对附图中的曲线进行聚类/分组。数据已经被规范化，我的方法是使用dtw (动态时间翘曲)来计算距离，并利用这种特性使用聚类算法(如kmeans或DBSCAN)对它们进行分类。
我是选择一个轨迹作为开始曲线来比较其他曲线，还是计算出所有曲线的“平均”曲线，并以此作为比较的起始曲线？
此外，我还不完全确定如何解释dtw距离。请看下面的代码：
from dtaidistance import dtw
import numpy as np
y=np.random.randint(0,10,10)
y1=y+2
dist=dtw.distance(y,y1)
这两条
浏览 0提问于2020-08-31得票数 1
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我正在研究相同类型的数据，我想对时代系列进行分类，以找到明确的使用模式。我的数据是从一家电信公司的客户那里收集的，我们希望用他们的wifi盒检测客户所消耗的数据量的模式。因此，每个客户都有一个时间序列，说明他每6分钟消耗多少数据(我将其重放为小时)。我还使用KmeansTimeSeries使用tslearn应用DTW。
km = TimeSeriesKMeans(n_clusters = cluster_count, metric="dtw", verbose=1)
labels = km.fit_predict(mySeries)
我的问题是，我想更改python中DTW的翘
浏览 16提问于2022-06-29得票数 0
我正在寻找和之间的区别。
基本上，它们都找到了对齐分数。我需要计算短字符串序列(<20个字符)和几千个字符串之间的比对(相似性)分数。
我无法弄清楚这两种算法之间的差异，也无法决定为我的工作选择哪种算法。有没有人能帮我弄清楚其中的区别？
浏览 0提问于2011-08-05得票数 7
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正如几本书所述，孤立词的识别过程包括以下几个方面：
对于给定的一组信号(模板)，确定每个模板的特征向量-矩阵M×N，其中M是特征数(MFCC，ZCR，…)。N是帧数。
利用ANN、HMM、GMM、SVM等算法对模板进行训练。
通过训练模型识别测试信号。
由于语音信号具有不同的持续时间，它们的长度通过动态时间扭曲(DTW)技术对齐，使得N对所有模板都是相同的。这可以在训练期间完成。
我的问题是:如何改变测试信号的长度？我不能在上面使用DTW，因为我不知道它属于哪个类。我应该使用“时间拉伸”算法，保持音调，如果我应该，这将如何影响识别的准确性？
浏览 3提问于2015-12-18得票数 0
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我以前也这样做过(大约1年前)，但我想通过rpy2再次使用R。我已经确认，当我这样做时，我可以加载默认的包：
from rpy2 import robjects
plot = robjects.r.get('plot')
现在，当我尝试像这样加载外部包时，
from rpy2.robjects.packages import importr
betareg = importr('betareg')
我得到以下错误：
Traceback (most recent call last):
File "<ipython-input-1-b1ed20
浏览 3提问于2015-10-07得票数 2
当我试图计算2个wav文件的dtw时，我得到了错误"dtw()得到了一个意外的关键字参数'dist'“。我不知道为什么或者怎么做才能修好它。我正在附加下面的代码。
import librosa
import librosa.display
y1, sr1 = librosa.load('sample_data/Abir_Arshad_22.wav')
y2, sr2 = librosa.load('sample_data/Abir_Arshad_22.wav')
%pylab inline
subplot(1, 2, 1)
m
浏览 30提问于2022-01-01得票数 0
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运动数据比较
、、、、
我正在从事一个项目，涉及从加速度计和陀螺仪传感器收集的运动数据的比较。假设我有一种特定类型的运动(例如投掷球)的数据，并且我手动创建了段，你可以在下面的图像中看到，其中A、B和C表示三个片段。
具有分段的加速度计数据：
目标：给了X一个新的运动数据序列，这是我从同一个传感器记录下来的，我如何从我收集到的运动数据Y来判断每个片段的运动有多相似。注意，对于新的数据，我没有关于段的信息。
的想法：，我知道如何将两个时间序列与互相关或DTW进行比较，但在我的例子中，这些片段有一个问题。将DTW与1-KNN相结合，从我的集合中找出‘最近’的时间序列，然后将Y_nearest的每个片段与X进行比较，
浏览 0提问于2018-07-14得票数 0
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我正在尝试根据R中的借款人的过去行为将我的数据分组为3个集群
我正在使用dtwclust包使用DTW距离进行层次聚类。我的数据集有4000行--年份是按列表示的。我想分成3组。这需要永远的时间来运行。有没有更好的方法去做，或者我做错了什么？
install.packages("BBmisc")
install.packages("dtwclust")
cluster_data <- data.frame(name = LETTERS, x2001 = 1:26 , x2002 = 27:52,x2003 = 52:77)
remit.norm <-
浏览 0提问于2019-06-08得票数 0
背景
我正在做一个教程练习"“
问题
具体来说，问题是
仅将此航班路径筛选为:达美航空枢纽(ATL、JFK、LGA、BOS、DTW、MSP、SLC、SEA、LAX)之间的航班
我知道，在SQL中，我会执行如下操作：
SELECT * FROM flights
WHERE origin IN ATL, JFK, LGA, BOS, DTW, MSP, SLC, SEA, LAX
AND dest IN ATL, JFK, LGA, BOS, DTW, MSP, SLC, SEA, LAX
但我不知道如何在等高线上完成这个任务。我知道我不应该为每一个机场和产地/最大的机场安装一
浏览 5提问于2022-02-02得票数 2
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我想对2个音频文件(每个音频文件都是"ba a ta")与matlab中现有的动态时间规整(DTW)功能进行比较。在执行动态时间扭曲之前，我从matlab中提供的快速傅立叶变换(FFT)函数中获得了一个数组/向量，这是我到目前为止的代码(我的matlab文件名: test.m)：
fftRecording1 = fft(audioread('C:\Users\handy\Documents\MATLAB\my_recording_1.wav'));
fftRecording2 = fft(audioread('C:\Users\handy\Documen
浏览 2提问于2018-03-13得票数 0
我目前正在尝试使用rpy2访问"R“DTW (动态时间规整)包，以计算多变量时间序列之间的距离。也许因为时间序列真的不同，所以我得到了错误"No warping path exists that is allowed by costraints"
我认为库中的默认步长模式是对称的，但我想用非对称步长模式来测试它，但当我试图将步长模式设置为“非对称”时，玩具代码就不起作用了。以下是代码
import numpy as np
from sklearn import cluster
import rpy2.robjects.numpy2ri
rpy2.robjects.num
浏览 0提问于2017-03-23得票数 2
3回答
我正在研究时间序列数据。可用的数据是多元的。因此，对于每一个时间实例，都有三个数据点可用。格式：
X，Y，Y，Z，
因此，可以实时生成上述格式的一个时间序列数据。我正试图在另一个时间序列基数据中找到这个实时生成的时间序列的良好匹配，该数据已经被存储(该数据的大小要大得多，并且是以不同的频率收集的)。如果我将标准DTW应用于每个系列(X、Y、Z)，那么它们最终可能会在基数据库中的不同点得到匹配，这是不利的。因此，我需要在基本数据库中找到一个点，其中所有三个组件(X，Y，Z)都匹配得很好，并且在同一点。
我对此进行了研究，发现多维DTW是解决这一问题的理想方法。在R中，dtw包确实包含多维
浏览 1提问于2016-05-20得票数 9
1回答
我已经重写了一个动态时间扭曲implementation，从普通的python到Tensorflow。但它真的很慢--比预先计算距离并将它们作为数据加载到Tensorflow中要慢得多。我不明白为什么它很慢，也不知道如何改进它。 我也尝试过用autograph转换其他DTW实现，但都没有成功。有什么建议吗？ def tfDTW(s1, s2):
r = tf.cast(tf.shape(s1)[0], tf.int32)
c = tf.cast(tf.shape(s2)[0], tf.int32)
window = tf.math.reduce_max([r,c])
max_
浏览 16提问于2019-10-02得票数 4
我试图得到两个时间序列与DTW之间的相关性。但我发现时间序列的振幅会影响结果。这是我的密码：
import numpy as np
import rpy2.robjects.numpy2ri
rpy2.robjects.numpy2ri.activate()
from rpy2.robjects.packages import importr
# Set up our R namespaces
R = rpy2.robjects.r
DTW = importr('dtw')
L1 = [np.sin(i*.01) for i in range(350)];
L2 = [np
浏览 2提问于2015-07-24得票数 0
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1回答
我在绘制两个具有正确缩放比例的数组时遇到了问题。我使用dtw包比较两个数组x和y ()。函数dtw返回一个矩阵和一个路径。使用以下代码，我可以绘制矩阵和路径：
import matplotlib.pyplot as plt
dist, cost, acc, path = dtw(x, y, dist=lambda x, y: norm(x - y, ord=1))
plt.imshow(acc.T, origin='lower', cmap=cm.gray, interpolation='nearest')
plt.colorbar()
plt.plot(p
浏览 0提问于2016-01-06得票数 1
1回答
两个时间序列之间的相似性
、、、、
我有两个带有加速器读数的文件，我想获得一些度量/度量来获得这两个文件之间的相似性。我试过皮尔逊的R系数，dtw距离，dtw分数。如果文件相同，则Pearson的r给出返回值1；如果文件相同，则dtw分数和路径为0。 但我需要一个解决方案，如果文件与图中的文件相似，有一点时间延迟。它们是来自两个不同加速器的读数，这些加速器连接到同一个源。采样频率和采样幅度不同。甚至读数的数量也不一样。时间戳可以是不同的。 如何衡量这些文件之间的相似度？是否有一些度量或度量可以使用Python获得？因为dtw score和dtw distance确实提供了一些输出，但我无法使用这些值来判断文件是否相似。 ?
浏览 16提问于2020-12-06得票数 0
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我有两个文件和加速器读数，我想得到一些度量/测量，以获得这两个文件之间的相似性。我试过皮尔逊R系数，dtw距离，dtw分数。Pearson‘s r给出一个值，如果文件相同，则返回值1，如果文件相同，dtw分数和路径为0。
但我需要一个解决方案，如果文件是那些在数字中，类似，有一点时间滞后。它们是两个不同的加速器的读数，它们连接在同一个源上。采样频率和幅值不一致。即使是读数的数目也不一样。时间戳可能会有所不同。
如何度量这些文件之间的相似性？我是否可以使用Python获得度量或度量？因为dtw评分和dtw距离确实提供了一些输出，但是我不可能使用这些值来表示文件是相似的。
📷
📷
浏览 0提问于2020-12-07得票数 1
1回答
我使用R中的dtwclust包来获取图片中的集群。
dtw_cluster2 = tsclust(transdatawide2, type="partitional",k=4,preproc = zscore,
distance="dtw_basic",centroid = "pam",trace=T)
plot(dtw_cluster2)
我想要更改标签x，其中数字显示为实际日期，并添加图例以了解哪个时间序列对应于什么。你知道怎么做吗？
head(transdatawide2)
201
浏览 4提问于2019-01-21得票数 1
2回答
我的数据集是由105个国家(行)的14年(列)相同指数的测量结果组成的。我想根据这些国家随时间变化的指数趋势对其进行聚类。
我正在尝试使用DTW距离矩阵(dtw包)的层次聚类(hclust)和K Medoids (pam)。
我还尝试了K均值，使用DTW距离矩阵作为函数kmeans的第一个参数。该算法有效，但我不确定其准确性，因为K均值利用Eucledian距离并计算质心作为均值。
我也在考虑直接使用数据，但我不能理解结果如何准确，因为算法会将同一变量随时间的不同测量视为不同的变量，以便计算每次迭代和Eucledian距离的质心，以将观测值分配给集群。在我看来，这个过程似乎不能像分层和K Me
浏览 7提问于2020-03-03得票数 0
我正在使用来度量单词之间的相似性。与最简单的实现不同，我的信件有时间戳，比方说在示例数字N=0,1,2中，.
我面临的问题是，我可以沿着成本矩阵得到不同的路径，以相同的(最小)成本结束，而这些不同的路径与不同的目标字符串相关联。例如，如果我测量源字符串aa和目标字符串bab之间的距离，并且假设源字符串是在时间戳N=0上开始的，那么我有两个路径，成本相同，为2(一个添加和一个替换)：
在N=-1处添加b，保留原来的第一个a，用b代替第二个a。
将第一个a替换为b，保留第二个a的原样，在N=2添加b。
在时间线上对齐，这两个结果是不同的：
Time: ... -1 0 1 2
浏览 2提问于2011-08-11得票数 2
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1回答
聚类相似时间序列？
、、、、
我有10-20k不同的时间序列(24维数据--一天中每小时一列)，我对聚类时间序列感兴趣，这些时间序列显示出大致相同的活动模式。
我最初开始实现动态时间扭曲(DTW)，因为：
并不是我所有的时间序列都是完全对齐的两个轻微移位的时间序列应该被认为是相似的两个时间序列具有相同的形状，但是不同的尺度应该被认为是相似的。
我在DTW中遇到的唯一问题是，它似乎没有很好地扩展--在500×500距离矩阵上的fastdtw花费了~30分钟。
还有哪些其他方法可以帮助我满足条件2和3？
浏览 2提问于2019-10-12得票数 6
我知道如何在K-means聚类中找到每个簇的中心。但对于层次聚类，我不确定如何在R中做到这一点。以下是我的代码:首先，我使用DTW距离生成距离矩阵，并将其输入到R中：
DTW<-read.csv(file.choose(), head=T, row.names=1)
DTWS2N <- as.dist(as(DTW, "matrix"))
然后，我做了分层聚类(K=10)：
hc <- hclust(DTWS2N)
plot(hc)
groups <- cutree(hc, k=10)
rect.hclust(hc, k=10, border="
浏览 1提问于2016-03-03得票数 0
我见过，但它似乎只支持1D-DTW。
我还尝试使用R：
def getDTW(A, B):
""" Calculate the distance of A and B by greedy dynamic time warping.
@param list A list of points
@param list B list of points
@return float Minimal distance you have to move points from A to get B
>>> '%
浏览 0提问于2014-06-08得票数 0
1回答
我在研究动态时间扭曲的时间序列。我需要绘制两个序列的数据点之间的对齐情况：
t=[t1,t2,t3,...,tx]
s=[s1,s2,s3,...,sy]
这两个序列的长度可能不同。我也有哪个分匹配，说：
[(1,1),(1,2), (2,2), (3,3), (4,3), (4,4)]
这一条被解读为：
t[1] matches s[1]
t[1] matches s[2]
t[2] matches s[2]
...
t[4] matches s[4]
我想要达到这样的目标：
或者更好的是，就像这样(除了这两个序列及其对齐之外，什么也没有)：
我
浏览 0提问于2015-07-23得票数 2
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我正在比较库、和的DTW计算。这是我的密码：
from fastdtw import fastdtw
from cdtw import pydtw
import fastdtw
import array
from timeit import default_timer as timer
from dtaidistance import dtw, dtw_visualisation as dtwvis
s1 = mySampleSequences[0] # first sample sequence consisting of 3000 samples
s2 = mySampleSequenc
浏览 0提问于2018-09-24得票数 7
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图在R中快速显示和消失
、、、
我正在使用R绘制一些图表。当我运行该程序时，绘图出现，然后很快消失。我怎样才能让情节保持不变呢？
我正在运行在中找到的以下代码
import numpy as np
import rpy2.robjects.numpy2ri
from rpy2.robjects.packages import importr
# Set up our R namespaces
R = rpy2.robjects.r
DTW = importr('dtw')
# Generate our data
idx = np.linspace(0, 2*np.pi, 100)
template =
浏览 1提问于2013-05-20得票数 0
1回答
我尝试为语音识别应用程序实现DTW算法，我已经成功地做到了这一点，现在我正在尝试通过剪枝来提高DTW算法的性能。我试图对这个算法进行改进，并发现我应该以某种方式在特定范围内计算2D数组DTW中的值，如Image #1所示，但我似乎不知道如何做到这一点。有人能帮上忙吗？算法的代码包括在内(C#)
/// <summary>
/// Calculates the distance between two audio frames in the form of two MFCCFrame objects as input parameters
/// returns th
浏览 2提问于2015-12-17得票数 3
回答已采纳
我正在尝试使用库来查找口语单词之间的相似度。我目前的方法如下。
1)首先，我把口语单词分解成更小的框架。
2)然后对每一帧应用MFCC，并将结果存储在向量中。
3)最后使用DTW计算距离。
这是我正在使用的代码。
int frame_size = 1024;
Aquila::WaveFile waveIn0("start_1.wav");
Aquila::FramesCollection frameCollection0(waveIn0, frame_size);
vector<vector<double>> dtwdt0;
Aquila::Mfcc
浏览 1提问于2015-05-11得票数 2
当我试图安装需要编译x86_64源代码的R软件包(R4.0.6，x86_64，Linux)时，我开始注意到一个奇怪的错误。最后一个链接步骤似乎是在命令中获取无关的文本。例如install.packages("IncDTW")，跟踪显示：
g++ -std=gnu++11 -shared -L/usr/lib/R/lib -Wl,-Bsymbolic-functions\
-Wl,-z,relro -o IncDTW.so GCM.o RcppExports.o dtw2vec.o dtw_dismat.o\
dtw_disvec.o help_functions.o init
浏览 3提问于2020-11-11得票数 1
我通过以下方式安装了python DTW (动态时间扭曲)模块
python -m pip install dtw
当我尝试使用from dtw import dtw (我正在使用)导入模块时，我得到了一个ImportError: cannot import name dtw。我检查了C:\Python27\Lib\site-packages中是否存在dtw.py和dtw.pyc文件。有谁知道这个问题的解决方案吗？
浏览 7提问于2017-03-03得票数 2
1回答
我正在使用dtwclust软件包对包含多变量时间序列数据的数据帧进行聚类。在对这些数据进行聚类后，我想根据聚类，而不是时间序列数据，生成一个图表来呈现$k$组中的观察结果！
dtw_cluster2 = tsclust(sample_data, type="partitional",k=6,preproc = zscore,distance="dtw_basic",centroid = "pam",trace=T)
然后去画图，
plot(dtw_cluster2)
我得到了：
我不想要这些情节！我想要一组观察结果。我试图以dtw_clus
浏览 0提问于2020-11-08得票数 1
1回答
我有一个crossdist对象d，它是我使用包proxy获得的，如下所示 # data is a data frame of 5000 rows and 5 columns
# Find dtw distance between rows in data
d <- proxy::dist(data, method = "dtw_basic", normalize = FALSE)
str(d)
'crossdist' num [1:5000, 1:5000] 0 3.72 6.38 2.66 3.43 ...
- attr(*, "
浏览 18提问于2020-12-31得票数 0
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2回答
是否有说明如何使用DTW (动态时间扭曲)和Kinect的文档？我需要记录()一个手势，然后使用记录的手势向Simple Open-NI应用命令。但是，我已经下载了，但是我在理解它应该如何工作方面有问题。
来自
int DTWDistance(char s[1..n], char t[1..m], int w) {
declare int DTW[0..n, 0..m]
declare int i, j, cost
w := max(w, abs(n-m)) // adapt window size (*)
for i
浏览 5提问于2012-09-20得票数 0
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1回答
Gusfield (关于串、树和序列的算法，第11.8.6节)描述了一种求两个序列A和B之间最佳对齐的动态规划算法，假设在一个对齐序列中分配给长度x间隙的惩罚形式是常数R和S的R+Sx形式，在特殊情况下，当S=0开始一个空隙时有一个惩罚，但是没有延长它的惩罚。在我看来，古斯菲尔德的公式中有一个错误，我希望有人能帮助我理解事情的真实状况。
Gusfield定义了四个函数V(i，j)，G(i，j)，E(i，j)和F(i，j)，具有下列性质：
V(i，j)是前缀A1.i和B1.j对齐的最佳得分。
E(i，j)是对齐这些前缀的最佳得分，条件是Bj与A中的间隙成对。
F(i，j)是对齐这些前
浏览 3提问于2014-06-22得票数 3
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我使用的是python脚本。我想打开一个文件来检索里面的数据。我将正确的路径添加到sys.path
sys.path.append('F:\WORK\SIMILITUDE\ALGOCODE')
sys.path.append('F:\WORK\SIMILITUDE\ALGOCODE\DTW')
更确切地说，我要打开的文件file.txt在DTW文件夹中，我还添加了上层文件夹ALGOCODE。然后，我有了指挥权
inputASTM170512 = open("file.txt","r")
我有个礼物：
Traceback (mo
浏览 0提问于2012-06-25得票数 1
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2回答
在选择合适的机器学习算法在项目中实现之前，我需要评估不同的机器学习算法。我列出了四种不同的算法:k近邻算法，朴素贝叶斯算法，动态时间规整和二次判别分析。我使用Weka工具包来评估kNN和朴素贝叶斯。你知道有什么其他的工具可以用来评估后两者吗？
浏览 3提问于2013-04-28得票数 0
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