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对于遗传程序来说，每一代都是主染色体，每一条染色体都是从染色体。突变后，染色体必须将结果回馈给世代。一个世代的所有染色体都可以并行处理。如何在App Engine中实现此功能？
如果我去寻找一个任务队列，每个染色体都是一个任务，我会面临以下问题。1.染色体如何将结果返回给调用世代。在数据存储中存储结果很麻烦(染色体的数据结构有一个KDTree) 2.如何通知代代一个染色体已经完成了一个任务，以便代可以聚合所有染色体的结果并触发下一代？(轮询很麻烦。)
任务队列或其他任务，我该如何完成？
浏览 0提问于2014-12-26得票数 0
我正在尝试使用sed命令来修改文件。原始文件有5条染色体，分别命名为"1染色体“、"2染色体”、"3染色体“、"4染色体”、"5染色体“。现在我想把这五条染色体重新命名为chr1，chr2，chr3，chr4，chr5。我尝试使用sed命令来完成这个任务。我知道我可以一次做一个，但我怎么能把这五个都重命名一次。
提前谢谢你。
浏览 0提问于2022-01-03得票数 1
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我有一个.csv文件，里面有不同染色体的数据。染色体名称存储在第一列(列名: Chr)。我的目标是分离每个染色体的数据，即(Chr1，Chr2等)，并为每个染色体创建单独的csv文件。我不明白如何在有限的步骤中做到这一点。谢谢
浏览 1提问于2011-11-15得票数 2
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我正在尝试创建一个功能，现在我的代码在某一点上被卡住了，给出了这个错误： in stochasticUniversalSampling
if fitness_prob[j] > points[i]:
KeyError: 0 我试图为每个染色体分配一个与其适合度相等的长度范围和一个在前一条染色体终点之后的起点(例如，第一条染色体0-1.53，第二条染色体1.54-2.26，第三条染色体2.27-3.42，等等)。选择其范围包含一个标记的染色体(请注意，一个染色体可能有两个标记，在这种情况下会选择两次)。 city.txt 5
1 823170 415922
2 793699 27
浏览 20提问于2019-10-18得票数 0
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我正在用JGAP实现一个遗传算法来解决染色体是一个整数列表的问题(我希望在结果中保持N个良好的拟合解，而不仅仅是最合适的)。
每个整数必须在染色体上出现一次(我将fitness=0设置为具有重复等位基因的染色体，这样就可以了.)
我的问题是：
在我的问题中，数字出现在染色体上的顺序是不计数的(12，3和2，1，3)。
因此，在执行结束时，我列出了一些可能的解决方案
我使用这里报告的解决方案()以这种方式删除重复染色体：
conf.getNaturalSelectors(false).clear();
BestChromosomesSelector bcs = new B
浏览 2提问于2014-04-22得票数 0
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我在摆弄awk，因为我认为用这个工具来咀嚼标签分隔或csv文件的标题要简单得多。
我有两种类型的文件(逗号或制表符分隔)，我要做的就是修改标题(NR =1)以：
降低了所有单词的字数
用每个字段名的下划线替换任何空格。例如。将癌变类型改为*cancer_type*
癌症类型，组装版本，染色体，染色体起始，染色体末端
到目前为止，我所做的就是列出第一行
awk 'NR == 1‘test2.csv
我真是不知所措。无论如何，在进行一些下游修改之前，我可能会运行这个脚本(sed或awk)。
任何帮助(或指点我一个好的教程/一行)将是非常感谢的。
编辑
嗨，我
浏览 5提问于2013-07-20得票数 3
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我有一个基因组测序文件，格式如下：
染色体名称(字符串)=位置(int)
所有染色体的数据都存储在一个文件中，我希望
将染色体分割成单个染色体数据文件；
将染色体名(如“chr1 1”、“x”)转换为整数。
我怎么能和潘达斯一起这么做？
import pandas as pd
df = pd.read_csv('sample.txt', delimiter='\t', header=None)
数据如下所示
0 chr1 3000573 0
1 chr1 3000574 3
2 chr2
浏览 2提问于2015-08-28得票数 0
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我是UNIX的新手请耐心点。我有一个很长的文件看起来是这样的：
0 MitoT217C 0 217
0 MitoG228A 0 228
0 MitoC295T 0 295
0 MitoC458T 0 458
此文件中没有头文件。第一列代表1-22以及X和Y染色体的染色体数目.我只想提取22号染色体和X染色体的数据，然后放到一个单独的文件中。我知道如何做后者，但我搞不懂如何只获取这两条染色体的数据。
浏览 4提问于2013-12-16得票数 2
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我想知道某些基因是否聚集在一起。现在，我已经有了一个基因列表，以及它们的起始和停止位置，我已经知道如何计算这些基因之间的距离。问题是我不知道如何考虑染色体的转换。
你不能测量1号染色体上的基因和2号染色体上的基因之间的距离。
我想像这样计算距离:基因2的起始位置--基因1的停止位置。然后，这些基因之间的距离。
但是我该如何解释:当你到达下一个染色体时，R码获取了第2号染色体上一个基因的起始位置，但是一个基因在第1号染色体上的终止位置是不可能的(至少对于我的研究来说)。
所以我想知道如何在R中解释这一点，如果基因位于不同的染色体上，我只需要略过这些基因。
希望你们能帮我。
关于下面的代码:这三个
浏览 0提问于2019-01-09得票数 1
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我有一个遗传算法，我必须计算每个染色体的适应度分数。所有染色体的适应度得分必须不同，或者其中一些染色体的适应度得分相同？
浏览 0提问于2017-05-17得票数 0
我有一个具有属性适应度的对象(染色体)列表(chromosome.fitness介于0和1之间)
给定一个这样的对象列表，我如何实现一个返回单个染色体的函数，该染色体被选中的机会与其适应度成正比？也就是说，适应度为0.8的染色体被选中的可能性是适应度为0.4的染色体的两倍。
我发现了一些Python和伪代码实现，但是它们对于这个需求来说太复杂了:函数只需要一个染色体列表。染色体将自身的适合度存储为内部变量。
我已经写的实现是在我决定允许染色体存储它们自己的适合度之前，所以要复杂得多，涉及压缩列表和事情。
谢谢Lattyware。下面的函数似乎起作用了。
def selectOne(self,
浏览 0提问于2012-04-26得票数 19
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我有一个点云在联合，我正在做一些图像识别的东西。在图像识别完成后，当我开始图像识别时，我需要屏幕空间中点云点的屏幕点。由于图像识别需要一段时间，至少有几个帧已经通过，摄像机进行了新的变换(位置、旋转)。
如何从旧的相机位置获得屏幕空间点？(从保存的投影矩阵和相机到世界矩阵)
浏览 0提问于2019-06-26得票数 1
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例如群体大小为300，交叉概率为0.75,224个染色体选择为亲本，突变概率为0.005，导致2条染色体发生突变。随着精英的尺寸1，我们将有227个后代解决方案。73条染色体的其余部分将如何产生，以完成300个群体的大小？
浏览 1提问于2019-05-12得票数 1
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我计划写一个移动应用程序(iOS和安卓)，其中有很多图像识别处理。
用C或C++编写图像识别代码，以便在两个平台上重用，这是一个好的解决方案吗？
会不会有很多特定于平台的C/C++代码使得编写和维护它变得不合理？
注意:此应用程序基于图像识别，代码的最大部分用于图像识别。
浏览 4提问于2011-06-17得票数 5
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我想知道我是否能得到一些关于提高一个实现遗传算法的程序的整体效率的建议。是的，这是一个作业问题，但我已经完成了我自己的作业，我只是在寻找一种方法让它执行更好的。
我的程序目前读取由成分类型h或p (例如: hphpphhphpphphhpphph)组成的给定链，对于每一个H和P，它生成一个随机移动(上、下、左、右)，并将移动添加到包含在“染色体”对象中的arrayList中。在一开始，这个程序正在为10,000条染色体产生19次移动。
SecureRandom sec = new SecureRandom();
byte[] sbuf = sec.generateSeed(8);
浏览 0提问于2011-01-12得票数 4
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我正在使用R的genalg库，并试图在运行二进制泛型算法时保存所有代。在库中似乎没有一种内置的方法，所以我试图通过评估函数保存每个染色体，x。
为了测试这个方法，我尝试在评估函数中插入print(x)，以便能够看到所有被评估的染色体。然而，印刷染色体的数量并不总是与我所怀疑的相匹配。
我以为印刷染色体的数量将等于群体大小的迭代次数，但似乎并不是一直都在尝试。
问题是，我想知道每个染色体属于哪一代(或迭代)，我无法判断染色体的数目是否与iter倍popSize不同。
这是什么原因，以及我如何“修复”它。还是有另一种方法来保存每条染色体，以及它属于哪一种迭代？
下面是一个例子，我认为评估函数会打印
浏览 6提问于2016-04-13得票数 0
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在基因组学中，一个区间由染色体1-22，x，y和染色体上的位置(开始，结束)组成。染色体可以被编码为一个具有24个不同值的enum，染色体上的位置可以编码为INT8RANGE。
为了进行有效的范围查询和区间联接，我想在列(chr，pos)上构建一个索引，但是我读了这个。
在PostgreSQL的基因组范围内什么是最好的索引类型？
浏览 2提问于2020-04-27得票数 1
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我正在尝试使用用于python：的Dash技巧库生成。
我有SNP结果数据的植物，如小麦，有染色体名称的字母，例如3A，3B，3D。
这样的标识符(带有字母后缀)是否可以用技巧/python来处理呢？
在文件中，有以下关于染色体id的注释：
chrm (字符串；默认的'CHR')：表示染色体的列名的字符串。此列必须是浮点数或整数。染色体的最小数目是1，如果你有X，Y或MT染色体，一定要重新编号这23，24，25等。
我有许多植物基因组的数据，其中含有染色体名称中的字母。似乎CHR列不能有字符串值，这从用户的角度来看是很奇怪的。
浏览 10提问于2022-05-06得票数 2
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我正在使用ggplot2做一些基因组数据的绘图，所以基本的格式是有一个染色体和一个位置。我将位置转换为连续的比例，然后将断点放在染色体的边界上：
scale_x_continuous("Genome Position", breaks = c(0, cumsum(chromosome_length)))
就实际绘制而言，这看起来很棒，但标签随后被放在染色体的开头和结尾。我希望它们沿着每个染色体居中，在默认情况下绘制小断点的位置。
这个是可能的吗？
浏览 1提问于2009-10-12得票数 2
我正在开发一个AR应用程序，做图像识别。现在我需要我的应用程序来支持数百万张图片。我用的是vuforiaVuforia免费版本对支持的镜像数量有限制。有没有其他在图像识别方面做得很好并且支持大量图像识别的库
浏览 2提问于2013-03-19得票数 2
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我下载了1000个基因组数据(染色体1-22)，这是VCF格式.我怎么能把所有的染色体组合在一个文件里？我应该先把所有的染色体转换成二进制文件，然后再做--bmerge mmerge-list吗？或者还有其他方法把它们结合起来呢？有什么建议吗？
浏览 0提问于2018-04-04得票数 4
我想用SNP标记画一个核型图。
它与函数segments一起工作，但是我想使用ggplot2包来显示一个优雅的图形。
ggbio：
我用函数layout_karyogram检查了ggbio包，但是染色体是在垂直位置绘制的。我没有找到一种方法来旋转每个染色体下面的名字的图表，并写我的SNP的名字在他们的片段旁边。
geom_bar：
然后我尝试了来自包geom_bar的ggplot2：
数据<- data.framework(chromosome=paste0(“chr”，1:4)，size=c(100,400,300,200)，stringsAs
浏览 1提问于2017-03-28得票数 3
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一个看似简单的问题，但事实证明，这个问题有点令人烦恼。我有一份染色体清单(有23条染色体--第1至21号染色体，然后是X染色体和Y染色体)如下：
['chr11','chr14','chr16','chr13','chr4','chr13','chr2','chr1','chr2','chr3','chr14','chrX',]
我想按以下顺序对此进行排序：
['chr1', 'c
浏览 19提问于2022-06-29得票数 4
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我有两个遗传数据集有匹配的染色体位置ID。我想数一下文件1's染色体位置in出现在文件2中的次数。
例如，我的数据看起来如下：
文件1(染色体位置实际上是我的第125栏，由...暗示)：
Gene pval ... Chromosome position ID
ACE 0.002 ... 01:3290834_CT_C_1
NOS 0.01 ... 03:3304593_GA_G_1
BRCA 0.004 . ... 06:6265733_GA_G_1
CYP3 0.34 ... 09:9433933_GA_G_1
文件2(染色体位置是我的第一栏)：
浏览 0提问于2020-01-31得票数 2
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我正在尝试为GWAS I的表演生成曼哈顿的情节。我有染色体的位置和分数了。我可以做5个单独的图，每个染色体上的位置作为x轴，p分数在y轴上。我想把它们并排画在同一张图上，这样只有一个y轴，然后染色体按顺序(1-5)显示。有谁有什么想法吗？
浏览 1提问于2015-04-09得票数 0
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遗传算法通常采用“变异率”来控制染色体的变异率。研究门的大多数研究人员建议保持低速率，以便快速收敛，找到局部最优，而不是使优化成为随机游走。然而，我发现一个主要的问题是保持一个低的突变率。如果在某一点上的育种不产生“新的”儿童/染色体，该算法将运行效率很低。假设种群中的所有个体都有相同的染色体，那么交叉就会变成相同的个体，直到其中一条染色体发生突变。以较低的速率，这可能需要相当长的时间(在此之前，具有相同染色体的适应度函数会被一次又一次地恢复)。
为了确保我们探索新的解决空间，当下一代的儿童/染色体重复时，故意突变难道不是更有效吗？这不是让“变异率”过时了，整个算法更高效吗?还是我在这里遗漏了
浏览 0提问于2019-09-26得票数 4
如何自动单击非浏览器交互界面(例如。( Exe软件)没有图像识别？(例如，微软的onenote，或一些小众软件)
我想学习相关的技术，但我不知道我应该走哪个方向，我希望有人能给我一些指导。
(现在我只能对这些非浏览器软件使用Python的图像识别和点击技术，但是这种效率很低。我希望我可以跳过图像识别&直接点击，并能直接操作底层数据处理，比如操纵HTTP请求或CSS selenium )
浏览 2提问于2020-11-19得票数 0
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用于分层数据存储的最佳C#集合
、、、、
我的数据有层次关系。让我们想象一下人类的染色体。我们有24条染色体，每条染色体都是双链的(即+/-)，在每条链上我们有多个区域。让我们假设不同链和染色体上的区域是独立的。目前我存储的所有区域如下：
List<List<List<Region>>> regions;
第一个列表表示染色体，第二个列表表示链，第三个列表表示区域。
出于我的处理目的，需要对这些列表进行各种插入/删除操作，以及大量的顺序和随机访问。由于可能有大量的区域(数十亿)，因此在速度和内存消耗方面的效率至关重要。人类的染色体数目是24条，只有2条，因此: 24 x 2 x 1E+9是regi
浏览 0提问于2014-08-28得票数 0
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二维阵列遗传算法中的交叉算法
、、、、
我有以下两条染色体，它们被表示为二维数组。
// First chromosome
[
[ 12 45 23 ]
[ 34 01 89 ]
[ 33 90 82 ]
]
// Second chromosome
[
[00 45 89 ]
[00 00 34 ]
]
染色体上的限制是染色体阵列中的每个阵列必须保持在一起。例如，在第一染色体上，[ 12 45 23 ]必须保持在一起。考虑到这一点，我认为采用上述染色体结构进行交叉的方法是随机选择一个水平交叉点。例如：
// First produced off-spring
[
[ 12 45 23 ] // First
浏览 1提问于2020-01-06得票数 3
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我目前正在试验的JGAP 3.6为一个简单的地牢游戏生成水平。这个问题涉及到使用染色体表示法，其中每个基因包含一个整数值，它表示房间的类型，例如0=起始室，1=怪物室，等等。
问题是，我想确保在一个水平上只有一个起始空间(在一个染色体中只有一个0的基因)。我读过，特别是染色体和基因类，但没有找到直接的方法来做到这一点。我也考虑过使用定制的基因，但这似乎是无用的，因为我认为这种“验证”需要由染色体类而不是基因类来完成。
我目前对这个问题的解决方案是在对不满足上述条件的染色体进行健康评估时给予很大的惩罚。有什么想法、解决方案、建议或评论吗？谢谢
浏览 2提问于2015-04-11得票数 4
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首先，这是家庭作业的一部分。
我正在尝试实现一种遗传算法。我对选择父母交叉感到困惑。
在我的笔记中(显然有些地方不对)，这就是我们所做的例子；
群体大小=估计的染色体数到交叉(如果不是偶数的话，是最接近的偶数之一)
为每个染色体选择一个0,1的随机数，如果这个数目较小，那么Pc，选择这个染色体作为交叉对。
但在第二步应用时，所选择的染色体计数与第一步的结果相等。但由于随机性，这并不总是被保证的。
所以这没有任何意义。我寻找选择父母进行交叉，但我发现的只是交叉技术(单点、切割和切片等)。以及如何在被选中的父母之间进行交叉(我对这些没有问题)。我只是不知道我该选择哪一个染色体进行交
浏览 5提问于2012-12-23得票数 3
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我对D3.js图书馆有意见。我试图在x轴代表不同染色体的图表中绘制出染色体数据。这对于条形图等来说是很容易做到的。
然而，我想绘制基于染色体位置的线性数据。蜱间距的大小也应与染色体的大小相关。
我的问题是，我应该使用哪个比例？我不认为线性比例符合这个目的。我读过一些关于阈值尺度的文章，但我不知道这是否是最好的选择。有人有更好的主意吗？
谢谢!我
tl:我需要一个x轴，在滴答之间有可变的间隔，根据线性数据，我该怎么做呢？
编辑:用示例显示图像
浏览 4提问于2016-03-08得票数 2
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我试着沿着基因组绘制点:每个染色体都会有点。我的数据文件如下所示：
CHROM BP P DP
1 234567 0.0000555 30
.....
Y 12345678 0.09 14
我使用gglopt2绘制每个染色体的P值，用DP着色，使用以下方法：
mc.points <- ggplot(sample,aes(x = BP,y = P, colour =DP)) +
geom_point() +
labs(x = "Chromosome",y = "P") +
浏览 1提问于2014-04-05得票数 0
我有一个文本文件chunk_names.txt，如下所示：
chr1_12334_64321
chr1_134435_77474
chr10_463252_74754
chr10_54265_423435
chr13_5464565_547644567
这是一个例子，但所有的染色体表示(1.22，X和Y)。所有条目都采用相同的格式chr{1..22, X or Y}_*string of numbers*__*string of numbers*。
我想将这些分割成每个染色体文件，例如，启动chr10的所有块都被放入一个名为chr10.txt的文件中
在Linux中，我尝试过：
for
浏览 7提问于2019-11-14得票数 3
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我有一个sql数据库，由基因组、染色体和“感兴趣的”区域(在床上格式)组成。一个基因组(例如4GB)由+/- 20染色体组成，因此每条染色体的长度约为200 4GB。例如，基因组中的染色体由字符串组成：
NNNNATCCAGGAGAATTACAT...ACCGGGAATTCCCGGNNNNN # 200 MB large
假设我有大约1.000.000个ATAC峰，我想得到只有3号染色体100 bp的序列。我的SQL查询如下：
SELECT substr(Chr.Sequence, Bed.ChromStart + Bed.Peak - 50, 100) FROM Bed Bed
INNER
浏览 1提问于2020-01-06得票数 3
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遗传算法中的交叉技术
、、、
我正在用C++编写一个小的遗传算法框架。我的染色体被编码成比特串，每个基因都有一个预定的大小。每条染色体都把自己的基因一个接一个地存储在比特串中。现在，我希望实现交叉操作。
我的问题是，当选择一个从另一个染色体插入比特的点时，我是在基因边界上这样做呢，还是把染色体看作是一串比特，而忽略了基因的分裂？换句话说，我是把最小的可互换单位当作基因还是有点？
浏览 1提问于2013-12-05得票数 1
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染色体上有很多基因，你的生物信息学朋友想要检查一个特定的染色体是否有一系列的基因。基因发生的顺序很重要。你想在这件事上帮助你的朋友。他给你n条染色体和一系列他想要检查的基因。帮助他确定这些基因是否以给定的顺序存在于染色体中。
因为你不是生物系的学生，他让你变得更容易了。他用ASCII中的字母、数字或特殊字符来代表基因。空格不代表基因。
示例
如果染色体是abdfgc，而他要查询的基因是abc，这些基因在染色体中(以正确的顺序)存在(用粗体标记)。a*b*dfg*c*。但是，如果查询是bca，则这在染色体中没有以正确的顺序出现。
输入
第一行输入由一个整数n组成，它是测试用例的数量。
每个测试用
浏览 0提问于2018-11-22得票数 0
1回答
我有两个遗传数据集。File1是一个txt文件，具有染色体is，所有的染色体is都出现在文件2中。文件2是一个csv文件，大于文件1，具有更多独特的染色体is。与文件1相比，我如何只提取文件2中具有独特染色体ID的线条？
例如，我的数据如下所示：
文件1(染色体位置实际上是我的第125栏，由.所暗示)：
Gene pval ... Chromosome position ID
ACE 0.002 ... 01:3290834_CT_C_1
NOS 0.01 ... 03:3304593_GA_G_1
BRCA 0.004 . ... 06:6265733_GA_G_
浏览 0提问于2020-01-31得票数 0
我有一个数据集，它显示了人类染色体的长度(在这里称为“值”)和它们各自的基因。进一步将基因分为RNA、prot编码、假基因和rest 4组(gtype)。我想在y轴和x轴上绘制单个染色体，我想用一个geom_point、bar或col来绘制染色体的密度(即“每条染色体的基因数目”除以染色体的长度)，然后根据基因的gtype生成一个facet_wrap。因此，4个小区只计算RNA基因除以值，1个小区计数prot编码基因除以值。
这个图只是将所有基因的总数除以单个值(不过，chrM是最大的，这是正常的)。
然而，我总是在x轴上失败，我不知道如何得到一个有意义的图。到目
浏览 1提问于2021-06-03得票数 0
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您好，我有一个关于在python中链接子进程的输入和输出的问题。我试图通过跳过一个步骤的输出来简化程序，将其传递给另一个子进程，而不是将其输出到文件中。然后打开另一个进程在该文件上运行。
例如，第一个过程使用SAMTOOLS从一个大的bam文件中输出一个特定的染色体。所以..。bigfile.bam被读入并输出染色体22.bam
下一个子过程使用BEDTOOLS将染色体22.bam转换为染色体22.bed，因此...染色体22.bam被读入并输出染色体22.bed
我想要做的是将第一个进程的stdout传递给第二个进程，这样就不需要中间文件了。
到目前为止我有这个..。
for x in 1,
浏览 3提问于2012-01-31得票数 3
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AR SDK中图像识别的一个问题。目标图像是否必须是应用程序本身的一部分，或者我们可以在应用程序内存中设置一组图像并使用它执行设备图像识别(当我们每次单击应用程序中的一个按钮时，图像可能会改变或下载)？注意:用例只是图像识别，而不是AR功能。
浏览 1提问于2018-06-20得票数 2
3回答
这个问题建立在的基础上。
我们如何有效地在由独特元素的有序集合形成的染色体上实现交叉操作？
两个这样的双亲染色体是{'a','b','c','d'}和{'e','f','a','b'}；而这些双亲的两个可能的子染色体是{'e','f','c','d'}和{'a','f','c','b'}。
浏览 0提问于2016-03-08得票数 1
我正在尝试从染色体/位置数据帧中提取区域，这些区域与描绘组蛋白位置的染色体位置的相关列表相对应。我目前的“流水线”：
导入包含染色体和位置的原始数据集：
> mapinfo<- read.table()
> colnames(mapinfo)<-c("CHR","M")
> mapinfo$CHR<- paste("chr",mapinfo$CHR),sep="")
> head(mapinfo)
CHR M
1 chrX 24072640
2 chr9 131463
浏览 2提问于2016-12-22得票数 0
我在我的代码中使用JGAP，我想像这样评估染色体：
Evaluation 0:
1 2 3 4 5 6 7 8 9
Evaluation 1:
3 5 2 1 4 6 7 8 9
到目前为止，我得到的是带有重复等位基因的染色体，就像这样：
Evaluation 1:
3 3 5 6 7 8 9 9 1
有没有什么配置可以用来获得具有非重复等位基因的染色体？
浏览 0提问于2012-06-15得票数 0
我读过的大多数关于GAs的文献都建议使用一个大约0.7的交叉值，所以你用一个染色体的前70%的基因，而另一个染色体的最后30%的基因来产生一个新的染色体。
如果你选择双亲染色体，取前两位(按适合度排列)，那么我可以看到这里的逻辑，因为你给了更高级别染色体的基因更多的权重。然而，如果您使用随机方法(如轮盘赌轮)来选择父母，那么使用0.5以外的值作为交叉值有什么意义呢？考虑到你选择了染色体A和B作为父母，你很可能选择A第一和B第二，B第一和B第二，不是吗？
到目前为止，我只写了一本GA (仍然在学习曲线的底部，但是由于一些巨大的帮助，它的速度很快)，但是实验表明，0.5比任何其他值都能更快地收敛到
浏览 0提问于2016-12-22得票数 9
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我正在编写一个Android应用程序，将执行图像识别和分析。我听说神经网络是进行图像识别的较好方法之一，并试图将Mike‘’Neill在CodeProject上的库移植到Win32的优秀手写数字识别应用程序中。然而，最近有人告诉我Encog和Neuroph这两个优秀的用于神经网络/图像识别的Java库。我只需要神经网络工作，我将写我自己的图像识别套件周围的另一个神经网络库。有没有人知道Encog或Neuroph是否能在Android上运行，最好是Encog？
编辑：--我已经在谷歌上搜索过了，我想知道是否有人能证明图书馆在工作。
浏览 3提问于2012-01-02得票数 6
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我想知道GA的交叉阶段。据我所知，0.7 => 70%的交叉发生的几率，是一个典型的值开始。如果你的父母选择的过程是基于特定染色体的回归适应度，那么最合适的染色体通过而不是交叉的可能性很高，那么精英主义真的有必要吗？
我.我也需要一个过滤器来去除每一代的重复染色体？
浏览 1提问于2013-07-26得票数 4
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2回答
如何选择n条最佳染色体并将它们作为数组返回？
Chromosome[] Selection(int n) {}
我知道我需要比较染色体的健康程度。我有方法public double calculateFitness()
浏览 3提问于2016-03-30得票数 0
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我有一个我认为应该是一个常见问题，但我还没有找到任何好的解决方案。
我有一个文件，其中每一行都有一个染色体编号，染色体中的起始位置和一些相关的值，如下所示。
1 1.07299851019 1 1.07299851019 HQ chrY 2845223 + 0.251366120219 46
1 1.06860686763 1 1.06860686763 HQ chr10 88595309 + 0.256830601093 47
浏览 0提问于2013-07-07得票数 1
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人有22条染色体，2条性染色体X和Y。
我想从‘chr3 1’，‘chr3 2’，'chr3‘中生成这些染色体名.‘chrX 22’，'chrX‘和'chrY’，只输入染色体数目，X和Y。
# Input the data here
number_of_chr = 22,'X','Y'
for x in range(number_of_chr[0]):
print('chr'+str(x+1))
从代码中，我可以生成'chr1‘到’chr1 22‘，但是如何生成'chrX’和chrY‘并将它们附加
浏览 10提问于2013-11-30得票数 3
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