来自Bio.PDB.PDBList的retrieve_pdb_file创建.ent文件，而不是.pdb

Bio.PDB.PDBList是Biopython库中的一个模块，用于从Protein Data Bank（PDB）中检索蛋白质结构数据。其中的retrieve_pdb_file函数用于下载.pdb文件。

在使用retrieve_pdb_file函数时，可以通过指定file_format参数来选择下载的文件格式。默认情况下，该函数会下载.pdb文件，但也可以通过将file_format参数设置为"pdb"或"ent"来下载.ent文件。

.ent文件是PDB文件的一种格式，它是以文本形式存储的蛋白质结构数据。与.pdb文件相比，.ent文件包含更多的元数据信息，例如实验条件、结构解析方法等。

Bio.PDB.PDBList.retrieve_pdb_file函数的使用示例：

from Bio.PDB import PDBList

# 创建PDBList对象
pdb_list = PDBList()

# 下载.ent文件
pdb_list.retrieve_pdb_file('1XYZ', file_format='ent')

在上述示例中，'1XYZ'是要下载的蛋白质结构的PDB ID。通过将file_format参数设置为'ent'，可以下载.ent文件。

Bio.PDB.PDBList.retrieve_pdb_file函数的优势是可以方便地从PDB中获取蛋白质结构数据，并且可以选择下载不同格式的文件。它适用于需要使用蛋白质结构数据进行生物信息学研究、蛋白质结构预测、药物设计等领域。

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