云服务器分为很多种类型，现在市面上的云服务器有很多，包括不同品牌、不同规格大小，能够满足不同消费者的使用需求，云服务器能够提供安装软件的服务，那么云服务器如何安装软件呢？云服务器可以干什么？虽然不同的云服务器操作系统并不一样，但是这些操作系统都是大同小异的，所以下面为大家简单介绍云服务器如何安装软件。
随着5G信息技术的不断发展，关于云服务器的租用的需求量也是非常广的，只要是人们想在网上创办自己的网站，那么对于云服务器就少不了，很多人都不知道云服务器怎么安装软件，同时也不知道云服务器如果租用的话贵不贵？
我们平时用手机与电脑的时候，如果想安装一个软件就需要去下载它的安装包（软件包），下载安装包的前提就是必须连接网络，这就说明安装包并不在你的本地上。 **那么软件包是在哪里的呢？**是在别人的电脑上（远端服务器/云服务器）。
我们平时使用的手机上，都会有一个应用叫做“应用商店”，那大家思考一下，我们在应用商店里面去下载一些软件的时候，这些软件是从本地直接下载的呢还是从远端的服务器下载的？
一、YUM 实验拓扑图： 实验要求： （1）配置网络，并连通。 （2）在1.10主机上安装ftp服务，搭建yum服务器，将系统安装光盘下的所有文件复制到/var/ftp/rhel6下，启动FTP 服务
像我们日常使用的windows提供的应用商店或者手机提供的应用市场那样，大多数现代的类 Unix 操作系统也都提供了一种中心化的机制用来搜索和安装软件。软件通常存放在存储库中，并通过包的形式对外进行分发。处理包的工作称为包管理。包提供了操作系统的基本组件，以及共享的库、应用程序、服务和文档。这个我们称为软件包管理系统，其除了安装软件外，它还提供了工具来更新已经安装的包。
之前，小编教过大家使用Conda轻松安装生信工具，但有时候公共服务器由于安全原因是不能连接外网的，无法使用Conda在线安装软件，今天小编就教大家在离线环境下使用Conda安装软件。
今天学习的是linux环境下的软件安装，因为花花老师的教程特别棒，所以操作上基本没出现特别难的地方。
linux很少用图形界面，都是用命令行，使用。可以把服务当成一台没有图形界面的自己的电脑。
conda config --add channels https://mirrors.bfsu.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
Miniconda是最方便快捷的软件下载和管理器，相当于应用商店，大多软件都能搜到，一键安装。日常生信使用小而精的Miniconda即可。学习linux要丢弃之前的图形界面思维
上一篇写的是如何安装debian9系统服务器，但是刚安装完毕的服务器是没有接口IP地址信息的，所以还需要对系统配置eth0接口IP地址。
有些软件本来就是开源的，如果不想用别人直接发布好的软件，我们就可以把源代码下载下来，在我们的环境中编译，自己安装
在 Linux 下安装软件， 一个通常的办法是下载到程序的源代码， 并进行编译， 得到可执行程序。
YUM（全称为 Yellow dog Updater, Modified）是一个在Fedora和RedHat以及CentOS中的Shell前端软件包管理器。基于RPM包管理，能够从指定的服务器自动下载RPM包并且安装，可以自动处理依赖性关系，并且一次安装所有依赖的软件包，无须繁琐地一次次下载、安装。
：就是进行不同项目（转录组，基因组组装等等）分析的时候，需要不同的软件和同一软件的不同版本，需要进行conda环境分开互不干扰。
是指使用服务器等设备作为代理，通过伪造IP地址来实现代理的功能，这种代理相对于原生IP代理，具有更好的隐蔽性，难以被目标网站检测出来。
初学者当安装模式为默认的 Server with GUI 即可，右侧额外的软件包不要选择，可以在后续学习过程中慢慢安装。生成环境一般为Minimal Install（最小化安装）。
Installer：Installer是指Softango.com提供的软件安装程序。
Samba是在Linux和UNIX系统上实现SMB协议的一个免费软件，由服务器及客户端程序构成。SMB（Server Messages Block，信息服务块）是一种在局域网上共享文件和打印机的一种通信协议，它为局域网内的不同计算机之间提供文件及打印机等资源的共享服务。SMB协议是客户机/服务器型协议，客户机通过该协议可以访问服务器上的共享文件系统、打印机及其他资源。通过设置“NetBIOS over TCP/IP”使得Samba不但能与局域网络主机分享资源，还能与全世界的电脑分享资源。
由于特殊的专用网络环境和安全策略等方面的原因，服务器往往无法访问互联网，这时我们还需要在服务器上安装软件，比如mysql、httpd。
运行 ：bash Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
Conda 是 linux 系统中最方便快捷的下载器，两个版本：建议安装miniconda版
Mac环境比较省心的是自带PHP环境，不需要从下载源码编译安装开始，默认的PHP版本是7.1
对于使用惯windows系统的人来说，刚开始接触使用linux系统一定是很不习惯，因为使用环境的变化经常会出现一些错误。当然，对于我来说，我也是刚刚才开始接触Linux，对此，有些地方想不到的，可以多多交流。
https://www.aliyun.com/daily-act/ecs/activity_selection?source=5176.11533457&userCode=3enjgk6n
为提升我们在云服务器上的软件安装效率，减少下载和安装软件的成本，在 CentOS 环境下，我们可以通过 yum 命令快速安装软件。对于 YUM 下载源，我们不需要添加软件源，可以直接安装软件包。
在 Windows 操作系统中安装软件通常是通过已经编译成功的 exe 文件进行操作，但在 Linux 操作系统中情况就比较复杂。由于自由软件及开源社区的蓬勃发展，许多软件制作者是将源代码发布后，由使用者进行源码编译安装，此过程不仅耗时耗力，而且对使用者的技术有一定要求，无形中提高了软件使用的门槛。
选中-鼠标右键-复制链接-转到xshell-cd ~/biosoft 打开之前建立的biosoft目录-wget 左键-回车，等待下载
Linux面板命令行对于新手来说上手比较困难，需要安装各种环境还要注意权限的操作，宝塔面板很好的提供了运维服务，包含了安装软件和管理文件，安全防护等Linux基础操作，让新手也能够容易上手来管理自己的Linux服务器。
不同的分析需要的软件/软件版本不同，即环境不同，则需要不同的conda environment
CC攻击是一种成本极低的DDOS攻击方式，只要有上百个IP，每个IP弄几个进程，那么可以有几百上千个并发请求，很容易让服务器资源耗尽，从而造成网站宕机；防御CC攻击，硬件防火墙的效果不怎么明显，因为CC攻击的IP量太小，很难触发防御机制，反而是软件防火墙、WEB防火墙更容易防御。 那么，软件防火墙和WEB防火墙之间有什么区别呢？要怎么选择软件防火墙、WEB防火墙呢？ 为了让大家更好地认识软件防火墙和WEB防火墙，本着已有的认识，对两者进行较为全面的的比较，或许会让大家更好地认识网站防火墙，进一步选
这个命令将会安装名为 package_name 的软件包，同时也会解决和安装所有必需的依赖关系。
在这篇文章的结尾介绍了共享文件，但是还有一些问题。前文已经说了不能让该共享文件在任何一个用户的家目录里，只要不在这里，其他位置能在(最好是root进行创建)。问题就是，如果多人共享文件的话，那怎么才能让别人没有办法进去，防止别人妨碍用户之间的文件共享，实现指定人员的允许访问呢？
③在打开的配置文件界面，单击快捷键“shift+g”,进入配置文件最后一行。单击快捷键“i”进入编辑模式，移动光标至配置文件末尾，回车换行，拷贝粘贴以下配置代码。
--第四步（重点），使用miniconda，也就是查看已安装的软件、安装、卸载（生信需要的）软件，我们以fastqc为例，其实安装软件很复杂，甚至有专门的一门课来讲这个，今天这里仅是入门操作。
学软件开发，各种台的软件熟练安装是必须要熟练掌握。大家都知道，Windows下安装软件时，只需用鼠标双击软件的安装程序，或者用Zip等解压缩软件解压缩即可安装；在android或者apple中安装软件时，只需要在手机应用商店点击安装即可。而在Linux下安装软件难度高于Windows、Android、ios和windows phone下软件安装。下面我就详细讲解Linux下如何安装软件。
conda相当于是windows系统下的一个应用商店，可以在这个里面下载你想下载的软件，因为在Linux系统中下载软件要通过软件的官网源码安装，这个方式非常的慢而且下载好之后还有配置环境，有些软件是国外开发下载也相当不容易，于是我们使用conda这个“应用商店”就非常方便了
软件包通常会依赖其他的包，为了前者能够正常运行，补依赖的包必须提前安装在系统中。PMS工具将会检测这些依赖关系关系，并在安装需要的包之前，先安装好所有额外的软件包。
首先在浏览器中输入https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/，找到最新版本64位，右键复制链接，然后登录服务器，然后创建一个目录，在目录下在wget后将链接复制，点击Enter,下载过后，在bash后加上安装包名称，进行安装，按q跳过它们,按q不动的地方按回车，看到问问题，就回答一个yes，按回车，注意回答yes，不然就会失败。
输入 uname -a 查看服务器是多少位的（查看过后是x86_64即64-bit） 进入biosoft cd biosoft wget 下载链接https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-latest-Linux-x86_64.sh
相比于之前在网站上去找下载源,如今我们更加喜欢使用应用商店的方式下载软件. 一方面不需要我们一个个需要下载源,另一方面应用商店会帮我们选择适合我们的软件版本.
gcc 是 C 语言的编译器，鉴于该软件包涉及到的依赖包较多，建议使用 yum 命令安装。
anaconda：所有语言的包、依赖和环境管理器，几乎全平台（Windows、macOS、Linux）
Ansible YUM模块是Ansible中用于管理Red Hat系Linux发行版软件包的强大工具，它具有以下优点：
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