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1
回答
是否
在
slurm
中
打印
每个
作业
使用
的
cpus
数量
?
我们已经将sge
的
slurm
用于我们
的
集群
作业
排队系统。
在
sge
中
,当您
使用
qstat函数时,它会
打印
每个
作业
使用
的
cpus
/插槽
的
数量
--
在
slurm
中有没有简单
的
方法可以做到这一点?squeue只显示
每个
作业
使用</e
浏览 59
提问于2020-11-20
得票数 2
回答已采纳
1
回答
充分利用
SLURM
上
的
所有CPU
、
、
、
、
我想在群集上运行
作业
。
在
不同
的
节点上有不同
数量
的
CPU,我不知道哪些节点将分配给我。什么是适当
的
选项,以便
作业
可以在所有节点上创建与CPU一样多
的
任务? #!
浏览 29
提问于2019-08-13
得票数 3
回答已采纳
1
回答
如何保存
SLURM
作业
配置?
、
、
假设我
使用
以下配置运行
slurm
作业
: #SBATCH --ntasks=1 # Run a single task echo '\n ntasks: ' $
SLURM
_NTASKS echo '\n <e
浏览 2
提问于2018-02-18
得票数 1
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2
回答
Slurm
的
srun比mpirun慢
、
如果我在下面的代码中将'mpirun‘替换为'srun’,我
的
mpi+openmp
作业
运行速度会慢3倍!##SBATCH --
cpus
-per-task=16#Process Manager: pmi Launchers available: ssh rsh fork <em
浏览 18
提问于2015-08-06
得票数 2
1
回答
确定分配给
作业
的
处理器
数量
、
、
我正在尝试修改一个python程序,该程序将
使用
一个工作程序池
在
Linux hpc计算环境
中
执行任务。我希望将池中
的
工作线程数设置为等于我为
作业
请求
的
线程数。multiprocessing.cup_count()和num_procs等命令返回64,这是一个节点上
的
线程数,但不是分配给我
的
作业
的
线程数。我目前
的
解决方案是
在
批处理文件
中
grep指定线程数
的</
浏览 1
提问于2019-05-23
得票数 2
1
回答
MPI和
Slurm
概念
、
如何指定要在X个
cpus
数量
上运行mpi
作业
,
在
使用
slurm
时,我看到
的
所有参数都是用于
使用
节点
的
? 我可以跨多个分区运行mpi
作业
吗?
浏览 9
提问于2015-10-04
得票数 4
回答已采纳
1
回答
SLURM
C++看到
的
可用内核比分配
的
多
、
、
、
、
我试图
在
SLURM
管理
的
HPC集群上运行一个进程多线程
作业
。我打算在我
的
线程中
使用
多核。当我将资源分配给HPC时,我
使用
以下命令:#SBATCH --ntasks=1这应该将8个CPU分配给同一台机器上
的
一个进程我怀疑,尽管
SLURM
只为任务分配了8个CPU,但机器总共有32个CPU。 但是,我
使用
的
浏览 0
提问于2019-09-07
得票数 2
回答已采纳
1
回答
如何
使用
SLURM
限制
在
同一节点上运行
的
作业
数?
我有一个由100个
作业
组成
的
作业
数组。我希望最多可以将
作业
数组
中
的
2个
作业
分配给同一个节点。我怎么能用
SLURM
做这件事?谢谢!
浏览 4
提问于2017-11-19
得票数 3
回答已采纳
1
回答
获取可调优
的
节点数、代码数和可用RAM
、
、
我正在尝试来调优我
的
HPC集群(我
使用
Sparklyr),并尝试收集由指定
的
一些重要规范: 我知道如何
使用
sinfo -n -l,但我看到太多
的
核心,我很难获得这些信息。有更简单
的
方法来了解我<
浏览 2
提问于2017-06-26
得票数 0
回答已采纳
1
回答
linux一个节点上并行运行
的
任务
的
单独.out文件
、
、
、
我
在
linux上
使用
slurm
并行运行
作业
,方法是请求一个节点,
每个
cpu运行一个任务。 但是,指定
的
输出将两个流连接到单独
的
out文件
中
。我尝试了
在
替换时
使用
%t标志,它将分离任务,但它只是记录输出文件
中
的
所有内容,并附加了_0 (例如,sample_output__XXX_XX_0.out)。任何关于如何最好地为
每个
任务生成单独
的
.out日志
浏览 2
提问于2021-06-17
得票数 0
回答已采纳
1
回答
Snakemake WorkflowError:未能将
作业
组合在一起
、
背景:我必须将我
的
Snakemake管道从一个节点
的
使用
调整到一个具有资源管理
的
集群。
使用
特定于
SLURM
的
Snakemake配置文件,我
的
规则成功地作为
SLURM
作业
提交,因此我继续将Snakemake指令resources添加到
每个
非本地规则
中
,以优化队列调度。ruleB: resources:
浏览 5
提问于2021-11-12
得票数 0
回答已采纳
1
回答
slurm
- sbatch
作业
数组,用于并行执行
使用
wrap命令填充
每个
节点
的
串行
作业
、
我有一个文件,每行只有一个命令,如下所示: myprog.sh <args abc> myprog.sh <args def> 我正在尝试将这些提交为数组
中
的
作业
。阵列应
使用
1台主机以及该主机上
的
所有
cpus
。相反,
每个
阵列
使用
2个主机,并在这两个主机上执行这两个命令。.out将具有来自
作业
1
的
标准输出,而
slurm
1_2.out将具有来自job2
的
标准输出
浏览 100
提问于2021-06-26
得票数 0
2
回答
SLURM
如何在
每个
节点上启动一次脚本
、
我通过
SLURM
提供了一个大集群。我想在
每个
请求
的
节点上启动我
的
脚本,例如,
在
每个
具有指定
数量
的
核心
的
节点上启动./calc。例如,
在
2个节点上,
每个
节点16个核心。/clac 2 & wait 然而,它并没有像预期
的
那样工作。我尝试了--ntask --nodes --
cpus
-per-task
的
许多配置,但都不起作
浏览 166
提问于2021-04-30
得票数 0
3
回答
将HEREDOC与
SLURM
sbatch一起
使用
--wrap
、
、
、
我
在
使用
(Bash) HEREDOC和通过--wrap提交
SLURM
sbatch时遇到了困难。' '--mail-type=ALL')
SLURM
_
CPUS
_ON_NODE=\${
SLURM
_
CPUS
_ON_NODE:-8}
浏览 107
提问于2018-10-31
得票数 0
回答已采纳
1
回答
SLURM
不遵循请求
的
资源。
、
我有一个名为“test.sub”
的
提交脚本:...NumNodes=1 NumCPUs=64
CPUs
/Task=1 ReqB:S:C:T=0:0:*:*这
是否
意味着
作业
使用
的
是64个
cpus
,而不是
作业
脚本中指定
的<
浏览 2
提问于2018-03-28
得票数 2
回答已采纳
1
回答
编译器没有
使用
所有的CPU,我需要你
的
建议
、
、
、
我
的
PC有两个cpu xeon e5-2678v3,12个核心/24个线程
每个
cpu (总共24个核心/ 48个线程)我提交了
slurm
批处理
作业
,为我
的
代码请求多核(CFD fortran代码与英特尔fortran编译器
在
linux)代码运行良好,但似乎所有48个线程只
在
一个cpu上运行,而不是双cpu。我
使用
上面相同
的
slurm
批处理
作业
文件检查了串行和openMP运行;结果
浏览 2
提问于2020-05-19
得票数 0
1
回答
列出每种状态
的
作业
数
是否
有一种简单
的
方法可以让
SLURM
为给定
的
用户
打印
出
每个
状态
的
作业
数量
(例如,运行、挂起、完成、失败等)?
浏览 1
提问于2018-12-11
得票数 2
回答已采纳
1
回答
配置
Slurm
使其具有比核心更多
的
MPI任务
、
、
、
我正在Raspberry Pi 4
的
集群上设置
Slurm
,成功地
在
我
的
24 RPi集群上配置和
使用
Slurm
,并允许
每个
RPi执行4个MPI任务。我还没能设置
Slurm
配置来完成这个任务。 我不希望
每个
MPI任务都有多个线程。我希望能够设置
Slurm
,以便它允许
每个
节点分别为192或384个MPI任务执行8或16个MPI任务。对于我目前
的
工作,我
使用
Slu
浏览 11
提问于2022-02-24
得票数 1
1
回答
SLURM
:
在
作业
中
不能
使用
超过8个CPU
抱歉问了个愚蠢
的
问题。我们
使用
slurm
-16.05.9设置了一个小型集群。,
每个
套接字有20个核心,总共有40个CPU。然而,我们不能提交一个
使用
超过8个CPU
的
作业
。例如,
使用
以下职务说明文件:即使集群
中
根本没有
作业
,除非我们设置-
cpus
每个
任务<= 8。我们
的
slu
浏览 9
提问于2022-08-25
得票数 1
1
回答
在
处于空闲状态
的
两个节点上
使用
SLURM
运行
作业
、
我是
slurm
的
新手,我有两个处于空闲状态
的
节点,但是我
的
作业
只在其中一个主节点(node01)上运行,而我不明白为什么第二个节点(node02)不运行
作业
。我为500个要提交
的
作业
创建了一个while循环
在
脚本"myscript.sh--time=00:03:00 #SBATCH
浏览 9
提问于2021-12-08
得票数 0
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