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强制snakemake在不使用--use-conda的规则中运行python2

强制snakemake在不使用--use-conda的规则中运行Python2是通过在Snakemake规则中指定所需的Python版本来实现的。可以通过在规则的shell命令中使用特定的Python解释器路径来实现。

以下是一个示例规则,展示了如何强制snakemake在不使用--use-conda的情况下运行Python2:

代码语言:txt
复制
rule my_rule:
    input:
        "input.txt"
    output:
        "output.txt"
    shell:
        "/path/to/python2 /path/to/script.py {input} > {output}"

在上述示例中,/path/to/python2是Python2解释器的路径,/path/to/script.py是要运行的Python脚本的路径。通过在shell命令中使用这些路径,可以确保Snakemake在不使用--use-conda的情况下使用Python2来运行规则。

请注意,这只是一个示例,实际的路径和脚本名称可能会有所不同。您需要根据您的实际情况进行相应的更改。

关于Snakemake和Python的更多信息,您可以参考腾讯云的产品文档:

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