那么今天我们就为大家介绍一下目前在R语言中流行的绘图包ggplot2。 1. ggplot2的安装:install.packages("ggplot2")。...2. ggplot2的绘图原理: ggplot2的核心理念是将绘图与数据分离,数据相关的绘图与数据无关的绘图分离,并按图层作图。...) geom_polygon 多边形 geom_quantile 一组分位数线(来自分位数回归) geom_rect 二维的长方形 geom_ribbon 彩虹图(在连续的x值上表示y的范围,例如Tufte...二维密度图,用六边形表示 stat_boxplot 绘制带触须的箱线图 stat_contour 绘制三维数据的等高线图 stat_density 绘制密度图 stat_density2d 绘制二维密度图...coord_map 地图投影 coord_polar 极坐标投影 coord_trans 变换笛卡儿坐标 分面函数 描述 facet_grid 将分面放置在二维网格中 facet_wrap 将一维的分面按二维排列
split选项将页面分割为一个指定行数和列数的矩阵,然后将图形放置到该矩阵中。...它将把第一幅图放置到第二幅图的上面。具体来讲,第一个plot()函数把页面分割成一列 两行的矩阵,并将图形放置到第一列、第一行中(自上往下、从左至右地计数)。...playwith()函数允许用户识别和标注点、查看一个观测所有的变量值、缩放和旋转图形、 添加标注(文本、箭头、线条、矩形、标题和标签)、修改视觉元素(颜色、文本大小等)、应用先前存储的图形风格,以及以多种格式输出图形结果...这些点将会被突出显示,而其他图形窗口中相应的观测点也将会变成红色。 按住Ctrl键不动,将鼠标移动到某幅图形中点、条、箱线图或线上,该对象的详细信息将会在一个弹出窗口中显示出来。...你可尝试在柱状图(gears)窗口选择三号和五号齿轮条。
今天的推文没有详细介绍代码,代码的介绍会以视频形式放到B站,欢迎大家关注我的B站 小明的数据分析笔记本 https://space.bilibili.com/355787260 image.png 首先是示例数据的格式...画热图的数据 image.png 用来添加文本的数据 image.png 如果还有其他文本需要添加,可以再准备一份数据 image.png 加载需要用到的R包 library(ggplot2...) library(tidyverse) #install.packages("see") library(see) ggplot2 是用来作图的 tidyverse 是用来做数据整理的 see 这个包里有很多配色函数...读取热图的数据作图 dfa<-read.csv("20211007.csv") head(dfa) pivot_longer(dfa, !...X, names_to = "Y", values_to = "Value") -> dfa.1 head(dfa.1) 读取添加文本的数据 dfb
由于我们将此图层添加到最上层(即代码的最后),因此更改的任何细节都会覆盖在theme_bw()中的设置的。在这里,将轴标签和轴刻度标签的大小增加到默认大小的1.5倍。修改文本大小使用rel()函数。...提供了不同的示例图和相关代码(geom或theme的代码)。 ---- 练习 当前坐标轴标签文本默认为geom_point的输入内容(即列标题)。...箱形图提供了基于五分位数的数据分布图。框的顶部和底部代表第一和第三个四分位数(分别为25%和75%)。框内的线代表中位数(50%)。在框的上方和下方延伸到的点代表数据集的最大值和最小值。...以'Genotype'作为x轴标签,'Mean expression'为y轴标签。 将轴标签的大小更改为默认值的1.5倍。 将轴文本的大小(刻度线上的标签)更改为比默认值大1.25倍。...将图片导出到文件 有两种方法可以将图输出到文件中(而不是简单地在屏幕上显示)。第一种(也是最简单的)是直接从RStudio“Plots”面板导出,点击绘图面板上方的Export。
ggplot2 初探 在ggplot2中,图是采用串联起来(+)号函数创建的。每个函数修改属于自己的部分。...在上述例子中,geom_point()函数在图形中画点,创建了一个散点图。labs()函数是可选的,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选的参数。...分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。 分组是通过ggplot2图将一个或多个带有诸如颜色、形状、填充、尺寸和线条类型的视觉特征的分组变量来完成的。...指定刻度标记、labels=指定刻度标记标签、limits=控制要展示的值的范围 scale_x_discrete()和scale_y_discrete() breaks=对因子的水平进行放置和排序,labels...=指定这些水平的标签,limits=表示哪些水平应该展示 coord_filp() 颠倒x轴和y轴 我们将这些函数应用一个分组箱线图中,其中包含按学术等级和性别分组的薪资水平,代码如下: data(Salaries
图1 合并多幅图形 上面的代码中,首先绘制了三幅图形,箱线图,点图和时间序列图。然后使用cowplot包中的plot_grid函数将三幅图形合并到一幅图当中。...另外,使用ggdraw()函数、draw_plot()函数和draw_plot_label()函数的组合可用于将图形和标签放置在具有特定大小的特定位置。...ggdraw():初始化一个空的绘图画布;draw_plot():在绘图画布上的某个位置放置一个绘图。draw_plot_label():在图的左上角添加一个plot标签。...函数的参数含义是: plot:要放置的plot (ggplot2图形或gtable图形)。 x,y::用于指定标签的位置。 size :要绘制的标签的字体大小。...则可以使用arangeGrop()函数轻松的实现,下面的代码在图形的左侧放置了一幅点图,在右侧放置了两幅图形,箱线图的直方图,如图4所示。
R base graphs R带有简单的函数来创建许多类型的图形。 例如: ? 在大多数情况下,您可以使用以下参数来自定义绘图: pch:改变点形状。 允许值包括1到25之间的数字。...分别指定主标题和x / y轴标签 las:对于垂直x轴文本,使用las = 2。 在下面的R代码中,我们将使用iris数据集来创建: 首先我们绘制一个以iris ?...ggplot2图形 GGPlot2是一个功能强大且灵活的R软件包,由Hadley Wickham实现,用于逐件生成优雅的图形。...ggplot2中的gg表示图形语法,这是一个图形概念,通过使用“语法”来描述图。...它还可以用来控制点的颜色,大小和形状等...... geometry:对应于图形类型(直方图,箱形图,线图,......)
使用ggplot2进行数据可视化② 添加其他变量的一种方法是aesthetics。 另一种对分类变量特别有用的方法是将绘图分割为多个子图,每个子图显示一个数据子集。...在ggplot2语法中,我们说它们使用不同的geom。 geom是绘图用于表示数据的几何对象。 人们经常根据情节使用的几何类型来描绘情节。...例如,条形图使用条形图,折线图使用线条图,箱形图使用箱形图格栅等。 散点图打破了这一趋势; 他们使用点geom。 如上所述,您可以使用不同的geom来绘制相同的数据。...如果这听起来很奇怪,我们可以通过在原始数据上叠加线条然后根据drv着色所有内容来使其更清晰。 请注意,此图包含同一图表中的两个geom!我们将很快学会如何在同一个地块中放置多个geoms。...image.png 如果将映射放在geom函数中,ggplot2会将它们视为图层的本地映射。 它将使用这些映射来仅扩展或覆盖该层的全局映射。 这使得可以在不同层中显示不同的aesthetics。
通常密度会随附一种叠加的图表类型,如箱形图,以提供一些其他的数据信息,即矩形上下边框代表第一个和第三个四分位数,中间点是中位数。 小提琴图可以用来观察数据的分布情况,也可用于比较多个组之间的分布。...#p值校正方法 notchwidth = 0.5, #对于有缺口的箱形图,缺口相对于主体的宽度(默认为0.5) linetype = "solid", title = "Fuel efficiency...这里的小提琴图是箱形图和核密度图的组合。...(fill=factor(cut))) + #"trim"为TRUE(默认值),将小提琴的尾部修剪到数据范围。...legend.position="none" #不加图例 ) + coord_flip() #翻转坐标 ggnormalviolin ggnormalviolin是使用ggplot2根据指定的均值和标准差创建正态分布的小提琴图的方法
abline()、hline()与vline() 在R的基础绘图系统中我们可以在已绘制的图床上通过abline来添加线条,在ggplot2中当然也有类似的方法: geom_abline(): ...,箱线图是非常有代表性的,它通过图形表现五数概括的情况,在数据基本的描述性统计中具有重要意义,而ggplot2中必然可以绘制箱线图,而且可以绘制得非常精美,下面先看一个最朴素的分组箱线图形式: p 的标签: p + geom_label() 改变文本标签的大小: p + geom_text(size = 10) 调整文字标签位置: p + geom_point() + geom_text...= "white", fontface = "bold") 在图床指定位置添加文本标签: df <- data.frame( x = c(1, 1, 2, 2, 1.5), y = c(1,...,且更为美观,ggplot2可以绘制出与seaborn中的小提琴图同样优美的图形,因为涉及的内容比较复杂,我准备在之后单独开一篇来介绍,下面仅展示一张简单的小提琴图: library(ggplot2)
、fill、alpha、linetype 二、精雕细琢 以上做出来的图还是比较粗糙的,接下来将逐步对其进行微调 (1) 添加标题、横纵轴标签 ggplot(data=singer, aes...scale_fill_discrete(breaks=c())等命令(但是它是将原图例和新的图例一起呈现的 (6) 多图汇总 当需要结合多组图片进行说明时,就需要将其放置一张画布上呈现。...而普通设置画布的方式par(mfrow=c(n,m)),在ggplot中是不起作用的。以下,介绍两种多图呈现的方式。使用的数据集为鸢尾花 I....无法指定各个图片放置的位置,当然也无法指定某个图片占一排的情况。...它们均需要指定为一个类别型变量,而实际中数据排列方式通常如左图所示,ggplot2需要的是右图排列样式。
在对数据可视化的时候,我们需要明确想要展示的信息,从而选择最为合适的图突出该信息。本系列文章将介绍多种基于不同R包的作图方法,希望能够帮助到各位读者。...什么是箱形图 箱形图(Box-plot)是一种用作显示一组数据分散情况的统计图,因形状如箱子而得名。除了生信领域,该图在其他领域也经常被使用。...箱形图能显示出一组数据的最大值(Maximum)、最小值(Minimum)、中位数(Median)及上下四分位数(1st/3rd Quartile),同时还可以显示逸出值(Outlier)。 ?...箱形图怎么画 (1) 需要什么格式的数据 我们需要的数据只要两列,一列为x,一列为y。本次我们使用R中提供的iris数据。 ?...比如我们想要探究不同物种的花萼长度差异。 (2) 如何使用ggplot2做箱形图 利用ggplot2画图的核心命令是geom_boxplot。我们先来尝试做一个最最基础也是最丑的boxplot图。
绘图系统 ggplot2初识 更多下期详解 引言 不同类型变量常用的图表 连续数值变量 一个数值变量可以用:柱状图,点图,箱图 两个数值变量可以用:散点图 分类变量 一个分类变量的可视化:频率表,条形图...两个分类变量的可视化:关联表,相对频率表,分段条形图 一个分类变量一个数值变量: 分类箱图、条形图 1 Lattice绘图系统 特点:一次成图;适用于关系变量间的交互:在变量z的不同水平,变量y如何随变量...1.5 页面布局 lattice无法使用par()函数,因此需要将图形存储到对象中,然后利用plot()函数中的split = 或position = 选项来进行控制 split的方法,将第一幅图放置到第二幅图的上面...:第一个plot()函数把页面分割为一列两行的矩阵,并将图形放置到第一列第一行中;第二个plot()函数将图形放置到第一列第二行中,由于plot()函数默认启动新的页面,因此使用newpage = FALSE...2 ggplot2绘图系统 ggplot2将数据、数据到图形要素的映射以及图形要素绘制分离,然后按图层叠加的方式作图,通过+进行叠加。
许多人包括ggplot2的创建人Hadley Wickham将这一成功归功于ggplot2背后的哲学。...幸运的是,在过去10年里,R社区一直在努力为ggplot2构建扩展包,到如今已有超过40个扩展包可供使用,今天为要介绍的是大家比较钟爱的12个ggplot2扩展包,想要查看所有ggplot2扩展包的介绍及使用例子...8 ggrepel 作者:Kamil Slowikowski 网址:https://cran.r-project.org/web/packages/ggrepel 简介:当我们在图形中添加标签时,标签之间很容易相互重叠...条形图、散点图、方框图、地图等,并在悬停时显示数据信息(例如数据值或标签),如下图所示。...- 基础概念和矩阵操作 R语言 - 热图简化 R语言 - 热图美化 R语言 - 线图绘制 R语言 - 线图一步法 R语言 - 箱线图(小提琴图、抖动图、区域散点图) R语言 - 箱线图一步法 R语言 -
在ggplot2 中,可以通过使用 geom_point() 来在箱线图上增加点,这些点可以代表分组中特定指标的出现率。...density: 密度参数,可能用于调整箱线图内密度图的显示。legend.h: 图例的高度。legend.x.pos 和 legend.y.pos: 图例在图表中的位置。...geom_point(size = 2, shape = 5):在箱线图上添加点,大小为 2,形状为 5(通常是一个星号)。labs(x = ""):设置 x 轴的标签为空字符串。...数据框的基础上添加文本标签,映射 Group 到 x 轴,position 到 y 轴,occ_lab 作为标签文本,不显示图例。...pl结果:带有显示Index在不同分组出现率的箱线图画图: prism主题结果:带有显示Index在不同分组出现率的prism风格的箱线图
5.8 ggplot2简介 5.8.1 什么是ggplot2 ggplot2是由Hadley Wickham设计的R软件包,它有助于数据绘图。在本实验中,我们将简要介绍该软件包的一些功能。...5.8.2 ggplot2的原理 如果要使用ggplot2绘制数据,则数据必须是数据框。 使用aes映射函数来指定数据框中的变量如何映射到图上的要素 使用geoms来指定数据在图表中的表示方式,例如。...散点图,条形图,箱形图等。 5.8.3 使用aes映射功能 该aes函数指定数据框中的变量如何映射到绘图上的要素。...例如,我们选择的geom可以指定我们的数据显示为散点图,条形图或箱形图。 让我们看看我们的图形怎样看起来像散点图。...在图的顶部和左侧绘制的树是聚类算法的结果,并使我们能够看到,例如,细胞4,8,2,6和10彼此更相似它们是相似的细胞7图表左侧的树表示应用于数据集中基因的聚类算法的结果。
分面 5.1 使用分面将数据分割绘制到子图中 5.2 在不同坐标轴下使用分面 5.3 修改分面的文本标签 5.4 修改分面标签和标题的外观 6....(drv ~ cyl) # 同时根据drv纵向、cyl横向分面 5.1.2 使用facet_wrap()分面 使用facet_wrap()时,各子图将像纸上的文字一样被依次横向排布并换行。...5.2 在不同坐标轴下使用分面 使每个分面的坐标轴不一样,将标度设置为"free_x"、"free_y"或"free"。...通过设置只有的坐标轴标度,各个子图将拥有自己的坐标轴值域。...5.3 修改分面的文本标签 分面变量一般为离散型变量或者分类变量,直接修改分面变量各水平的名称就可以修改分面的文本标签。
坐标系可能是ggplot2中最复杂的部分。 默认坐标系是笛卡尔坐标系,其中x和y位置独立地确定每个点的位置。 还有一些偶尔有用的其他坐标系统。...ggplot2可以通过coord_flip()切换x和y轴。例如,如果你想要水平箱形图。 这对长标签也很有用:很难让它们在x轴上不重叠的情况下适合。
Q: 如何加载一个以符号分隔的文本文件中的数据?...绘制散点图 library(ggplot2) ggplot(mtcars, aes(x= wt, y= mpg))+geom_point() #这里的第一部分ggplot2创建绘图对象,将数据框传递给该函数...第二个设置每一个条形对应的标签,若向量中的元素已被命名则自动使用元素的名字作为条形标签 head(BOD)#BOD数据记载了BOD与时间的关系 Time demand 1 1 8.3 2...mpg))+geom_histogram()#默认的组距为30 ggplot(mtcars,aes(x=mpg))+geom_histogram(binwidth = 4) 2.5绘制箱型图 Q: 如何绘制箱型图以对不同分布进行比较...~supp,data=ToothGrowth) #在x轴引用两个变量的交互 boxplot(len~supp+dose,data=ToothGrowth) 3.ggplot2绘制箱线图 #基础画法
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