如果这些项是通过用户输入从弹出窗口添加的，我应该在哪里调用方法从ListView中删除这些项？

如果这些项是通过用户输入从弹出窗口添加的，你可以在ListView的适配器中调用remove()方法来删除这些项。具体步骤如下：

1. 首先，你需要创建一个适配器(Adapter)来管理ListView中的数据项。适配器是ListView和数据之间的桥梁，负责将数据项显示在ListView中。
2. 当用户通过弹出窗口添加新的项时，你需要将这些项添加到适配器的数据集中。
3. 接下来，你可以在适配器中的某个方法中调用remove()方法来删除这些项。通常，你可以在适配器的getView()方法中处理ListView的每个项，当用户点击删除按钮时，调用适配器的remove()方法来删除该项。
4. 在remove()方法中，你可以使用ArrayList或其他数据结构来存储ListView的数据项。通过调用ArrayList的remove()方法，你可以删除指定的项。
5. 最后，当你调用remove()方法后，记得调用适配器的notifyDataSetChanged()方法来通知ListView数据集发生了变化，从而更新ListView的显示。

总结起来，你应该在适配器中调用remove()方法来从ListView中删除通过用户输入从弹出窗口添加的项。具体实现步骤可以参考以下示例代码：

// 创建适配器
MyAdapter adapter = new MyAdapter(dataList);

// 将新项添加到适配器的数据集中
adapter.addData(newItem);

// 在适配器中调用remove()方法删除项
adapter.remove(itemToRemove);

// 通知ListView数据集发生变化
adapter.notifyDataSetChanged();

请注意，这只是一个示例代码，具体实现可能会根据你的项目结构和需求有所不同。