我正在使用drc软件包绘制使用13个点的剂量响应曲线。然而，当使用下面的数据时，在绘图中13个点中只有6个是可见的。有谁有解决这个问题的办法吗？我怀疑重复的X值是问题的一部分-复制是否被模型平均？library(drc)y<-c(15,10,19,11,10,5,13,4,0,0,10,19,21
浏览 16提问于2017-12-30得票数 3
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我正在使用drc包中的drm函数在R中进行非线性回归。drm函数接受curveid参数，这使得drm能够拟合多条曲线，并将结果存储在单个模型对象中。接下来，我绘制曲线和置信区间。然而，我有一个问题，当模型对象包含多条曲线时，这些曲线看起来很好，但置信区间通常只为第一条曲线绘制(尽管按照它的alpha级别，似乎已经绘制了几次)。这让我想到，也许plot.drc (类‘drc’的S3方法)中存在一个bug，所以“曲线”被硬编码在其中。我看
浏览 6提问于2017-12-06得票数 1
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我很难预测r中的置信区间ros和nls。model = nls(cases ~ SSlogis(log(date), Asym, xmid, scal), data= data )
interval <- predict(model, n
浏览 5提问于2020-04-21得票数 9
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我试图用IC50包估计drc值。绘制模型的效果很好。但是当我使用ED时，我得到了不合理的结果。根据我的理解，IC50应该围绕模型的拐点。在这种情况下，我估计大约0.25。2.31306991, 0.07294833)
library(drc
浏览 2提问于2017-01-23得票数 2
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我正试图用drc复制ggplot2的情节。这是我的第一次尝试(下面给出MWE)。然而，我的ggplot2与基数R图有点不同。我在想我是不是漏掉了什么东西？library(drc)
plot
浏览 0提问于2016-07-03得票数 5
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我经常使用drc软件包来分析数据。在这里，您可以定义一个curveid，它将在一个图中绘制多行。它将把它绘制成drc包。我也想试一试reshape2，但是无法安装这个软件包。是否有更简单的解决方案(类似于drc)包？
谢谢你的帮忙
浏览 3提问于2015-06-14得票数 0
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我想用r平方值来比较三种模型的曲线拟合。我使用nls和drc包运行模型。然而，这两个包似乎都没有计算r平方值；它们给出了“残差std误差”和“残差平方和”。
这两者能用来比较适合的模型吗？
浏览 4提问于2014-02-23得票数 3
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我想使用drc软件包中的mselec函数来选择剂量反应数据集的最佳模型。但是，如果在函数中使用mselect，则它不起作用。下面的代码可以工作：ryegrass.m1 <- drm(rootl~conc, data = ryegrass, fct = LL.4())
但不是这个：model1=drm(rootl~conc, data=data, fct=LL.4
浏览 5提问于2018-05-02得票数 1
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我目前正在尝试建模并绘制一条具有较少点数的S型曲线。>myExperiment0.1 9 0.9 10 9 0.1 我使用的是minpack.lm包中的nlsLM函数
浏览 8提问于2016-09-16得票数 0
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DRC软件包中的曲线在图上不正确拟合
我有困难绘制一个drm在R包DRC。剂量反应曲线工作良好，个别的图样和模型起作用。
浏览 27提问于2016-03-10得票数 1
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在生物学中，我们经常想要绘制剂量反应曲线。R包'drc‘是真正有用的，基本图形可以轻松处理'drm模型’。但是，我想将我的drm曲线添加到一个ggplot2中。我的数据集： library("reshape2") demo=structure(list(X = c(0, 1e-08,为了在ggplot2中绘制同样的情节，我偶然发现了两
浏览 13提问于2016-04-21得票数 9
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我试图使用刚果民主共和国封装中的Gompertz函数来拟合纵向数据上的增长模型。为了在几个国家同时生成模型，我嵌套了数据并使用了tidyverse的map函数。使用purrr::map的建模步骤运行得很好，但是当我试图使用扫帚中的try选项获取模型摘要时，我会得到一个错误，即对于类drc的对象不存在瞥视方法。软件包> library(drc)
> data = read.delim("test_data.txt&q
浏览 2提问于2020-06-21得票数 0
我试图建立一种高通量的方法，从一个大型筛选实验中绘制出剂量反应曲线。棱镜显然有最简单的方法做剂量-反应曲线很好，但我不能复制和粘贴这么多的数据。由于CRAN删除了drc，所以包dr4pl似乎是可行的，但目前可用的指令非常少。但是，我如何在一幅图上绘制多个数据集/曲线？理想情况下，我更愿意用ggplot2：plot+geom_point()绘制数据，并将dr4pl摘要作为+stat_smooth()模型添加到剂量响应行中，如果这有意义的话？但我不知道该怎么做。
浏览 9提问于2021-03-25得票数 3
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我在R中使用drc包，在计算模型后，我尝试使用函数ED来获得几个级别(IC50，IC75，IC90...)的有效剂量，但是我有时会收到以下错误消息，但我似乎找不到任何关于如何解决它的信息。类型错误(parmChosen，respLevj，EDlist= reference，type = type，：找不到函数"EDhelper“
软件包已经正确安装和加载，在查看文档后，似乎EDhelper
浏览 0提问于2014-12-04得票数 0
evaluating the modelIn sqrt(1 - (1 + k) * rd^2/R^2) : NaNs produced
上面给出了该模型的功能我打算先拟合模型，然后计算出每一次测量的残差。
浏览 0提问于2014-04-24得票数 2
fct=LL.4(fixed=c(NA,0,1,NA)), type="binomial") 这是我收到的回复： could not find function "drm" 我知道这可能与正确安装软件包的问题有关当我使用以下命令安装drc包时 install.packages("drc") 我明白了，这看起来很好： trying URL 'https://cran.pacha.dev/bin/macosx&#x
浏览 16提问于2021-08-03得票数 1
我对R比较陌生，对绘制剂量-反应曲线很感兴趣。我发现了GRMetrics，我发现它非常有用。示例(如纪录片中给出的)将产生一个散射斑点，并绘制出它们上面的近似函数-完美，但如何根据点和曲线的颜色，轴标签，厚度等对绘图设计进行完美的设计。我很感谢任何关于如何解决这个问题的建议。if (!browseVignettes("GRmetrics") #link to documentation
data(inputCaseA)
he
浏览 4提问于2018-11-09得票数 1
0.00015625 0.00031250 0.00062500 0.00125000 0.00250000 0.00500000 0.01000000)plot(fit_OK)
而这个
Data_NotOK <- c(1.51851, 1.50515, 1.49136,
浏览 2提问于2021-08-23得票数 0
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