1回答
biplot<-ggbiplot(pcobj = PCA,choices= c(1,2),scale = 1,groups = Fdata$Tissue,ellipse = TRUE)+
geom_vline
浏览 23提问于2021-10-12得票数 0
回答已采纳
有两类10个数据(SNP1-SNP10)，我希望用符号来分隔它们，但如何在R中写代码。我的代码如下： data=read.table(file= "snp.txt",header= T,sep = "")library(ggplot2)
pca.data<-data.frame(Sample=rownames(pca$x), X=pca$x[,
浏览 18提问于2020-12-19得票数 1
1回答
自动打印更改代码的符号
、、、
我有一个小小的图谋困境，我希望你们都能给我一个快速而简单的答案。我使用prcomp()运行了一个PCA，并第一次尝试使用ggplot绘制它。我使用的配色方案不容易更改(因为这个PCA图需要协调许多其他图形)，所以我一直在尝试更改我的图形，以便为每个组包含不同的符号。我发现了另一个提到使用scale_shape_manual()添加这些符号的，但是当我尝试实现它时，
浏览 2提问于2016-10-27得票数 3
对数据集样本进行主成分分析，保留前两个分量向量.I，然后用k=3计算前两个分量的k均值聚类，然后根据聚类组的前两个特征函数和颜色绘制二维散点图。我用散点图完成了所有的事情，但是当我看到这个图时，我无法区分哪些样本是聚在一起的，所以我想将样本标签添加到散点图中的各个点。有人能建议我怎么做吗？tdata<-t(subdata)dat.loadings <-pca$x[,1:2]
cl <-
浏览 1提问于2013-08-07得票数 2
回答已采纳
1回答
PCA变换簇颜色
、、
我想改变我的集群的颜色，但保持形状。habillage=iris$Species改变颜色和形状，什么可以只改变颜色？library("devtools")library("factoextra")fviz_pca_ind(iris.pca, geom=&qu
浏览 0提问于2017-10-25得票数 2
回答已采纳
请帮帮我，我用ggplot制作了一个由红色和蓝色点组成的图。现在我想用一条线把红色的点连在一起，用另一条线把蓝色的点连在一起，这是我的代码ggplo
浏览 1提问于2022-12-02得票数 0
回答已采纳
如何使用ggplot2使用dataIris.pca中的信息创建方差图的比例，并将其添加到主ggplot (mainPlot)的右上角library(MASS)library(ggplot2) dataIris.pca <- data.frame(summary(
浏览 2提问于2020-07-29得票数 0
回答已采纳
我已经制作了一个PCA图，我正在努力让它成为一个传奇(这是R的新手)。 下面是代码，其中包含了颜色的向量。pca_cols <- c("seagreen3","seagreen3","seagreen3","seagreen3","seagreen3","seagreen3","steelblue","steelblue","steelblue&qu
浏览 13提问于2020-04-22得票数 0
回答已采纳
我一直在努力调整ggplot2/ggfortify PCA中的加载(箭头)长度。ggfortify中缩放/更改PCA加载的大小？下面是使用stock R函数绘制PCA的代码，以及使用autoplot/ggfortify绘制PCA的代码。我仍然希望使用ggplot2绘制PCA，但是如果ggfortify不能做到这一点，那么我需要找到另一
浏览 2提问于2016-03-11得票数 6
所以我做了一个PCA分析，我通常用ggplot2绘制结果，但我最近才发现可以用变量显示箭头的图形。虽然它显示了一些问题(比如改变点大小的不可能性，因此我在MWE中所做的整个层的事情)，但是ggbiplot似乎还能正常工作。就我的数据而言，ggbi图非常窄，并且留下了非常宽的垂直边距，尽管它扩展了与ggplot2图相同的x轴间隔(实际上，它是相同的图)。ggplot
浏览 2提问于2017-09-14得票数 0
回答已采纳
我的图目前看起来像这样： ? 我想要更改图例中的形状(当前为"a")，仅用于指示各自颜色的点。这是我到目前为止的代码： ggplot(data=pca2.data, aes(x=X, y=Y, label=Sample, colour = col)) +xlab(paste("PC1 - ", pca2.var.per[1], "%",
浏览 35提问于2021-02-08得票数 0
我已经做了PCA，但是我尝试用冒泡图格式绘制点，根据变量值使用不同的大小：library("FactoMineR")ulva2<-c("1","1","0","2","3","2")
data<-data.frame(site,s
浏览 9提问于2022-03-07得票数 1
回答已采纳
1回答
实际上，我试图通过这个包来绘制PCA，但是当我绘制加载时，我不能按我的意愿更改图例(例如，如果我想将图例设置为(+)M，它会显示其他内容。我所做的工作如下：require(ggplot2)
data <- data.frame(iris[,1:4]) theta <- seq(0,2*pi,length.out = 100)
circle <- data.frame
浏览 2提问于2015-05-08得票数 1
回答已采纳
1回答
我试图用ggplot2制作两个散点图，它们将有不同的分组，但我希望两个元素/组的颜色在两个图中保持不变。下面的代码根据顺序产生不同的颜色。Coronary", "Pulmonary", "Vein", "Vein")PC2<-sample(x=1:10, size = 7)g
浏览 3提问于2020-01-24得票数 0
回答已采纳
1回答
我想删除PCA图中的标签并添加点。通过这种方式，您可以很容易地看到它们是否基于其类型进行聚类。我使用这个例子来执行我的PCA，我如何删除样例名称并添加点来代替？library(ggplot2)
data.matrix <- matrix(n
浏览 0提问于2020-06-09得票数 0
此散点图中的每个点都是数据帧中的一列。我想得到我画的那条线左边的列的列表。我真的不知道现在该从哪里开始。
为了澄清我的问题，我希望获得该行左侧或右侧的列的列表或数组。我不需要别人帮我划清界限。这是我是如何生成这个图的。
浏览 1提问于2018-04-17得票数 0
1回答
我正在用factoextra包绘制一个pca。我对每个因子都有3个点，并想在每个点周围画椭圆。但是我得到了错误Too few points to calculate an ellipse。使用stat_ellipse函数可以在ggplot2中围绕3个点绘制椭圆。我可以通过查看来自ggplot2的calculate_ellipse 来确认这一点，它说的是else if (dfd < 3) {message("Too fe
浏览 0提问于2018-04-20得票数 2
我必须绘制判别分析函数的结果。但是判别函数给了我三个LD，LD1，LD2，LD3。我只知道如何在2D(X=LD2和Y=LD1)中使用以下代码：library(MASS)library(scales)
require(ggplot2)require(gridExtra)
center[
浏览 0提问于2017-10-30得票数 0
回答已采纳
在生成一个模拟数据集，三个类中的20个观测(即60个观测总数)和50个变量之后，我需要绘制前两个主成分得分向量，使用不同的颜色来表示这三个唯一的类。我相信我可以创建模拟数据集(请验证)，但我有问题，如何颜色的类和情节。我需要确保这三个类在图中是分开的(否则我需要重新运行模拟数据)。x <- matrix( rnorm(3000), ncol=50)
dim(x)dim(xymatrix)
[1] 60 51
浏览 0提问于2016-10-28得票数 0
回答已采纳
我在PCA图中有3个不同的组，并为每个组分配了一个符号。data_pca$symbol[which(data_pca$Species == "species 1")] <- 15data_pca$symbol[which(data_pca$Species ==
浏览 0提问于2014-05-01得票数 0
云服务器
ICP备案
实时音视频
云直播
对象存储
腾讯云开发者
