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我有142张Nifti CT的大脑图像，我把它们从Dicom转换过来。每个NIfti文件的尺寸为512×512×40。我的计划是使用3d Conv神经网络进行多类分类。我应该如何在3d CNN中给Nifti图像喂食？
浏览 3提问于2021-12-26得票数 1
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我尝试使用itk将数组转换为3d图像作为.img。但是itk并没有起作用。甚至我使用演示代码将图像转换为数组，然后将数组转换回图像。它仍然显示了一张二维图像。我该如何解决这个问题？而且它应该是3d图像。
浏览 3提问于2019-03-27得票数 0
对于我正在做的一个项目，我想写一个脚本，可以计算nifti格式(.nii扩展)的核磁共振图像的总脑体积。我不知道怎么做的是循环遍历所有独立的体素，并提取其中的整数数据。有人知道怎么做吗？这是我用来在Python中加载特定nifti图像的代码： import nibabel as nibimport os
path = '/Users/arnavloheMR_MP-RAGE_REPEAT_br_raw_20060814
浏览 10提问于2019-01-04得票数 0
假设我想要在图像中人工生成不同类型的运动(例如，3D NIFTI MRI图像)。我想知道是否有任何软件包或软件可以做到这一点，但没有找到任何。使用这种类型的特征，我们可以验证我们的配准方法或模拟不同的变形模型。我需要一些帮助来生成这样的人工数据使用python或matlab的NIFTI/DICOM 3D<
浏览 3提问于2017-08-03得票数 1
我可以用以下代码使用vtkNIFTIImageReader显示切片图像： vtkSmartPointer<vtkNIFTIImageReader> reader =
vtkSmartPointer<vtkNIFTIImageReader
浏览 5提问于2015-03-02得票数 0
目前，在Python上学习医学成像数据，并考虑是否能够识别NIFti图像的正确方向，以及如何进行转换。我在网上查了一下，找到了一些算法，可以通过一定角度的仿射变换来“旋转”成像数据(主要是JPG格式)，但是没有关于如何在nifti图像上“旋转”并通过nibabel将其保存为新的nifti图像的文档。
浏览 6提问于2021-02-16得票数 1
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共配准三维Nifti图像
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我有两个3D nifti图像，一个大小为29x512x512的Flair图像和一个大小为73x112x112的dwi图像，我想将flair图像与dwi图像共同注册。你知道怎么做吗？我正在使用Python，但是任何解释得很好的方法都可以
浏览 3提问于2022-09-11得票数 0
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我有一个3D MR图像作为一个NIfTI文件(.nii.gz)。我也有一个‘掩码’图像作为一个NIfTI文件，这只是一堆0和1。这个面具图像中的1s代表了我感兴趣的3D MR图像的区域。我要检索存在于掩码中的3D MRI图像中像素的强度(即掩码图像文件中的1s )。我发现的唯一的强度特征是sitk.MinimumMaximumI
浏览 30提问于2022-04-16得票数 0
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我正在尝试从3d NIFTI图像中提取一个32x32补丁，并将其保存为png。我在R中工作，NIFTI图像包含155片240x240像素。library(oro.nifti)
arr = array(rnorm(240*240*155), dim = c(240,240,155))
png("
浏览 4提问于2020-06-09得票数 1
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我正在处理.dcm图像(dicom图像)我用过..。用于分段的链接。分割后，我在分割区域上使用感兴趣区域(ROI)。现在我有了参数x，y，w，h和从ROI得到的裁剪图像。有没有办法把这些数据可视化。我搞不懂vtk的功能和参数是什么。
浏览 15提问于2019-11-15得票数 0
我是python的新手。我有一个NIFTI格式的3D大脑图像(.nii.gz)，我想用不同的方法对它进行插值(最近邻，双线性，样条，...)并比较结果。图像的体素大小是1*0.45*0.45，我希望它是0.45*0.45*0.45。
我知道这是一项非常简单的任务。我所做的和问题是:在Scipy中，函数只获得点，但在这里我有一个Image。而可用于获取图像输入的函数仅适用于2D图像。你有什么解决方案吗？
浏览 1提问于2019-06-04得票数 0
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从NP数组到STL的映射值
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最近，我正在努力使用STL对象的特定空间坐标来获取3D卷(np数组)的像素值。STL对象在空间上与3D体重叠，但后者没有坐标，因此我不知道如何选择与STL坐标对应的像素值。有什么想法吗？
浏览 3提问于2021-12-14得票数 0
我有很多二维的nibabel (.nii)切片，我需要从这些切片创建一个3D nibabel (.nii)图像，有什么方法吗？
浏览 14提问于2022-03-17得票数 0
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我将读取一个nifti图像，并更改体素的值，然后保存新的nifti图像，与主图像相似，但只是体素值不同。换句话说，我希望我在分割图像中的标签是从0到7，而不是有不同的数字。Image const &，std::vector< std::string，std::allocator< std::string >> const &，bool) 代码： 对于os.listdir中的
浏览 391提问于2021-01-05得票数 1
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我的任务是在3D中创建颅骨的受损区域，以便可以将其用于3D打印，然后用于手术以覆盖受损的颅骨区域。我选择了vtk和itk工具包和visual studio一起进行处理，并选择Slicer在3D中查看它。我想知道在这个特定的场景中是否有任何方法可以遵循，以及从给定的CT图
浏览 3提问于2015-11-17得票数 0
我有一个从NIfTI文件读取到SimpleITK (使用python)的3D图像，取每个轴向切片，对其做一些操作，并将新的2D切片重新插入到具有(希望)适当尺寸的3D体积中。, in <module> File "/Library/Python/2.7/site-packages/SimpleITK-0.8.1-
浏览 1提问于2015-05-14得票数 3
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我正在尝试获取一些DICOM堆栈，并将它们转换为Nifti文件。当我进行转换并在3D查看器中打开新的Nifti文件时，体积在z方向上被粉碎在一起。Nifti文件不知道切片之间的间距。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？
浏览 12提问于2020-08-05得票数 0
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我需要从一个分段的NIFTI文件生成曲面。我可以很容易地在3D切片器中做到这一点，但我想在Python中做到这一点。在Python中可以做到这一点吗？
浏览 2提问于2019-09-04得票数 0
我用nibabel写出3D灰度.nii文件并在NIfTI查看器(芒果，MCIcron)中打开它们都没有问题。然而，我还无法写出3D颜色，因为每个RGB平面都被解释为不同的体积。例如，下面的输出：import numpy as nptest_stack = (255.0(ni_img, nifti_path)
被视为3个独立的20x2
浏览 1提问于2016-11-11得票数 4
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我试图重塑图像后，我面临的问题，当涉及到保存方法。(newimg，img.affine)中，第17行文件“d：\卷转换为img.affine”文件"C:\Python39\lib\site-packages\nibabel\analyze.p
浏览 20提问于2022-01-12得票数 1
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