奇怪的是GenomicFeatures既然把GTF文件读取进去了还抽取基因id了,但它就是不提供抽gene symbol的功能。...谷歌了一波没有发现满意的答案,有个refGenome包好像可以做,但读取文件半天卡死了,特别奇怪。最后还是自己动手,完成了6万个gene feature的转换。...整个提取操作包装为函数了,输入可以是文件名或已经导入的gtf文件数据框(最好还是文件吧)。由data.table包支持,速度杠杠的!....*" gene_id = sub(pattern_id, "\\1", input[[9]]) gene_name = sub(pattern_name, "\\1", input[[9...]]) data.frame(gene_id = gene_id, gene_name = gene_name, stringsAsFactors
本教程将分享如何通过 Serverless SCF Component 、云函数 SCF 及 API 网关组件,快速构建一个 REST API ,并实现 GET/PUT 操作。 ?.... ├── code | └── index.py └── serverless.yml 查看 code/index.py 代码,可以看到接口的传参和返回逻辑: # -*- coding: utf8...部署 通过 sls 命令进行部署,并可以添加 --debug 参数查看部署过程中的信息 如您的账号未登陆或注册腾讯云,您可以直接通过微信扫描命令行中的二维码进行授权登陆和注册。...测试 通过如下命令测试 REST API 的返回情况: 注:如 Windows 系统中未安装 curl,也可以直接通过浏览器打开对应链接查看返回情况 curl -XGET http://service-...touch .env # 腾讯云的配置信息 在 .env 文件中配置腾讯云的 SecretId 和 SecretKey 信息并保存 # .env TENCENT_SECRET_ID=123 TENCENT_SECRET_KEY
v=HSd9uYj2LJA ServerLess 框架安装和配置 ServerLess 框架是一个使用 Node.js 编写的 CLI 工具,开发者无需关注底层资源即可部署完整可用的 Serverless...└── serverless.yml # ServerLess 配置文件 handler.js handler.js 是逻辑处理的地方,当然你也可以自定义其它的文件,一旦自定义文件之后需要在 serverless.yml...文件里也进行响应更改,本节只是入门所以不会太复杂,后续会出一个使用 ServerLess 实现的 REST API 实践,可以关注公众号 “Nodejs技术栈” 获取最新消息。...serverless-offline 插件可以在本地启动一个 HTTP 服务器模拟 AWS λ 和 API Gateway。...REST API,敬请关注公众号 “Nodejs技术栈” 获取最新信息。
“无服务器架构”,从技术角度来讲是 FaaS 和 BaaS 的结合,FaaS(Function as a Service)是一些运行函数的平台。...项目根目录下创建 db.js 文件 数据库链接字符串就是上面 MongoDB Atlas cloud 链接集群中所讲的,注意替换你的用户名和密码,以下代码中 initialize 函数接收两个参数 dbName...API 的设计要保证职责单一、清晰合理、便于他人快速理解使用等原则,而 REST 也是 API 设计的一种准则,同时它也是一种架构思想,用于客户端与服务端资源传递与交互。...本节中我们将用到的是 GET、POST、PUT、DELETE 四个表示操作方式的动词,分别对应用于获取资源、新建资源、更新资源、删除资源。...serverless.yml 里的路由规则为 books/{id} service: mongodb-serverless-node-rest-api provider: name: aws
本文主要内容: 如何快速部署 Serverless Next.js 如何自定义 API 网关域名 如何通过 COS 托管静态资源 静态资源配置 CDN 基于 Layer 部署 node_modules...Next.js 组件,会默认帮助我们创建一个 云函数 和 API 网关,并且将它们关联,实际我们访问的 是 API 网关,然后触发云函数,来获得请求返回结果,流程图如下: ?...接下来将介绍如何基于 Next.js 组件,进一步优化我们的部署体验。 如何自定义 API 网关域名 使用过 API 网关的小伙伴,应该都知道它可以配置自定义域名,如下图所示: ?...STATIC_URL : "", }; 上面配置中的 STATIC_URL 就是静态资源托管服务提供的访问 url,示例中是腾讯云对应的 COS 访问 url。 那么针对第二种资源我们如何处理呢?...staticConf.cosConf 指定 COS 桶,执行部署时,会默认自动将编译生成的 .next 和 public 文件夹静态资源上传到指定的 COS。
Serverless的开发模型,应用层有 REST API、BFF、 SSR、Website、Full-Stack APP,需要研发团队与 TencentCloud 进行功能的对接,如API、SCF、存储...标准化做的是部署、调试、架构、资源整合、应用、监控、告警等,对上是承接应用层,如REST API、BFF、SSR、Website、Full-Stack App;对下是接入云服务,如 API、COS、DB...Serverless 应用,也就是上述提到的标准化框架和组件化开发。 Serverless资源,是可以无缝对接腾讯云Serverless资源。...配置 在 hexo 目录下,创建 serverless.yml 文件 $ touch serverless.yml 在 serverless.yml 文件中进行如下配置 # serverless.yml...如您的账号未登陆或注册腾讯云,您可以直接通过微信扫描命令行中的二维码进行授权登陆和注册。
什么是 Serverless Component Serverless Component 是 Serverless Framework 的,支持多个云资源编排和组织的场景化解决方案。...然后新增 serverless.yml 和 .env 配置文件,项目目录结构如下: ├── README.md // 项目说明文档 ├── api // Restful api 后端服务...└── serverless.yml // serverless 文件 2、后台服务开发 进入目录 api,新增 app.js 文件,编写 express 服务代码,这里先新增一个路由 /,并返回当前服务器时间...3、后端修改 这里使用 .env 来进行数据库连接参数配置,在 api 目录下新增 .env 文件,将之前的数据库配置填入文件中,参考 api/.env.example 文件。...然后修改 serverless.yml 中的配置: # ... api: component: '@serverless/tencent-express' # more configuration
那么有小伙伴就有疑惑了,我的业务开发完了,如何管理不同环境的配置呢?比如测试环境的数据库配置和正式环境的如何切换?于是抛转引入,写了此篇文章,来跟大家一起学习和探讨。...可以发现,Serverless Framework 部署命令默认会帮我们注入 .env 文件中的环境变量到部署流程中,这也是为什么我们在使用腾讯云的组件时,需要创建一个内容如下的 .env 文件: TENCENT_SECRET_ID...但是对于私密的配置,还是放到 .env 中比较合适,这样就可以基于文件去忽略部署。 配置优化 3 当需要将同一份业务代码部署到不同的地区,但是函数参数配置和 API 网关配置都是一致时,如何配置呢?...配置 通过在 serverless.yml 中定义变量 他们都可以定义全局变量,那么在实际开发中如何去抉择使用呢?...通常我会将跟 执行部署时的配置 放到 serverless.yml 中,将 业务相关的配置 放到 .env 文件中。当然,这里只是个人建议,具体如何去配置还是要看个人使用习惯。
让我们一起来看看如何能够以最简单的方式完成开发吧。...0. serverless.yml 所有Serverless服务中的Lambda函数和事件都可以在名为serverless.yml的配置文件中找到。...该文件对服务(包含Functions和Events)进行了定义。...在上面的例子中: 我们有名为myFunc的Function handler属性指向包含你想在函数中运行的代码的文件和模块 events属性为要执行的函数指定Event触发器 一个服务中可以包含多个函数...*) # 12PM UTC 如果你使用的是AWS的话,事件即为AWS中可以出发AWS Lambda函数的任意事件,比如: AWS API Gateway HTTP端点请求(例如,REST API) AWS
添加 VPC 创建子目录 vpc 并在子目录中添加新的 serverless.yml 文件如下: component: vpc # [必选]要使用组件,更多组件请查看 https://github.com...VPC 私有网络:serverless.com/cn/framework/docs/infrastructure/vpc/ 在子组件的配置文件中,app 名称会自动继承父目录的 serverless.yml...添加数据库 创建子目录 db 并在子目录中添加新的 serverless.yml 文件如下: component: postgresql #(必填) 引用 component 的名称...创建子目录 src 并将创建生成的 index.js (重命名为todos.js) 和 serverless.yml 移动到目录中。 2....这里使用 invoke 功能演示如何调试函数功能。 invoke 和 远程调试功能 需要在组件的目录内执行。 2.
通过这一系列文章,我希望能够提供给大家的内容包括: 如何开发一个real world serverless app 对于服务拆分的理解,如何更有效的利用资源 现有的 BaaS 迁移至 FaaS 的设想...api 十分容易,整个过程如官方宣称的极速部署。...但看一下项目的结构会发现,只有一个 yml 配置文件、一个依赖文本和一个 app.py 文件,由于配置文件中会使用 hooks 参数将依赖安装到当前文件夹,这是一个非常简单的一个示例。...但是实际开发过程中,我们不可能每一个功能模块都会去安装一次依赖,因此我们可以借助公共模块来解决这个问题。但是公共模块如何进行引入呢。...在 common 中创建配置文件 touch serverless.yml 编辑配置文件: component: layer # 注意,这里使用的是layer组件 name: common-layer
Mutating 的字面理解是“变异”的意思,真正的含义是,在资源持久化到 ETCD 之前,Mutating 控制器可以修改所部署的资源文件,比如给特定的 POD 动态增加 Labels,动态注入 sidecar...根目录下的 Jenkinsfile,将上一步获取的凭据 ID 替换光标处的凭据 ID [5-Edit-Credentials.png] 修改 serverless/.env 的 VPC_ID 和 SUBNET_ID.../serverless/api/serverless.yml API Gateway 部署文件 events: - apigw: name: k8sAdmission parameters.../serverless/api/serverless.yml 云函数部署文件 org: k8sAdmission component: scf # (必填) 引用 component 的名称,当前用到的是...在生产实践中,如本例的 token,属于动态的 yaml 制品类型部署,我们可以结合 CODING 持续部署来为制品文件提供动态的参数绑定。
标准化做的是部署、调试、架构、资源整合、应用、监控、告警等,对上是承接应用层,如REST API、BFF、SSR、Website、Full-Stack App;对下是接入云服务,如API、COS、DB等...配置 在hexo目录下,创建serverless.yml文件,在其中进行如下配置 $ touch serverless.yml 复制代码 # serverless.yml myWebsite: component...部署 通过sls命令进行部署,并可以添加--debug参数查看部署过程中的信息 如您的账号未登陆或注册腾讯云,您可以直接通过微信扫描命令行中的二维码进行授权登陆和注册。...$ touch .env # 腾讯云的配置信息 在 .env 文件中配置腾讯云的 SecretId 和 SecretKey 信息并保存 如果没有腾讯云账号,可以在此注册新账号。...如果已有腾讯云账号,可以在 API 密钥管理中获取 SecretId 和SecretKey. # .env TENCENT_SECRET_ID=123 TENCENT_SECRET_KEY=123 [vsje6ajwo7
这样多个云资源编排的Serverless场景化的解决方案是如何运行的,开发者应该怎样按照自己的需求定制化开发?本次将分享如何开发一个 Serverless Express 组件。...那么第二部分就是Web API的一个组件,我们认识的API其实也是封装了一个express,express下面又有几个组件,Cloud Function和API Gateway,还有COS静态存储等一系列的东西...创建 本地创建 serverless.yml 文件: $ touch serverless.yml 初始化一个新的 npm 包,并安装 Express: npm init #...DEBUG ─ Endpoint ANY / already exists with id api-9z60urs4....DEBUG ─ Updating api with api id api-9z60urs4. DEBUG ─ Service with id api-9z60urs4 updated.
如果知道如何使用 Action,那么直接用下面这句就可以了,里面封装了安装 Serverless framework 和执行部署命令的步骤。...和TENCENT_SECRET_KEY,所以需要在 Github 代码仓库的设置中的 Secrets 里面配置这两个变量。...如下图所示,ID 和 KEY 可以在腾讯云的访问控制里面获取: 配置完成之后,每次推送代码,都将会自动触发部署流程,同时在 Actions 中可以实时看到执行结果与错误日志。.../zip" // 此行仅用于Java Web函数,用于移动jar和scf_bootstrap文件。Java事件函数只需要在Serverless.yml中指定Jar目录就好。...), ]) { // 生成凭据文件 sh 'echo "TENCENT_SECRET_ID=${TENCENT_SECRET_ID}\
这样可以更方便的创建对应的资源。引用一个 Component 的时候,只需要在 serverless.yml 文件中增加 “components” 属性,并且引用这个 Component,如图所示。...如图所示,这些配置也都会在 serverless.yml 文件中体现。 [serverless components] 根据这张图可以看出 Components 的价值。...当你构建一个 Express 框架的时候,你需要做很多准备工作,需要开通、配置很多产品,比如创建函数,配置 REST API,配置和连接 DB等。...例如,他们可能会修改 REST API 的路径或者支持的协议等。...例如你需要对动态资源和静态资源做隔离,优化页面的访问速度,提供更丰富的 API 等。 别担心,你依然可以利用 Serverless Components 进一步扩展和完善你的应用。
那么接下来一个必然会问到的问题:我的业务开发完了,如何管理不同环境的配置呢?比如测试环境的数据库配置和正式环境的如何切换?...目标多环境配置主要解决:编译构建过程中,serverless.yml文件中的多环境配置,比如,发布到上海地区还是广州地区,命名空间是什么,内存大小、初始化时间等等;代码运行过程中,代码文件中的多环境配置...整体方案的处理逻辑是:在执行sls deploy阶段通过参数--stage选择不同的.env文件,导入配置信息,输入serverless.yml文件中的{env:配置Key}对应配置Key的Value,...解决serverless.yml文件中的多环境配置。...通过serverless.yml文件中的inputs-environment-variables解决代码文件中的多环境配置。
单词计数通过两个函数 Map 和 Reduce,可以快速地统计出文本文件中每个单词出现的个数,它虽然简单,但也是最能体现 MapReduce 思想的程序之一。...函数通过收到的事件数据获得了 Bucket 名称和文件名称,从该源 Bucket中获取该文件,根据代码中实现的 wordcount 进行字数统计,然后将其保存到目标 Bucket 上。...部署成功后,本模版将会为您创建以下资源: 两个 SCF 函数:Mapper 和 Reducer。 三个 COS Bucket:srcmr、middlestagebucket 和 destmr。...开发步骤 通过 COS 组件完成创建上传文件的 COS 存储桶的配置文件编写,yml 文件配置如下 # serverless.yml org: serverless app: MapReduce_Demo...mapreduce-demo › Created 在环境配置 .env 文件中填入您自己的密钥信息 # .env TENCENT_SECRET_ID=123 TENCENT_SECRET_KEY=123
概括性地讲 —— Serverless 的内涵就是对全部底层资源和运维工作的封装,让开发者更专注于业务逻辑。 原文首发于知乎回答:前端为什么要关注Serverless?...你的厨房里已经准备好了所有厨具和处理好的食材,你现在只需要关心火候认真炒菜,成为美食博主指日可待。也就是文首所说的 —— 开发者能更专注于业务逻辑,其他的底层资源和运维工作已经全部封装好了。...然后新增 serverless.yml 和 .env 配置文件,项目目录结构如下: ├── README.md // 项目说明文档 ├── api // Restful api 后端服务...└── serverless.yml // serverless 文件 2....配置 前后端代码都准备好了,再简单配置下 serverless.yml 文件了: name: fullstack-application-vue frontend: component: '@serverless
那么有小伙伴就有疑惑了,我的业务开发完了,如何管理不同环境的配置呢?比如测试环境的数据库配置和正式环境的如何切换?于是抛转引入,写了此篇文章,来跟大家一起学习和探讨。...可以发现,Serverless Framework 部署命令默认会帮我们注入 .env 文件中的环境变量到部署流程中,这也是为什么我们在使用腾讯云的组件时,需要创建一个内容如下的 .env 文件: TENCENT_SECRET_ID...但是对于私密的配置,还是放到 .env 中比较合适,这样就可以基于文件去忽略部署。 配置优化 3 当需要将同一份业务代码部署到不同的地区,但是函数参数配置和 API 网关配置都是一致时,如何配置呢?... 配置 通过在 serverless.yml 中定义变量 他们都可以定义全局变量,那么在实际开发中如何去抉择使用呢?...通常我会将跟 执行部署时的配置 放到 serverless.yml 中,将 业务相关的配置 放到 .env 文件中。当然,这里只是个人建议,具体如何去配置还是要看个人使用习惯。