我正在尝试从GEO/SRA下载一个BAM格式的数据集,我可以用它在RStudio中进行分析。sam-dump C:\Users\Desktop\sratoolkit.2.10.8-win64\bin\ncbi\SRA\sra\GSM2692389.sra3L]](cond) :
failed to open BamFile: SAM/
我正在尝试优化一个for循环,以便从一个基于物种名称和相应加入数的文件中下载文件。我希望循环首先与第一个物种和每个文件的第一个登录号一起工作,等等。我试过这个基本规则,但它不起作用。/bin/sh module load sra-toolkit/2.10.7-centos_linux64 for j in $ACCESION mkdir