增加用于gromacs模拟的.pdb文件的总体“大小”

.pdb文件的总体"大小"是指文件的存储空间占用量。在gromacs模拟中，.pdb文件是一种常用的分子结构文件格式，用于描述蛋白质、核酸等生物大分子的结构信息。

.pdb文件的大小取决于其中包含的分子结构的复杂程度和大小。通常情况下，分子结构越复杂、原子数量越多，.pdb文件的大小就会越大。

优势：

1. 方便的结构描述：.pdb文件采用文本格式，易于阅读和编辑，可以方便地描述分子的结构信息。
2. 广泛应用：.pdb文件是生物大分子结构的标准文件格式，被广泛应用于生物化学、药物研发、分子模拟等领域。
3. 兼容性好：.pdb文件格式被众多生物信息学软件和分子模拟软件所支持，可以方便地进行数据交换和共享。

应用场景：

1. 蛋白质结构研究：通过分析.pdb文件中的原子坐标和键结构等信息，可以研究蛋白质的结构、构象变化和功能。
2. 药物研发：通过分析.pdb文件中的蛋白质结构，可以进行药物分子的对接和筛选，加速药物研发过程。
3. 分子模拟：通过读取.pdb文件中的分子结构信息，可以进行分子动力学模拟、蒙特卡洛模拟等计算，研究分子的运动和相互作用。

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