基于ssh的多台机器的snakemake (或并行) - 腾讯云开发者社区 - 腾讯云

开发者社区

文档建议反馈控制台

最新优惠活动

文章/答案/技术大牛

发布

组件分享之后端组件——基于Golang实现的以并行线程计算或分发到机器集群组件GLOW

组件分享之后端组件——基于Golang实现的以并行线程计算或分发到机器集群组件GLOW 背景近期正在探索前端、后端、系统端各类常用组件与工具，对其一些常见的组件进行再次整理一下，形成标准化组件专题，后续该专题将包含各类语言中的一些常用组件...组件基本信息组件：glow 开源协议：http://www.apache.org/licenses/LICENSE-2.0 内容本节我们分享一个基于Golang实现的以并行线程计算或分发到机器集群组件

5052 0

如何在多台服务器添加ssh的免密码登录顶

然后分别在三台主机刷新网卡 service network restart 然后分别ping node1,node2,node3我们可以看到都可以ping的通了然后分别在三台主机上执行以下命令 ssh-keygen...以node1对node2的免密登录为例，其他相同，注意登录方向！...进入node2的root目录 cd scp root@'node1':~/.ssh/id_dsa.pub ./ 输入密码 id_dsa.pub已经拷贝了过来 cat id_dsa.pub >> ~/.ssh.../authorized_keys 将node1的公钥追加到authorized_keys文件返回node1机器，ssh node2，此时我们可以看到node1登录node2已经不需要再输入密码，免密登录成功...其他的方法相同!

1.5K2 0

您找到你想要的搜索结果了吗？

是的

没有找到

Linux多台机器之间的免密登录设置

别名服务器2IP 服务器2的计算机名别名服务器3IP 服务器2的计算机名别名这样我们就可以使用ssh server1而不用使用ssh 192.168.157.133; ssh配置免密之前...配置免密 1.在第一台服务器执行: ssh-keygen -t rsa image.png 2.将公钥发送给需要免密的机器上 ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub ‘用户名...’@‘发送的机器的ip地址’ ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub root@192.168.157.134 image.png 注意,以上操作之后需要重新启动三台服务器...如果需要两两之间实现互相免密,则每个服务器需要重复上面操作,即server2上执行 ssh-keygen -t rsa 然后执行 ssh-copy-id -i ~/.ssh/id_rsa.pub ‘用户名...’@‘发送的机器的ip地址’ 发送到的是server1和server3 server3同样重复上面操作测试: image.png image.png 如果要退出免密登录的服务器返回到之前的服务器

1.4K3 0

【QQ问题汇总】基于任务的并行与基于数据的并行有什么区别吗

问题1：基于任务的并行与基于数据的并行有什么区别吗？答：有区别，前者往往是cpu上的当时，而后者往往是gpu上的。前者可以看成只有一个work-item的kernel实例。...最初OpenCL有两种工作模型的。包括任务并行的(clEnqueueTask),如上所述, 可以看成是(1,1,1)个work-item的一次kernel启动。...因为基本上除了CPU外,常见的GPU并不能很有效的执行此模型下的kernel实例。...在GPU上的常见做法依然建议使用数据并行的(一份kernel代码, N个work-item在同时执行它, 但对应不同的数据)。CUDA从来只建议使用数据并行的, 否则将十分低效。...(P2P = peer to peer) 一张显卡可以从同一个PCI-E Root Switch/Complex下的另外一张显卡身上,直接访问对方的显存, 或者直接的将对方的显存里面的东西复制到自己的显存里

1.6K6 0

基于MPI的并行遗传算法

基于MPI的并行遗传算法求解港口船舶调度问题在上一篇文章中我们大致了解到了MPI的基本概念以及其运行原理，并且学习了一些简单的MPI通信函数以及例子。...当我们的问题规模变大的时候，往往需要几个小时甚至几天遗传算法才能停止。因此我们就需要用到并行计算方式去加速其求解过程，正好可以运用上MPI这一工具。...上述模型基于MPI的实现为了以MPI加速上述模型，我们首先需要分析模型的并行性。...为了在MPI通信中传递自定义的数据，MPI并行库提供了多种多样的方式供我们选用。我们可以定义一个新的类型，其由已知MPI类型构成。...高性能计算之并行编程技术—— MPI 并行程序设计[M]北京: 清华大学出版社，2001-1 [2] Quinn, M.J.

2.2K4 0

基于SSH的医院在线挂号

基于SSH的医院在线挂号医院挂号系统主要用于实现医院的挂号，前台基本功能包括：用户注册、用户登录、医院查询、挂号、取消挂号、修改个人信息、退出等。...因为第一个映入用户眼睑的就是网站的首页，它的好坏直接影响了用户对网站的喜爱程度；在对首页设计上我们要内容丰富的同时又要有一定的色彩搭配以及上下呼应等特色，以下是本网站的首页： ?...5.2 网站引导设计网站的导航视为了使用户使用更加方便灵活，能使网站有一个较好的用户体验，提高用户的满意度，他是网站的路标，可以提示用户如何操作，就像字典查询需要目录一样，网站设计也需要这样的“目录”...，对不同科室信息查询、对所有专家信息的查询，可以按照网站的导航进行大概的查询，每次查询不用特别精确的填写所有信息，但是如果患者希望可以精准的查询就必须填写完整的信息来查询。...（3）停诊信息查询查询医院最近的就诊情况、自己所在区域的医院公告，包括停诊信息，方便患者能及时的正确的作出选择。

1K2 0

java基于ssh的旅游系统

西安旅游网就是通过线上网站与线下服务相结合的运营模式来实现旅游活动的。本系统采用B/S模式，基于SSH开发完成。包含了景区介绍，西安人文介绍，酒店查询，旅游路线规划等多种形式，来满足用户需求。...该系统利用ssh框架，可以通过前台的操作界面进行网站的访问和浏览，而后台是对数据表的操作对前台相关数据的管理，对数据库进行数据的更新和修改等操作。...前言本文提出了基于SSH的西安旅游网站的设计和实现方法，具体介绍了该系统从构思到设计再到开发的一系列步骤。第一章主要介绍了在基于SSH的西安旅游网站的分析和研究的背景、意义及发展前景方向。...JDK(Java Development Kit)称为Java开发包或Java开发工具，JDK是整个Java的核心，包括了Java运行环境(Java Runtime Envirnment)，一些Java...2.2 系统开发的内容本系统是基于SSH框架的线下与线下相结合的西安旅游网站，从西安著名景点，附近酒店，旅游路线和西安人文等方面来介绍这个历史悠久的文明古都，希望远方的朋友更好的了解西安，热爱西安，吃好玩好学好

5842 0

Hadoop集群机器的SSH认证配置

SSH免密码认证，其实也很简单，只要玩过Linux的人都会，即使不会通过查找度娘，也很容易就能配置好，我这里因为公司环境的原因的，内，外网两个不同的网段，没法直接访问，所以我就没法截取图片，把每一步的详细步骤跟大家一起分享...，只能通过文字来描述，希望能看懂我写的寒酸的文字： 1： Hadoop安装官方建议是通过新建一个gird用户来安装，那我们就新建一个grid用户。...C: cd .ssh 进入.ssh目录 D: HadoopSrv01上： scp id_rsa.pub grid@Hadoop02:/home/grid/.ssh/authorized_keys...grid@Hadoop01:/home/grid/.ssh/authorized_keys scp id_rsa.pub grid@Hadoop02:/home/grid/.ssh/authorized_keys...grid@Hadoop02:/home/grid/.ssh/authorized_keys 测试是否OK的话，很简单，只需要直接通过命令 ssh hostname看是否需要输入密码即可。

4612 0

Reverse_SSH：一款基于SSH的反向Shell工具

关于Reverse_SSH Reverse_SSH上一款基于SSH的反向Shell工具，在该工具的帮助下，广大研究人员可以使用SSH来实现反向Shell，并同时拥有下列功能： 1、使用原生SSH语句管理和连接反向...Shell； 2、动态、本地和远程转发； 3、原生SCP和SFTP实现，用于从目标获取文件； 4、完整功能的Windows Shell； 5、实现了客户端&服务器端身份验证，以创建高信任高可用的控制通道...（向右滑动，查看更多）或直接使用主机名连接： ssh -J your.rssh.server.com:3232 root.wombo 接下来，可以开启远程转发功能： ssh -R 1234:localhost...:1234 -J your.rssh.server.com:3232 root.wombo （向右滑动，查看更多）或开启动态转发： ssh -D 9050 -J your.rssh.server.com...--goos windows http://your.rssh.server.com:3232/windows_dll（向右滑动，查看更多）这种情况适用于无文件注入的场景。

1.1K3 0

基于xargs命令的多行命令并行管理

我在去年整理了一个关于多行命令并行管理的脚本「submit.sh」，前些日子曾老师发来消息提供了更新的版本，今天我们一起来探讨一下。...# submit.sh # 把命令分为10份并行 for i in {0..9};do (nohup bash submit.sh script2.sh 10 $i 2>&1);done 今天要介绍的多行命令并行管理主要是基于...小结使用xargs的好处是可以将该命令写入到代码中，适用于流程搭建的情况（如snakemake）；而之前的submit.sh只能在脚本外面使用，实际上还会产生多个PID。...在遇到特殊情况需要kill任务的情况，使用xargs就可以直接kill母命令的PID，而submit.sh只能一个个的kill或killall。...另外需要注意的是，xargs 只能传递单个变量（本文中为F），上述命令通过-iF来传递ls输出的内容；当需要输入多个文件的时候（如比对），似乎是没办法实现的。

1.3K3 0

【分享】并行或串行运行多个NPM脚本的CLI工具

，当我们要在一个命令执行完后接着去执行下一个命令的时候（如：打包后需要推送打包内容到服务器）就需要增加一条脚本并使用&&进行拼接两条或多条命令来实现，并且符号&在windows下的...本期介绍的主角（npm-run-all）：今天主要想分享一个比较不错的Node包，我们可以通过提供的命令来制定脚本的执行计划，在你开发Node应用、Cli工具或着有复杂的多条script需要执行的时候会很有帮助...具体案例可参考文末整理的思维导图或项目的readme文件定制复杂计划：npm-run-all 定制串行计划：run-s 案例：使用前： npm run clean && npm run lint...lint clean build:** run-s --silent --print-name lint clean build:** run-s -sn lint clean build:** 定制并行计划...run-p：并行执行示例： { "scripts": { "clean": "rimraf dist", "lint": "eslint src", "build

1.5K3 0

ssh远程执行目标机器上的命令

一句话： ssh -t -p 端口号用户名@远程机器IP '远程机器上的命令完整路径' 例如：　　 ssh -t -p 22 yangjunming@dev '/opt/app/deploy.sh'...注意事项：一般先配置ssh免密码登录，然后结合这个可以实现一键远程自动部署，大概思路如下： a）先在本机build项目（ant/maven/gradle均可） b) 然后打包成tar并copy到远程机器的指定目录...(最简单的方式就是用scp) c) 调用远程机器上的shell脚本，解压tar并执行nohup之类的命令重启应用(如果考虑到备份的话，可以在解压前，先备份原来的应用或目录) 注：如果启用过程中，依赖一些环境变量...或export JAVA_HOME=......强制让环境变量生效，否则可能出现启动过程中，无法正常找到环境变量的各种诡异问题。 d) 删除(或备份)远程机器上的tar包

1.2K10 0

批量实现多台服务器之间ssh无密码登录的相互信任关系

检查下这些机器的/root/.ssh目录，发现他们的公私钥文件都是192.168.10.202这台机器的。...在上面脚本文件的同目录下新建名为host的文件，将要建立ssh互信的机器名或ip地址添加到该文件中，每个机器名或ip占一行，如： [root@server-202 ~]# vim /opt/host 192.168.10.202...，ssh_auth.sh接受三个参数，远程机器用户名、密码和host文件名（相对路径或绝对路径均可）。...机器的.ssh目录下的文件一致。...最后就可以在这些机器之间进行相互信任的ssh无密码跳转登录了！

1.5K2 0

Snakemake入门

本期内容主要以整理Snakemake的简单介绍[1]视频为主。 1啥是Snakemake Snakemake 是一个基于Python3的用于构建和管理数据分析工作流程的免费工具。...当你整理好流程以后，只需简单替换几个参数，就能快速开始分析一个新的数据。 Snakemake 的另一个强大特性是它的并行处理能力。...它可以根据任务之间的依赖关系，智能地并行执行可以并行执行的任务，从而加快整个工作流程的运行速度。...如果我们修改了数据，程序会识别文件的修改时间判定其为一个新文件，进而重新运行命令。 3Snakemake 参数 Snakemake的参数非常多，常用的有以下几个： -p：打印运行的shell命令。...-n：只展示需要完成的步骤，不运行。 -F：强制运行所有步骤。 -j：并行运行多个任务。

3213 0

长文 | 详解基于并行计算的条件随机场

在实际应用中，还是需要用到batch，也就是需要用到GPU的，那么此时并行计算就变得极为重要。在研究到一定的程度上，困住你的不是算法本身，而是时间。同一件事，当然是越快越好。...此时困住你的就是加速问题。我认为的加速大概分为两种：算法的本身的速度。程序中的循环怎么改为矩阵计算，也就是并行计算。这里先以条件随机场CRF为例，详细讲解CRF原理和如何加速的并行计算。...5.batch 上面的那种求总和的方法，还有一种好处就是可以加快并行计算，也就刚好能做多个句子的batch批处理。...先说什么是并行计算，字面意思就能理解，并行，并排行进，大家同时进行的意思，同时进行的前提条件是需要用到的东西都已经准备好。放在计算机里的意思就是当前运行的程序需要的数据都已经准备好了。...那我们来看看我们的数据怎么能并行计算吧，我拿出来一列数据来看看（先说下为什么拿出的是一列，而不是一行，因为一列所需要的数据前一列都已经计算过了，而一行不具备这样的条件），比如第二列： ?

1.3K2 0

ssh服务认证---基于密钥的认证过程讲解

现在尝试使用“ssh'root@172.16.1.31'”登录到计算机，然后签入： .ssh/authorized_keys 以确保我们没有添加您不期望的额外密钥。...[root@web01 .ssh]# ls id_dsa id_dsa.pub known_hosts 来自服务端的公钥rsa [root@web01 .ssh]# cat known_hosts...在接收到服务端公钥之后，输入服务端密码，将客户端公钥信息发送到服务端/root/.ssh/authorized_keys文件中此时，服务端拥有客户端的公钥和本机的私钥，客户端拥有服务的公钥和本机的私钥...客户端拥有服务端的公钥; 服务端拥有客户端的公钥客户端使用服务端的公钥进行数据的加密，对接收的服务端的数据使用本机私钥解密。 ...注：本博客基于自己的理解所写，读者可根据自己的思路进行理解，如果此博文有错误，请告知，谢谢！

2.3K3 0

让两台或多台群辉共享一个UPS电源的解决方案

家里有两台群辉服务器，但只有一个UPS，一直想让两台群辉都能检测到ups，在市电停电的情况下提前关机，避免系统或硬盘损毁。今天有空，研究了一下，居然很简单的就实现了！下面把方法分享给大家！...首先，是直接连接UPS的群辉设置，如下图： ? 这项设置，是使直接连接UPS的群辉，变成一个UPS服务器，让其他未直接连接UPS的群辉设备也能识别到UPS。...然后，我们设置一下未直接连接UPS的群辉，让其也能够识别UPS，如下图： ? 点击应用，即可使未直接连接UPS的DiskStation设备，也能识别到UPS的信息！

1.8K1 1

Linux：SSH和基于密钥的身份验证

使用密码建立 SSH 连接您可能已经知道连接到远程机器的基本 SSH 语法。...基于密钥的身份验证允许自动化工具在无需管理员输入密码（或将密码存储在配置文件中）的情况下对远程系统进行身份验证。我将在下面更详细地探讨这个想法。什么是基于密钥的身份验证？...非对称密钥比标准密码更难猜测或暴力破解，这使得这种方法比可能基于可预测的单词或短语的密码更安全可靠。为 SSH 配置基于密钥的身份验证实现基于密钥的 SSH 身份验证很简单。...将基于密钥的身份验证与自动化一起使用 SSH 连接在现代 DevOps 和基础设施即代码 (IaC) 环境中仍然很重要。许多配置管理实用程序必须连接到远程系统以对软件进行清单、管理设置或启动软件测试。...审核 SSH 连接的日志文件定期审核远程 SSH 连接的日志文件，以识别任何未经授权的连接或重复的连接失败尝试。这些可能表明用户或恶意行为者试图访问远程服务器。

9109 0

python 自动化部署工具Fabric

具体而言，如果fabric在fabfile或它import的文件中发现了基于Task类的new-style定义，那么，所有以classic方式定义的task(s)均会被fabric忽略。...Fabric还允许我们指定以并行方式（借助multiprocessing模块实现多个进程并行执行）在多台机器上并行地运行任务，甚至还可在同一个fabfile文件中指定某些task以并行方式运行，而某些task...如果要在多台机器上执行task，那这些密码输入的过程可以自动化吗？答案是肯定的。实现方式有两种，下面分别进行说明。...1）通过env.password或env.passwords配置目标机器的登录信息下面的示例说明了如何通过env.passwords配置多台机器的登录信息： #!...在具体实现上，需要事先在目标机器上生成ssh public key并配置在~/.ssh/config文件中，然后在定义任务的fabfile中将env.use_ssh_config设置为True来启用基于

1.6K2 0

SSH基于用户名密码的认证原理

今天来聊一聊什么是SSH以及SSH基于用户名密码的认证原理。...注：公钥和私钥是一对用于非对称加密和解密的密钥。公钥可以公开分享，用于加密数据或验证签名。私钥必须保密，用于解密数据或创建签名。...二、SSH基于用户名密码的认证原理1、基本语法：ssh [选项] 远程服务器的用户名@远程服务器的IP地址# 选项说明：-p：指定ssh服务的端口号，默认为222、认证原理：1）SSH客户端向SSH服务端发起一个登录请求...2）SSH服务端将自己的公钥发送给SSH客户端。3）SSH客户端使用服务端发过来的公钥将自己的密码加密并发送给SSH服务端。...3.1 环境准备：准备两台机器，跳板机（JumpServer）和线上生产服务器（RealServer）。

2690 0

点击加载更多

扫码

添加站长进交流群

领取专属 10元无门槛券

手把手带您无忧上云

扫码加入开发者社群

相关资讯

热门标签

活动推荐

运营活动

活动名称

广告关闭