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我生成一个4D复杂的numpy数组，例如： numpy_array = np.tile(np.array([3, 4, 0], dtype=np.complex64), (100,100,100,1)) 我想将numpy数组保存为nifti文件 我尝试使用vtk和SimpleITK，但它们都不支持复数(只支持实数向量)似乎只有nibabel支持复数向量，我设法保存了文件，但我只能用nibabel加载它我知道ITK-SNAP可以打开<e
浏览 109提问于2019-09-12得票数 0
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我有一个列表(mask_pairs_list)，每个“子列表”都有2个Nifti文件，所以它看起来如下所示。
我正在循环这个列表for (z in mask_pairs_list)，并在主"mask_pairs_list“的每个元素/子列表中使用”热图“和”掩码“来做一些事情。然后，我想用一个包含"mordor2_result“或"apple10_result”这样的子列表的名称来保存生成的Nifti
浏览 5提问于2022-05-07得票数 1
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我有一个Nifti文件，它的大小是62*62*38。如何将Nifti文件转换为.mat Matlab文件？
浏览 4提问于2015-03-17得票数 0
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我得用别人的代码。代码涉及到NiBabel，一个用于访问的程序/库，它是一种混乱的神经成像文件格式，我无法真正理解以下代码所做的事情：result = os.path.join(folderData, name + '.nii.gz')
nib.save(nib.Nifti1Image(Seg, nib.load(ground_truth_path).affin
浏览 0提问于2019-07-10得票数 1
我是新来的。目前，在Python上学习医学成像数据，并考虑是否能够识别NIFti图像的正确方向，以及如何进行转换。我在网上查了一下，找到了一些算法，可以通过一定角度的仿射变换来“旋转”成像数据(主要是JPG格式)，但是没有关于如何在nifti图像上“旋转”并通过nibabel将其保存为新的nifti图像的文档。来说明我的意思。我想学习如何将这个转换为。
浏览 6提问于2021-02-16得票数 1
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我正在尝试从3d NIFTI图像中提取一个32x32补丁，并将其保存为png。我在R中工作，NIFTI图像包含155片240x240像素。我已经将感兴趣的区域定位在第63片上，但是当我将其导出为png时，默认情况下补丁会保存为480x480像素。::nifti(arr) #create NIFTI
png("C:/Users/Downloads/patchimg.png&qu
浏览 4提问于2020-06-09得票数 1
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我正在尝试获取一些DICOM堆栈，并将它们转换为Nifti文件。当我进行转换并在3D查看器中打开新的Nifti文件时，体积在z方向上被粉碎在一起。Nifti文件不知道切片之间的间距。我尝试使用<code>D1</code>，但它只读取一个文件。如何在转换格式时将元数据从DICOM堆栈复制到Nifti文件？<code>A2<
浏览 12提问于2020-08-05得票数 0
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我正在使用一个程序，它将存储在两个不同文件夹(输入文件夹)中的dicom文件转换为nifti格式，并将它们保存到第三个文件夹(输出文件夹)。目前，这个程序需要我手动指定这三个文件夹的文件路径。我有一个目录，里面有多个患者/受试者，每个都包含两个(输入)文件夹。第三个(输出)文件夹不存在，但我已经在上面
浏览 3提问于2021-01-27得票数 0
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我在蟒蛇上做单体素模拟，以产生附加噪声的模拟信号.然后，我希望将生成的numpy数组转换为nifti文件，其形状如下(100,100)。DWIs阵列我要用以下格式将这个矩阵保存到一个nifti文件中(10，10，1,100)。期望
浏览 5提问于2021-12-17得票数 1
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我想通过每一个病例的中心50片来训练一个3D漂亮数据(CT扫描)的2D unet。我将图片和标签保存为png，但是标签完全是黑色的。我的目标是预测肿瘤区域(Y)，给予CT扫描切片(X)。我的代码： seg = Path("/content/drive/My Drive/")/"case_{:05d}".formatimsa
浏览 4提问于2020-04-18得票数 1
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我试图重塑图像后，我面临的问题，当涉及到保存方法。= nib.Nifti1Image(newimg，img.affine)中，第17行文件“d：\卷转换为img.affine”文件
浏览 20提问于2022-01-12得票数 1
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我有很多二维的nibabel (.nii)切片，我需要从这些切片创建一个3D nibabel (.nii)图像，有什么方法吗？
浏览 14提问于2022-03-17得票数 0
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选择NIfTi而不是DICOM有什么主要好处吗？作为数据格式的选择？我正在研究3D体积语义分割。在提供给网络之前，我必须将格式转换为numpy数组或张量，但对选择的性能优势感到好奇。
浏览 76提问于2020-01-21得票数 0
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default, May 6 2020, 11:45:54) [MSC v.1916 64 bit (AMD64)] 我正在尝试从BraTS 2019 dataset中使用SimplyITK和Numpy加载大量的NIFTI这是我用来将图像加载到numpy数组中的代码。import SimpleITK as sitk
"""
Read nifti file
浏览 27提问于2020-08-11得票数 0
我正在尝试使用SimplyITK和Numpy从BraTS 2019年数据集加载大量的NIFTI图像。
"""
Read nifti files fromRead nifti files from a gziped file using Simp
浏览 0提问于2020-08-11得票数 2
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我正在尝试使用Nibabel将numpy数组转换为Nifti文件格式。我的一些Numpy数组有dtype('<i8')，当Nibabel调用数据类型时，它应该是dtype('uint8')。arr.get_data_dtype()
有人知道如何转换和保存Numpy数组的数据类型吗？
浏览 8提问于2017-06-06得票数 4
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ID来保存组件。使用Type和Id组合访问组件。代码通常检查同一Id中存在哪些其他组件类型。场景、层和类型通过其名称进行访问，该名称存储为32位CRC散列。速度是至关重要的。ID是由代码分配的数字，简单地从0到更高。向量保存组件，当我们需要访问某个类型的组件时，我们搜索该向量。这并不理想，因为它需要一个周期的许多搜索。或者使用unordered_
浏览 0提问于2019-06-20得票数 3
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我有一个保存为文本文件的数据集，它基本上包含一个逐行存储的向量。我的向量是10k维，我有250个这样的向量。每个向量条目都是双精度的。下面是一个例子：向量2 -> 0.0 0.0 0.0 0.439367 0.0 0.0 0.0 .....10
浏览 0提问于2011-02-16得票数 1
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