的问题可能是由于文件名重复导致的。为了解决这个问题,可以在每次生成png文件时,使用不同的文件名来避免重复。
以下是一个示例代码,展示了如何在for循环中使用rdkit生成不同的png文件:
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw
# 假设你有一个包含多个分子的列表
molecules = [Chem.MolFromSmiles('CCO'), Chem.MolFromSmiles('CCN'), Chem.MolFromSmiles('CCC')]
# 遍历分子列表
for i, mol in enumerate(molecules):
# 生成不同的文件名
filename = f'molecule_{i}.png'
# 使用rdkit绘制分子结构
img = Draw.MolToImage(mol)
# 保存png文件
img.save(filename)
在上述代码中,我们使用了一个enumerate函数来同时获取分子的索引和分子对象。然后,我们根据索引来生成不同的文件名,确保每次生成的png文件都有唯一的名称。
此外,我们使用了rdkit的Draw模块中的MolToImage函数来将分子对象转换为图像。最后,我们使用图像对象的save方法将图像保存为png文件。
请注意,上述代码仅为示例,实际应用中可能需要根据具体情况进行适当的修改。
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