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在for循环中使用rdkit生成png文件,但每次都生成相同的png文件

的问题可能是由于文件名重复导致的。为了解决这个问题,可以在每次生成png文件时,使用不同的文件名来避免重复。

以下是一个示例代码,展示了如何在for循环中使用rdkit生成不同的png文件:

代码语言:txt
复制
from rdkit import Chem
from rdkit.Chem import Draw

# 假设你有一个包含多个分子的列表
molecules = [Chem.MolFromSmiles('CCO'), Chem.MolFromSmiles('CCN'), Chem.MolFromSmiles('CCC')]

# 遍历分子列表
for i, mol in enumerate(molecules):
    # 生成不同的文件名
    filename = f'molecule_{i}.png'
    
    # 使用rdkit绘制分子结构
    img = Draw.MolToImage(mol)
    
    # 保存png文件
    img.save(filename)

在上述代码中,我们使用了一个enumerate函数来同时获取分子的索引和分子对象。然后,我们根据索引来生成不同的文件名,确保每次生成的png文件都有唯一的名称。

此外,我们使用了rdkit的Draw模块中的MolToImage函数来将分子对象转换为图像。最后,我们使用图像对象的save方法将图像保存为png文件。

请注意,上述代码仅为示例,实际应用中可能需要根据具体情况进行适当的修改。

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