1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后,我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的,在离线环境下如何安装R的包,能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...搭建需要注意,PACKAGES文件中记录了所有包的描述信息,且每个包只有一个版本。...4.配置R使用私有源 ---- 1.在$R_HOME/ lib64/R/etc目录下增加配置文件Rprofile.site 在Rprofile.site文件中增加如下内容: [root@ip-172-31...(如:设置R启动时加载的包、设置编辑器、制表符宽度等) 5.测试R私有源 ---- 1.进入R控制台,执行包安装命令 [ec2-user@ip-172-31-21-45 etc]$ R R version
目前有两种仓库:公共仓库和私有仓库。最方便的就是使用公共仓库上传和下载镜像,下载公共仓库中的镜像不需要注册,但上传镜像到公共仓库是需要注册的。...公共仓库中填写完成仓库的ID号、邮箱以及登录仓库的密码并在邮件中进行激活就可以上传自己的镜像。 那么怎么构建属于自己的私有仓库呢?可以使用registry来搭建本地私有仓库。...51bb55f23ef7e25ac9b8313b139a8dd45baa832943c8ad8f7da2ddad6355b3c8 Status: Downloaded newer image for registry:latest 创建json文件...# systemctl restart docker.service ==注==:创建完json文件后,一定要重启服务,不然后面可能会出错 创建容器并挂载 # docker create -it registry...5000 -v /data/registry:/tmp/registry registry //宿主机的/data/registry自动创建挂载容器中的/tmp/registry 上传镜像 # docker
方法很简单,也不用改配置文件什么的,只需要几行命令: 拉取phpmyadmin镜像 sudo docker pull phpmyadmin 运行镜像 其中,PMA_HOST和PMA_PORT填写的内容是...MySQL数据库的地址和端口号 sudo docker run --restart=always -d --name myadmin -e PMA_HOST=172.17.0.1 -e PMA_PORT...=49153 -p 20888:80 phpmyadmin 然后phpmyadmin就成功运行在了本机的20888端口,在浏览器中输入localhost:20888就能访问了。
Docker容器——在Ubuntu中安装Docker 背景 日常我们开发时,我们会遇到各种各样的奇奇怪怪的问题(踩坑o(╯□╰)o),这个常见问题系列就是我日常遇到的一些问题的记录文章系列,这里整理汇总后分享给大家...runc sudo apt-get purge docker-ce docker-ce-cli containerd.io 2、删除原有的映像、容器、卷或自定义配置文件 sudo rm -rf /var...1、更新apt包索引并安装基础包 sudo apt-get update sudo apt-get install \ apt-transport-https \ ca-certificates.../docker.list > /dev/null 4、再次更新包索引,开始进行安装docker sudo apt-get update sudo apt-get install docker-ce docker-ce-cli...| https://download.docker.com/linux/ubuntu focal/stable amd64 Packages 2、安装指定版本 替换下方命名中的<VERSION_STRING
tab=tags&page=1 这里选取最新版本进行安装,如果想安装其他的可用版本,可以使用命令“docker search mongo”来查看 2.拉取最新版本镜像 这里执行命令"sudo docker...pull mongo:latest" 拉取最新版的mongodb镜像文件 等待镜像拉取完成后,通过命令"sudo docker images"查看下拉取的镜像,可以看到,已经成功拉取到了本地 3.开始运行...创建一个文件夹,用作mongodb的数据目录挂载 运行启动命令“docker run -p 27017:27017 -v /data/mongo:/data/db --name mongodb -d...外部可以直接通过 宿主机 ip:27017 访问到 mongo 的服务 -v 为设置容器的挂载目录,这里是将本机的“/data/mongo”目录挂载到容器中的/data/db中,作为 mongodb 的存储目录...--auth 也就是在之前的启动命令后面加上 --auth:需要密码才能访问容器服务 此时强行访问,可以看到提示,没有授权 这里我们在连接的地方指定一下账户密码 再来查询,已经正确查询出来之前添加的用户信息
ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样,代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统,64位的R-3.4.3,安装过程中除了网速较慢,花费一点时间安装之外,并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库,在加载R包的过程中,如果这个R包有对应的动态链接库,那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统,R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...("d:/Documents/.Renviron", mustWork = FALSE) 第一个参数为.Renviron文件的真实路径,然后在加载ChAMP包就可以了 >> Package version
文章目录 一、什么是Tomcat❔ 二、Docker下安装Tomcat操作演示 1️⃣前期准备 2️⃣下载tomcat镜像 3️⃣启动tomcat 4️⃣测试访问报错 5️⃣修改配置参数 6️⃣重新测试访问...二、Docker下安装Tomcat操作演示 1️⃣前期准备 #检查docker是否安装完成。...# 查看文件 root@c0b92c78776b:/usr/local/tomcat# ls BUILDING.txt CONTRIBUTING.md LICENSE NOTICE README.md...79 Dec 22 17:06 host-manager drwxr-xr-x 6 root root 114 Dec 22 17:06 manager # 拷贝 webapps.dist目录下的文件到...webapps目录下 root@c0b92c78776b:/usr/local/tomcat# cp -r webapps.dist/* webapps/ # 查看webapps目录 root@c0b92c78776b
我希望每次在docker容器中安装vi的时候谁会给我1美元...我想要一个在运行的docker容器编辑文件的更简单的方式。首先,尝试避免编辑文件,这违背了容器的哲学理念(见最后一段)。...Zedrem 打包在docker镜像中:sequenceiq/zedapp 这里有一个脚本,帮助在本地运行zed服务器,在目标容器运行zed客户端: zed 安装docker镜像和shell脚本: docker...ssh "sudo zed $@" ; } Boot2docker中安装的的zed帮助脚本需要这一句,所以你需要boot2docker ssh工作区。...zedrem客户端 在指定的路径中为文件服务的小程序。...Jérôme Petazzoni提供了一个带有帮助脚本:docker-enter包装好的nsenter。
(WJW)Docker私有Registry在CentOS6.X下安装指南 说明: docker.yy.com 这是docker registry服务器的域名也就是你的公司docker私有服务器的主机地址...---- 安装,配置,运行nginx (1) 添加组和用户: groupadd www -g 58 useradd -u 58 -g www www (2) 下载nginx源文件: cd /tmp wget...命令稍加解释一下: -p 127.0.0.1:5000:5000 registry 作为上游服务器,这个 5000 端口可以不用映射出来,因为所有的外部访问都是通过前端的nginx来提供,nginx 可以在私有网络访问...registry服务器端的根证书追加到ca-certificates.crt文件里 先从docker registry服务器端把文件/etc/pki/CA/cacert.pem拷贝到本机,然后执行命令...编辑/etc/sysconfig/docker文件 在DOCKER_OPTS里添加-H tcp://0.0.0.0:4243 -H unix:///var/run/docker.sock,例如: DOCKER_OPTS
最近由于自动化测试需要,要在docker里面安装chromedriver。Docker是基于python3.8.10的,安装也比较简单。...修改docker的源 下载chrome wget -q https://dl.google.com/linux/direct/google-chrome-stable\_current\_amd64.deb...安装chrome apt-get install ..../google-chrome-stable\_current\_amd64.deb -y 如果安装chrome出错,可以试一下以下命令安装: apt-get --fix-broken install ....selenium的pip包 pip install selenium 测试代码 from selenium import webdriver options = webdriver.ChromeOptions
尤其是在R包中编程改变了从ggplot2引用函数的方式,以及在aes()和vars()中使用ggplot2的非标准求值的方式。...引用ggplot2函数 与引用其他包类似,你需要在DESCRIPTION文件下的Imports条目下列出ggplot2,并使用::访问ggplot2提供的函数。...有时候在开发R包时为了保证正常运行,不得不将依赖包列入Depdens。...常规任务最佳实践 使用ggplot2可视化一个对象 ggplot2在包中通常用于可视化对象(例如,在一个plot()-风格的函数中)。...如果没有,则会将主题对象存储在编译后的包的字节码中,而该字节码可能与安装的ggplot2不一致!
摘要 在Go语言开发中,使用第三方包是提高效率和代码复用性的关键。有时,我们需要从私有Git仓库中引入包,以便与团队合作或使用专有功能。...本文将指导你如何在Go项目中引入私有Git仓库的包,从设置SSH密钥到导入包和使用包,一步步详细介绍了操作过程。 导语 Go语言在现代软件开发中变得越来越重要,而合理利用第三方包可以加速开发流程。...引言 在Go语言开发中,包管理是一个关键的话题。引入第三方包能够显著提高代码复用性和开发效率,而私有Git仓库则为团队合作和专有功能提供了便利。...根据你的项目需求,调用包中的函数、方法或结构体等。 注意事项和建议 在某些情况下,私有Git仓库可能需要认证信息。如果需要,确保你在go get命令中提供了适当的认证参数。...Go Modules是一种更现代化的包管理方式,允许你在项目中直接引用私有Git仓库中的包,而无需担心GOPATH的问题。
查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说,很多R包的安装对R版本是有要求的,比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0),但是并不需要最新版R语言。...会删除软件包而保留软件的配置文件r # apt-get purge 会同时清除软件包和软件的配置文件 #然后更新Ubuntu源文件 ## 这里,不同Ubuntu系统有点不一样: cat /etc/issue...r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包 这里只是举例,我比较常用的包,安装非常耗时,一般来说小半天就过去了。...安装我们的主角-3大R包 从代码的角度来看,很简单: options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn...web/packages/Seurat/index.html http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.html R包安装失败通常是
安装某些软件包时可能会出现一些问题。一个窍门是打开终端 然后使用sudo命令安装一些软件包, (输入密码后)。...apt-get install r-cran-plyr r-cran-xml r-cran-reshape r-cran-reshape2 r-cran-rmysqlsudo apt-get install...r-cran-rjavasudo apt-get install r-cran-glmnetsudo apt-get build-dep r-cran-bootsudo apt-get build-dep...r-cran-classsudo apt-get build-dep r-cran-clustersudo apt-get build-dep r-cran-codetoolssudo apt-get...apt-get build-dep 然后,在RStudio中,输入 install.packages("RCurl")install.packages("xml")install.packages("
R包 用不了V**的话就用国内镜像下载 检验R包是否安装成功的标志是看能否“library” 进阶安装方式:嵌套 if 函数 文件的读写 纯文本数据的重要参数 sep 分隔符 header 第一行是否为列名...row.name 行名 col.name 列名 check.name 是否自动检查 后缀并不重要,重要的是数据里的数据格式、内容 用于读写的R包 data.table::fread;;用于读取大文件时...rio import();;读取excel等 import_list() export() split() tips 读写文件后与自己要求不符时,考虑更改默认参数 str( )函数可以用于描述数据 注意赋值
这是《Bioconductor 中的 R 包安装教程》的第二篇,完整的文章可以点击阅读原文查阅。...以 DiffBind 包为例,DiffBind==3.4.0 是基于 Bioconductor==3.14(对应 R-4.1)开发的;我们在 Bioconductor==3.13(对应 R-4.0)中执行...源码方式安装 如果想要在 Bioconductor==3.13(对应 R-4.0)中安装 DiffBind==3.4.0,可以直接通过源码包的方式安装: > packageurl 安装 我们以在 R-3.4(Bioconductor==3.6)中安装最新版本的 clusterProfiler 为例。...在 Aanconda2 环境 R==3.4.3 中安装 clusterProfiler,发现package ‘clusterProfile’ is not available (for R version
在docker中安装ES怎么安装?本文就教大家怎么安装 1.部署单点es 1.1.创建网络 因为我们还需要部署kibana容器,因此需要让es和kibana容器互联。...课前资料提供了镜像的tar包: 大家将其上传到虚拟机中,然后运行命令加载即可: 比如,凯哥将es.tar、kibana.tar先上传到宿主机的apps目录下,然后使用rz命令上传: 上传后: 图片...我们使用: docker load -i 文件 docker load -i /root/apps/es.tar 需要等待,带镜像加载完成后,会出现镜像信息。...如下图: 同理还有kibana的tar包也需要这样做。...安装完成之后,docker ps -a 图片 看到es状态是UP的才可以。 然后在浏览器中输入:http://宿主机id:9200 即可看到es的响应结果。如下图:
centos安装方式,采用阿里云的镜像和安装脚本 或者到https://store.docker.com/search?...type=edition&offering=community下载相应系统的安装包安装 #安装docker客户端 curl -sSL http://acs-public-mirror.oss-cn-hangzhou.aliyuncs.com.../docker-engine/internet | sh - #配置加速镜像 sudo mkdir -p /etc/docker sudo tee /etc/docker/daemon.json "] } EOF sudo systemctl daemon-reload sudo systemctl restart docker...windows安装 https://store.docker.com/editions/community/docker-ce-desktop-windows 安装包下载,双击安装就完事了。
文章目录 Docker版本说明 Docker安装 前置条件 Step1. Set up the Repository Step2....Verify that Docker CE Docker CE中安装RabbitMQ Docker版本说明 参考官网: https://docs.docker.com/release-notes/docker-engine...在 2017 年 3 月 2 日, docker 团队宣布 企业版 Docker Enterprise Edition ( EE ) 发布....# install必要的包 [root@artisan ~]# yum install -y yum-utils device-mapper-persistent-data lvm2 Loaded...CE中安装RabbitMQ Docke镜像官方下载地址: https://www.rabbitmq.com/download.html#docker 我们这里使用rabbitmq:3.7.8-management
在上一篇中,我们已经在docker里面安装了ES。 kibana可以给我们提供一个elasticsearch的可视化界面,便于我们学习。...所以,本篇咱们就在docker里面安装kibana图文教程: 我们使用rz命令先将kibana镜像上传到宿主机的apps目录下。... \ -p 5601:5601 \ kibana:7.12.1 命令讲解: --network es-net :加入一个名为es-net的网络中,与elasticsearch在同一个网络中 -e ELASTICSEARCH_HOSTS...kibana启动一般比较慢,需要多等待一会,可以通过命令: docker logs -f kibana 查看运行日志,当查看到下面的日志,说明成功: 图片 此时,我们在浏览器中输入 宿主机ip:5601...OK.至此,在docker里面安装kibana完成