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如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源

1.文档编写目的 ---- 继上一章如何在Redhat中配置R环境后,我们知道对于多数企业来说是没有外网环境的,在离线环境下如何安装R的包,能否搭建R的私有源对R的包进行管理。...本文档主要讲述如何在Redhat中安装R的包及搭建R的私有源。...搭建需要注意,PACKAGES文件中记录了所有包的描述信息,且每个包只有一个版本。...4.配置R使用私有源 ---- 1.在$R_HOME/ lib64/R/etc目录下增加配置文件Rprofile.site 在Rprofile.site文件中增加如下内容: [root@ip-172-31...(如:设置R启动时加载的包、设置编辑器、制表符宽度等) 5.测试R私有源 ---- 1.进入R控制台,执行包安装命令 [ec2-user@ip-172-31-21-45 etc]$ R R version

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在Docker中创建私有仓库

目前有两种仓库:公共仓库和私有仓库。最方便的就是使用公共仓库上传和下载镜像,下载公共仓库中的镜像不需要注册,但上传镜像到公共仓库是需要注册的。...公共仓库中填写完成仓库的ID号、邮箱以及登录仓库的密码并在邮件中进行激活就可以上传自己的镜像。 那么怎么构建属于自己的私有仓库呢?可以使用registry来搭建本地私有仓库。...51bb55f23ef7e25ac9b8313b139a8dd45baa832943c8ad8f7da2ddad6355b3c8 Status: Downloaded newer image for registry:latest 创建json文件...# systemctl restart docker.service ==注==:创建完json文件后,一定要重启服务,不然后面可能会出错 创建容器并挂载 # docker create -it registry...5000 -v /data/registry:/tmp/registry registry //宿主机的/data/registry自动创建挂载容器中的/tmp/registry 上传镜像 # docker

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    Docker容器——在Ubuntu中安装Docker

    Docker容器——在Ubuntu中安装Docker 背景 日常我们开发时,我们会遇到各种各样的奇奇怪怪的问题(踩坑o(╯□╰)o),这个常见问题系列就是我日常遇到的一些问题的记录文章系列,这里整理汇总后分享给大家...runc sudo apt-get purge docker-ce docker-ce-cli containerd.io 2、删除原有的映像、容器、卷或自定义配置文件 sudo rm -rf /var...1、更新apt包索引并安装基础包 sudo apt-get update sudo apt-get install \ apt-transport-https \ ca-certificates.../docker.list > /dev/null 4、再次更新包索引,开始进行安装docker sudo apt-get update sudo apt-get install docker-ce docker-ce-cli...| https://download.docker.com/linux/ubuntu focal/stable amd64 Packages 2、安装指定版本 替换下方命名中的<VERSION_STRING

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    在Docker中安装MongoDB

    tab=tags&page=1 这里选取最新版本进行安装,如果想安装其他的可用版本,可以使用命令“docker search mongo”来查看 2.拉取最新版本镜像 这里执行命令"sudo docker...pull mongo:latest" 拉取最新版的mongodb镜像文件 等待镜像拉取完成后,通过命令"sudo docker images"查看下拉取的镜像,可以看到,已经成功拉取到了本地 3.开始运行...创建一个文件夹,用作mongodb的数据目录挂载 运行启动命令“docker run -p 27017:27017 -v /data/mongo:/data/db --name mongodb -d...外部可以直接通过 宿主机 ip:27017 访问到 mongo 的服务 -v 为设置容器的挂载目录,这里是将本机的“/data/mongo”目录挂载到容器中的/data/db中,作为 mongodb 的存储目录...--auth 也就是在之前的启动命令后面加上 --auth:需要密码才能访问容器服务 此时强行访问,可以看到提示,没有授权 这里我们在连接的地方指定一下账户密码 再来查询,已经正确查询出来之前添加的用户信息

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    ChAMP R包安装中的事故

    ChAMP 包提供了完整的分析illumina甲基化芯片的pipeline, 和普通的Bioconductor 包的安装一样,代码只有简单的两行 source("http://bioconductor.org.../biocLite.R") biocLite("ChAMP") 我用的电脑是windows 操作系统,64位的R-3.4.3,安装过程中除了网速较慢,花费一点时间安装之外,并没有出现任何的问题。...dll 文件就是windows操作系统下的动态链接库,在加载R包的过程中,如果这个R包有对应的动态链接库,那么就会加载进来。...解决方案就是设置环境变量R_MAX_NUM_DLLS, 不管是什么操作系统,R语言对应的环境变量都可以在.Renviron文件中进行设置。...("d:/Documents/.Renviron", mustWork = FALSE) 第一个参数为.Renviron文件的真实路径,然后在加载ChAMP包就可以了 >> Package version

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    Docker私有Registry在CentOS6.X下安装指南

    (WJW)Docker私有Registry在CentOS6.X下安装指南 说明: docker.yy.com 这是docker registry服务器的域名也就是你的公司docker私有服务器的主机地址...---- 安装,配置,运行nginx (1) 添加组和用户: groupadd www -g 58 useradd -u 58 -g www www (2) 下载nginx源文件: cd /tmp wget...命令稍加解释一下: -p 127.0.0.1:5000:5000 registry 作为上游服务器,这个 5000 端口可以不用映射出来,因为所有的外部访问都是通过前端的nginx来提供,nginx 可以在私有网络访问...registry服务器端的根证书追加到ca-certificates.crt文件里 先从docker registry服务器端把文件/etc/pki/CA/cacert.pem拷贝到本机,然后执行命令...编辑/etc/sysconfig/docker文件 在DOCKER_OPTS里添加-H tcp://0.0.0.0:4243 -H unix:///var/run/docker.sock,例如: DOCKER_OPTS

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    在golang中引入私有git仓库的pkg包?引入私有Git仓库的包:在Go语言项目中轻松实现

    摘要 在Go语言开发中,使用第三方包是提高效率和代码复用性的关键。有时,我们需要从私有Git仓库中引入包,以便与团队合作或使用专有功能。...本文将指导你如何在Go项目中引入私有Git仓库的包,从设置SSH密钥到导入包和使用包,一步步详细介绍了操作过程。 导语 Go语言在现代软件开发中变得越来越重要,而合理利用第三方包可以加速开发流程。...引言 在Go语言开发中,包管理是一个关键的话题。引入第三方包能够显著提高代码复用性和开发效率,而私有Git仓库则为团队合作和专有功能提供了便利。...根据你的项目需求,调用包中的函数、方法或结构体等。 注意事项和建议 在某些情况下,私有Git仓库可能需要认证信息。如果需要,确保你在go get命令中提供了适当的认证参数。...Go Modules是一种更现代化的包管理方式,允许你在项目中直接引用私有Git仓库中的包,而无需担心GOPATH的问题。

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    在Ubuntu下安装单细胞3大R包

    查看Ubuntu系统以及R版本 cat /etc/issue 通常来说,很多R包的安装对R版本是有要求的,比如BiocManager需要 R (≥ 3.5.0),但是并不需要最新版R语言。...会删除软件包而保留软件的配置文件r # apt-get purge 会同时清除软件包和软件的配置文件 #然后更新Ubuntu源文件 ## 这里,不同Ubuntu系统有点不一样: cat /etc/issue...r-base-core r-base-dev 使用sudo安装一些必备包 这里只是举例,我比较常用的包,安装非常耗时,一般来说小半天就过去了。...安装我们的主角-3大R包 从代码的角度来看,很简单: options()$repos options()$BioC_mirror options(BioC_mirror="https://mirrors.ustc.edu.cn...web/packages/Seurat/index.html http://bioconductor.org/packages/release/bioc/html/monocle.html R包安装失败通常是

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    【图文安装教程】在docker中安装ES

    在docker中安装ES怎么安装?本文就教大家怎么安装 1.部署单点es 1.1.创建网络 因为我们还需要部署kibana容器,因此需要让es和kibana容器互联。...课前资料提供了镜像的tar包: 大家将其上传到虚拟机中,然后运行命令加载即可: 比如,凯哥将es.tar、kibana.tar先上传到宿主机的apps目录下,然后使用rz命令上传: 上传后: 图片...我们使用: docker load -i 文件 docker load -i /root/apps/es.tar  需要等待,带镜像加载完成后,会出现镜像信息。...如下图: 同理还有kibana的tar包也需要这样做。...安装完成之后,docker ps -a 图片 看到es状态是UP的才可以。 然后在浏览器中输入:http://宿主机id:9200  即可看到es的响应结果。如下图:

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    【图文安装教程】在docker中安装kibana

    在上一篇中,我们已经在docker里面安装了ES。 kibana可以给我们提供一个elasticsearch的可视化界面,便于我们学习。...所以,本篇咱们就在docker里面安装kibana图文教程: 我们使用rz命令先将kibana镜像上传到宿主机的apps目录下。... \ -p 5601:5601  \ kibana:7.12.1 命令讲解: --network es-net :加入一个名为es-net的网络中,与elasticsearch在同一个网络中 -e ELASTICSEARCH_HOSTS...kibana启动一般比较慢,需要多等待一会,可以通过命令: docker logs -f kibana 查看运行日志,当查看到下面的日志,说明成功: 图片 此时,我们在浏览器中输入  宿主机ip:5601...OK.至此,在docker里面安装kibana完成

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