首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

在R中绘制GAM响应时,visreg在y轴上显示地毯

在R中绘制GAM响应时,visreg(可视化reg)包提供了一种简单且直观的方法,它可以用地毯图(rug plot)显示y轴上的响应。

GAM(Generalized Additive Model)是一种用于建模非线性关系的统计模型,它通过将非线性函数(平滑函数)应用于预测变量,将其与线性模型结合起来。visreg包可以帮助我们可视化GAM模型的响应,并提供直观的解释。

要在R中使用visreg绘制GAM响应并在y轴上显示地毯,可以按照以下步骤进行操作:

  1. 安装visreg包(如果尚未安装):
代码语言:txt
复制
install.packages("visreg")
  1. 加载所需的库和数据:
代码语言:txt
复制
library(visreg)
data <- your_data # 替换为您自己的数据
  1. 拟合GAM模型:
代码语言:txt
复制
gam_model <- gam(y ~ x1 + x2, data = data) # 替换为您自己的响应变量(y)和预测变量(x1和x2)
  1. 使用visreg绘制GAM响应,并显示地毯:
代码语言:txt
复制
visreg(gam_model, "x1", rug = TRUE) # 替换为您自己的预测变量

其中,"x1"是您希望可视化响应的预测变量。通过设置rug参数为TRUE,visreg将在y轴上显示地毯,以表示观测值的分布。

这是一个简单的例子,您可以根据自己的数据和需求进行相应的修改和调整。visreg包还提供了其他可视化选项,例如线性、点估计、置信区间等,您可以根据需要进行进一步的探索和定制。

相关产品和产品介绍链接地址:

  • 腾讯云产品链接1
  • 腾讯云产品链接2
  • 腾讯云产品链接3

请注意,以上所提供的链接和产品仅作为示例,并非实际存在的链接和产品。在实际使用中,请根据实际情况选择适合的腾讯云产品。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用|附代码数据

根据此等式,我们可以从直线在y轴上开始的位置(“截距”或α)开始描述,并且每个单位的x都增加了多少y(“斜率”),我们将它称为x的系数,或称为β)。...“样条线”是分段多项式,以绘图员用来绘制曲线的工具命名。物理样条曲线是一种柔性条,可以弯曲成形,并由砝码固定。在构造数学样条曲线时,我们有多项式函数,二阶导数连续,固定在“结”点上。...= "Load (kW)") 在绘制的时间序列中可以看到两个主要的季节性:每日和每周。...调整后的R平方(越高越好)。我们可以看到R-sq.(adj)值有点低。 让我们绘制拟合值: 我们需要将两个自变量的交互作用包括到模型中。 第一种交互类型对两个变量都使用了一个平滑函数。...---- 本文摘选 《 R语言广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用 》 。

1.2K10

【视频】R语言广义加性模型GAMs非线性效应、比较分析草种耐寒性实验数据可视化

在链路(或链接)尺度上绘制GAM(广义加性模型)的效应时,用户最常采用的可视化手段是部分效应图(Partial Effects Plots)。...以下是一些建议的方法: 计算并绘制平均平滑效果:利用适当的统计软件包(如R中的mgcv和ggeffects或margins包),可以计算并绘制考虑所有其他预测变量影响的平均平滑效果图。...该图更清楚地表明,在我们达到 260 附近的值之前,斜率是正的,超过该值,函数将趋于平稳。 如何在结果量表上绘制平滑效应?...在响应量表上绘制 GAM 效应 我们现在可以选择在这些图上显示观测值 plot_predictions(model_1, co 这是再次的平均平滑度,但这次是在响应变量的尺度上。...在R中,使用mgcv包中的predict.gam()函数,并设置type = 'lpmatrix',我们可以轻松地生成这个矩阵。无论是针对新数据还是拟合模型时使用的原始数据,这一操作都同样适用。

21210
  • 【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用

    根据此等式,我们可以从直线在y轴上开始的位置(“截距”或α)开始描述,并且每个单位的x都增加了多少y(“斜率”),我们将它称为x的系数,或称为β)。...“样条线”是分段多项式,以绘图员用来绘制曲线的工具命名。物理样条曲线是一种柔性条,可以弯曲成形,并由砝码固定。在构造数学样条曲线时,我们有多项式函数,二阶导数连续,固定在“结”点上。...= "Load (kW)") 在绘制的时间序列中可以看到两个主要的季节性:每日和每周。...调整后的R平方(越高越好)。我们可以看到R-sq.(adj)值有点低。 让我们绘制拟合值: 我们需要将两个自变量的交互作用包括到模型中。 第一种交互类型对两个变量都使用了一个平滑函数。...本文摘选《R语言广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用》

    1.8K20

    Python Seaborn (3) 分布数据集的可视化

    在seaborn中这样做的最简单的方法就是在jointplot()函数中创建一个多面板数字,显示两个变量之间的双变量(或联合)关系以及每个变量的单变量(或边际)分布和轴。 ?...双变量分布的最熟悉的可视化方式无疑是散点图,其中每个观察结果以x和y值表示。这是两个方面的地毯图。...在seaborn中,这种图用等高线图显示,可以在jointplot()中作为样式传入参数使用: ? 还可以使用kdeplot()函数绘制二维核密度图。...呈现数据集中成对的关系 要在数据集中绘制多个成对双变量分布,可以使用pairplot()函数。这将创建一个轴的矩阵,并显示DataFrame中每对列的关系。...默认情况下,它也绘制每个变量在对角轴上的单变量: ?

    2.2K10

    跟我一起ggplot2(1)

    绘制不同类型的图表:geom参数 qplot(x,y,data=data,geom="")中的geom=""用来控制输出的图形类型      I....两变量图      (1) geom="points",默认参数,绘制散点图(x,y)      (2) geom="smooth" 绘制平滑曲线(基于loess, gam, lm...# (b). method = "gam": GAM 在大数据时比loess高效,需要载入 mgcv 包 library(mgcv) qplot(carat, price, data = dsmall,...你可以将它想象成是一个三维的数组:分面构成了二维平面,然后图层给予其在新的维度上的扩展。在这个例子中,不同图层上的数据是一样的,但是从理论上来讲,不同的图层中可以有不同的数据。...ggplot2中的基本概念 将数据中变量映射到图形属性。映射控制了二者之间的关系。 ? 标度:标度负责控制映射后图形属性的显示方式。具体形式上来看是图例和坐标刻度。

    2.2K80

    Python可视化 | Seaborn教你一行代码生成数据可视化

    _subplots.AxesSubplot at 0x7fd493fa0390> 直方图 直方图将数据分成bin(s),然后绘制条形以显示落在每个bin中的数据数量,来表示数据的分布。...为了说明这一点,可以删除密度曲线并添加一个地毯图,该图在每次观察时都会绘制一个小的垂直刻度。您可以使用rugplot()函数制作地毯图,也可以在distplot()中使用它。...像直方图一样,KDE根据一个轴上数据的密度,在另一个轴上显示高度。 sns.distplot(x, hist=False, rug=True) 双变量分布可视化 在seaborn中可视化双变量的方法是jointplot()函数,该函数创建一个多面板图形,该图形同时显示两个变量之间的双变量...六边形”图,因为它显示了落在六边形箱中的观测值。

    1.3K30

    R语言广义相加模型 (GAMs)分析预测CO2时间序列数据|附代码数据

    环境科学中的许多数据不适合简单的线性模型,最好用广义相加模型(GAM)来描述 这基本上就是具有 光滑函数的广义线性模型(GLM)的扩展 。...---- 点击标题查阅往期内容 【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用 左右滑动查看更多 01 02 03 04 运行分析 在R中运行GAM。...model_matrix gam_y, type = "lpmatrix") plot(y ~ x) 现在,让我们绘制所有基函数的图,然后再将其添加到GAM(y_pred)的预测中...当然,你可以在模型中包含普通的线性项(无论是连续的还是分类的,甚至在方差分析类型的框架中),并像平常一样从中进行推断。...您可以通过plot 在拟合的gam模型上调用函数来绘制局部效果 ,还可以查看参数项,也可以使用 termplot 函数。

    1K00

    实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归

    根据此等式,我们可以从直线在y轴上开始的位置(“截距”或α)开始描述,并且每个单位的x都增加了多少y(“斜率”),我们将它称为x的系数,或称为β)。...“样条线”是分段多项式,以绘图员用来绘制曲线的工具命名。物理样条曲线是一种柔性条,可以弯曲成形,并由砝码固定。在构造数学样条曲线时,我们有多项式函数,二阶导数连续,固定在“结”点上。...6广义相加模型(GAM) 广义加性模型(GAM)(Hastie,1984)使用光滑函数(如样条曲线)作为回归模型中的预测因子。...事实并非如此,但本质上,我们正转向一种模型,如: 摘自Wood _(2017)_的GAM的更正式示例 是: 其中: μi≡E(Yi),Y的期望 Yi〜EF(μi,ϕi),Yi是一个响应变量,根据均值...上面的示例显示了基于样条的GAM,其拟合度比线性回归模型好得多。 12参考: NELDER, J. A. & WEDDERBURN, R. W. M. 1972.

    1.4K10

    R语言拟合改进的稀疏广义加性模型(RGAM)预测、交叉验证、可视化

    )在电力负荷预测中的应用 01 02 03 04 图表和摘要 让我们再次拟合基本的rgam模型: fit <- rga 默认情况下,plot()给出了最后一个 fit 中的 lambda键的拟合函数,...在每个图表上(一个用于线性特征,一个用于非线性特征),x轴是从大到小的 xi 值,y轴是特征的系数。 summary 默认情况下,系数概况将针对所有变量进行绘制。...predict(cvf s = lambda.1se predict(cvfn") 其他类型的RGAM模型 在上述例子中,变量y是一个定量变量(即取值沿实数数轴)。...然而,RGAM算法非常灵活,可以在y不是定量变量时使用。 二元数据的逻辑回归 在这种情况下,响应变量y应该是一个只包含0和1的数字向量。...在进行预测时,请注意,默认情况下,predict()仅返回线性预测值,即 要获取预测的概率,用户必须在predict()调用中传递type = "response"。

    32410

    散点图及数据分布情况

    当数据集很大的时候,散点图上的数据会互相重叠,此时,很难在图上清晰的显示所有的数据点。通常,我们会先对数据进行汇总给,然后再绘制散点图。这里也会介绍一些数据汇总的操作。...A:边际地毯图实际上是一个一维的散点图,可以用于展示每个坐标轴上数据的分布情况,调用geom_rug()函数即可。...调用R基础绘图系统中的pairs()函数可以绘制散点图矩阵 #继续使用countries数据集 c2009 % filter(Year == 2009) %>% select...Q:如何绘制wilkinson点图以显示所有的数据点?...传递一个指定x和y带宽的向量到h,这个参数会被传递给实际生成密度估计的函数kde2d().在本例中,我们将在x,y轴方向上生成一个更小的带宽,以使密度估计对数据的拟合程度更高。

    8.2K10

    R语言广义相加模型 (GAMs)分析预测CO2时间序列数据|附代码数据

    环境科学中的许多数据不适合简单的线性模型,最好用广义相加模型(GAM)来描述这基本上就是具有 光滑函数的广义线性模型(GLM)的扩展 。...----点击标题查阅往期内容【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用左右滑动查看更多01020304运行分析在R中运行GAM。...model_matrix gam_y, type = "lpmatrix")plot(y ~ x)现在,让我们绘制所有基函数的图,然后再将其添加到GAM(y_pred)的预测中。...您可以通过plot 在拟合的gam模型上调用函数来绘制局部效果 ,还可以查看参数项,也可以使用 termplot 函数。...点击标题查阅往期内容【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用分位数回归、GAM样条曲线、指数平滑和SARIMA对电力负荷时间序列预测实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归R语言非参数模型厘定保险费率

    1.2K20

    R语言广义相加模型 (GAMs)分析预测CO2时间序列数据|附代码数据

    + geom_smooth(method = lm)查看图或 summary(lm_y),您可能会认为模型拟合得很好,但请查看残差图plot(lm_y, which = 1)显然,残差未均匀分布在x的值上...----点击标题查阅往期内容【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用左右滑动查看更多01020304运行分析在R中运行GAM。...model_matrix gam_y, type = "lpmatrix")plot(y ~ x)现在,让我们绘制所有基函数的图,然后再将其添加到GAM(y_pred)的预测中。...您可以通过plot 在拟合的gam模型上调用函数来绘制局部效果 ,还可以查看参数项,也可以使用 termplot 函数。...点击标题查阅往期内容【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用分位数回归、GAM样条曲线、指数平滑和SARIMA对电力负荷时间序列预测实现广义相加模型GAM和普通最小二乘(OLS)回归R语言非参数模型厘定保险费率

    1.9K20

    R语言广义相加模型 (GAMs)分析预测CO2时间序列数据|附代码数据

    环境科学中的许多数据不适合简单的线性模型,最好用广义相加模型(GAM)来描述 这基本上就是具有 光滑函数的广义线性模型(GLM)的扩展 。...---- 点击标题查阅往期内容 【视频】广义相加模型(GAM)在电力负荷预测中的应用 左右滑动查看更多 01 02 03 04 运行分析 在R中运行GAM。...model_matrix gam_y, type = "lpmatrix") plot(y ~ x) 现在,让我们绘制所有基函数的图,然后再将其添加到GAM(y_pred)的预测中...当然,你可以在模型中包含普通的线性项(无论是连续的还是分类的,甚至在方差分析类型的框架中),并像平常一样从中进行推断。...您可以通过plot 在拟合的gam模型上调用函数来绘制局部效果 ,还可以查看参数项,也可以使用 termplot 函数。

    96000

    R绘图笔记 | 一般的散点图绘制

    可先阅读文章:R绘图笔记 | R语言绘图系统与常见绘图函数及参数 1.利用plot()绘制散点图 R语言中plot()函数的基本格式如下: plot(x,y,...) plot函数中,x和y分别表示所绘图形的横坐标和纵坐标...分别表示水平(x轴)和垂直(y轴)坐标的数字向量; boxplots # 如为x,则在下方绘制水平x轴的边界箱线图;如为y,则在左边绘制垂直y轴的边界箱线图; # 如为xy,则在水平和垂直轴上都绘制边界箱线图...# 分组变量或因子;使用不同的颜色、绘图符号等来绘制分组图形; by.groups # 为TRUE,则按分组拟合回归线; xlab、ylab # x轴和y轴标签; log # 绘制对数坐标轴; jitter...shape # 点的形状 size # 数值,设置点和轮廓的大小 point # 逻辑词,为TRUE,则在图上显示点 rug # 逻辑词,为TRUE,则显示边缘地毯 title # 图形标题 xlab...、ylab # 指定x轴、y轴的标签;当xlab = FALSE时隐藏标签,y轴同 facet.by # 长度为1-2的字符向量,指定绘制分面的分组向量,分组向量应在数据框中 panel.labs

    5.3K20

    「R」ggplot2数据可视化

    一个连续型的y标度会将较大的数值映射至空间中纵向更高的位置。 引导元素向看图者展示了如何将视觉属性映射回数据空间。最常见的元素是坐标轴上的刻度线和标签(还有图例)。...在上述例子中,geom_point()函数在图形中画点,创建了一个散点图。labs()函数是可选的,可以添加注释、轴标签、标题等。 ggplot2中有很多函数,并且大多数包含可选的参数。...分组指的是在一个图形中显示两组或多组观察结果。小面化指的是在单独、并排的图形上显示观察组。需要注意,ggplot2包在定义组或面时使用因子。 这里我们使用mtcars数据集查看分组和面,并进行绘图。...让我们从分组开始吧——在一个图中展示多个分组观察值。 分组 在R中,组通常用分类变量的水平(因子)来定义。...Number by Rank3.png 值得注意的是,第三个图形中y轴的标签是错误的,它应该是比例而不是数量。我们可以通过添加y="proportion"参数到labs()函数来解决。

    7.4K10

    复杂相关性散点图复现(ggplot2绘图的层层递进)

    然而,这种相关性在肿瘤组织中很大程度上缺失(ρ=0.30),这表明在正常宫颈组织中观察到的DNA甲基化模式在宫颈肿瘤组织中被破坏( P <0.001;图1a ) Fig. 1 Correlations...Fig1 展示了 在正常组织和肿瘤组织中,DNA甲基化年龄与实际年龄之间的相关性存在差异。...# 添加边际地毯线显示数据分布情况 rug(data$age, col="black", lwd=1, side=3) rug(data$dnamage, col="black", lwd=1, side...✦ 标度(Scales)是将数据的取值映射到图形空间,例如用颜色、大小或形状来表示不同的取值,展现标度的常见做法是绘制图例和坐标轴。...✦ 主题(theme)控制细节显示,例如字体大小和图形的背景色。

    12810

    通过案例带你轻松玩转JMeter连载(49)

    :在条形图上绘制或不绘制边框线。 Ø 显示号码分组?:是否在Y轴标签中显示号码分组。 Ø 列标签值?:是否显示列标签。 Ø 列标签:按结果标签过滤。可以使用正则表达式,例如:登录。...X轴:定义X轴标签的最大长度(以像素为单位)。 Y轴:定义Y轴的自定义最大值。 图例:定义图表图例的位置和字体设置。...4 响应时间图 响应时间图绘制了一个折线图,显示测试期间每个标记请求的响应时间的变化。如果同一时间内存在多个样本,则显示平均值。...X轴和Y轴。 Ø X轴:设置自定义X轴标签的日期格式。语法是Java SimpleDataFormat API。 Ø Y轴:设置以毫秒为单位定义Y轴的自定义最大值。...Ø 显示号码分组:是否显示Y轴标签中的数字分组。 图例定义图表图例的位置和字体设置。 5 图形结果 图形结果生成一个简单的图形,用于绘制所有采样时间。

    2.4K10

    【视频】什么是非线性模型与R语言多项式回归、局部平滑样条、 广义相加GAM分析工资数据|数据分享|附代码数据

    本质上,我们可以将所有这些称为多项式回归,其中自变量 X 和因变量 Y 之间的关系被建模为 X 中的 N 次多项式。有多种回归类型可供选择,很有可能其中一个将非常适合您的数据集。...正如您在所有这些方程中看到的那样,Y 的变化取决于参数 Theta 的变化,不一定只取决于 X。也就是说,在非线性回归中,模型在参数上是非线性的。...接下来,我们 将局部回归拟合GAM  。 在调用GAM之前,我们还可以使用局部回归来创建交互项。 我们可以 绘制结果曲面图  。...R和Python机器学习:广义线性回归glm,样条glm,梯度增强,随机森林和深度学习模型分析 在r语言中使用GAM(广义相加模型)进行电力负荷时间序列分析 用广义加性模型GAM进行时间序列分析 R和...Python机器学习:广义线性回归glm,样条glm,梯度增强,随机森林和深度学习模型分析 在r语言中使用GAM(广义相加模型)进行电力负荷时间序列分析

    1.3K00
    领券