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在VScode中对R语言进行环境配置

从前,有一个名叫阿磊的程序员,他对编程充满了热情,但总是对新事物感到好奇又有点害怕。一天,他听说了一个强大的编程语言——R语言,它在数据分析和统计学领域非常流行。...阿磊决定要在他的VSCode编辑器中安装并配置R语言,以便他可以开始探索数据科学的奥秘。 阿磊打开了他的VSCode,开始在网上搜索如何在VSCode中安装R语言。...于是他开始在浏览器中输入“R语言下载”,结果不小心输入成了“R语言美餐”,网页上出现了各种美食图片,阿磊看得直流口水,完全忘记了下载R语言的事情。...,到系统环境变量里面,win11电脑下按win,搜环境变量; 把r库路径放在系统的环境变量中,新建一个: R_LIBS_USER 你的r库的路径 新建完后,点击三次确认 在bin x64下双击打开Rgui...设置中搜索 r.rterm.windows 填写radian的路径 设置里搜索 r.br, 选Radian为终端 在设置里搜索 httpgd 打勾 此外也可以用shell wind选取输出图像的终端样子

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在 golang 中是如何对 epoll 进行封装的?

在协程没有流行以前,传统的网络编程中,同步阻塞是性能低下的代名词,一次切换就得是 3 us 左右的 CPU 开销。...... } 在这个示例服务程序中,先是使用 net.Listen 来监听了本地的 9008 这个端口。然后调用 Accept 进行接收连接处理。...如果接收到了连接请求,通过go process 来启动一个协程进行处理。在连接的处理中我展示了读写操作(Read 和 Write)。...因为每一次同步的 Accept、Read、Write 都会导致你当前的线程被阻塞掉,会浪费大量的 CPU 进行线程上下文的切换。 但是在 golang 中这样的代码运行性能却是非常的不错,为啥呢?...list := netpoll(0) } 它会不断触发对 netpoll 的调用,在 netpoll 会调用 epollwait 看查看是否有网络事件发生。

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    GEO2R:对GEO数据库中的数据进行差异分析

    GEO数据库中的数据是公开的,很多的科研工作者会下载其中的数据自己去分析,其中差异表达分析是最常见的分析策略之一,为了方便大家更好的挖掘GEO中的数据,官网提供了一个工具GEO2R, 可以方便的进行差异分析...从名字也可以看出,该工具实现的功能就是将GEO数据库中的数据导入到R语言中,然后进行差异分析,本质上是通过以下两个bioconductor上的R包实现的 GEOquery limma GEOquery...一组样本在GEO数据库中用series表示,比如GSE25724, 包含了case和control两组样本,case组包含6个生物学重复,control组包含7个生物学重复,共13个样本,链接如下 https...在网页上可以看到GEO2R的按钮,点击这个按钮就可以进行分析了, 除了差异分析外,GEO2R还提供了一些简单的数据可视化功能。 1....第一个参数用于选择多重假设检验的P值校正算法,第二个参数表示是否对原始的表达量进行log转换,第三个参数调整最终结果中展示的对应的platfrom的注释信息,是基于客户提供的supplement file

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    怎么在isort Python 代码中的导入语句进行排序和格式化

    isort 是什么isort,全称是 "Import Sorting",是一个 Python 工具,用来对 Python 代码中的导入语句进行排序和格式化。...它可以帮助我们按照一定的规则对导入的模块进行排序,使得代码更加整洁,易于阅读和维护。isort 的主要特点包括:自动排序:isort 可以根据配置的规则自动对导入语句进行排序。...快捷命令:isort 提供了命令行工具,可以快速地对代码进行排序。使用 isort 可以大大提高代码的可读性和维护性,尤其是在多人协作的大型项目中,能够帮助团队保持统一的编码风格。...如何安装或者引入 isort在Python中,为了保持代码的整洁和有序,我们通常需要对导入的模块进行排序。isort是一个非常有用的工具,它可以帮助我们自动地完成这个任务。...isort的应用场景isort 是一个强大的 Python 代码排序和格式化工具,能够帮助开发者自动化地按照一定规则对代码中的导入语句进行排序和格式化。

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    R语言学习笔记-Day6

    R语言的综合应用tidyverse:集成化R包转换-可视化-模型1 字符串"stringr"str_length()str_split()str_sub()1.1 检测字符串长度str.length()..."o"替换成"A"1.6 字符删除str_remove(x,"o")只会对第一次出现的"o"进行删除#改进:str_remove_all(x,"o")对所有的"o"进行删除1.7 补充y = c("jimmy...#整行移动#升序排序降序排序arrange(test,desc(Sepal.Length))##列名不能加""2.2 去重复distinct(test,Species,.keep_all=T)#对某一列中重复的元素去重复...k2,"tumor","normal")3.4 for循环for(i in x){CODE}#对x中的每个元素i执行相同的代码CODE#有几个元素则执行几次,函数本身不存在判断条件,可自行添加其它函数进行判断...#对列表/向量中每个元素实施相同的操作e.g.lapply(1:4,rnorm)[1] 1.13[2]1 0.78 1.13[3]1 1.81 -0.04 -0.17[4]1 0.04 1.22 -1.13

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    生信入门马拉松之R语言基础-脚本项目管理、条件循环、表达矩阵和一丢丢数据挖掘(Day 7)

    数据框函数- 排序arrange()和desc参数、distinct()去重复、mutate()数据框新增列注意⚠️没有赋值就没有改变管道符号%>%-实现连续的步骤非常易读彩虹代码展现嵌套函数的逻辑。...2.3 if条件语句控制代码运行elseif(F){}啥都不敢if(F){}elese{}#运行else后的{}中的代码2.4 ifelse函数只有3个参数ifelse(x,yes,no)x:逻辑或逻辑值向量...table(x)2.7 for循环对x里的每个元素进行同一操作for(i in x){CODE}#x是向量;i是代称,i自动等于某个循环里的x元素for( i in 1:4){ print(i)}#for...生信实战中R语言的几个重点函数【小洁老师语录】编程能力,就是解决问题的能力,也是变优秀的能力R语言基础入门课程-到此结束7. 数据挖掘生信技能树小洁老师7.1 为什么数据挖掘?...表达矩阵:一行是一个基因在所有样品里的表达,一列是一个样本里所有基因的表达。在表达矩阵中,寻找在不同组有表达差异的基因。

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    阿榜的生信笔记7—R语言的综合运用1

    : R语言的综合运用内容较多,所以我将其分为两篇文章进行讲解。第一篇笔记先学习目录的前三个知识✊ 一、玩转字符串 字符串的学习要点在下方: 1、字符串长度 先上图,大家会不会觉得疑惑?...arrange(test, desc(Sepal.Length)) :按照"Sepal.Length"这个变量的值对"test"数组进行从大到小排序。...= T),这行代码是用来从数据框test中筛选出不重复的Species列,并保留所有列数据。...①、多次赋值,产生多个中间的变量 ②、嵌套,代码不易读 ③、管道符号传递,简洁明了 三、条件语句和循环语句 1、if条件语句:满足()里面的条件,执行;不满足()里面的条件,不执行 ②、长脚本管理的两种方法...长脚本可以进行折叠,if条件语句简洁了?

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    在VFP9中利用CA对远程数据的存取进行管理(二)

    2、 UPDATENAMELIST:必须提供一个本地和远程的字段名列表对,它们有逗号分隔,每一对名字中包含一个本地字段名,紧跟一个远程字段名,远程字段名前TABLES中的表名。...,使用CA对数据进行存取时,可以按如下的原则来进行设置: 更新命令: 1、 让CA自动生成更新语句的命令 2、 直接对相关的更新命令写入自己的更新语句 更新方法: 1、 由VFP自动执行更新 2、...值得关注的是,我们可以在这个事件中改变参数cSelectCmd的值来对CursorFill生成的临时表的结果集进行灵活控制,改变这个参数的值不会 修改CA对象中SelectCmd的属性值。...比如,我们可以为SelectCmd属性设置一个基本的SQL语句,在这个事件中 为cSelectCmd参数增加一个Where语句而不需要SelectCmd属性的本身的值。...可以在这个事件中对没有附着临时表的CA的属性进行重新设置以及对自由表进行数据操作。 7、 BeforeCursorClose:在临时表关闭之前立即发生。参数:cAlias:临时表的别名。

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    在VFP9中利用CA对远程数据的存取进行管理(一)

    本 人一直使用VFP开发程序,对这些东西也没有一个清晰的了解(太笨了),特别对远程数据进行访问时更是不知选什么好。...CursorAdapter既可以对本地数据进行存取,又可以对远程的不同类型的数据源进行存取,不需要关心数据源,只要对 CursorAdapter的属性进行适当的设置就可以了,甚至可以在程序中动态的对这些属性进行改变...3、 在数据源本身技术限制的范围内对数据源进行共享。 4、 对与CursorAdapter相关联的临时表(CURSOR)的结构可以有选择地进行定义。...7、 通过对CursorAdapter对象的属性和方法进行设置,可以控制数据的插入、更新和删除的方式,可以有自动与程序控制两种方式。...注意:VFP9中在TABLEUPDATE( )执行期间不能执行TABLEREVERT( )。

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    2023.4生信马拉松day7-R语言综合应用

    -(2)用多次嵌套避免中间变量不直观,且容易出错; ——设置彩虹括号,可以在多层嵌套时看清楚哪个括号和哪个括号是一对: options -- code -- display --use rainbow...TRUE时的返回值 -(4)no:逻辑值为FALSE时的返回值 -(5)支持单个的逻辑值,也支持多个逻辑值组成的向量 -(6)相当于对向量的每个元素逐个进行判断,然后对判断结果F/T进行逐个替换; i...可以检测样本中是不是含有某个字符,然后返回逻辑值,ifelse()对逻辑值T/F进行替换 samples = c("tumor1","tumor2","tumor3","normal1","normal2...,"normal");k2 ifelse(k2,"normal","tumor") 5. else if() 对多个条件进行判断 i = 0 if (i>0){ print('+') } else...4. full_join 保留所有的,缺失的位置填充NA 5. semi_join 半连接,效果是取子集:以右边表格为参考对左边取子集 6. anti_join 保留左边表格在右边表格里没有的东西 test1

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    单细胞空间|在Seurat中对基于图像的空间数据进行分析(1)

    在本指南中,我们分析了其中一个样本——第二切片的第一个生物学重复样本。在每个细胞中检测到的转录本数量平均为206。 首先,我们导入数据集并构建了一个Seurat对象。...这个矩阵在功能上与单细胞RNA测序中的计数矩阵相似,并且默认情况下存储在Seurat对象的RNA分析模块中。...在标准化过程中,我们采用了基于SCTransform的方法,并对默认的裁剪参数进行了微调,以减少smFISH实验中偶尔出现的异常值对我们分析结果的干扰。...通过使用ImageFeaturePlot()函数,我们可以根据单个基因的表达量来对细胞进行着色,这与FeaturePlot()函数的作用相似,都是为了在二维平面上展示基因表达的分布情况。...考虑到MERFISH技术能够对单个分子进行成像,我们还能够在图像上直接观察到每个分子的具体位置。

    1.1K10

    R语言 控制流:for、while、ifelse和自定义函数function

    行列引用、条件筛选等可以简单的数据管理,但其在无法有效处理多次、多重、有规律的循环和判断问题,而控制流却可以通过循环、判断、跳错等等操作轻松处理此类问题。...以下概念贯穿控制流张杰的内容,需要首先认识: 语句(statement):单独或组合语句,一般在{}中以;分隔 。例如:{语句1;语句2} 条件(cond): 最常见的是判断一个条件是否成立。...其中,分支控制是根据条件表达式的结果,执行不同的代码段;循环控制是根据条件重复执行代码块,为了避免无限循环,可以根据条件结束循环。接下来分别从分支控制和循环控制,对R语言中的控制流做简单讲述。...2.1 for循环 使用迭代器和一个向量参数,在每个循环中,迭代器变量从向量中取得一个值,直到迭代所有得向量 #语句 for (变量 in 序列/字符集) {语句/表达式} 示例 #依次执行序列/字符集中的每一个数据...source('avgfunction.R') #注意需用引号将文档名引起来,当avgfunction.R与operate.R在同一路径时,不需要加路径 将被调用的函数放置在电脑桌面(C:/Users

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    Java中多个ifelse语句的替代设计

    欢迎您关注《大数据成神之路》 今天在改老代码的过程中,亲眼见证了一段30个if-else嵌套的代码... 然后搜集了一些资料做了以下简单整理。 概述 ifelse是任何编程语言的重要组成部分。...但是我们编写了大量嵌套的if语句,这使得我们的代码更加复杂和难以维护。 接下来,让我们探索如何简化代码的中的ifelse语句写法。...但是有可能嵌套的if语句只是转移到了工厂类,这违背了我们的目的。 或者,我们可以在Map中维护一个对象存储库,可以查询该存储库以进行快速查找。...我们总是可以选择在嵌套的if语句或switch case中使用这些值作为不同的条件,但让我们设计一种将逻辑委托给Enum本身的替代方法。 我们将为每个Enum值定义方法并进行计算。...if语句时,每个条件都描述了一个业务规则,必须对其进行评估才能处理正确的逻辑。

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    十二、R语言的综合应用

    1.4.字符检测 str_detect(x2,"h") ### 看x2这个长度为8的向量中的每个元素是否含有h这个关键词,生成的与x2长度相等且一一对应的逻辑值向量 str_starts(x2,"...(i==0) { print('0') } else if (i< 0){ print('-') } ifelse(i>0,"+",ifelse(i<0,"-","0")) 3.2 循环语句...# 对列表/向量中的每个元素(向量)实施相同的操作 test <- list(x = 36:33,y = 32:35,z = 30:27);test #返回值是列表,对列表中的每个元素(向量)求均值(...,取右边表中存在的子集 anti_join(test1,test2,by="name") ###反连接,左边表里在右边表里没有的会被留下来。...---- dir() # 列出工作目录下的文件 dir(pattern = ".R$") #列出工作目录下以.R结尾的文件 file.create("douhua.txt") #用代码创建文件 file.exists

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    Learn R 专题1-3

    (i>0,"+",ifelse(i嵌套写法 先里后外 [1] "0" for循环 图片 图片 #variable是元素代称;vector是向量名字 { }中是对元素进行操作的...对x元素进行循环 s=0 for (i in x){ s=s+i print(c(i,s)) } [1] 5 5 [1] 6 11 [1] 0 11...#X 是数据框/矩阵名;MARGING为1表示行;为2表示列,FUN是函数 ;对x的每一行/列进行FUN这个函数;...用于写函数的参数 > test<- iris[1:6,1:4] > apply(test...1000) #每个基因的方差排序 每行计算方差,取后1000个 names(tail(sort(apply(test,1,var)),1000)) # 将后1000个的基因名称提取出来 对列表/向量中的每个元素...$z [1] 30 29 28 27 返回值是列表,对列表中的每个元素(向量)求均值(试试方差var,分位数quantile) > lapply(test,mean) #输出结果仍为列表 $x [1]

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    R07-R语言的综合应用

    ,"e") # 4.字符检测,字符串是否以e结尾str_replace(x2,"o","A") # 5.字符串替换,x2中的o替换为A(有重复的只替换了第一个)str_replace_all...() %>%head(50) %>% pheatmap::pheatmap()3.条件和循环一、条件语句if(一个逻辑值){ } 如果()中的条件T成立,{}中的函数被运行,如果F不成立,则不执行...if条件语句:如果...就...否则...if(一个逻辑值){ CODE1} else{CODE2}重点:ifelse函数ifelse(x,yes,no)x:逻辑值或逻辑值向量yes:逻辑值为TRUE时的返回值...循环for(i in x){CODE} # 对x里的每个元素i进行同一操作for( i in 1:4){print(i)} #对1:4中的每个元素进行循环输出批量画图par(mfrow = c...) #对1:4中的每个元素进行rnorm操作5.数据框的连接inner_join #取交集连接full_join #全连接left_join(test1,test2,by="name") #左连接

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