我想用R中的插入符号包为PLS-DA绘制一个个人图(类似于PCA图)，并为不同的组添加一种颜色(见附件中的图片，这是PCA的一个示例，但我想为PLS-DA添加相同类型的图)。有人能帮我一下吗？ 这是一个生成随机数据的代码，类似于我使用的数据。Ycalib包含一个具有2级的向量变量，Xcalib包含539个光谱波长(下面的代码生
浏览 29提问于2019-02-11得票数 1
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我试图在R中的插入符号包中创建预测模型，并从终端/cmd调用新数据的预测。"test.rds")print(Sys.time() - t)pawel@pawel-MS-1753:~$ Rscript script.R
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浏览 3提问于2017-07-22得票数 1
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以下数据显示了6个大小分别为5的样本的平均(xbar)和范围(r)。xbar <- c(1080͵1390͵1460͵1380͵1090͵1230)如何使用这类数据使用R程序的qcc包绘制xbar和r(这里没有对样本的单独观察，而只有它们的均值和R值。)
浏览 5提问于2015-03-18得票数 0
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我正在使用plotrix软件包中的stackpoly()命令在R中绘制堆叠面积图。至少可以说，默认的颜色是炫目的。有没有办法用符号或灰度来代替呢？
浏览 0提问于2011-05-20得票数 3
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加载一个数据集，包括在401波长的60个汽油样品的光谱强度，以及它们在pls封装中的辛烷值。在我的例子中： $ octane:of 2
浏览 1提问于2019-04-20得票数 0
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我在软件上有两个选择- matlab中的PLS工具或R中的素食包。在R中，我输入我的标准化(相对丰度)文件，并在素食包中使用rda：biplot(pca)
我注意到PLS工具给你提供了选择均值居中的选项，有了这个选项，不同软件的PCA图看起来完全不同。我在一些网站上读到，我们应该总是对PCA做均值居中，有
浏览 5提问于2013-12-04得票数 0
我最近在R中使用prcomp()函数运行PCA，现在我需要(客观地)确定我的两个不同组中的哪些样本是异常值，应该从进一步的分析中删除。我以前见过PCA图，其中置信度/方差椭圆(不确定术语)放在样本周围，而不是那些被认为是异常值的(例如，假设距离集群质心超过3个标准差)。我如何在R中实现这样的东西呢？编辑:我正在使用的R对象，以及我想要用于异常值标记的图之一：
countsTable <- read.t
浏览 1提问于2013-01-11得票数 5
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如何计算一个人在两棵树内(而不是在两棵整棵树之间)的同素距离？
我要计算两个树状图中每个个体位置上的相似/不同，并使用R包密度和热度在组合热图和树状图的行颜色中显示结果。
浏览 0提问于2018-08-31得票数 0
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我正在寻找一种在R中绘制“星级”样式图的方法，类似于条形图，但带有星形符号。我猜整数应该是输入，或者可能是半标，就像“三星半星”。
甚至不确定这些图表被调用来搜索现有的包...
浏览 8提问于2018-08-21得票数 2
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当用caret软件包训练R中的模型时，在绘制模型的变量重要性时会出现一个错误。这发生在几种挖掘算法(bayesglm、glm、naive_bayes、.)中。trControl = control,在以下方面的成果R版本为3.4.3，插入符号为插入
浏览 0提问于2018-05-18得票数 4
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当需要比较多个组件/集时，UpSetR R包提供了一种很好的方法来升级传统的Venn图。然而，R中的翻转图(使用UpSetR包)在图的左侧绘制设置大小(水平条)。有什么办法让他们站在右边吗？
浏览 2提问于2019-09-27得票数 2
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是否有一个包允许为非基于XGBoost或决策树的模型的多个观测值估计shap值？我用Caret和NNET创建了一个神经网络。我想开发一个蜂温图和形状依赖图，以探讨我的模型中的某些变量与结果之间的关系。我唯一的成功是使用DALEX包来估计SHAP值，但是DALEX只对单个实例这样做，不能使用SHAP值进行全局分析。任何洞察力或帮助都将不胜感激！我试过使用不同的shap包(快速成形，shapr)，但这些需要基于决策树的模型。我试着用<em
浏览 4提问于2022-12-03得票数 0
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在R中，我想要多个个体密度图，最好使用ggplot2软件包。数据框架具有变量V1，它具有多个级别(见下面的数据示例)。V1 V21 4 2 32 63 9
我如何使用qplot或ggplot为V1=1 V1=2和V1=3创建密度图，其中V2值与V1值相关联(即V1=1的密度图仅代表V2=(5、4、2))？
浏览 2提问于2014-11-18得票数 0
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假设我在R中有一个数据集，表示组内的个人。E9 3 D11 4 B13 4 E15 5 F
因此，第1组由个体(A，C，D)组成，第2组由个体(B，C，D，E)等组成。我想要创建一个网络图来显示个人是如何相互联系的。在一个群体中，所有的个体都是由边缘连接的。边缘的厚度应该反映两个人相互连接的频率。pairs <- do
浏览 0提问于2014-03-27得票数 2
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我如何在Python中进行分层聚类(在本例中是针对基因表达数据)，以显示基因表达值矩阵和树状图？我的意思是像下面这样的例子：
如何在Python中使用numpy/scipy或其他工具执行此操作？另外，用欧几里德距离作为度量，用大约11,000个基因的矩阵来做这件事，在计算上可行吗？
编辑:很多
浏览 0提问于2010-06-05得票数 3
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我在R中使用插入符号的训练函数来生成一个使用GBM的模型。我使用了重复交叉验证与5次重复，这意味着将有50个样本。我想问的是，是否有一种方法可以用不同的方式来绘制结果，比如在x轴上显示增强迭代，在y轴上显示auc，在里面显示从最佳参数选择中得到的结果，但是有一条单独的行来训练褶皱和测试褶皱。当您使用gbm包中的"gbm“函数，并使用&q
浏览 3提问于2015-10-01得票数 0
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当我试图加载插入符号库时，它会说ggplot2有问题。其他StackOverflow问题的答案是，这是因为在代码中不使用引号使R认为它在寻找一个名为pkgInfo的对象。但在这种情况下，错误来自内部.R version 3.5.1 (2018-07-02)Running under:
浏览 0提问于2018-08-22得票数 2
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我是R方面的新手，我需要知道如何绘制从随机森林训练模型中选择的树，该模型是使用插入符号包中的train ()函数创建的。
首先，我使用一个训练数据集来使用()函数创建一个随机森林的拟合模型。
浏览 1提问于2018-07-01得票数 0
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我正在寻找在R环境中用颜色填充的单元格绘制表格的方法。有没有人知道如何在R中绘制这种图，如下所示。我可以使用ggplot2包得到类似的图，但是我无法扩展行和列的行。
浏览 1提问于2018-09-25得票数 0
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