首页
学习
活动
专区
工具
TVP
发布
精选内容/技术社群/优惠产品,尽在小程序
立即前往

在Python中使用Girvan Newman算法时,根据社区对节点进行着色

是为了将网络图中的节点划分为不同的社区或群组。Girvan Newman算法是一种常用的社区发现算法,它基于网络图的边介数(betweenness)来度量边的重要性,并通过逐步删除介数最高的边来划分社区。

在Python中,可以使用NetworkX库来实现Girvan Newman算法。NetworkX是一个强大的网络分析库,提供了丰富的图算法和可视化工具。

以下是使用Girvan Newman算法对节点进行着色的步骤:

  1. 导入必要的库和模块:
代码语言:txt
复制
import networkx as nx
from networkx.algorithms.community import girvan_newman
  1. 创建一个空的无向图对象:
代码语言:txt
复制
G = nx.Graph()
  1. 添加节点和边到图中:
代码语言:txt
复制
G.add_nodes_from([1, 2, 3, 4, 5])
G.add_edges_from([(1, 2), (1, 3), (2, 3), (3, 4), (4, 5)])
  1. 使用Girvan Newman算法获取社区划分:
代码语言:txt
复制
communities = girvan_newman(G)
  1. 根据社区划分对节点进行着色:
代码语言:txt
复制
colors = {}
for i, community in enumerate(next(communities)):
    for node in community:
        colors[node] = i

在上述代码中,我们首先创建了一个包含5个节点和5条边的无向图。然后,使用Girvan Newman算法获取社区划分,返回的是一个生成器对象。我们通过调用next()函数获取第一个社区划分结果,并遍历每个社区中的节点,将节点与对应的社区索引进行映射。

最后,我们可以根据节点的着色信息进行可视化或进一步的分析。

页面内容是否对你有帮助?
有帮助
没帮助

相关·内容

实现、动态展示多种社区发现算法,这个Python库助你发现网络图的社区结构

机器之心报道 编辑:杜伟、陈萍 熟知社区发现算法,你不能错过这个 Python 库。它涵盖 Louvain 算法Girvan-Newman 算法等多种社区发现算法,还具有可视化功能。...由此衍生出来的社区发现(community detection)算法用来发现网络社区结构,这类算法包括 Louvain 算法Girvan-Newman 算法以及 Bron-Kerbosch 算法等...Louvain 算法最大化图模块性的社区进行贪婪搜索。如果一个图具有高密度的群体内边缘和低密度的群体间边缘,则称之为模图。...Girvan-Newman 算法迭代删除边以创建更多连接的组件。每个组件都被视为一个 community,当模块度不能再增加算法停止去除边缘。...,并且同一社区节点聚类结合在一起。

4.1K10

网络社区检测(社群发现)分析女性参加社交活动和社区节点着色可视化

让我们根据节点所属的社区节点着色: community(g) col <- membership + 1 plot 正如我们所看到的,该算法找到了2个社区,乍一看,这种划分似乎是合理的。...有几种方法可以使用非常不同的包进行社区分区。 网络社区检测算法 walktrap.community 该算法通过执行随机游走找到密集连接的子图。...这个想法是随机游走将倾向于留在社区内,而不是跳到其他社区。 边缘.中间.社区 这个算法就是Girvan-Newman算法。它是一种分割算法每一步,具有最高间性的边被从图中移除。...Newman快速算法(fast greedy)") 该算法是纽曼算法。在这种情况下,算法是凝聚的。每一步,两组合并。合并是通过优化模块化决定的。这是一种快速算法,但有一个贪婪算法的缺点。...我们现在可以绘制所有模块化的图 plot # 现在,让我们根据节点的成员资格为其着色 removed.edges color=membership # 让我们为图选择一个布局 layout

85320
  • 用 NetworkX + Gephi + Nebula Graph 分析人物关系(上篇)

    社区划分——Girvan-Newman 算法 我们使用 NetworkX 3 内置的社区发现算法 Girvan-Newman 来为我们的图网络划分社区。...以下为「社区发现算法 Girvan-Newman」解释: 网络图中,连接较为紧密的部分可以被看成一个社区。每个社区内部节点之间有较为紧密的连接,而在两个社区间连接则较为稀疏。...Girvan-Newman 算法即是一种基于介数的社区发现算法,其基本思想是根据边介数中心性(edge betweenness)从大到小的顺序不断地将边从网络移除直到整个网络分解为各个社区。...Girvan-Newman 算法的基本流程如下: (1)计算网络中所有边的边介数; (2)找到边介数最高的边并将它从网络移除; (3)重复步骤 2,直到每个节点成为一个独立的社区为止,即网络没有边存在...使用 Girvan-Newman 算法划分社区

    2.5K20

    图论与图学习(二):图算法

    当我们考察完当前节点的所有未访问节点,将当前节点标记为已访问,并将其移出未访问集。已访问节点不会再次进行检查。...二 社群检测 社群检测是根据给定的质量指标将节点划分为多个分组。 这通常可用于识别社交社群、客户行为或网页主题。 社区是指一组相连节点的集合。...但是,目前关于社群还没有广泛公认的定义,只是社群内的节点应该要密集地相连。 ? 社群 Girvan Newman 算法是一个用于发现社群的常用算法。其通过逐步移除网络内的边来定义社区。...你可以通过 Python 使用以下代码实现它: from networkx.algorithms import communityk = 1 comp = community.girvan_newman...尽管是谷歌让这种算法流行起来的,但这种方法能够用于检测任何网络的高影响力节点。比如可用在社交网络上进行推荐。

    3.6K22

    GitHub 热榜:这款 Python 工具火了,可对社群结构进行可视化、检测

    最近,又有一款 Python 可视化工具火了。 这一次,功能是针对图聚类问题的社群结构进行检测、可视化。 ? 该项目的帖子 reddit 上一经发布,就被顶到了 “机器学习板块” 的 榜首。...它支持多种算法,包括: Louvain 算法Girvan-Newman 算法; 层次聚类算法; 光谱聚类算法; Bron-Kerbosch 算法。...它根据顶点的共享边将顶点排列成社群结构,也就是说,它将节点分为几个社群,每个社群之间共享很少的连接,但是同一社群的节点之间共享许多连接。...实现可视化,并进行颜色编码 利用 communities 将图进行可视化,将节点分到社群进行颜色编码,还可以选择深色或浅色背景、保存图片、选择图片的分辨率等等 。...我们可以看到 Louvain 算法的动态过程: 首先扫描数据的所有节点,将每个节点看做一个独立的社群; 接下来,遍历每个节点的邻居节点,判断是否将该节点加入邻居节点所在的社群,以提升模块度; 这一过程重复迭代

    79910

    图神经网络(01)-图与图学习(上)

    Zachary 1970 到 1972 年这三年研究的一个空手道俱乐部的社交网络。该网络包含了这个空手道俱乐部的 34 个成员,成员之间的连接表示他们俱乐部之外也有联系。...这三种表示方式都是等价的,我们可以根据使用场景来选择图的存储方式。 三. 图的类型和性质 图可以根据不同标准进行分类,我们在这里主要讲一种分类方法,同构图与异构图。...传统同构图(Homogeneous Graph)数据只存在一种节点和边,因此构建图神经网络所有节点共享同样的模型参数并且拥有同样维度的特征空间。...主要的图算法 目前大多数框架(比如 Python 的 networkx 或 Neo4J)支持的图算法类别主要有三个: Pathfinding(寻路):根据可用性和质量等条件确定最优路径。...但是,目前关于社群还没有广泛公认的定义,只是社群内的节点应该要密集地相连。 ? image Girvan Newman 算法是一个用于发现社群的常用算法。其通过逐步移除网络内的边来定义社区

    2.8K32

    独家 | 使用Spark进行大规模图形挖掘(附链接)

    Raghavan,Usha Nandini,RékaAlbert和Soundar Kumara“大型网络检测社区结构的近线性时间算法。”...统计力学杂志:理论与实验2008.10(2008):P10008 工具选择 首先工具领域进行一个简要的分析。我根据图的大小,该库是否适配Python以及能否生成简单的可视化效果来划分工具。...如果确实需要使用非常大的数据集,则首先考虑图形进行采样,过滤感兴趣的子图,从示例推断关系,可以从现有任意工具获得更多收益。...我的解析代码是用Scala编写的,但我的演示是pyspark中进行的。我使用了WarcReaderFactory和Jericho解析器。python,像warc这样的库可以满足数据处理需求。...结果 当我示例Common Crawl Web图上运行LPA发生了什么? 我最初原始数据拥有超过1500万个网站。有很多节点,其中许多包含冗余信息。

    2K20

    如何将任何文本转换为图谱

    我已经整理了这些贡献并代码进行了一些改进,以解决原始实现的一些问题。我计划写一篇独立的文章关于这个。在这篇文章,我想分享另一个想法,当与递归RAG结合使用时可能有助于创造一个超级研究代理。...这个想法是根据我对较小LLMs进行递归RAG实验以及我Medium上阅读到的一些其他想法的结合产生的,特别是其中一个是知识图增强生成。...例如,使用简单的语义相似性搜索来检索与查询最相关的上下文并不总是有效的。特别是当查询没有提供足够的关于其真实意图的上下文,或者当上下文零散分布一个大型文本语料库。...算法 - NetworkX 3.2.1 文档 修改描述 networkx.org[5] 在这里,我使用社区检测算法节点添加颜色。社区是指那些彼此之间连接更紧密的节点群体,而不是图中其他部分。...概念的社区能为我们提供关于文本讨论的广泛主题的很好的想法。Girvan Newman算法我们所研究的评论文章检测到了17个概念的社区。这是其中一个社区

    83310

    Nature Methods | TooManyCells:单细胞聚类和可视化方法

    3.2停止标准 TooManyCells使用Newman-Girvan模块化Q作为停止标准,使用Q度量节点划分的强度,Q测量簇内边缘到其它簇的随机分布的距离,Q>0表示非随机群落,Q≤0显示存在随机发现的群落...TooManyCells可以解决这些限制,树数据抽象集群间关系进行完全可定制的可视化,TooManyCells可视化和聚类算法如图1。 ?...TooManyCells通过模块化值指出稀有群集,稀有种群即使没有细胞类型标签的情况下也很容易被识别。使用常用的聚类方法两个稀有群集和丰富群集混合物的细胞进行检测的实验结果如图2。 ?...图2 聚类算法两个稀有群集和丰富细胞群集混合物的细胞进行检测 5 总结 TooManyCells通过递归技术反复识别在树结构中亚群,其可视化模型结合一系列可视化特性为细胞状态提供一个灵活的平台,跟踪、...研究者设计该方法还考虑了其灵活性和通用性。

    84550

    TKDE21 | 网络社团发现新综述:从统计建模到深度学习

    尤其是,GirvanNewman 发现了复杂网络的另一个重要统计特性——社团结构,即网络通常会由一些稠密相连的结点簇组成。自此,学术界掀起了复杂网络社团结构的研究热潮。...其次,我们讨论了两类方法的主要思想,并针对不同方法进行了详细概述。此外,我们还发布了一些社团检测领域常用的基准数据集,重点介绍了社团检测各种网络分析任务的应用。...基于 SBM 的社团检测方法 2.1.2 主题模型 主题模型(如 LDA)是一种能够有效建模文本隐藏主题的统计模型,通过使用潜在变量主题进行建模。...将网络结构建模为文档的方法首先假设网络的每个结点可能属于多个社团,并将社团视为“主题”,将结点视为“文档”;其次,选择几个社团作为初始社团,根据网络拓扑结构社团进行迭代更新,得到最终的社团划分;使用网络属性的方法主要利用社交网络的属性...其次,我们这两类方法进行了详细的分析和比较。我们还介绍了社团检测各个任务和领域的广泛应用,并讨论了社团检测未来可能的研究方向。

    47920

    R语言社区发现算法检测心理学复杂网络:spinglass、探索性图分析walktrap算法与可视化|附代码数据

    然后,我们可以很容易地qgraph绘制这些社区,例如,节点进行相应的着色。...这很容易做到:让我们把这两个网络画在一起,并社区进行相应的着色。首先,我们根据结果来定义社群,然后用上面第一个网络的布局来绘制网络。...结论 如果你网络的项目之间的统计社区感兴趣,不要只视觉上检查你的图。当我为论文做这件事,我使用上面描述的三种方法,通常它们的结果相当相似。显然,你也可能对理论或概念更感兴趣。...通过SAS网络分析人口迁移进行可视化分析 python隶属关系图模型:基于模型的网络密集重叠社区检测方法 使用Python和SAS Viya分析社交网络 用R语言和python进行社交网络社区检测...python图工具基于随机块模型动态网络社团检测 R语言中使用航空公司复杂网络疫情进行建模 采用SPSS Modeler的Web复杂网络所有腧穴进行分析

    46130

    社区发现算法FastUnfolding的GraphX实现

    这些网络进行社区发现具有极大的意义,如在人际关系网,可以发现出具有不同兴趣、背景的社会团体,方便进行不同的宣传策略;交易网,不同的社区代表不同购买力的客户群体,方便运营为他们推荐合适的商品;资金网络...,社区有可能是潜在的洗钱团伙、刷钻联盟,方便安全部门进行相应处理;相似店铺网络社区发现可以检测出商帮、价格联盟等,商家进行指导等等。...Girvan等人使用 GN算法 进行求解,首先求解每条边的介数(betweenness),然后将介数最大的边删去,再重新求解每条边新的介数,依此循环。...消息滞后 由于并行化处理t轮每个节点根据t-1轮的邻居社区信息进行更新,存在一定的消息滞后现象,会造成 “互换社区” 的问题,示意图如下: ? 图3....实现需要进行算法并行化,充分利用并行化框架带来的计算优势。将传统的串行化算法改造成并行化算法的过程,会遇到中间计算量过大、消息滞后造成的问题,如“互换社区”和“社区归属延迟”问题。

    2.3K10

    用 NetworkX + Gephi + Nebula Graph 分析人物关系(下篇)

    NetworkX NetworkX 2 是一个用 Python 语言开发的图论与复杂网络建模工具,内置了大量常用的图与复杂网络分析算法,可以方便地进行复杂网络数据分析、仿真建模等工作,功能丰富,简单易用...我们已经演示了 NetworkX 的 Girvan-Newman 社区发现算法。...图数据库 Nebula Graph NetworkX 通常使用本地文件作为数据源,这在静态网络研究的时候没什么问题,但如果图网络经常会发生变化——例如某些中心节点已经不存在(Fig.1)或者引入了重要的网络拓扑变化...第二种方式更适合于全图的分析,这通常是项目前期全图进行一些启发式探索,当有进一步认知后再用第一种方式做精细的剪枝分析。...scan_edge_processor scan_edge_response 的数据进行解码,解码后的数据可以直接打印出来,也可以做一些简单处理,另作他用,比如:将这些数据读入计算框架 NetworkX

    2.4K31

    Academic social networks: Modeling, analysis, mining and applications 2019翻译

    **特征向量中心性是反映节点重要性的另一个度量。该方法根据高分节点节点得分的贡献大于低分节点的原则,给出了各节点的相对得分。它是利用等式的邻接矩阵来计算的。...现在已经证明,小世界特性现实世界是普遍存在的。SNs,小世界特性表示节点之间的平均最短路径长度与固定的平均网络大小成比例(Newman,2003b)。...社区可以定义为一组相似的节点NewmanGirvan,2004)。因此,我们通常在网络的某些区域发现高密度的边,而这些区域之间的边密度较低。大多数真实网络都表现出社区结构的特征。...在这里,我们提出了两种主要的检测方法,即基于模块化的方法和其他社区划分方法。 **基于模块化的方法。**模块化最早由NewmanGirvan(2004)提出,是确定网络分区质量的常用标准。...BGLL初始化阶段假设网络的每个节点都是一个社区,然后考虑每个节点的相邻节点,计算相邻节点社区模块化值的增量。

    75530

    干货:复杂网络及其应用简介

    其中,大度节点也被称为网络的枢纽,它们的存在使得网络意外故障有强大的承受能力,与此同时,面临协同攻击则显得异常脆弱。这种现象抽象为数学概念来讲就是无标度网络的节点度分布服从幂律分布。...也就是说,如果一个网络存在某些超级节点使用CommonNeighbor算法的过程,就会面临推荐超级节点的问题。...社团结构最早由GirvanNewman提出,后来逐渐被人们接受和应用。目前对于社团结构的研究已经持续了十年左右的时间,已成为复杂网络研究领域中的一个重要的研究热点和方向。...例如:根据社团结构的形成过程,算法可以分为凝聚算法、分裂算法、搜索算法及其他算法4大类。...,集聚系数较大的节点往往处于某个小社团内部,这种社团是欺诈团伙的概率很高; ·挖掘网络的社团结构,然后针对每个社团进一步分析社团内部的统计特征,分析该社团是欺诈团伙的可能性; 通过上述方法网络进行分析之后

    9.4K50

    从“青铜”到“王者”-图嵌入社区发现的升级之路

    2.2.1模块度 Newman 2003年的文献[4]首次提出了modularity的定义,论文中用来度量自己的社团发现算法的好坏。 这里直接给出最常用的模块度公式: ? ? 本质是: ?...图嵌入学习不仅考虑了顶点之间的相似特性,同时考虑了顶点与社区之间的相似度。 下面来看看该论文是怎么把社区信息融入到图表示学习的。...社区嵌入的可能方法是直接节点嵌入结果进行社区发现,从而为每个社区建立一个基于顶点嵌入向量的多变量高斯分布。也就是GMM的基础上将社区发现和嵌入到一个单一的目标函数。...因此,仅通过保持一阶邻近性,我们可能无法很好地区分其社区成员之间的差异。闭环的基础上,社区发现、社区嵌入和顶点嵌入进行了优化。需要考虑三种类型的顶点嵌入一阶近似、二阶近似和高阶近似。...Newman M E J , Girvan M . Finding and Evaluating Community Structure in Networks[J].

    2.4K40

    干货|社区发现算法FastUnfolding的GraphX实现

    这些网络进行社区发现具有极大的意义,如在人际关系网,可以发现出具有不同兴趣、背景的社会团体,方便进行不同的宣传策略;交易网,不同的社区代表不同购买力的客户群体,方便运营为他们推荐合适的商品;资金网络...,社区有可能是潜在的洗钱团伙、刷钻联盟,方便安全部门进行相应处理;相似店铺网络社区发现可以检测出商帮、价格联盟等,商家进行指导等等。...Girvan等人使用 GN算法 进行求解,首先求解每条边的介数(betweenness),然后将介数最大的边删去,再重新求解每条边新的介数,依此循环。...消息滞后 由于并行化处理t轮每个节点根据t-1轮的邻居社区信息进行更新,存在一定的消息滞后现象,会造成 “互换社区” 的问题,示意图如下: ? 图3....实现需要进行算法并行化,充分利用并行化框架带来的计算优势。将传统的串行化算法改造成并行化算法的过程,会遇到中间计算量过大、消息滞后造成的问题,如“互换社区”和“社区归属延迟”问题。

    2.4K30

    使用Python和SAS Viya分析社交网络|附代码数据

    我们将获取的行重定向到Python变量。我们将使用它来生成条形图,显示前5个最大的社区: 这表明最大的社区13具有35个顶点。...以下示例显示社区4节点: 最后,让我们再次渲染网络–这次在为节点着色考虑了社区: 通常,需要根据您的网络规模和期望的结果来调整社区的数量。将小型社区合并为大型社区。...更复杂的情况下,可能还需要在分析网络结构考虑使用其他维度。 ...---- 最受欢迎的见解 1.采用spss-modeler的web复杂网络所有腧穴进行分析 2.用R语言和python进行社交网络社区检测 3.R语言文本挖掘NASA数据网络分析,tf-idf和主题建模...4.R语言中使用航空公司复杂网络疫情进行建模 5.python隶属关系图模型 基于模型的网络密集重叠社区检测 6.使用Python和SAS Viya分析社交网络 7.关联网络分析:已迁离北京外来人口的数据画像

    1K00

    关于图计算&图学习的基础知识概览:前置知识点学习(Paddle Graph L)系列【一】

    搜索引擎返回结果,除了需要考虑网页内容与关键词的相关程度,还需要考虑网页本身的质量。 PageRank是最早Google用于网页进行排序的算法,通过将链接看成投票来指示网页的重要程度。...标签传播是一种常用的社区发现算法:每个顶点的标签即为自己的社区,初始化时设置自己的顶点编号;随后的每一轮迭代,每个顶点将邻居中出现最频繁的标签设置为自己新的标签;当所有顶点相邻两轮之间的标签变化少于某个阈值则停止迭代...当需要计算一个组的稳定性或者聚类系数,我们可以使用三角计数。三角计数社交网络分析中有广泛的应用,通航被用来检测社区。聚类系数可以快速评估特定组或整个网络的内聚性。...图片 Erdos-Rényi 图 Python ,networkx 软件包有用于生成 Erdos-Rényi 图的内置函数。...社区是指一组相连节点的集合。但是,目前关于社群还没有广泛公认的定义,只是社群内的节点应该要密集地相连。 图片 Girvan Newman 算法是一个用于发现社群的常用算法

    81540

    使用Python和SAS Viya分析社交网络

    本示例使用Python和SAS分析了预防高危药物研究的结果。这个社交网络有194个节点和273个边,代表药物、使用者之间的联系。...尽管你可以继续进行并简单地发出一系列REST API调用来访问数据 ,但通常使用编程语言来组织你的工作并使之可重复更有效。我决定使用Python,因为它在年轻的数据科学家中很流行 。...我们将获取的行重定向到Python变量。我们将使用它来生成条形图,显示前5个最大的社区: ? 这表明最大的社区13具有35个顶点。以下示例显示社区4节点: ?...最后,让我们再次渲染网络–这次在为节点着色考虑了社区: ? 通常,需要根据您的网络规模和期望的结果来调整社区的数量。将小型社区合并为大型社区。...更复杂的情况下,可能还需要在分析网络结构考虑使用其他维度。 ? ---- ?

    1.4K20
    领券