在Paraview上可视化SimpleITK坐标

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python、paraview、itk、simpleitk、medical-imaging

我正在尝试只制作一个SimpleITK图像，其中我希望特定的体素值为1，其余的为0。我是SimpleITK的新手，所以我觉得我错过了一些东西。无论如何，我已经生成了一些索引，我将体素值指定为1。但是，我希望能够可视化这些样本在空间中是如何相对于彼此定向的。我已经尝试了多种方法，从将所需索引为1的充满零的数组转换为NIFTI图像，但是我仍然无法将其可视化并查看这些点的外观下面是我试过的一个基本代码片段 def WriteSampleToDisk():the indices where I have S

浏览 79提问于2021-05-06得票数 0

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可视化3D数据结构

matlab、3d、visualization、paraview

我有一个C代码的3D数据结构，我想将其可视化为3D空间中的框和点。所以我有一堆坐标，一些是点的，一些是长方体的，我想在3D中绘制这些坐标，以可视化数据结构。有人做过类似的事情吗？我开始尝试使用paraview。我的计划是生成一个paraview statefile (xml类型的文件)，然后用paraview打开它。问题是这些状态文件既庞大又复杂。为了尝试弄清楚xml结构，我在paraview中创建了Boxes和Point sourc

浏览 3提问于2012-09-19得票数 4

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Paraview:如何绘制矢量？

paraview

我有一个3D身体，我用它在Paraview中进行可视化。我只想画一个向量:我知道它的组成部分和应用点(我身体的压力中心，我知道坐标)。有可能吗？

浏览 12提问于2016-04-28得票数 1

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在哪里可以找到SimpleITK文档和参考信息？

itk、simpleitk

我对尝试使用SimpleITK来解决我的映像问题很感兴趣。您能告诉我文档和培训材料在哪里吗？

浏览 5提问于2011-09-23得票数 7

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存储异构元素

c++、vtk、paraview

我希望生成输出文件，以便随后在Paraview中可视化。我将拥有：还是有办法将所有内容存储在一个文件中？

浏览 1提问于2014-10-19得票数 0

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2车身仿真剖视图

simulation、paraview

我有两个不同时间步长的身体坐标和速度数据。我想使用paraview将其可视化。我可以就使用哪种文件格式以及在哪里可以获得这些文件格式提供一些建议吗？模拟应包括粒子通过空间中不同点时的速度矢量图。

浏览 0提问于2016-04-08得票数 0

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将3D Numpy数组转换为ITK SNAP

numpy、itk

如何将代表医学数据视频的3D Numpy数组转换为适合ITK-SNAP应用程序的文件格式，以便进行手动分割？

浏览 0提问于2017-06-06得票数 0

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在Paraview中将多个.vtk文件可视化

matlab、paraview、visualize

我在Matlab上运行了一些模拟，然后使用.vtk文件将它们传递给Paraview。我希望在Paraview屏幕上看到所有这三个.vtk文件，但似乎我只能一个接一个地可视化它们，而不是一起。

浏览 6提问于2017-02-20得票数 0

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基于VTK/截视的三维可视化

visualization、data-visualization、vtk、paraview

在每个三角形(表示T)上，我定义了一个常数标量，表示f(T)。我想看(感谢Paraview理想情况下，这个例子的可视化应该是两个三角形:第一个三角形的z坐标等于2，第二个三角形的z坐标等于-5。我不知道是否有什么可能，或者vtk格式是否

浏览 0提问于2016-04-06得票数 1

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当我将鼠标移动到paraview图像上时，可以看到鼠标坐标。

paraview

我正在寻找一种方法来查看paraview (vtk)中2D绘图的光标位置，也就是说，当我将鼠标移动到paraview图像上时，可以看到鼠标的坐标。

浏览 13提问于2017-08-09得票数 1

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将瞬态数据导入Paraview

vtk、paraview、geometry-surface

Nodes和Conn变量存储三角形的坐标和连通性。在每个顶点上，存储一个标量量S和一个包含三个分量的向量V。这些数据与时间有关。换句话说，我想要在这个3D曲面上的不同时间步骤在一个VTK文件中写入S和V的值。我最终希望将这个VTK文件导入Paraview中，以便进行可视化。vtkPolyData是否可以用来定义时间，以便Paraview知道我的数据集的短暂性？如有任何帮助或评论，我将不胜感激。

浏览 1提问于2016-04-05得票数 1

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无法用pvpython呈现某物(截图)

paraview、pvpython

我在截屏上是新手，我想制作一个只使用pvpython呈现vtk文件的脚本。因此，我写了这个脚本from paraview.vtk.vtkFiltersSources import vtkSphereSource有人知道为什么我的网格没有呈现在视图中吗？

浏览 4提问于2019-11-18得票数 0

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替代Mayavi进行科学三维绘图

python、numpy、data-science、vtk、mayavi

我需要绘制一个在3D网格中结构化的标量字段，如下所示：from mayavi import mlab X,Y,Z = np.mgrid[0:dtmlab.xlabel('Only end ticks') 我想在Python中这样做，因为我用这种语言模拟了许多数据集，并且我希望能够在我的模拟参数中执行敏感性时快速地可视化它们然而，当涉及到在出版物中传递这些情节时，没有非常基本的

浏览 3提问于2016-02-29得票数 9

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Ubuntu的Paraview

opengl

我现在正在使用Paraview与Open海绵。我对看我的模特有个问题。每当我单击Apply，模型就会出现，过了一段时间，它就消失了。然后每当我试图点击某个东西时，终端上就会出现一个错误../../../..

浏览 0提问于2016-07-19得票数 0

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远程桌面(Windows 10到Ubuntu 20.04)无法使用GPU

drivers、nvidia、windows-10、remote-desktop、nvidia-geforce

我试图在我的新工作PC上使用ParaView可视化3D模型，它安装了Ubuntu 20.04，并配备了NVIDIA RTX3080 GPU。当我在办公室的时候，可视化数据是没有问题的。ParaView启动时，我可以加载数据，但是除了坐标方向(X )以外，RenderView没有显示任何内容。过了一段时间，它发出了这样的信息： QStandardPaths: XDG_RUNTIME_DIR not set, defaulting to '/tmp&#x

浏览 0提问于2020-12-23得票数 2

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在Python、paraview python中使用辅助视图过滤器

vtk、paraview

我一直在使用Paraview可视化和分析VTU文件。我觉得计算梯度滤波器很有用。我想知道是否有一个用于Paraview的python，我可以使用这个过滤器。 Divergence = pv.filters.GradientOfUnstructuredDataset

浏览 3提问于2021-03-03得票数 0

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如何将vtkSphere保存到VTK文件中？

python、c++、vtk、paraview

我正在尝试将多个球面保存到一个文件中，以便稍后使用ParaView进行可视化。我有一个文本文件，里面有关于每个球的位置和形状(半径)的信息。使用Python和VTK，我正在构建一个文件来可视化ParaView中的数据。现在，我可以将球体的中心和半径保存为一个vtkUnstructuredGrid，稍后在ParaView中，我将添加一个球形字形，以进行正确的可视化。这种方法是可行的，但在每次我不得不可视化数据时手动添加字形是非常繁琐的。所以我想弄清楚如

浏览 10提问于2015-04-22得票数 4

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FEniCS与Paraview在Mac上的兼容性问题

docker、paraview、fenics

我正通过Docker在mac上使用FEniCS，但是我在使用mac上安装的Paraview版本可视化分析结果时遇到了问题。文件发送到桌面随后，我打开ParaView(我直接安装在我的mac上，而不是Docker上<

浏览 40提问于2020-02-06得票数 2

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在openfoam中，paraview无法连接到X服务器

ubuntu-18.04、paraview、xserver、openfoam

我在笔记本电脑上安装了windows10，并从应用商店下载了ubuntu 18.04。在ubuntu中，OpenFOAM和paraview是由一个来自信息和通信技术服务台的人安装的(paraview已经起作用了)。此外，还安装了Xming X服务器。我的问题:在第一个教程( data )中，您必须使用paraview可视化数据。所以在他安装了所有东西之后，我就可以使用paraview了。现在我关闭了ubuntu并重新启动。如果我现在调

浏览 7提问于2018-09-13得票数 0

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将VTK UnstructuredGrid转换为StructuredGrid

python、vtk、paraview、simpleitk

问题In [1]: import SimpleITK as sitk转换为numpy，然后转换为sitk图像img = sitk.GetImageFromArray(npgrid) sitk.WriteImage(img,fi

浏览 2提问于2018-07-26得票数 0

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