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Julia机器学习核心编程.6

在Julia中本身就存在数组这个概念。 在大多数编程语言中,数组的下标都是从0开始的。但是在Julia中,数组的下标是从1开始的。...,可能会知道吧.MIT哦......我可以去吗?...在这段代码中,我们使用Float和Int数据来创建一个数组。在Julia中创建数组时会将Int类型转换为Float类型。一般来说,Julia会尝试使用promote()函数来提升类型。...DataFrames中的NA数据类型 在实际生活中,我们会遇到无值的数据。虽然Julia中的数组无法存储这种类型的值,但DataFrames包中提供了这种数据类型,即NA数据类型。...因此,不涉及NA值或不受其影响的方法可以应用于数据集;如果涉及NA值,那么DataArray将给出NA作为结果。在下面的代码中,我们使用了mean()函数和true||x。

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单细胞数据分析新选择(基于Julia编程语言)

ASCT安装 在Julia中进入包管理界面后,可以通过网络直接安装github上ASCT包(所以需要大家自行掌握基本的Julia编程基础哦,包括安装Julia,以及使用Julia的IDE) add https...结果 在ASCT中,目前暂时只支持使用最多的Cellranger结果的读取,同时一个函数既可以读取传统的matrix.mtx目录,也可以读取单一的h5格式文件。...函数,ASCT直接修改WsObj结构,添加特定基因集在每个细胞中的表达比例结果。该函数默认通过正则表达式选定人或小鼠的线粒体基因集,也可以直接输入一个包含特定基因集名称的向量Vector来进行计算。...可以通过trt/ctl参数来设定不同分组之间进行比较,同时使用group_name来设置分组变量的名称,还能通过sub_group参数来限定只对某个特定批次的样本搜寻marker基因等多样化的分析。...数据交换 在Julia中,推荐用户使用JLD2来将计算过程的变量保存到基于HDF5的JLD2文件中,可以实现快速的保存和读取,以方便随时恢复当前的分析进度。

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    Julia 生产环境就绪了吗?我们跟项目维护者聊了聊

    InfoQ:在文章中,您的主要观点是 Julia 生态环境已经达到了成熟的水平,可以投入生产环境了。您能进一步说明一下这一点吗?是什么阻碍了 Julia 在生产环境采用?...如果使用 Julia 编写项目的话,我们可以要么预期有一个包能够完成你想做的事情,要么可以使用 C 或 Python 编写代码并使其能够正常运行。...在实践中,这意味着什么呢?如果你正在做一个项目的话,那么你不会陷入这样的思考:“我可以使用 Julia 吗,在未来的三个月内,我可能在项目里会使用一些 Julia 还没有提供的东西?”...您认为它是 Python、R 或其他语言的替代方案吗,或者至少在科学计算和数据科学领域是这样的吗? Kamiński:在这里,我觉得最好引用一下 Julia 开发人员调查 的第 8 页到第 11 页。...其次,大多数包都是使用 Julia 编写的,如果你不喜欢某些方面的话,可以自行修改(这比在 R/Python 中要容易得多,在这些语言中通常你需要修改的内容都是使用像 C、C++、Fortran 等语言编写的

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    Julia中的数据分析入门

    在本篇文章中,我们将使用约翰霍普金斯大学系统科学与工程中心在其GitHub存储库中提供的Covid-19数据(https://github.com/CSSEGISandData/)。...using CSV using DataFrames using Dates using Plots 如果包还没有添加到您的项目环境中,您可以轻松地添加它们。...首先,我们使用groupby函数按国家分割数据。然后我们对每组(即每个国家)的所有日期列应用一个求和函数,因此我们需要排除第一列“国家/地区”。最后,我们将结果合并到一个df中。...savefig(joinpath(pwd(), "daily_cases_US.svg")) 总结 在本文中,我们介绍了使用Julia进行数据分析的基础知识。根据我的经验,Julia很像python。...我喜欢Julia的原因是它的高性能以及它与其他编程语言(如Python)的互操作性。我喜欢Python的地方在于它庞大的包集合和庞大的在线社区。

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    Julia语言初体验

    1、环境选择: 强烈建议选择JuliaPro来安装,这里稍稍说明一下,julia虽然在8月8日更新了Julia 1.0.0版本,但是作为一门新兴语言,它的版本后向兼容实在是不敢恭维,原生环境里面一个包都不给配置...: ASCII/Unicode U+0021 (category Po: Punctuation, other) julia中字符串可以继续遍历(区别于R,与Python相同) Julia中区别标量和向量...Tuple{String,String} julia> getindex(my_tuple,2) "world" typeof()函数可以用于检查数据对象的类型结构(同R中的typeof,区别于Python..." "F" "F" 在数据框索引这一点儿上,julia是吸收了R和Python的特点,即允许直接基于数据框 本身索引行列,使用 范围符号numA:numB,同时默认取所有列或行时用:。...,julia中的DataFrames中的dataframe都能够很好地满足。

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    有比Pandas 更好的替代吗?对比Vaex, Dask, PySpark, Modin 和Julia

    Pandas可以处理大量数据,但受到PC内存的限制。数据科学有一个黄金法则。如果数据能够完全载入内存(内存够大),请使用Pandas。此规则现在仍然有效吗?...通常存在产生相同或相似结果的替代方法,例如sort或orderBy方法。 首先,必须初始化Spark会话。然后使用python API准备步骤,也可以使用Spark SQL编写SQL代码直接操作。...在下面的图表中,您可以看到第一次运行的时间明显长于其余六次测量的平均值。我还尝试过在单个内核(julia)和4个处理器内核(julia-4)上运行Julia。 ?...从1.5开始,您可以通过julia -t n或julia --threads n启动julia,其中n是所需的内核数。 使用更多核的处理通常会更快,并且julia对开箱即用的并行化有很好的支持。...对于某些操作,它可以提供性能提升,我必须说,有些代码在julia中更优雅。即使Julia没有进入前20名最流行的编程语言,我想它还是有前途的,如果你关注它的开发,你就不会犯错误。

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    【数据整理】比pandas还骚的pandasql

    如果你在 Rodeo 中跟随着,开始时候有会一些提示: Run Script 确实会运行在文本编辑器中编写的所有内容 你可以高亮显示代码块,并通过单击 Run Line 或按 Command + Enter...可以在 group by 子句中使用别名列名或列号。 ? locals() 与 globals() pandasql 需要在会话/环境中访问其他变量。...为了避免一直传递给 locals,你可以将这个帮助函数添加到脚本中,来其设置 globals() 如下: ? 08. 联结 你可以使用正常的 SQL 语法联结 dataframes。 ? 09....这只是SQL 由于 pandasql 由 SQLite3 提供支持,你可以用 SQL 中执行大部分任务。以下是使用常见 SQL 功能(例如子查询,排序分组,函数和联合)的一些示例。 ? ? ?...在我自己学习 R 的个人经验中,sqldf 是一个熟悉的界面,可以帮助我尽快使用新工具来提高生产力。

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    使用Julia进行统计绘图

    与[SPJ02]一样,我们假设示例数据在DataFrames结构countries、subregions_cum和regions_cum中可用。...在VegaLite中,所有图表都是使用@vlplot命令创建的。在下面的代码中,使用了Julia的流水线语法(|>),将regions_cum-DataFrame指定为@vlplot的输入。...为此,我们可以使用Julia对subregions_cum-DataFrame进行排序(与在Gadfly示例中所做的一样),但VegaLite提供了使用sort属性在图形引擎中对数据进行排序的可能性。...然后,数据按地区分组,并为每个组计算密度。这是通过变换操作完成的。将密度分配给x轴会得到垂直密度图。在下一步中,所有五个密度图使用column属性水平排列。...在VegaLite中,也可以使用scale = {domain = [0, 100000]}来指定此限制。

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    【Rust 日报】2022-05-25 从头开始构建云数据库:为什么我们从 C++ 迁移到 Rust

    我们开始质疑自己:C++ 是我们编写新数据库系统的正确语言吗?经过大约七个月的开发,接下来是整整一个月的辩论。最后,我们做出了从 C++ 迁移到 Rust 的艰难决定。...事实上,Rust 需要(按设计)较长的时间来编译。每天在你自己的机器上运行多次测试会分散你的注意力。 相反,测试应该从 CI(持续集成)运行。...dataframes 的开源项目。...Docker 教程 在本教程中,我们将研究几种不同的方法,这些方法可以有效地将 Rust 应用程序 docker 化并将它们作为容器运行。...这些天我正在努力学习 Rust 并扩展我的技能,因此,我将写更多基于 Rust 的文章作为帮助自己学习的方法,并希望帮助其他人可以一起参与进来。

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    8 Julia IO操作

    读写文件: csv JLD2 IOBuffer: IO操作 在对文件的操作中,如果我们未指定文件的路径,则默认的路径为 在使用Atom或vscode时,默认路径即为.jl文件的目录 在使用jupyter...在使用REPL时,系统默认路径为Julia的安装目录,可以执行pwd()命令可查看当前的工作路径,,如果想更换路径,使用cd(dir::String)命令,若想跟换回原始路径,使用homedir()命令...中,可以查看open的用法,在open中,还可以调用函数 open(readline, "sdy.txt") 当然,也可以调用自定义的函数 readFunc(s::IOStream) = read(s...using DelimitedFiles data = rand(Int8,10,5) writedlm("file1.csv", data, ',') 读文件时,我们可以使用DataFrames来读...using DataFrames df = readtable("file1.csv") 也可以使用CSV package自带的函数读取 using CSV df1 = CSV.read("file1

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    史上最全!国外程序员整理的机器学习资源

    Stats—Julia 编写的统计测试函数包 RDataSets —读取R语言中众多可用的数据集的 Julia 函数包。 DataFrames —处理表格数据的 Julia 库。...使用 Python 编写,可以在 Mac、Windows 以及 Ubuntu 上运行。...Ruby 自然语言处理 Treat—文本检索与注释工具包,Ruby 上我见过的最全面的工具包。 Ruby Linguistics—这个框架可以用任何语言为 Ruby 对象构建语言学工具。...在 JRuby 世界中释放了 Apache Mahout 的威力。 CardMagic-Classifier—可用贝叶斯及其他分类法的通用分类器模块。...Algorithms For Machine Learning Machine Learning For Hackers Machine Learning Task View on CRAN—R语言机器学习包列表,按算法类型分组

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    【开源工具】国外程序员整理的机器学习资源大全

    Stats—Julia编写的统计测试函数包 RDataSets —读取R语言中众多可用的数据集的Julia函数包。 DataFrames —处理表格数据的Julia库。...Python 计算机视觉 SimpleCV—开源的计算机视觉框架,可以访问如OpenCV等高性能计算机视觉库。使用Python编写,可以在Mac、Windows以及Ubuntu上运行。...Ruby 自然语言处理 Treat—文本检索与注释工具包,Ruby上我见过的最全面的工具包。 Ruby Linguistics—这个框架可以用任何语言为Ruby对象构建语言学工具。...在JRuby世界中释放了Apache Mahout的威力。 CardMagic-Classifier—可用贝叶斯及其他分类法的通用分类器模块。...Algorithms For Machine Learning Machine Learning For Hackers Machine Learning Task View on CRAN—R语言机器学习包列表,按算法类型分组

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    美联储加持的小众语言 Julia ,能否成为机器学习的明日之星?

    我们认为,在同个封装中获得易用性和性能是可能的。于是,我们开始投入到这个项目之中,并把它命名为 Julia。” ?...2016 年九月发布了Julia 0.5,涵盖了 1100 个工具包,比一年前的 0.4 版本增加了 57%。Julia 开发者社区的规模还很小,目前在全世界范围内大约有 15 万用户。...但随着计划于今年 6 月在加州大学伯克利分校举办的 JuliaCon 峰会,以及将在峰会上发布的 Julia 1.0;届时,它的用户群有望快速增长。...通常来讲,当你用 R 或 Matlab 写了一些东西,想让它运行得更快。你需要把它重新翻译至 C++,或者其他更快的语言。而使用 Julia 就不需要这样——它的速度是拔尖的。”...由于他们需要不断为模型添加数据和层级,纽联储认为 Julia 能更好应付提升的复杂性——他们估算基于 Julia 的模型运行时间大约只需要一至两天,而 Matlab 可能需要一个月才能等到输出结果。

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    为什么我不再推荐你用Julia?

    根据我的经验,在我使用过的所有编程系统中,Julia 及其包的错误率最高,我来举例说明一下: 对概率密度进行采样会出现错误; 对数组进行采样会产生有偏差的结果; 乘积函数可能对 8 位、16 位和 32...我在尝试完成 JSON 编码 、发出 HTTP 请求、将 Arrow 文件与 DataFrames 一起使用,以及使用 Pluto 编辑 Julia 代码等日常任务时,发现一些库中也存在 bug。...@JordiBolibar:从我开始使用 Julia 进行研究以来,我在 Zygote 中遇到了两个 bug,这使我的工作减慢了几个月。...在 Julia 中,使用者可以有效地联合使用由一个人编写的通用算法和由其他人编写的自定义类型。...这些说法在小范围内似乎是合理的,但如果一直如此会造成使用者的合法体验被削弱或淡化,更深层次的根本问题没有得到承认和解决。

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    针对SAS用户:Python数据分析库pandas

    可以认为Series是一个索引、一维数组、类似一列值。可以认为DataFrames是包含行和列的二维数组索引。好比Excel单元格按行和列位置寻址。...导入包 为了使用pandas对象, 或任何其它Python包的对象,我们开始按名称导入库到命名空间。为了避免重复键入完整地包名,对NumPy使用np的标准别名,对pandas使用pd。 ?...该文件包括从2015年1月1日到2015年12月31日中国香港的车辆事故数据。.csv文件位于这里。 一年中的每一天都有很多报告, 其中的值大多是整数。...5 rows × 27 columns OBS=n在SAS中确定用于输入的观察数。 PROC PRINT的输出在此处不显示。 下面的单元格显示的是范围按列的输出。...列列表类似于PROC PRINT中的VAR。注意此语法的双方括号。这个例子展示了按列标签切片。按行切片也可以。方括号[]是切片操作符。这里解释细节。 ? ?

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    pandas 时序统计的高级用法!

    比如时间序列数据是以天为周期的,通过重采样我们可以将其转换为按分钟、小时、周、月、季度等等的其他周期上。根据转换的频率精度可分为向上采样和向下采样。...向上采样:转换到更细颗粒度的频率,比如将天转为小时、分钟、秒等 向下采样:转换到更粗颗粒度的频率,比如将天转为周、月、季度、年等 resample用法 pandas中时间重采样的方法是resample(...最后一天的午夜 offset:对origin添加的偏移量,Timedelta或str类型 group_keys:指定是否在结果索引包含分组keys,当采样对象使用了.apply()方法,默认False不包含...以上可以看到,上采样的过程中由于频率更高导致采样后数据部分缺失。这时候可以使用上采样的填充方法,方法如下: 1)ffill 只有一个参数limit控制向前填充的数量。...它最大的优势在于可以链式使用,每次函数执行后的输出结果可以作为下一个函数的参数,形式如:pipe(func1).pipe(func2),参数可以是series、dataFrames、groupBy对象、

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    开发 | 美联储加持的小众语言 Julia ,能否成为机器学习的明日之星?

    我们认为,在同个封装中获得易用性和性能是可能的。于是,我们开始投入到这个项目之中,并把它命名为 Julia。”...2016 年九月发布了Julia 0.5,涵盖了 1100 个工具包,比一年前的 0.4 版本增加了 57%。Julia 开发者社区的规模还很小,目前在全世界范围内大约有 15 万用户。...但随着计划于今年 6 月在加州大学伯克利分校举办的 JuliaCon 峰会,以及将在峰会上发布的 Julia 1.0; 届时,它的用户群有望快速增长。...通常来讲,当你用 R 或 Matlab 写了一些东西,想让它运行得更快。你需要把它重新翻译至 C++,或者其他更快的语言。而使用 Julia 就不需要这样——它的速度是拔尖的。”...由于他们需要不断为模型添加数据和层级,纽联储认为 Julia 能更好应付提升的复杂性——他们估算基于 Julia 的模型运行时间大约只需要一至两天,而 Matlab 可能需要一个月才能等到输出结果。

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    使用Dask DataFrames 解决Pandas中并行计算的问题

    如何将20GB的CSV文件放入16GB的RAM中。 如果你对Pandas有一些经验,并且你知道它最大的问题——它不容易扩展。有解决办法吗? 是的-Dask DataFrames。...郑重声明,我使用的是MBP 16”8核i9, 16GB内存。 本文的结构如下: 数据集生成 处理单个CSV文件 处理多个CSV文件 结论 数据集生成 我们可以在线下载数据集,但这不是本文的重点。...read_csv()函数接受parse_dates参数,该参数自动将一个或多个列转换为日期类型。 这个很有用,因为我们可以直接用dt。以访问月的值。...处理多个CSV文件 目标:读取所有CSV文件,按年值分组,并计算每列的总和。 使用Pandas处理多个数据文件是一项乏味的任务。简而言之,你必须一个一个地阅读文件,然后把它们垂直地叠起来。...您可以使用data/*. CSV模式来获取data文件夹中的所有CSV文件。然后,你必须一个一个地循环读它们。最后,可以将它们连接起来并进行聚合。

    4.3K20

    全能语言Julia 10岁了!从Covid-19建模到太空规划,为什么科研人员偏爱Ta?

    2012年Julia正式发布,在《我们为什么要创建Julia》博客中,开发人员说:因为我们很贪婪,想让Julia拥有得更多。...同年发布的Julia 1.6通过并行预编译和更快的软件包加载改善了性能,v1.7引入了更快的随机数生成器,并使用Xoshiro256系列RNG中更小的状态,在每个任务中都放一个状态,并在每个任务创建时分叉它...2022年2月,Julia走过十年,版本号也将发布1.8版本。...当时手握大学录取通知书,并没有什么其他事情可做,我对计算科学中需要更好的工具产生了强烈的共鸣,并在那一天开始着手开发Julia。在过去的十年里,我几乎每天都在使用Julia。...网友@aviks 分享:十年前,我在Hacker News上看到这篇博客时的第一反应是「我们真的需要另一种编程语言吗」。那天工作很忙,所以我下载了源代码,并惊讶地看到它第一次就成功构建了。

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    Julia机器核心编程.7

    可以说,无论是R(data.frame)还是Python(Pandas)中的表格都是统计计算中最重要和最常用的数据类型。...这是因为真实世界中的数据大多是表格式的,不能用简单的DataArray来表示。 要使用DataFrame,请从Julia的已注册包中添加DataFrames包,范例如下。 ?...就画出来,我提醒你多用Tab,很多东别自己打.会错的 ---- 对于这种类型的数据,无法使用DataArray来表示。这种数据具有以下功能: • 在不同列中具有不同类型的数据。...不能使用矩阵表示不同列中的不同数据类型,因为矩阵只能包含一种类型的值。 • 它是一个表格数据结构,其记录与不同列的同一行中的其他记录有关系。因此,所有列必须具有相同的长度。...因此,可以使用数字索引以及它们的标记访问列。DataFrame包用于表示表格数据,并将DataArrays用作列。

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