是用于在高性能计算集群中使用Mpirun命令运行并行计算任务的配置文件。Mpirun是一个用于并行计算的工具,它可以在多个计算节点上同时运行同一个程序,实现分布式计算。
主机文件是一个文本文件,其中列出了参与计算的计算节点的主机名或IP地址。通过在主机文件中指定计算节点的信息,Mpirun可以将计算任务分发到这些节点上,并协调它们之间的通信和数据交换。
使用slurm作为作业调度系统的多节点集群,可以通过以下步骤在带有slurm的多节点上运行Mpirun的主机文件:
node1
node2
node3
#!/bin/bash
#SBATCH -N 3
#SBATCH --ntasks-per-node=4
mpirun -np 12 -hostfile hosts.txt ./my_parallel_program
其中,-N
指定计算节点的数量,--ntasks-per-node
指定每个计算节点上的任务数量,-np
指定总的任务数量,-hostfile
指定主机文件的路径,./my_parallel_program
是要运行的并行程序。
sbatch job.sh
这样,slurm将根据作业脚本中的配置信息,将计算任务分发到指定的计算节点上,并在这些节点上运行Mpirun命令,实现并行计算。
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