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入门 | 从PCC到MIC,一文教你如何计算变量之间的相关性

相关性 一般来说,当我们谈到两个变量之间的「相关性(correlation)」时,在某种意义上,我们是指它们的「关系(relatedness)」。 相关变量是包含彼此信息的变量。...事实上,这是一个数据科学的老生常谈: 「相关性不意味着因果关系」 这当然是正确的——有充分的理由说明,即使是两个变量之间有强相关性也不保证存在因果关系。...然而,这些变量之间的关系很显然是非随机的。幸运的是,我们有不同的相关性方法。 让我们来看看其中几个。...距离相关性不是根据它们与各自平均值的距离来估计两个变量如何共同变化,而是根据与其他点的距离来估计它们是如何共同变化的,从而能更好捕捉变量之间非线性依赖关系。...有盛行风向时,小船倾向于同向漂流 与之类似,无关变量可以被看作无盛行风向时随机漂流的小船;相关变量可以被看作在盛行风向影响下漂流的小船。在这个比喻中,风的强弱就代表着两个变量之间相关性的强弱。

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    R计算mRNA和lncRNA之间的相关性+散点图

    我们在做表达谱数据分析的时候,经常需要检测基因两两之间表达的相关性。特别是在构建ceRNA网络的时候,我们需要去检查构成一对ceRNA的mRNA和lncRNA之间的表达是否呈正相关。...前面给大家分享过R计算多个向量两两之间相关性,今天小编就给大家分享一个实际的应用案例,用R去批量的检测大量mRNA跟lncRNA之间表达的相关性,并绘制散点图。...expand.grid(deLNC, dePC) #第一列为lncRNA,第二列为mRNA names(combination)=c("lnc","pc") #通过循环来计算所有lncRNA和mRNA之间表达的相关性以及...值和相关系数 mtext(paste0("cor=",cor,"\npval=",pval), side=3,line= -2,adj = 0.1) dev.off() } 下面是一对mRNA-lncRNA之间相关性的散点图...参考资料: R计算多个向量两两之间相关性

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    字面量,常量和变量之间的区别?

    经常看到这三者,基本每天作为一个程序媛的我,都和这三者在打着交道。之前每个都会使用,但是这样的来区别三者之间的关系还是第一次。从定义到实际例子,这次全面搞清楚,以后就省的定义混淆。...几乎所有计算机编程语言都具有对基本值的字面量表示,诸如:整数、浮点数以及字符串;而有很多也对布尔类型和字符类型的值也支持字面量表示;还有一些甚至对枚举类型的元素以及像数组、记录和对象等复合类型的值也支持字面量表示法...const int b = 10; //b为常量,10为字面量 变量与常量的区别 它们在内存中的存储方式是一样的。只是常量不允许改变,就像只读文件一样。...变量、常量与字面量的区别 字面量是指由字母,数字等构成的字符串或者数值,它只能作为右值出现,(右值是指等号右边的值,如:int a=123这里的a为左值,123为右值。)...常量和变量都属于变量,只不过常量是赋过值后不能再改变的变量,而普通的变量可以再进行赋值操作。

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    如何快速分析样本之间的相关性(主成分分析):Clustvis

    首先给大家介绍一下主成分分析(PCA)的定义,PCA是一种通过正交变换将一组可能存在相关性的变量转换为不相关的变量的统计方法,这些转换后的变量就被称为主成分(来自维基百科)。...对于生物信息和统计的科研工作者而言,生物学领域的数据由于生物与环境、生物之间和生物自身基因、代谢等相互作用的高度复杂,往往具有变量多、样本数较少的特点,这个时候我们通过主成分分析(PCA)就可以快速发现数据背后隐藏的关系...但是如果你作为刚入门的生物信息和生物统计学的小白,自己要实现PCA的整套流程就有一些困难了。...需要注意的是,数据格式要求样本的分类信息或者变量的注释信息都放在最左边的列或者最上面的行,ClustVis会根据数据类型自动识别为column(row) annotations,这些信息对可视化非常重要...这些都要根据同学们自己的数据情况和分析的需要来设置。 接下来我们就可以进入可视化的步骤了。 3 Step3: 第三步和前两步一样,点击页面上方的PCA就可以看到第一个可视化的结果。

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    核心网络生命力和网络特征之间的相关性

    核心网络生命力和网络特征之间的相关性 介绍 方法 数据源 网络特征 分析 结果 LCP CLS 结论 附录 相关内容 介绍 核心网络活力(CWV)是Google认为是衡量网络体验质量的最重要指标的指标...识别和优化CWV问题的过程通常是被动的。网站所有者决定使用哪种技术或查看哪种指标通常是通过反复试验而不是经验研究来决定的。可以使用新技术来构建或重建站点,只是发现站点在生产中会导致UX问题。...在此分析中,我们同时分析了CWV和许多不同类型的Web特征之间的相关性,而不是在真空中分析单一类型的Web特征之间的相关性,因为Web开发的选择不是在真空中而是在网站的许多部分中。...我们希望这些结果将为团队在评估各种Web开发选择时提供更多参考,并邀请社区帮助进一步了解CWV和Web特性之间的相互作用。...1.带有最大满意油漆的显着负面关联: TTFB,JavaScript,CSS和图像的字节数 JavaScript框架-AngularJS,GSAP

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    字符串和列表之间的转换

    字符串本身是由一个或多个字符组成;列表可以看作是由一个或多个相对独立的字符串构成,因此,两者之间在一定条件下是可以转换的。...split命令可以将字符串按照指定规则进行分割,并将分割后的各个字符串构成列表返回。该命令接收两个参数,第一个参数是字符串变量,第二个参数是分割字符。看一个例子。...在这个例子中变量birthday其内容由“/”隔开。Split命令将其按照“/”分割成独立的三部分。这样返回值就可以按照列表方式进行处理。 ?...它把列表元素串接成一个字符串,元素之间用指定的分隔符号隔开。该命令接收两个参数,第一个参数是列表,第二个参数是分割字符。看一个例子。 ? 再看一个例子。...一种可行的方案是在每个元素之间插入换行符,这样每个元素单独占用一行,从而增强了可视性,如下图所示。 ?

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    Python中字符串String的基本内

    Python中字符串String的基本内置函数与用法 首先我们要明白在python中当字符编码为:UTF-8时,中文在字符串中的占位为3个字节,其余字符为一个字节 下面就直接介绍几种python中字符串常用的几种字符串内置函数...(本文中牵扯到了模块与一些之前章节没讲过的相关知识,坑我之后会填的) 字符串切片(截取字符串): #字符串切片 string[开始位置:结束位置:步长] name = "巩祎鹏"print(name[0...(pattern, repl, string[, count]): #第一个参数:需要屏蔽的关键词 第二个参数:过滤后替换原来关键字的字符串 第三个参数:需要过滤的字符串 #使用repl替换string...中每一个匹配的子串后返回替换后的字符串。...def filterfar(string): """ 用于过滤字符串 :param 需要过滤的字符串: 参数 :return: 过滤后的字符串 """ #

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    Python进阶——修改闭包内使用的外部变量

    修改闭包内使用的外部变量 修改闭包内使用的外部变量的错误示例: # 定义一个外部函数 def func_out(num1): # 定义一个内部函数 def func_inner(num2...): # 这里本意想要修改外部num1的值,实际上是在内部函数定义了一个局部变量num1 num1 = 10 # 内部函数使用了外部函数的变量(num1)...return func_inner # 创建闭包实例 f = func_out(1) # 执行闭包 f(2) 修改闭包内使用的外部变量的错误示例: # 定义一个外部函数 def func_out...nonlocal num1 # 告诉解释器,此处使用的是 外部变量a # 修改外部变量num1 num1 = 10 # 内部函数使用了外部函数的变量(num1...小结 修改闭包内使用的外部函数变量使用 nonlocal 关键字来完成。

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    【说站】python字符串之间的运算

    python字符串之间的运算 说明 1、当Python中的两个字符串可以大于(等于)或小于(等于)时,比较的是与字符串相对应的Unicode编码,并逐个比较。...2、利用这个特性,字符串可以按字母顺序排序,但对中文意义不大。 注:如果不想比较两个字符串的Unicode编码, 需要通过数据类型进行转换。 在比较之前,将字符串转换为数值型。...实例 """ #  a(0061) 和 b(0062) 比较 print('a' > 'b') # False   # 比较两个字符串的Unicode编码时,是逐位比较的。...= 比较的是结果对象的值,而不是id。     ...True)) # 8791323868224 8791323365904 print(1 is True) # False print(1 is not True) # True 以上就是python字符串之间的运算

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    NLP笔记:浅谈字符串之间的距离

    汉明距离 汉明距离(Hamming Distance)算是计算文本相似度的最简单的方式,他考察的是等长的字符串之间的距离,其具体定义就是两字符串之间不相同字符的个数。...最长公共子串 最长公共子串(longest common substring)也是常用的一种用于评估两段文本间相似度的方法。故名思意,他就是求取两个字符串之间最长的共有子序列长度。...4. jaccard距离 在大多数情况下,编辑距离事实上足够用于比较字符串之间的相似度了,但是,编辑距离还是存在一定的缺陷的,一个典型的例子就是它依赖于顺序,这就导致一些语义相同但是顺序不同的文本就会遭到误判...,针对这样的数据,jaccard距离相对而言会是一个更好的判断方法,他是顺序无关的,只考虑两个字符串之间的token重合率。...,那么bleu、rouge等指标也可以用于评估两个字符串之间的距离。

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    【C 语言】结构体 ( 结构体变量之间的赋值 )

    文章目录 一、结构体变量之间的赋值 二、完整代码示例 一、结构体变量之间的赋值 ---- 声明结构体变量 s1 , 同时进行初始化操作 ; // 声明结构体变量 , 同时进行初始化操作...Student s1 = {"Tom", 18, 1}; 声明结构体变量 s2 , 不进行初始化 ; // 声明结构体变量 , 不进行初始化 Student s2; 将结构体变量 s1...赋值给 结构体变量 s2 , 该赋值的过程是将 s1 结构体变量赋值给 s2 结构体变量 , 会为 s2 的每个 结构体成员 进行赋值 ; 将 s1 结构体的 成员 取出 并赋值给 s2 结构体 的 相应成员.../ 打印两个结构体变量的地址值 , 上述赋值不是地址赋值 , 而是实际的值之间进行的赋值 printf("s1 address = %d, s2 address = %d\n", &s1, &s2...); // 由上面的 s2 打印结果可知 , 将 s1 结构体变量赋值给 s2 结构体变量 // 会为 s2 的每个 结构体成员 进行赋值 // 将 s1 结构体的 成员 取出

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    java对string类型的操作方法,包括字符串与其他类型之间的转换, 字符串之间的比较

    1String类型 基本操作 (1)获取字符串长度length() (2)获取字符串中的第i个字符charAt(i) (3)获取指定位置的字符方法getChars(4个参数) 格式:char array...); 解释一下括号中四个参数的指向意义:1、indexBegin:需要复制的字符串的开始索引 2、 indexEnd:...需要复制的字符串的结束索引,indexEnd-1 3、array: 前面定义的char型数组的数组名...2 字符串之间的比较 字符串比较也分为两大类:一类是字符串大小的比较,这样的比较有三种结果,大于、等于以及小于;还有一类比较方法就是比较两个字符串是否相等,这样产生的比较结果无非就两种,ture和false...3 字符串与其他类型之间的转换 举一个例子,整数与字符串之间如何转换 ?

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    在Bash命令中展开单引号内的变量?

    问题 我想从一个 bash 脚本中运行一个包含单引号且单引号内有其他命令和一个变量的命令。 例如:repo forall -c '.......$variable "'" 如果我将变量的值直接替换进去,命令就能正常执行。 请告诉我哪里出了错。 回答 在单引号内,所有内容都会被原样保留,无一例外。...不要拼接由 Shell 解析的字符串 你应绝对避免通过拼接变量来构建 Shell 命令。这和 SQL 片段的拼接(导致 SQL 注入)一样是个坏主意!...请勿这样做: script="echo \"Argument 1 is: $myvar\"" /bin/sh -c "$script" 如果变量 $myvar 的内容不可信,这里存在一个可能的攻击方式...1 is: $1"' /bin/sh -c "$script" -- "$myvar" 注意在给 script 变量赋值时使用了单引号,这意味着其内容将被按字面意思使用,期间不会进行变量扩展或其他任何形式的解释

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