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我用Seurat软件包分析了六个单细胞RNA-seq数据集。这6个数据集是通过每一个不同的10倍运行获得的，然后结合批处理效应-通过Seurat函数"FindIntegrationAnchors“进行校正。同时，在6个数据集中，数据1、2、3和4属于“未处理”组，而数据5和6属于“处理”组。我合并了所有的6个数据集与批处理校正，但我也需要比较的特点“未处理”与“处理”。如何将数据1,2,3
浏览 15提问于2020-07-16得票数 0
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稀疏数据有这样的问题吗？比方说，我们需要在列联表中测试两个序数随机变量X和Y的独立性，其中X或Y或维数为1000 (1000000)，而表的输入包含许多没有观察到的单元格？
浏览 3提问于2017-05-26得票数 1
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我能够通过AllenSDK get_cell(id)方法获取单元元数据，但是返回的元数据似乎不包含集群的名称。
浏览 2提问于2018-05-09得票数 0
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我正在使用Pagesus软件包分析我的单细胞RNA测序数据。我遇到了以下错误，使用飞马软件包进行单细胞分析。
浏览 7提问于2022-04-17得票数 -2
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嗨，我正在使用公共数据pbmc来练习单细胞分析，我在这一点上被这个错误信息卡住了。刚从R开始，遇到困难，有人能给一个指针吗？非常感谢代码: RidgePlot(pbmc3k.final，features = features，ncol = 2)
FetchData.Seurat中的错误(对象=对象
浏览 3提问于2022-08-11得票数 0
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我需要在批量转录和LUIS之间进行集成，其中我将把转录作为这样的方式传递给LUIS，并获得音频的意图。 据我所知，我们可以将用于意图分析的数据作为一个只接受500个字符的查询传递给LUIS。因此，问题来了，是否有可能将完整的从语音到文本的转录批量转录API传递给LUIS进行意图分析，或者我们必须将数据分块提供给LUIS？如果我们以块(500个字符)的形式提供数据，我们将如何获得音频的总体意图，因为不同的发声可能会导致不同的顶级意图。
浏览 20提问于2020-06-11得票数 3
全血管的单细胞测序进行数据分析时发现在所有clusters均表达血管平滑肌的成熟marker（包括免疫细胞，内皮细胞，成纤维细胞等等），为什么？
浏览 298提问于2022-01-09
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我得到了一些结果：在这里，重叠群由两组读取组装而成，左侧为反向读取，右侧为正向读取。(为了可视化，我有反向补充正确的伙伴)
但有些重叠群完全是从反向或正向读取组装而来的。
浏览 0提问于2012-06-19得票数 0
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我是R的新手，并试图安装Seurat来分析我的基因组单细胞数据。但是，我想使用Seurat ()，但是在安装软件包时遇到了困难。
浏览 3提问于2015-08-03得票数 1
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我使用RStudio很长一段时间了，它对我来说没问题，但是在我尝试编译代码的前一天，它给出了这样的消息："R遇到致命错误“，它迫使我再次重启RStudio，但问题仍然存在。library(Rtsne)我之前已经运行了很多次了，现在还好。
浏览 0提问于2018-09-02得票数 3
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我正在尝试查看已发布的数据集，以便为我自己的项目检查基因表达。我很难找到教我如何从GEO NCBI数据库中分析R上的单细胞RNA测序数据的材料。这是我试图访问的数据谢谢!
浏览 12提问于2020-04-14得票数 0
我使用存储在单细胞实验分析中的单细胞RNA-seq数据，使用R中的pheatmap对~ 11.3000个表达基因(而不是聚类样本)进行层次聚类，以显示数据的异质性。
浏览 5提问于2018-05-22得票数 2
嗨，我的要求是，我有实时音频流作为输入，说两个人之间的一个电话，现在转换该音频为文本在现场和选择某些关键字从提取的文本和插入数据库。按照中的体系结构，服务和AWS转录服务都用于实时流，但是作为链接： AWS转录支持实时转录，那么为什么在该体系结构中使用Kinesis呢？如果有人知道，请帮助我在理解，希望亚马逊连接可以摄取实时音频到AWS转录为现场转录。
浏览 2提问于2019-03-15得票数 0
我正在处理一组转录的呼叫中心数据，客户在与代理交互时被记录下来。然后由外部转录系统自动转录。我想自动评估这些转录的质量。还有一个问题:是否有任何方法可以自动评估NLP方法的转录质量？我们希望量化和比较转录质量，以筛选出最佳样本，以便在下游任务中对客户的输入进行语义推断。为了找出最有意义的句子，
浏览 0提问于2021-01-24得票数 2
每组数据(来自单个行，如上面的示例)将对应于单个文本。我将启动子定义为txStart (例如134212702) -2000年。然后，每个转录本都具有在外显子计数中指定的设定数量的外显子(例如，8)。较大转录本中每个外显子的开始和结束由exonStarts和exonEnds列表中的匹配值指定。例如，本例中的第一个外显子的范围是134212702到134213049。[:-1].split(","))
ExonEnd = map(int, ExonEnd[:-1].split(",")
浏览 1提问于2013-07-02得票数 0
我创建了一个自定义声学模型(它包括压缩文件中的一组语音数据文件，以及每个音频文件的转录，由文本文件中的一个选项卡隔开)并导入它。在创建部署之后，我尝试通过上传一个音频文件来测试端点，它按预期返回文本转录。现在，我们希望将录制的音频文件和正确的转录提供给自定义语音服务。我们如何以编程
浏览 7提问于2017-02-23得票数 0
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我希望写一个程序来从NCBI/GEO获取数据集，并分析数据以进行比较转录，但无法使其工作。我想知道是否有人在GEO数据集上工作，并帮助一些示例程序或指导我使用这个软件包。
谢谢，阿维纳什
浏览 2提问于2011-02-22得票数 0
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我正在用MySQL开发基因组数据库，我必须获取每个基因的平均转录本数量(每个表中的条目)(在它自己的列上标记，因此每个相同基因的转录本都有相同的数量)。
浏览 3提问于2016-11-05得票数 1
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我正在寻找一个解决方案，在这里我想创建一个有n个用户的组，并让他们-用户加入这个组。最后，一旦工作完成，就删除这个组。(组的创建者可以删除此内容或当组中的每个人断开连接时)。我正在构建转录应用程序，这个小组将维护每个主题的会话。对于每一个新的主题/场景，都需要一个新的组/会话。我应该如何以及何时删除这个组？假设我创建了一个组，然后每个人都加入，我可以维护一个数据库，并在每个人都与这个<
浏览 3提问于2022-10-26得票数 -1
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